MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome linear

Total Repeats: 923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010547	GAAA	2	8	470	477	75 %	0 %	25 %	0 %	172054854
2	NC_010547	TTGC	2	8	931	938	0 %	50 %	25 %	25 %	172054854
3	NC_010547	TTAA	2	8	1863	1870	50 %	50 %	0 %	0 %	172054856
4	NC_010547	TGAT	2	8	2195	2202	25 %	50 %	25 %	0 %	172054857
5	NC_010547	TGGA	2	8	2929	2936	25 %	25 %	50 %	0 %	172054859
6	NC_010547	ATCA	2	8	3018	3025	50 %	25 %	0 %	25 %	172054859
7	NC_010547	AACC	2	8	3900	3907	50 %	0 %	0 %	50 %	172054861
8	NC_010547	CTTT	2	8	4128	4135	0 %	75 %	0 %	25 %	172054861
9	NC_010547	GGTA	2	8	4482	4489	25 %	25 %	50 %	0 %	172054862
10	NC_010547	ACTA	2	8	4751	4758	50 %	25 %	0 %	25 %	172054862
11	NC_010547	CTTT	2	8	5493	5500	0 %	75 %	0 %	25 %	172054863
12	NC_010547	TTTG	2	8	5817	5824	0 %	75 %	25 %	0 %	172054863
13	NC_010547	TGAT	2	8	6640	6647	25 %	50 %	25 %	0 %	172054864
14	NC_010547	CTTT	2	8	7981	7988	0 %	75 %	0 %	25 %	172054865
15	NC_010547	TTCT	2	8	8729	8736	0 %	75 %	0 %	25 %	172054865
16	NC_010547	CATT	2	8	9068	9075	25 %	50 %	0 %	25 %	172054865
17	NC_010547	AACA	2	8	10453	10460	75 %	0 %	0 %	25 %	172054868
18	NC_010547	TGTC	2	8	11725	11732	0 %	50 %	25 %	25 %	172054869
19	NC_010547	GTAA	2	8	12335	12342	50 %	25 %	25 %	0 %	172054870
20	NC_010547	AATA	2	8	12429	12436	75 %	25 %	0 %	0 %	172054870
21	NC_010547	CTCA	2	8	13563	13570	25 %	25 %	0 %	50 %	172054874
22	NC_010547	GTTT	2	8	13677	13684	0 %	75 %	25 %	0 %	172054874
23	NC_010547	GCTG	2	8	13687	13694	0 %	25 %	50 %	25 %	172054874
24	NC_010547	TAAT	2	8	15764	15771	50 %	50 %	0 %	0 %	172054876
25	NC_010547	CTAC	2	8	17578	17585	25 %	25 %	0 %	50 %	172054879
26	NC_010547	TAAA	2	8	18604	18611	75 %	25 %	0 %	0 %	172054880
27	NC_010547	CCTC	2	8	19180	19187	0 %	25 %	0 %	75 %	172054880
28	NC_010547	AGTG	2	8	19601	19608	25 %	25 %	50 %	0 %	172054880
29	NC_010547	CAGC	2	8	20255	20262	25 %	0 %	25 %	50 %	172054880
30	NC_010547	TTCT	2	8	21334	21341	0 %	75 %	0 %	25 %	172054880
31	NC_010547	TCAA	2	8	21547	21554	50 %	25 %	0 %	25 %	172054880
32	NC_010547	TGGT	2	8	22768	22775	0 %	50 %	50 %	0 %	172054881
33	NC_010547	TGGC	2	8	22966	22973	0 %	25 %	50 %	25 %	172054881
34	NC_010547	GTTG	2	8	23760	23767	0 %	50 %	50 %	0 %	172054882
35	NC_010547	TGAT	2	8	24105	24112	25 %	50 %	25 %	0 %	172054882
36	NC_010547	CAAT	2	8	24863	24870	50 %	25 %	0 %	25 %	172054883
37	NC_010547	TAAT	2	8	24957	24964	50 %	50 %	0 %	0 %	172054883
38	NC_010547	ATCA	2	8	25504	25511	50 %	25 %	0 %	25 %	172054883
39	NC_010547	TTTG	2	8	26330	26337	0 %	75 %	25 %	0 %	172054883
40	NC_010547	AGCA	2	8	27061	27068	50 %	0 %	25 %	25 %	172054883
41	NC_010547	TCTT	2	8	27110	27117	0 %	75 %	0 %	25 %	172054883
42	NC_010547	TACT	2	8	27293	27300	25 %	50 %	0 %	25 %	172054883
43	NC_010547	CTCC	2	8	27924	27931	0 %	25 %	0 %	75 %	172054884
44	NC_010547	TGAA	2	8	28334	28341	50 %	25 %	25 %	0 %	172054885
45	NC_010547	TTTA	2	8	28878	28885	25 %	75 %	0 %	0 %	172054886
46	NC_010547	CAAA	2	8	29332	29339	75 %	0 %	0 %	25 %	172054886
47	NC_010547	GATT	2	8	29836	29843	25 %	50 %	25 %	0 %	172054886
48	NC_010547	TTTA	3	12	29849	29860	25 %	75 %	0 %	0 %	172054886
49	NC_010547	ACGA	2	8	30237	30244	50 %	0 %	25 %	25 %	172054886
50	NC_010547	CAAA	2	8	30256	30263	75 %	0 %	0 %	25 %	172054886
51	NC_010547	TAAA	2	8	30630	30637	75 %	25 %	0 %	0 %	172054886
52	NC_010547	ATAG	2	8	31624	31631	50 %	25 %	25 %	0 %	172054887
53	NC_010547	ATTT	2	8	31668	31675	25 %	75 %	0 %	0 %	172054887
54	NC_010547	TTTG	2	8	31841	31848	0 %	75 %	25 %	0 %	172054887
55	NC_010547	ATTG	2	8	32135	32142	25 %	50 %	25 %	0 %	172054887
56	NC_010547	TTTG	3	12	32314	32325	0 %	75 %	25 %	0 %	172054887
57	NC_010547	TCAT	2	8	32462	32469	25 %	50 %	0 %	25 %	172054887
58	NC_010547	TTAT	2	8	32493	32500	25 %	75 %	0 %	0 %	172054888
59	NC_010547	TTGA	2	8	32748	32755	25 %	50 %	25 %	0 %	172054888
60	NC_010547	AGAT	2	8	32836	32843	50 %	25 %	25 %	0 %	172054888
61	NC_010547	GAAG	2	8	33428	33435	50 %	0 %	50 %	0 %	172054889
62	NC_010547	AAGA	2	8	33690	33697	75 %	0 %	25 %	0 %	172054889
63	NC_010547	TGGC	2	8	33723	33730	0 %	25 %	50 %	25 %	172054889
64	NC_010547	AAAT	2	8	34164	34171	75 %	25 %	0 %	0 %	172054889
65	NC_010547	AATG	2	8	34909	34916	50 %	25 %	25 %	0 %	172054889
66	NC_010547	GGAT	2	8	36566	36573	25 %	25 %	50 %	0 %	172054889
67	NC_010547	TAAA	2	8	37683	37690	75 %	25 %	0 %	0 %	172054890
68	NC_010547	AAAT	2	8	37828	37835	75 %	25 %	0 %	0 %	172054890
69	NC_010547	AACG	2	8	38593	38600	50 %	0 %	25 %	25 %	172054891
70	NC_010547	GGAA	2	8	38618	38625	50 %	0 %	50 %	0 %	172054891
71	NC_010547	AAAC	2	8	40681	40688	75 %	0 %	0 %	25 %	172054893
72	NC_010547	ATTC	2	8	40751	40758	25 %	50 %	0 %	25 %	172054893
73	NC_010547	TTAC	2	8	40856	40863	25 %	50 %	0 %	25 %	172054893
74	NC_010547	ATCA	2	8	41856	41863	50 %	25 %	0 %	25 %	172054893
75	NC_010547	TTGA	2	8	42609	42616	25 %	50 %	25 %	0 %	172054893
76	NC_010547	ATAA	2	8	42747	42754	75 %	25 %	0 %	0 %	172054893
77	NC_010547	TAGA	2	8	42826	42833	50 %	25 %	25 %	0 %	172054893
78	NC_010547	GAAA	2	8	42882	42889	75 %	0 %	25 %	0 %	172054893
79	NC_010547	TAAA	2	8	42994	43001	75 %	25 %	0 %	0 %	172054893
80	NC_010547	CTCA	2	8	43190	43197	25 %	25 %	0 %	50 %	172054893
81	NC_010547	GAAA	2	8	43388	43395	75 %	0 %	25 %	0 %	172054894
82	NC_010547	TTGT	2	8	43837	43844	0 %	75 %	25 %	0 %	172054894
83	NC_010547	ATTG	2	8	44160	44167	25 %	50 %	25 %	0 %	172054894
84	NC_010547	CAGA	2	8	44808	44815	50 %	0 %	25 %	25 %	172054895
85	NC_010547	GAAA	2	8	45232	45239	75 %	0 %	25 %	0 %	172054895
86	NC_010547	ACCT	2	8	45555	45562	25 %	25 %	0 %	50 %	172054895
87	NC_010547	GACA	2	8	45646	45653	50 %	0 %	25 %	25 %	172054895
88	NC_010547	AAAG	2	8	45970	45977	75 %	0 %	25 %	0 %	172054895
89	NC_010547	AACC	2	8	46062	46069	50 %	0 %	0 %	50 %	172054895
90	NC_010547	TATG	2	8	46196	46203	25 %	50 %	25 %	0 %	172054895
91	NC_010547	AGCC	2	8	46263	46270	25 %	0 %	25 %	50 %	172054895
92	NC_010547	AAGA	2	8	46538	46545	75 %	0 %	25 %	0 %	172054895
93	NC_010547	AAAT	2	8	46638	46645	75 %	25 %	0 %	0 %	172054895
94	NC_010547	CCAT	2	8	48085	48092	25 %	25 %	0 %	50 %	172054896
95	NC_010547	TAGA	2	8	48555	48562	50 %	25 %	25 %	0 %	172054896
96	NC_010547	AAAC	2	8	49472	49479	75 %	0 %	0 %	25 %	172054897
97	NC_010547	ATTC	2	8	49898	49905	25 %	50 %	0 %	25 %	172054898
98	NC_010547	ACCA	2	8	50416	50423	50 %	0 %	0 %	50 %	172054899
99	NC_010547	AATT	2	8	50752	50759	50 %	50 %	0 %	0 %	172054899
100	NC_010547	AAAC	2	8	50862	50869	75 %	0 %	0 %	25 %	172054899
101	NC_010547	CCAC	2	8	51267	51274	25 %	0 %	0 %	75 %	172054899
102	NC_010547	GGAT	2	8	51329	51336	25 %	25 %	50 %	0 %	172054899
103	NC_010547	AAGT	2	8	51836	51843	50 %	25 %	25 %	0 %	172054900
104	NC_010547	ATAA	2	8	51919	51926	75 %	25 %	0 %	0 %	172054900
105	NC_010547	TAAT	2	8	52768	52775	50 %	50 %	0 %	0 %	172054901
106	NC_010547	CATC	2	8	52904	52911	25 %	25 %	0 %	50 %	172054901
107	NC_010547	CATA	2	8	52927	52934	50 %	25 %	0 %	25 %	172054901
108	NC_010547	TCCC	2	8	53125	53132	0 %	25 %	0 %	75 %	172054901
109	NC_010547	TAAT	2	8	53683	53690	50 %	50 %	0 %	0 %	172054901
110	NC_010547	GAAG	2	8	53738	53745	50 %	0 %	50 %	0 %	172054901
111	NC_010547	GTTT	2	8	54055	54062	0 %	75 %	25 %	0 %	172054902
112	NC_010547	TATC	2	8	54428	54435	25 %	50 %	0 %	25 %	172054902
113	NC_010547	AAAT	2	8	54619	54626	75 %	25 %	0 %	0 %	172054902
114	NC_010547	AAAT	2	8	54650	54657	75 %	25 %	0 %	0 %	172054902
115	NC_010547	TAAA	2	8	54680	54687	75 %	25 %	0 %	0 %	172054902
116	NC_010547	CAAC	2	8	54726	54733	50 %	0 %	0 %	50 %	172054902
117	NC_010547	GAAA	2	8	55318	55325	75 %	0 %	25 %	0 %	172054903
118	NC_010547	ATTA	2	8	55445	55452	50 %	50 %	0 %	0 %	172054903
119	NC_010547	ACTA	2	8	55555	55562	50 %	25 %	0 %	25 %	172054904
120	NC_010547	ACTT	2	8	55804	55811	25 %	50 %	0 %	25 %	172054904
121	NC_010547	CTAT	2	8	56329	56336	25 %	50 %	0 %	25 %	172054905
122	NC_010547	TTTG	2	8	57003	57010	0 %	75 %	25 %	0 %	172054906
123	NC_010547	ATTC	2	8	57339	57346	25 %	50 %	0 %	25 %	172054906
124	NC_010547	GTTA	2	8	58193	58200	25 %	50 %	25 %	0 %	172054907
125	NC_010547	GGAG	2	8	59125	59132	25 %	0 %	75 %	0 %	172054908
126	NC_010547	GATT	2	8	60856	60863	25 %	50 %	25 %	0 %	172054908
127	NC_010547	AACT	2	8	61048	61055	50 %	25 %	0 %	25 %	172054909
128	NC_010547	TTGG	2	8	61210	61217	0 %	50 %	50 %	0 %	172054909
129	NC_010547	AACC	2	8	61437	61444	50 %	0 %	0 %	50 %	172054909
130	NC_010547	GTGA	2	8	61517	61524	25 %	25 %	50 %	0 %	172054910
131	NC_010547	ATTT	2	8	61536	61543	25 %	75 %	0 %	0 %	172054910
132	NC_010547	GTTT	2	8	61564	61571	0 %	75 %	25 %	0 %	172054910
133	NC_010547	TGGT	2	8	62172	62179	0 %	50 %	50 %	0 %	172054910
134	NC_010547	TGTT	2	8	62448	62455	0 %	75 %	25 %	0 %	172054910
135	NC_010547	CAAC	2	8	63483	63490	50 %	0 %	0 %	50 %	172054911
136	NC_010547	CCAA	2	8	63650	63657	50 %	0 %	0 %	50 %	172054911
137	NC_010547	CAAA	2	8	64155	64162	75 %	0 %	0 %	25 %	172054911
138	NC_010547	ATGT	2	8	65069	65076	25 %	50 %	25 %	0 %	172054913
139	NC_010547	ATTT	2	8	65146	65153	25 %	75 %	0 %	0 %	172054913
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