MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum B str. Eklund 17B plasmid pCLL

Total Repeats: 726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010680	CAG	2	6	17	22	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187935816
2	NC_010680	TGT	2	6	51	56	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187935816
3	NC_010680	TAC	2	6	72	77	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935816
4	NC_010680	CAA	2	6	89	94	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187935816
5	NC_010680	CAT	2	6	95	100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935816
6	NC_010680	TAC	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935816
7	NC_010680	GAA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935816
8	NC_010680	TTA	2	6	224	229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935816
9	NC_010680	TAA	3	9	268	276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935816
10	NC_010680	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935829
11	NC_010680	AAT	2	6	481	486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935829
12	NC_010680	ATT	2	6	492	497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935829
13	NC_010680	AAC	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187935829
14	NC_010680	AGT	2	6	755	760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935840
15	NC_010680	TGG	2	6	812	817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187935840
16	NC_010680	ACA	2	6	821	826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187935840
17	NC_010680	AGC	2	6	920	925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187935840
18	NC_010680	ATA	2	6	1012	1017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935828
19	NC_010680	TAA	2	6	1067	1072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935828
20	NC_010680	TGG	2	6	1193	1198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187935828
21	NC_010680	ATT	2	6	1241	1246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935828
22	NC_010680	TAT	2	6	1294	1299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935828
23	NC_010680	ATG	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935828
24	NC_010680	TAC	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935828
25	NC_010680	AGA	2	6	1379	1384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935828
26	NC_010680	AGA	2	6	1421	1426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935828
27	NC_010680	TGA	2	6	1481	1486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935828
28	NC_010680	TAA	2	6	1496	1501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935828
29	NC_010680	TAT	3	9	1502	1510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935828
30	NC_010680	TAC	2	6	1514	1519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935828
31	NC_010680	CAA	2	6	1552	1557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187935828
32	NC_010680	TAA	3	9	1594	1602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935828
33	NC_010680	TTA	2	6	1680	1685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935828
34	NC_010680	TAA	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935828
35	NC_010680	GTA	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935828
36	NC_010680	TAT	2	6	1797	1802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935828
37	NC_010680	TGA	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935828
38	NC_010680	GAA	2	6	1959	1964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935828
39	NC_010680	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935828
40	NC_010680	ATT	2	6	2068	2073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935828
41	NC_010680	TCA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935828
42	NC_010680	AAC	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187935828
43	NC_010680	ATG	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935828
44	NC_010680	ATC	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935828
45	NC_010680	TGA	2	6	2423	2428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935828
46	NC_010680	CCA	2	6	2442	2447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187935828
47	NC_010680	ATT	2	6	2466	2471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935828
48	NC_010680	GAT	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935828
49	NC_010680	CAG	2	6	2614	2619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187935828
50	NC_010680	GAA	2	6	2643	2648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935828
51	NC_010680	CAA	2	6	2689	2694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187935828
52	NC_010680	ATT	2	6	2726	2731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935828
53	NC_010680	AGA	2	6	2738	2743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935828
54	NC_010680	TGT	3	9	2771	2779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187935828
55	NC_010680	AAG	2	6	2792	2797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935828
56	NC_010680	TAA	2	6	2810	2815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935828
57	NC_010680	TGA	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935828
58	NC_010680	TAA	5	15	2975	2989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935828
59	NC_010680	TAA	2	6	3011	3016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935828
60	NC_010680	ATA	3	9	3025	3033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935828
61	NC_010680	ATT	2	6	3039	3044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935828
62	NC_010680	TGA	2	6	3065	3070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935828
63	NC_010680	TGA	2	6	3187	3192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935828
64	NC_010680	ATA	3	9	3290	3298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
65	NC_010680	TAA	2	6	3317	3322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
66	NC_010680	ATA	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
67	NC_010680	ATA	2	6	3373	3378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
68	NC_010680	CAA	2	6	3398	3403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187935809
69	NC_010680	GAT	2	6	3480	3485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935809
70	NC_010680	AAT	2	6	3504	3509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
71	NC_010680	ATA	2	6	3520	3525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
72	NC_010680	ATT	2	6	3591	3596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935809
73	NC_010680	ATG	2	6	3604	3609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935809
74	NC_010680	TCA	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935809
75	NC_010680	ATA	2	6	3809	3814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
76	NC_010680	GGT	2	6	3899	3904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187935809
77	NC_010680	TGT	2	6	3942	3947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187935809
78	NC_010680	TGA	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935809
79	NC_010680	ATT	2	6	4273	4278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935809
80	NC_010680	GGT	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187935809
81	NC_010680	TGC	2	6	4344	4349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187935809
82	NC_010680	GTT	2	6	4354	4359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187935809
83	NC_010680	CTG	2	6	4412	4417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187935809
84	NC_010680	ATA	2	6	4493	4498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
85	NC_010680	TAA	2	6	4521	4526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
86	NC_010680	TAA	2	6	4539	4544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
87	NC_010680	AAT	2	6	4579	4584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
88	NC_010680	ATA	3	9	4592	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
89	NC_010680	GAA	2	6	4603	4608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935809
90	NC_010680	TAA	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
91	NC_010680	TAA	2	6	4674	4679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
92	NC_010680	ATG	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935809
93	NC_010680	ATA	2	6	4721	4726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
94	NC_010680	AAT	2	6	4807	4812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
95	NC_010680	AAT	2	6	4855	4860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
96	NC_010680	AAT	2	6	4903	4908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
97	NC_010680	AAT	2	6	4951	4956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
98	NC_010680	AAT	2	6	4999	5004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
99	NC_010680	AAT	2	6	5047	5052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
100	NC_010680	AAT	2	6	5095	5100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
101	NC_010680	AAG	2	6	5143	5148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935809
102	NC_010680	GAA	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935809
103	NC_010680	ATA	2	6	5207	5212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
104	NC_010680	TAA	2	6	5276	5281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935809
105	NC_010680	ATA	2	6	5512	5517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935805
106	NC_010680	GAA	2	6	5827	5832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935815
107	NC_010680	GAA	2	6	5893	5898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935815
108	NC_010680	ATT	2	6	6077	6082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935815
109	NC_010680	CAA	2	6	6133	6138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187935815
110	NC_010680	TGA	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935815
111	NC_010680	ATA	2	6	6239	6244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935815
112	NC_010680	ATT	2	6	6363	6368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935815
113	NC_010680	CAT	2	6	6555	6560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935827
114	NC_010680	ACA	2	6	6614	6619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187935827
115	NC_010680	ATT	2	6	6643	6648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935827
116	NC_010680	TGA	2	6	6655	6660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935827
117	NC_010680	TGT	3	9	6661	6669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187935827
118	NC_010680	TAA	2	6	6691	6696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935827
119	NC_010680	TGA	2	6	6751	6756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935827
120	NC_010680	ATA	2	6	6765	6770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935827
121	NC_010680	ATA	2	6	6845	6850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935827
122	NC_010680	TAA	2	6	7030	7035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935827
123	NC_010680	TAC	2	6	7129	7134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935827
124	NC_010680	TGG	2	6	7141	7146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187935827
125	NC_010680	GAT	2	6	7175	7180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935827
126	NC_010680	ATA	2	6	7257	7262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935827
127	NC_010680	TGG	2	6	7333	7338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187935827
128	NC_010680	CAA	2	6	7395	7400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187935827
129	NC_010680	TGA	2	6	7405	7410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935827
130	NC_010680	AGA	2	6	7429	7434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935827
131	NC_010680	GCA	2	6	7447	7452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187935827
132	NC_010680	ATG	2	6	7469	7474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935827
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