MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum B str. Eklund 17B plasmid pCLL

Total Repeats: 1237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010680	TAA	2	6	18392	18397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935814
502	NC_010680	A	6	6	18419	18424	100 %	0 %	0 %	0 %	187935814
503	NC_010680	ATTT	2	8	18485	18492	25 %	75 %	0 %	0 %	187935814
504	NC_010680	T	6	6	18490	18495	0 %	100 %	0 %	0 %	187935814
505	NC_010680	AAAAG	2	10	18496	18505	80 %	0 %	20 %	0 %	187935814
506	NC_010680	CAAT	2	8	18517	18524	50 %	25 %	0 %	25 %	187935814
507	NC_010680	ATTAT	2	10	18534	18543	40 %	60 %	0 %	0 %	187935814
508	NC_010680	AT	3	6	18555	18560	50 %	50 %	0 %	0 %	187935814
509	NC_010680	AGC	2	6	18588	18593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187935814
510	NC_010680	AATAA	2	10	18674	18683	80 %	20 %	0 %	0 %	187935808
511	NC_010680	AGTA	2	8	18694	18701	50 %	25 %	25 %	0 %	187935808
512	NC_010680	ATT	2	6	18716	18721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935808
513	NC_010680	TAT	2	6	18726	18731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935808
514	NC_010680	A	7	7	18738	18744	100 %	0 %	0 %	0 %	187935808
515	NC_010680	AT	3	6	18782	18787	50 %	50 %	0 %	0 %	187935808
516	NC_010680	ATA	2	6	18795	18800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935808
517	NC_010680	CTA	2	6	18801	18806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935808
518	NC_010680	ATT	2	6	18828	18833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935808
519	NC_010680	TAT	3	9	18835	18843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935808
520	NC_010680	AAG	2	6	18858	18863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935808
521	NC_010680	ATA	2	6	18926	18931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935808
522	NC_010680	TA	3	6	18939	18944	50 %	50 %	0 %	0 %	187935808
523	NC_010680	ATG	2	6	19558	19563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935849
524	NC_010680	AAG	3	9	19564	19572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935849
525	NC_010680	AATG	2	8	19602	19609	50 %	25 %	25 %	0 %	187935849
526	NC_010680	TGA	2	6	19664	19669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935849
527	NC_010680	GAA	2	6	19677	19682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935849
528	NC_010680	TAT	2	6	19689	19694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935849
529	NC_010680	TAAA	2	8	19715	19722	75 %	25 %	0 %	0 %	187935849
530	NC_010680	TAT	2	6	19739	19744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935799
531	NC_010680	CAG	2	6	19807	19812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187935799
532	NC_010680	AGA	2	6	19838	19843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935799
533	NC_010680	AGTT	2	8	19879	19886	25 %	50 %	25 %	0 %	187935799
534	NC_010680	ATT	2	6	19932	19937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935798
535	NC_010680	GAA	2	6	20040	20045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935798
536	NC_010680	A	6	6	20089	20094	100 %	0 %	0 %	0 %	187935798
537	NC_010680	GA	3	6	20110	20115	50 %	0 %	50 %	0 %	187935798
538	NC_010680	AGA	2	6	20150	20155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935798
539	NC_010680	ACAGT	2	10	20162	20171	40 %	20 %	20 %	20 %	187935798
540	NC_010680	TTC	2	6	20495	20500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187935846
541	NC_010680	ATA	2	6	20509	20514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935846
542	NC_010680	ATC	2	6	20575	20580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935846
543	NC_010680	AT	3	6	20877	20882	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
544	NC_010680	TTATA	2	10	20908	20917	40 %	60 %	0 %	0 %	187935832
545	NC_010680	AT	3	6	20947	20952	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
546	NC_010680	TAA	2	6	20966	20971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935832
547	NC_010680	TGT	2	6	21009	21014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187935832
548	NC_010680	TAAA	2	8	21055	21062	75 %	25 %	0 %	0 %	187935832
549	NC_010680	TTA	2	6	21078	21083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935832
550	NC_010680	TAT	2	6	21115	21120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935832
551	NC_010680	TAT	2	6	21218	21223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935832
552	NC_010680	GAA	2	6	21231	21236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935832
553	NC_010680	CTT	2	6	21259	21264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187935832
554	NC_010680	CT	3	6	21265	21270	0 %	50 %	0 %	50 %	187935832
555	NC_010680	AGA	2	6	21296	21301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935832
556	NC_010680	GTA	2	6	21320	21325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935832
557	NC_010680	TTA	2	6	21336	21341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935832
558	NC_010680	AAC	2	6	21347	21352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187935832
559	NC_010680	ATC	2	6	21413	21418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935832
560	NC_010680	AT	3	6	21467	21472	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
561	NC_010680	TGG	2	6	21479	21484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187935832
562	NC_010680	ATT	2	6	21488	21493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935832
563	NC_010680	GTA	2	6	21519	21524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935832
564	NC_010680	ATA	2	6	21535	21540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935832
565	NC_010680	TA	3	6	21539	21544	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
566	NC_010680	ATT	2	6	21551	21556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935832
567	NC_010680	TATT	2	8	21604	21611	25 %	75 %	0 %	0 %	187935832
568	NC_010680	CTA	2	6	21643	21648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935832
569	NC_010680	TTC	2	6	21653	21658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187935832
570	NC_010680	ACT	2	6	21705	21710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935832
571	NC_010680	AAGG	3	12	21753	21764	50 %	0 %	50 %	0 %	187935832
572	NC_010680	TAA	2	6	21781	21786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935832
573	NC_010680	TAT	2	6	21829	21834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935832
574	NC_010680	AT	3	6	21847	21852	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
575	NC_010680	CTT	2	6	21868	21873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187935832
576	NC_010680	AAT	2	6	21906	21911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935832
577	NC_010680	TCTT	2	8	21935	21942	0 %	75 %	0 %	25 %	187935832
578	NC_010680	TTG	2	6	21950	21955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187935832
579	NC_010680	TAT	2	6	21967	21972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935832
580	NC_010680	AAT	2	6	21984	21989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935832
581	NC_010680	TGA	2	6	22031	22036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935832
582	NC_010680	TAA	2	6	22049	22054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935832
583	NC_010680	TA	3	6	22085	22090	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
584	NC_010680	TTA	2	6	22101	22106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935832
585	NC_010680	TG	3	6	22143	22148	0 %	50 %	50 %	0 %	187935832
586	NC_010680	CTA	2	6	22149	22154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935832
587	NC_010680	T	7	7	22207	22213	0 %	100 %	0 %	0 %	187935832
588	NC_010680	TTTA	2	8	22268	22275	25 %	75 %	0 %	0 %	187935832
589	NC_010680	T	6	6	22276	22281	0 %	100 %	0 %	0 %	187935832
590	NC_010680	TGT	2	6	22356	22361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187935832
591	NC_010680	TAT	2	6	22370	22375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935832
592	NC_010680	AT	3	6	22407	22412	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
593	NC_010680	TAT	2	6	22501	22506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935832
594	NC_010680	T	6	6	22506	22511	0 %	100 %	0 %	0 %	187935832
595	NC_010680	AT	3	6	22512	22517	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
596	NC_010680	ATA	3	9	22541	22549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935832
597	NC_010680	ATA	2	6	22642	22647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935832
598	NC_010680	TCCA	2	8	22648	22655	25 %	25 %	0 %	50 %	187935832
599	NC_010680	T	8	8	22741	22748	0 %	100 %	0 %	0 %	187935832
600	NC_010680	T	6	6	22781	22786	0 %	100 %	0 %	0 %	187935836
601	NC_010680	ATTTG	2	10	22798	22807	20 %	60 %	20 %	0 %	187935836
602	NC_010680	TA	3	6	22813	22818	50 %	50 %	0 %	0 %	187935836
603	NC_010680	GTA	2	6	22829	22834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935836
604	NC_010680	AGT	2	6	22837	22842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935836
605	NC_010680	ATTC	2	8	22895	22902	25 %	50 %	0 %	25 %	187935836
606	NC_010680	TTTA	2	8	22905	22912	25 %	75 %	0 %	0 %	187935836
607	NC_010680	ATA	2	6	22921	22926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935836
608	NC_010680	AAAT	2	8	22988	22995	75 %	25 %	0 %	0 %	187935836
609	NC_010680	AT	3	6	23068	23073	50 %	50 %	0 %	0 %	187935836
610	NC_010680	ATT	2	6	23091	23096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935836
611	NC_010680	AGA	2	6	23100	23105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935836
612	NC_010680	TAT	2	6	23174	23179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935836
613	NC_010680	TAA	2	6	23290	23295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935824
614	NC_010680	ATC	2	6	23309	23314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935824
615	NC_010680	TAG	2	6	23338	23343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935824
616	NC_010680	TA	3	6	23365	23370	50 %	50 %	0 %	0 %	187935824
617	NC_010680	CAT	2	6	23458	23463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935824
618	NC_010680	AGA	2	6	23477	23482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935824
619	NC_010680	GAA	2	6	23505	23510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935824
620	NC_010680	GTATT	2	10	23536	23545	20 %	60 %	20 %	0 %	187935824
621	NC_010680	A	6	6	23546	23551	100 %	0 %	0 %	0 %	187935824
622	NC_010680	TAT	2	6	23572	23577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935824
623	NC_010680	TA	3	6	23617	23622	50 %	50 %	0 %	0 %	187935824
624	NC_010680	TTG	2	6	23651	23656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187935824
625	NC_010680	TCT	2	6	23727	23732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187935824
626	NC_010680	TA	3	6	23744	23749	50 %	50 %	0 %	0 %	187935824
627	NC_010680	ATT	2	6	23756	23761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935824
628	NC_010680	ATA	2	6	23803	23808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935824
629	NC_010680	AAT	2	6	23834	23839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935824
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