MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome linear

Total Repeats: 7564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_010547	AGG	2	6	425756	425761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172055298
7502	NC_010547	C	6	6	425841	425846	0 %	0 %	0 %	100 %	172055298
7503	NC_010547	TTA	2	6	425877	425882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055298
7504	NC_010547	TAG	2	6	425896	425901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055298
7505	NC_010547	ACGG	2	8	425908	425915	25 %	0 %	50 %	25 %	172055298
7506	NC_010547	TCT	2	6	425978	425983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055298
7507	NC_010547	CAT	2	6	425997	426002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055298
7508	NC_010547	CTGTA	2	10	426207	426216	20 %	40 %	20 %	20 %	172055298
7509	NC_010547	GAA	2	6	426226	426231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055298
7510	NC_010547	ACC	2	6	426240	426245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172055298
7511	NC_010547	AG	3	6	426278	426283	50 %	0 %	50 %	0 %	172055298
7512	NC_010547	A	7	7	426303	426309	100 %	0 %	0 %	0 %	172055298
7513	NC_010547	ATG	2	6	426370	426375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055298
7514	NC_010547	AGA	2	6	426395	426400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055298
7515	NC_010547	ACA	2	6	426447	426452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172055298
7516	NC_010547	CAA	2	6	426522	426527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172055298
7517	NC_010547	A	6	6	426538	426543	100 %	0 %	0 %	0 %	172055298
7518	NC_010547	TCT	2	6	426618	426623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055298
7519	NC_010547	GCAG	2	8	426629	426636	25 %	0 %	50 %	25 %	172055298
7520	NC_010547	ATT	2	6	426706	426711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055298
7521	NC_010547	AAG	2	6	426774	426779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055298
7522	NC_010547	TCA	2	6	426882	426887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055298
7523	NC_010547	A	8	8	426889	426896	100 %	0 %	0 %	0 %	172055298
7524	NC_010547	AGAT	2	8	426898	426905	50 %	25 %	25 %	0 %	172055298
7525	NC_010547	AGC	2	6	426908	426913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172055298
7526	NC_010547	GAAA	2	8	427046	427053	75 %	0 %	25 %	0 %	172055298
7527	NC_010547	AGA	2	6	427082	427087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055298
7528	NC_010547	TCA	2	6	427088	427093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055298
7529	NC_010547	TCCT	2	8	427209	427216	0 %	50 %	0 %	50 %	172055299
7530	NC_010547	CTT	2	6	427245	427250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172055299
7531	NC_010547	AAT	2	6	427275	427280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172055299
7532	NC_010547	TCCTC	2	10	427292	427301	0 %	40 %	0 %	60 %	172055299
7533	NC_010547	TGT	2	6	427307	427312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055299
7534	NC_010547	AGA	2	6	427710	427715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055300
7535	NC_010547	TCG	2	6	427797	427802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172055300
7536	NC_010547	AGT	2	6	427827	427832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055300
7537	NC_010547	TCA	2	6	427855	427860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055300
7538	NC_010547	ATT	2	6	427944	427949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055300
7539	NC_010547	ATT	2	6	427962	427967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055300
7540	NC_010547	ATT	2	6	428126	428131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055301
7541	NC_010547	TTAT	2	8	428158	428165	25 %	75 %	0 %	0 %	172055301
7542	NC_010547	AGGA	2	8	428215	428222	50 %	0 %	50 %	0 %	172055301
7543	NC_010547	TAC	2	6	428242	428247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055301
7544	NC_010547	TAAT	2	8	428290	428297	50 %	50 %	0 %	0 %	172055301
7545	NC_010547	AAC	2	6	428311	428316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172055301
7546	NC_010547	TAT	2	6	428335	428340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055301
7547	NC_010547	ACA	2	6	428381	428386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172055301
7548	NC_010547	ATTA	2	8	428389	428396	50 %	50 %	0 %	0 %	172055301
7549	NC_010547	AGA	2	6	428582	428587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055302
7550	NC_010547	TCG	2	6	428669	428674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172055302
7551	NC_010547	AGT	2	6	428699	428704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172055302
7552	NC_010547	TCA	2	6	428727	428732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172055302
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7554	NC_010547	ATT	2	6	428834	428839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055302
7555	NC_010547	AGC	2	6	428942	428947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172055302
7556	NC_010547	TAT	2	6	428971	428976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172055302
7557	NC_010547	TTG	2	6	429000	429005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172055302
7558	NC_010547	AGA	2	6	429008	429013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172055302
7559	NC_010547	TTAT	2	8	429031	429038	25 %	75 %	0 %	0 %	172055302
7560	NC_010547	GGAA	2	8	429065	429072	50 %	0 %	50 %	0 %	172055302
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7564	NC_010547	AATC	2	8	429164	429171	50 %	25 %	0 %	25 %	172055302

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.