MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 92402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_010546	TCA	2	6	158666	158671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035087
3003	NC_010546	ATA	2	6	158683	158688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035087
3004	NC_010546	ATT	2	6	158759	158764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035087
3005	NC_010546	AAC	2	6	158797	158802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035087
3006	NC_010546	AAC	2	6	158875	158880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035088
3007	NC_010546	TCAA	2	8	158919	158926	50 %	25 %	0 %	25 %	172035088
3008	NC_010546	TTC	2	6	158929	158934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035088
3009	NC_010546	A	6	6	158985	158990	100 %	0 %	0 %	0 %	172035088
3010	NC_010546	T	6	6	159041	159046	0 %	100 %	0 %	0 %	172035088
3011	NC_010546	ATTT	2	8	159087	159094	25 %	75 %	0 %	0 %	172035088
3012	NC_010546	GAA	2	6	159141	159146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035088
3013	NC_010546	TTTA	2	8	159197	159204	25 %	75 %	0 %	0 %	172035088
3014	NC_010546	A	7	7	159232	159238	100 %	0 %	0 %	0 %	172035088
3015	NC_010546	AGT	2	6	159260	159265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035088
3016	NC_010546	TCG	2	6	159305	159310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035088
3017	NC_010546	GAT	2	6	159326	159331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035088
3018	NC_010546	TGA	2	6	159344	159349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035088
3019	NC_010546	AT	3	6	159371	159376	50 %	50 %	0 %	0 %	172035088
3020	NC_010546	ACCA	2	8	159423	159430	50 %	0 %	0 %	50 %	172035088
3021	NC_010546	ACA	2	6	159467	159472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035088
3022	NC_010546	A	6	6	159512	159517	100 %	0 %	0 %	0 %	172035088
3023	NC_010546	GAA	2	6	159570	159575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035088
3024	NC_010546	TGATG	2	10	159587	159596	20 %	40 %	40 %	0 %	172035088
3025	NC_010546	TAT	2	6	159614	159619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035088
3026	NC_010546	GAT	2	6	159771	159776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035088
3027	NC_010546	AAG	2	6	159811	159816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035088
3028	NC_010546	A	6	6	159821	159826	100 %	0 %	0 %	0 %	172035088
3029	NC_010546	TTA	2	6	159827	159832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035088
3030	NC_010546	CAA	2	6	159855	159860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035088
3031	NC_010546	ATG	2	6	159879	159884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035088
3032	NC_010546	ATCAGG	2	12	159893	159904	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	172035088
3033	NC_010546	ACC	2	6	159909	159914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035088
3034	NC_010546	GCA	2	6	160029	160034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035088
3035	NC_010546	ATG	2	6	160077	160082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035088
3036	NC_010546	AAG	2	6	160087	160092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035088
3037	NC_010546	TCA	2	6	160127	160132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035088
3038	NC_010546	A	6	6	160161	160166	100 %	0 %	0 %	0 %	172035088
3039	NC_010546	ACA	3	9	160277	160285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035088
3040	NC_010546	AAT	2	6	160287	160292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035088
3041	NC_010546	AAC	2	6	160347	160352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035088
3042	NC_010546	TCA	2	6	160733	160738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035089
3043	NC_010546	ACA	2	6	160778	160783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035089
3044	NC_010546	AGA	2	6	160804	160809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035089
3045	NC_010546	TGC	3	9	160816	160824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035089
3046	NC_010546	TGG	2	6	160879	160884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035089
3047	NC_010546	ATG	2	6	161019	161024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035089
3048	NC_010546	TAGA	2	8	161028	161035	50 %	25 %	25 %	0 %	172035089
3049	NC_010546	TTGT	2	8	161056	161063	0 %	75 %	25 %	0 %	172035089
3050	NC_010546	ACT	3	9	161303	161311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035089
3051	NC_010546	TGG	2	6	161409	161414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035089
3052	NC_010546	TGT	2	6	161428	161433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035089
3053	NC_010546	TGA	2	6	161500	161505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035089
3054	NC_010546	TGA	2	6	161508	161513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035089
3055	NC_010546	CGG	2	6	161593	161598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172035089
3056	NC_010546	CGGT	2	8	161607	161614	0 %	25 %	50 %	25 %	172035089
3057	NC_010546	TGG	2	6	161620	161625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035089
3058	NC_010546	TTA	2	6	161795	161800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035089
3059	NC_010546	TCA	2	6	161821	161826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035089
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3086	NC_010546	TCTA	2	8	163156	163163	25 %	50 %	0 %	25 %	172035091
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3092	NC_010546	CCTT	2	8	163828	163835	0 %	50 %	0 %	50 %	172035092
3093	NC_010546	TCG	2	6	163868	163873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035092
3094	NC_010546	GTGAC	2	10	163937	163946	20 %	20 %	40 %	20 %	172035092
3095	NC_010546	GT	3	6	163976	163981	0 %	50 %	50 %	0 %	172035092
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3101	NC_010546	GAC	2	6	164209	164214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035092
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3103	NC_010546	A	6	6	164306	164311	100 %	0 %	0 %	0 %	172035092
3104	NC_010546	CAA	2	6	164326	164331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035092
3105	NC_010546	GGA	2	6	164356	164361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172035092
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3107	NC_010546	CAT	2	6	164440	164445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035092
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3122	NC_010546	TGT	2	6	165192	165197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035093
3123	NC_010546	TCT	2	6	165211	165216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035093
3124	NC_010546	GTC	2	6	165219	165224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035093
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3236	NC_010546	TAGT	2	8	171271	171278	25 %	50 %	25 %	0 %	172035101
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3240	NC_010546	T	7	7	171331	171337	0 %	100 %	0 %	0 %	172035101
3241	NC_010546	ATTCCC	2	12	171363	171374	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	172035101
3242	NC_010546	GAA	2	6	171415	171420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035101
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3244	NC_010546	TTC	2	6	172003	172008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035102
3245	NC_010546	T	7	7	172071	172077	0 %	100 %	0 %	0 %	172035102
3246	NC_010546	TTG	2	6	172468	172473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035103
3247	NC_010546	AGC	2	6	172528	172533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035103
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3249	NC_010546	AGA	2	6	172649	172654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035103
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3251	NC_010546	ACT	2	6	172704	172709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035103
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3367	NC_010546	CGG	2	6	178695	178700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172035110
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3396	NC_010546	GA	3	6	181947	181952	50 %	0 %	50 %	0 %	172035112
3397	NC_010546	CTCC	2	8	181983	181990	0 %	25 %	0 %	75 %	172035112
3398	NC_010546	TTGTC	2	10	182011	182020	0 %	60 %	20 %	20 %	172035112
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3483	NC_010546	GAATT	2	10	186397	186406	40 %	40 %	20 %	0 %	172035116
3484	NC_010546	TA	3	6	186424	186429	50 %	50 %	0 %	0 %	172035116
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3487	NC_010546	AAT	3	9	186622	186630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035116
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3489	NC_010546	GCA	2	6	186668	186673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035116
3490	NC_010546	CCA	2	6	186674	186679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035116
3491	NC_010546	AAAT	2	8	186685	186692	75 %	25 %	0 %	0 %	172035116
3492	NC_010546	CAG	2	6	186760	186765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035117
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3500	NC_010546	TCAC	2	8	187104	187111	25 %	25 %	0 %	50 %	172035117

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