MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum B str. Eklund 17B plasmid pCLL

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010680	GGAT	2	8	157	164	25 %	25 %	50 %	0 %	187935816
2	NC_010680	AAAT	2	8	463	470	75 %	25 %	0 %	0 %	187935829
3	NC_010680	AATT	2	8	2228	2235	50 %	50 %	0 %	0 %	187935828
4	NC_010680	TTTA	2	8	2282	2289	25 %	75 %	0 %	0 %	187935828
5	NC_010680	GTTT	2	8	2475	2482	0 %	75 %	25 %	0 %	187935828
6	NC_010680	ATTT	2	8	3145	3152	25 %	75 %	0 %	0 %	187935828
7	NC_010680	TTGG	2	8	3341	3348	0 %	50 %	50 %	0 %	187935809
8	NC_010680	TAAA	2	8	4031	4038	75 %	25 %	0 %	0 %	187935809
9	NC_010680	TAAT	2	8	5126	5133	50 %	50 %	0 %	0 %	187935809
10	NC_010680	AATG	2	8	5178	5185	50 %	25 %	25 %	0 %	187935809
11	NC_010680	TTAA	2	8	5227	5234	50 %	50 %	0 %	0 %	187935809
12	NC_010680	GAAT	2	8	5292	5299	50 %	25 %	25 %	0 %	187935809
13	NC_010680	GAAT	2	8	5303	5310	50 %	25 %	25 %	0 %	187935809
14	NC_010680	TATT	2	8	5437	5444	25 %	75 %	0 %	0 %	187935805
15	NC_010680	AAAT	2	8	6150	6157	75 %	25 %	0 %	0 %	187935815
16	NC_010680	ATAA	2	8	6178	6185	75 %	25 %	0 %	0 %	187935815
17	NC_010680	ACAA	2	8	6275	6282	75 %	0 %	0 %	25 %	187935815
18	NC_010680	ATTT	2	8	6321	6328	25 %	75 %	0 %	0 %	187935815
19	NC_010680	TTAT	2	8	6508	6515	25 %	75 %	0 %	0 %	187935827
20	NC_010680	ATTT	2	8	7161	7168	25 %	75 %	0 %	0 %	187935827
21	NC_010680	TAAT	2	8	7371	7378	50 %	50 %	0 %	0 %	187935827
22	NC_010680	AAGA	2	8	7695	7702	75 %	0 %	25 %	0 %	187935827
23	NC_010680	AAAG	2	8	7915	7922	75 %	0 %	25 %	0 %	187935827
24	NC_010680	ATAA	2	8	8520	8527	75 %	25 %	0 %	0 %	187935822
25	NC_010680	AAAG	2	8	8544	8551	75 %	0 %	25 %	0 %	187935822
26	NC_010680	GGAT	2	8	9455	9462	25 %	25 %	50 %	0 %	187935817
27	NC_010680	CAAG	2	8	10198	10205	50 %	0 %	25 %	25 %	187935817
28	NC_010680	AGGA	2	8	10282	10289	50 %	0 %	50 %	0 %	187935817
29	NC_010680	ATTA	2	8	10523	10530	50 %	50 %	0 %	0 %	187935800
30	NC_010680	TTAT	2	8	10660	10667	25 %	75 %	0 %	0 %	187935800
31	NC_010680	AGAA	2	8	10801	10808	75 %	0 %	25 %	0 %	187935800
32	NC_010680	AAAT	2	8	10969	10976	75 %	25 %	0 %	0 %	187935800
33	NC_010680	CTAA	2	8	11568	11575	50 %	25 %	0 %	25 %	187935826
34	NC_010680	TAAA	2	8	11602	11609	75 %	25 %	0 %	0 %	187935826
35	NC_010680	ATTT	2	8	11623	11630	25 %	75 %	0 %	0 %	187935826
36	NC_010680	AGAA	2	8	11860	11867	75 %	0 %	25 %	0 %	187935796
37	NC_010680	TGGT	2	8	12103	12110	0 %	50 %	50 %	0 %	187935801
38	NC_010680	ATTA	2	8	12165	12172	50 %	50 %	0 %	0 %	187935801
39	NC_010680	AAAT	2	8	12568	12575	75 %	25 %	0 %	0 %	187935801
40	NC_010680	ATAG	2	8	12648	12655	50 %	25 %	25 %	0 %	187935801
41	NC_010680	AAAT	2	8	12673	12680	75 %	25 %	0 %	0 %	187935801
42	NC_010680	ATGA	2	8	12819	12826	50 %	25 %	25 %	0 %	187935801
43	NC_010680	AAAG	2	8	12933	12940	75 %	0 %	25 %	0 %	187935801
44	NC_010680	TAAT	2	8	13235	13242	50 %	50 %	0 %	0 %	187935801
45	NC_010680	ATGA	2	8	13525	13532	50 %	25 %	25 %	0 %	187935831
46	NC_010680	TTGA	2	8	14293	14300	25 %	50 %	25 %	0 %	187935831
47	NC_010680	AAAT	2	8	14985	14992	75 %	25 %	0 %	0 %	187935841
48	NC_010680	ATTA	2	8	15333	15340	50 %	50 %	0 %	0 %	187935841
49	NC_010680	GAAA	2	8	15954	15961	75 %	0 %	25 %	0 %	187935821
50	NC_010680	AATG	2	8	16036	16043	50 %	25 %	25 %	0 %	187935821
51	NC_010680	ATTA	2	8	16975	16982	50 %	50 %	0 %	0 %	187935810
52	NC_010680	AATT	2	8	17340	17347	50 %	50 %	0 %	0 %	187935842
53	NC_010680	TAAT	2	8	18043	18050	50 %	50 %	0 %	0 %	187935848
54	NC_010680	AATT	2	8	18228	18235	50 %	50 %	0 %	0 %	187935848
55	NC_010680	ATTT	2	8	18485	18492	25 %	75 %	0 %	0 %	187935814
56	NC_010680	CAAT	2	8	18517	18524	50 %	25 %	0 %	25 %	187935814
57	NC_010680	AGTA	2	8	18694	18701	50 %	25 %	25 %	0 %	187935808
58	NC_010680	AATG	2	8	19602	19609	50 %	25 %	25 %	0 %	187935849
59	NC_010680	TAAA	2	8	19715	19722	75 %	25 %	0 %	0 %	187935849
60	NC_010680	AGTT	2	8	19879	19886	25 %	50 %	25 %	0 %	187935799
61	NC_010680	TAAA	2	8	21055	21062	75 %	25 %	0 %	0 %	187935832
62	NC_010680	TATT	2	8	21604	21611	25 %	75 %	0 %	0 %	187935832
63	NC_010680	AAGG	3	12	21753	21764	50 %	0 %	50 %	0 %	187935832
64	NC_010680	TCTT	2	8	21935	21942	0 %	75 %	0 %	25 %	187935832
65	NC_010680	TTTA	2	8	22268	22275	25 %	75 %	0 %	0 %	187935832
66	NC_010680	TCCA	2	8	22648	22655	25 %	25 %	0 %	50 %	187935832
67	NC_010680	ATTC	2	8	22895	22902	25 %	50 %	0 %	25 %	187935836
68	NC_010680	TTTA	2	8	22905	22912	25 %	75 %	0 %	0 %	187935836
69	NC_010680	AAAT	2	8	22988	22995	75 %	25 %	0 %	0 %	187935836
70	NC_010680	AAAG	2	8	24637	24644	75 %	0 %	25 %	0 %	187935839
71	NC_010680	GATA	2	8	24812	24819	50 %	25 %	25 %	0 %	187935839
72	NC_010680	TTTC	2	8	25263	25270	0 %	75 %	0 %	25 %	187935807
73	NC_010680	AGAT	2	8	26105	26112	50 %	25 %	25 %	0 %	187935807
74	NC_010680	TAAA	2	8	26248	26255	75 %	25 %	0 %	0 %	187935807
75	NC_010680	TAAT	2	8	26266	26273	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
76	NC_010680	TTCT	2	8	26660	26667	0 %	75 %	0 %	25 %	187935807
77	NC_010680	TTTA	2	8	26683	26690	25 %	75 %	0 %	0 %	187935807
78	NC_010680	AAAT	2	8	27305	27312	75 %	25 %	0 %	0 %	187935807
79	NC_010680	AATT	2	8	27448	27455	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
80	NC_010680	ATTT	2	8	27852	27859	25 %	75 %	0 %	0 %	187935807
81	NC_010680	ATTT	2	8	27915	27922	25 %	75 %	0 %	0 %	187935807
82	NC_010680	TAGA	2	8	27967	27974	50 %	25 %	25 %	0 %	187935807
83	NC_010680	TTAG	2	8	28461	28468	25 %	50 %	25 %	0 %	187935807
84	NC_010680	AATA	2	8	28692	28699	75 %	25 %	0 %	0 %	187935837
85	NC_010680	ACAA	2	8	28947	28954	75 %	0 %	0 %	25 %	187935837
86	NC_010680	ATTA	2	8	29100	29107	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
87	NC_010680	AAAT	2	8	29643	29650	75 %	25 %	0 %	0 %	187935837
88	NC_010680	TAAA	2	8	29927	29934	75 %	25 %	0 %	0 %	187935837
89	NC_010680	AATT	2	8	30149	30156	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
90	NC_010680	AATG	2	8	31006	31013	50 %	25 %	25 %	0 %	187935837
91	NC_010680	AAAT	2	8	31116	31123	75 %	25 %	0 %	0 %	187935837
92	NC_010680	TAAT	2	8	31535	31542	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
93	NC_010680	TAGA	2	8	31823	31830	50 %	25 %	25 %	0 %	187935837
94	NC_010680	ATTT	2	8	31836	31843	25 %	75 %	0 %	0 %	187935837
95	NC_010680	ATCA	2	8	31880	31887	50 %	25 %	0 %	25 %	187935837
96	NC_010680	GATT	2	8	32387	32394	25 %	50 %	25 %	0 %	187935837
97	NC_010680	TAAA	2	8	34434	34441	75 %	25 %	0 %	0 %	187935830
98	NC_010680	ATTA	2	8	34780	34787	50 %	50 %	0 %	0 %	187935830
99	NC_010680	AGAA	2	8	35049	35056	75 %	0 %	25 %	0 %	187935825
100	NC_010680	AAAT	2	8	35254	35261	75 %	25 %	0 %	0 %	187935825
101	NC_010680	TTAA	2	8	37060	37067	50 %	50 %	0 %	0 %	187935803
102	NC_010680	AAAG	2	8	37194	37201	75 %	0 %	25 %	0 %	187935803
103	NC_010680	AAGC	2	8	37533	37540	50 %	0 %	25 %	25 %	187935806
104	NC_010680	TTTA	2	8	37687	37694	25 %	75 %	0 %	0 %	187935806
105	NC_010680	ATTA	2	8	38019	38026	50 %	50 %	0 %	0 %	187935806
106	NC_010680	GAAA	2	8	38591	38598	75 %	0 %	25 %	0 %	187935818
107	NC_010680	GATA	2	8	38722	38729	50 %	25 %	25 %	0 %	187935818
108	NC_010680	AAAT	2	8	39069	39076	75 %	25 %	0 %	0 %	187935818
109	NC_010680	TAAA	2	8	39784	39791	75 %	25 %	0 %	0 %	187935797
110	NC_010680	TCTT	2	8	40438	40445	0 %	75 %	0 %	25 %	187935802
111	NC_010680	AATC	2	8	41173	41180	50 %	25 %	0 %	25 %	187935844
112	NC_010680	GAAA	2	8	41226	41233	75 %	0 %	25 %	0 %	187935844
113	NC_010680	AATA	2	8	41273	41280	75 %	25 %	0 %	0 %	187935844
114	NC_010680	AGAA	2	8	41462	41469	75 %	0 %	25 %	0 %	187935845
115	NC_010680	TAGA	2	8	41871	41878	50 %	25 %	25 %	0 %	187935843
116	NC_010680	TTCT	2	8	41898	41905	0 %	75 %	0 %	25 %	187935843
117	NC_010680	AGTA	2	8	43900	43907	50 %	25 %	25 %	0 %	187935833
118	NC_010680	ATCA	2	8	44541	44548	50 %	25 %	0 %	25 %	187935833
119	NC_010680	AATT	2	8	44682	44689	50 %	50 %	0 %	0 %	187935833
120	NC_010680	AAAT	2	8	44889	44896	75 %	25 %	0 %	0 %	187935833
121	NC_010680	TAAA	2	8	45270	45277	75 %	25 %	0 %	0 %	187935833
122	NC_010680	TGAA	2	8	45633	45640	50 %	25 %	25 %	0 %	187935833
123	NC_010680	AAGA	2	8	46016	46023	75 %	0 %	25 %	0 %	187935833
124	NC_010680	AAGA	2	8	46277	46284	75 %	0 %	25 %	0 %	187935833
125	NC_010680	AAGA	2	8	46538	46545	75 %	0 %	25 %	0 %	187935833
126	NC_010680	AAGA	2	8	46799	46806	75 %	0 %	25 %	0 %	187935833
127	NC_010680	AATG	2	8	47168	47175	50 %	25 %	25 %	0 %	187935833
128	NC_010680	CAAA	2	8	47219	47226	75 %	0 %	0 %	25 %	187935833

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.