MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum B str. Eklund 17B chromosome

Total Repeats: 2028

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010674	GTAATA	2	12	566	577	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187935721
2	NC_010674	CTAAAG	2	12	716	727	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187935721
3	NC_010674	AAATTT	2	12	2297	2308	50 %	50 %	0 %	0 %	187933007
4	NC_010674	AAAAGA	2	12	2846	2857	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187933007
5	NC_010674	GTAAAG	2	12	5061	5072	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187934052
6	NC_010674	TTTGAT	2	12	5165	5176	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187934052
7	NC_010674	GGTAAA	2	12	6227	6238	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187934052
8	NC_010674	ATTCTG	2	12	6255	6266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187934052
9	NC_010674	TTTAAA	2	12	7574	7585	50 %	50 %	0 %	0 %	187934554
10	NC_010674	TGATAT	2	12	9080	9091	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187934554
11	NC_010674	TGAAGA	2	12	15074	15085	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187935109
12	NC_010674	TTAAGT	2	12	15179	15190	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187935109
13	NC_010674	AGTTGA	2	12	17841	17852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187934733
14	NC_010674	AGGATT	2	12	18648	18659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187934733
15	NC_010674	AGATAG	2	12	22608	22619	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187932856
16	NC_010674	ATCTGT	2	12	23427	23438	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187932856
17	NC_010674	TTTAGA	2	12	23586	23597	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187932856
18	NC_010674	CAGGAT	2	12	26148	26159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187935208
19	NC_010674	AAGAGG	2	12	27222	27233	50 %	0 %	50 %	0 %	187935208
20	NC_010674	TTAGAT	2	12	28916	28927	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187934401
21	NC_010674	ATAAAT	2	12	29800	29811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187934016
22	NC_010674	GCTTTT	2	12	33859	33870	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	187932470
23	NC_010674	AAGGAA	2	12	39369	39380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187934144
24	NC_010674	AAAAAT	2	12	40419	40430	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187932875
25	NC_010674	CAATCA	2	12	44233	44244	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	187933402
26	NC_010674	GTATAA	2	12	47607	47618	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187933204
27	NC_010674	AAATAA	2	12	47775	47786	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187933204
28	NC_010674	TAGTTA	2	12	53582	53593	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187932894
29	NC_010674	AATCTT	2	12	54033	54044	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187932894
30	NC_010674	TAGTAT	2	12	54192	54203	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187932894
31	NC_010674	TATAGC	2	12	55661	55672	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187935171
32	NC_010674	TATTTT	2	12	56754	56765	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	187934459
33	NC_010674	TGGGAA	2	12	58833	58844	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	187932478
34	NC_010674	TAAAGA	2	12	59221	59232	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187932478
35	NC_010674	TAAAAA	2	12	59505	59516	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187932478
36	NC_010674	ATTTGG	2	12	66300	66311	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	187934564
37	NC_010674	AGTTTT	2	12	66752	66763	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187933586
38	NC_010674	GTATTT	2	12	68301	68312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187935111
39	NC_010674	ATTAAA	2	12	68468	68479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935111
40	NC_010674	GATAAA	2	12	68583	68594	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187935111
41	NC_010674	GAATTA	2	12	73228	73239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187933326
42	NC_010674	AAAGTT	2	12	73731	73742	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187933326
43	NC_010674	TGAAGT	2	12	75656	75667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187934720
44	NC_010674	AGTAAT	2	12	75683	75694	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187934720
45	NC_010674	TAAAGG	2	12	76070	76081	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187934720
46	NC_010674	TCTATT	2	12	79788	79799	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187933927
47	NC_010674	TTTAGA	2	12	87450	87461	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187934625
48	NC_010674	CAGGAG	2	12	89624	89635	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	187933173
49	NC_010674	TCTTTA	2	12	92550	92561	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187933779
50	NC_010674	GAAAAA	2	12	95057	95068	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187934447
51	NC_010674	TAGTTT	2	12	95671	95682	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187934447
52	NC_010674	AACAAA	2	12	99877	99888	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	187934673
53	NC_010674	TAAAAA	2	12	100391	100402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187933696
54	NC_010674	ATTAAT	2	12	101337	101348	50 %	50 %	0 %	0 %	187933696
55	NC_010674	GGTGAA	2	12	105982	105993	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	187932895
56	NC_010674	AGAAAA	2	12	106699	106710	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187935410
57	NC_010674	GTAAAA	2	12	107054	107065	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187935410
58	NC_010674	TTAATT	2	12	107912	107923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187933565
59	NC_010674	TATATT	2	12	108775	108786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187932573
60	NC_010674	ACAGCA	2	12	110466	110477	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	187935274
61	NC_010674	GCATCT	2	12	112023	112034	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187933665
62	NC_010674	AAATAA	2	12	112207	112218	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187933665
63	NC_010674	TAGCAA	2	12	112597	112608	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187933665
64	NC_010674	GAGCAA	2	12	114283	114294	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187932898
65	NC_010674	ATTCCA	2	12	117913	117924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187932878
66	NC_010674	TATATT	2	12	120152	120163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187934901
67	NC_010674	ATTAGG	2	12	121661	121672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187934211
68	NC_010674	AGATAA	2	12	126578	126589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187934680
69	NC_010674	TGAAGT	2	12	131450	131461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187934062
70	NC_010674	TAAAGA	2	12	132378	132389	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187935135
71	NC_010674	AGGAAA	2	12	133916	133927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187934022
72	NC_010674	TTATCT	2	12	139914	139925	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187935520
73	NC_010674	GCAGTA	2	12	141445	141456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187935149
74	NC_010674	TGTTAT	2	12	144566	144577	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187933099
75	NC_010674	ATAGAA	2	12	145429	145440	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187933099
76	NC_010674	AGCAAA	2	12	145969	145980	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	187933099
77	NC_010674	ATTAAA	2	12	151966	151977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187934759
78	NC_010674	TTTTAA	2	12	155614	155625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935566
79	NC_010674	GAGTAT	2	12	158995	159006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187933881
80	NC_010674	ATAGTT	2	12	163805	163816	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187934339
81	NC_010674	TATTGT	2	12	169073	169084	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187932793
82	NC_010674	AAAAAG	2	12	170376	170387	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187932793
83	NC_010674	TGCATA	2	12	171716	171727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187932793
84	NC_010674	AGATTT	2	12	172230	172241	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187932793
85	NC_010674	GCAGGA	2	12	175474	175485	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	187934907
86	NC_010674	TTGAAT	2	12	177360	177371	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187933661
87	NC_010674	CAACTT	2	12	179266	179277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187932437
88	NC_010674	TAAAGT	3	18	179657	179674	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187935343
89	NC_010674	CAAAGG	2	12	179879	179890	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187935343
90	NC_010674	ATAAAA	2	12	181331	181342	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187934170
91	NC_010674	TAGATA	2	12	183509	183520	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187934170
92	NC_010674	TAGTGA	2	12	189020	189031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187933375
93	NC_010674	AGTTAA	2	12	192702	192713	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187933763
94	NC_010674	TAGATA	2	12	193621	193632	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187935723
95	NC_010674	CAAAGA	2	12	194244	194255	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	187935723
96	NC_010674	GGAATG	2	12	194358	194369	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	187935723
97	NC_010674	TTACAT	2	12	197065	197076	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187934816
98	NC_010674	AATAAA	2	12	198762	198773	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187933718
99	NC_010674	ATGCTA	2	12	207830	207841	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187935776
100	NC_010674	GCTTCT	2	12	208222	208233	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	187935776
101	NC_010674	TGTGAA	2	12	209152	209163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187933090
102	NC_010674	AAGATG	2	12	210211	210222	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187935168
103	NC_010674	TAGAAA	2	12	216560	216571	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187934389
104	NC_010674	AAAGAA	2	12	217036	217047	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187934389
105	NC_010674	TAATTG	2	12	218510	218521	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187933788
106	NC_010674	TAAAAA	2	12	219141	219152	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187933788
107	NC_010674	TAGCAT	2	12	221748	221759	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187934989
108	NC_010674	TAATTG	2	12	222125	222136	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187933408
109	NC_010674	AAGATG	2	12	222737	222748	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187933408
110	NC_010674	TTTAGA	2	12	222798	222809	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187933408
111	NC_010674	CAAAGG	2	12	229763	229774	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187935194
112	NC_010674	AAGGAA	2	12	230237	230248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187935194
113	NC_010674	TAAAAA	2	12	230454	230465	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187932446
114	NC_010674	GCAAAA	2	12	231118	231129	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	187933087
115	NC_010674	TTTTAA	2	12	233604	233615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187935592
116	NC_010674	ACTTCA	2	12	234286	234297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187933626
117	NC_010674	AAAAGC	2	12	235696	235707	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	187934059
118	NC_010674	GAATCA	2	12	236120	236131	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187934059
119	NC_010674	GGATTA	2	12	236426	236437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187934836
120	NC_010674	AGAAGT	2	12	236542	236553	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187934836
121	NC_010674	GAAGTT	5	30	240525	240554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187932557
122	NC_010674	GAAACT	2	12	240555	240566	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187932557
123	NC_010674	TTGTAA	2	12	243299	243310	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187933483
124	NC_010674	TTTAAA	2	12	244169	244180	50 %	50 %	0 %	0 %	187933483
125	NC_010674	CAAGAA	2	12	245761	245772	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	187933091
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127	NC_010674	CTTAAT	2	12	248948	248959	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187933901
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130	NC_010674	AATGCT	2	12	256171	256182	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187935090
131	NC_010674	TAACTG	2	12	256640	256651	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187932394
132	NC_010674	GTTGGT	2	12	256867	256878	0 %	50 %	50 %	0 %	187932394
133	NC_010674	CGTTGG	2	12	257671	257682	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	187933948
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138	NC_010674	GCTATG	2	12	267908	267919	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187934224
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142	NC_010674	TTAAAA	2	12	274976	274987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935079
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231	NC_010674	CAGGTG	2	12	415935	415946	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187934190
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467	NC_010674	AAAACT	2	12	843235	843246	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187932589
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