MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 92402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_010546	ATT	2	6	264547	264552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035190
5003	NC_010546	AT	3	6	264566	264571	50 %	50 %	0 %	0 %	172035190
5004	NC_010546	CTTT	2	8	264663	264670	0 %	75 %	0 %	25 %	172035190
5005	NC_010546	T	6	6	264675	264680	0 %	100 %	0 %	0 %	172035190
5006	NC_010546	CAA	2	6	264723	264728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035190
5007	NC_010546	AGG	2	6	264838	264843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172035190
5008	NC_010546	GTT	2	6	264869	264874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035190
5009	NC_010546	TTA	2	6	264917	264922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035190
5010	NC_010546	TAAA	2	8	264937	264944	75 %	25 %	0 %	0 %	172035190
5011	NC_010546	T	7	7	265000	265006	0 %	100 %	0 %	0 %	172035190
5012	NC_010546	CGATCT	2	12	265067	265078	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	172035190
5013	NC_010546	GAA	2	6	265081	265086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035190
5014	NC_010546	CAT	2	6	265102	265107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035190
5015	NC_010546	TAAG	2	8	265159	265166	50 %	25 %	25 %	0 %	172035190
5016	NC_010546	TTG	2	6	265183	265188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035190
5017	NC_010546	CCT	2	6	265268	265273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172035190
5018	NC_010546	TC	3	6	265318	265323	0 %	50 %	0 %	50 %	172035190
5019	NC_010546	AAGCA	2	10	265333	265342	60 %	0 %	20 %	20 %	172035190
5020	NC_010546	AAT	3	9	265374	265382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035190
5021	NC_010546	TTG	2	6	265441	265446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035190
5022	NC_010546	ATT	2	6	265504	265509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035190
5023	NC_010546	T	7	7	265508	265514	0 %	100 %	0 %	0 %	172035190
5024	NC_010546	TTA	2	6	265601	265606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035190
5025	NC_010546	CTT	2	6	265719	265724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035190
5026	NC_010546	A	6	6	265789	265794	100 %	0 %	0 %	0 %	172035190
5027	NC_010546	TGA	2	6	265807	265812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035190
5028	NC_010546	TAA	2	6	265827	265832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035190
5029	NC_010546	ACG	2	6	265846	265851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035190
5030	NC_010546	ATC	2	6	265855	265860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035190
5031	NC_010546	TCA	2	6	265958	265963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035190
5032	NC_010546	ATA	2	6	265976	265981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035190
5033	NC_010546	CAT	2	6	266025	266030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035190
5034	NC_010546	CT	3	6	266050	266055	0 %	50 %	0 %	50 %	172035190
5035	NC_010546	TGC	2	6	266077	266082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035190
5036	NC_010546	TAA	2	6	266107	266112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035190
5037	NC_010546	AGA	2	6	266119	266124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035190
5038	NC_010546	TTCG	2	8	266201	266208	0 %	50 %	25 %	25 %	172035190
5039	NC_010546	CCA	2	6	266290	266295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035190
5040	NC_010546	CAAA	2	8	266307	266314	75 %	0 %	0 %	25 %	172035190
5041	NC_010546	A	6	6	266312	266317	100 %	0 %	0 %	0 %	172035190
5042	NC_010546	TTGT	2	8	266334	266341	0 %	75 %	25 %	0 %	172035190
5043	NC_010546	AAGT	2	8	266356	266363	50 %	25 %	25 %	0 %	172035190
5044	NC_010546	TTC	2	6	266500	266505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035190
5045	NC_010546	AGTT	2	8	266559	266566	25 %	50 %	25 %	0 %	172035190
5046	NC_010546	TCT	2	6	266660	266665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035190
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5049	NC_010546	T	7	7	267011	267017	0 %	100 %	0 %	0 %	172035191
5050	NC_010546	CAT	2	6	267052	267057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035192
5051	NC_010546	TGA	2	6	267076	267081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035192
5052	NC_010546	CAGG	2	8	267152	267159	25 %	0 %	50 %	25 %	172035192
5053	NC_010546	CAT	2	6	267194	267199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035192
5054	NC_010546	CTTT	2	8	267256	267263	0 %	75 %	0 %	25 %	172035192
5055	NC_010546	TTC	2	6	267270	267275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035192
5056	NC_010546	TAATT	2	10	267279	267288	40 %	60 %	0 %	0 %	172035192
5057	NC_010546	TTA	2	6	267451	267456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035192
5058	NC_010546	GTT	2	6	267557	267562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035192
5059	NC_010546	TTTG	2	8	267665	267672	0 %	75 %	25 %	0 %	172035192
5060	NC_010546	TAA	2	6	267729	267734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172035192
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5062	NC_010546	GTT	2	6	267848	267853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035192
5063	NC_010546	GCT	2	6	267856	267861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035192
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5065	NC_010546	TGG	2	6	268044	268049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035192
5066	NC_010546	CAAT	2	8	268061	268068	50 %	25 %	0 %	25 %	172035192
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5078	NC_010546	TTTC	2	8	268539	268546	0 %	75 %	0 %	25 %	172035193
5079	NC_010546	ACC	3	9	268572	268580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035193
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5105	NC_010546	TGT	2	6	270030	270035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035193
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5122	NC_010546	TAT	2	6	271521	271526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035194
5123	NC_010546	T	6	6	271581	271586	0 %	100 %	0 %	0 %	172035194
5124	NC_010546	GAT	2	6	271587	271592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035194
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5126	NC_010546	AATT	2	8	271649	271656	50 %	50 %	0 %	0 %	172035195
5127	NC_010546	TGT	3	9	271816	271824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035195
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5232	NC_010546	AAAG	2	8	277905	277912	75 %	0 %	25 %	0 %	172035203
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5235	NC_010546	A	6	6	278069	278074	100 %	0 %	0 %	0 %	172035203
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5240	NC_010546	CTT	3	9	278316	278324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035203
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5245	NC_010546	A	6	6	278393	278398	100 %	0 %	0 %	0 %	172035203
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5368	NC_010546	AAAG	2	8	284087	284094	75 %	0 %	25 %	0 %	172035207
5369	NC_010546	AGA	2	6	284095	284100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035207
5370	NC_010546	GAG	2	6	284262	284267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172035207
5371	NC_010546	CTT	2	6	284283	284288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035207
5372	NC_010546	GTA	2	6	284497	284502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035207
5373	NC_010546	AAG	3	9	284927	284935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035208
5374	NC_010546	TGT	2	6	284942	284947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035208
5375	NC_010546	AAG	2	6	285044	285049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035208
5376	NC_010546	TAT	2	6	285063	285068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035208
5377	NC_010546	CGA	2	6	285084	285089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035208
5378	NC_010546	C	7	7	285145	285151	0 %	0 %	0 %	100 %	172035208
5379	NC_010546	TTG	2	6	285260	285265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035208
5380	NC_010546	AGTA	2	8	285304	285311	50 %	25 %	25 %	0 %	172035208
5381	NC_010546	ATG	2	6	285322	285327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035208
5382	NC_010546	CCG	2	6	285338	285343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172035208
5383	NC_010546	GT	3	6	285355	285360	0 %	50 %	50 %	0 %	172035208
5384	NC_010546	T	6	6	285394	285399	0 %	100 %	0 %	0 %	172035208
5385	NC_010546	GGC	2	6	285414	285419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172035208
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5389	NC_010546	A	6	6	285514	285519	100 %	0 %	0 %	0 %	172035208
5390	NC_010546	GT	3	6	285524	285529	0 %	50 %	50 %	0 %	172035208
5391	NC_010546	AAG	2	6	285590	285595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035208
5392	NC_010546	CT	3	6	285666	285671	0 %	50 %	0 %	50 %	172035208
5393	NC_010546	TGA	2	6	285699	285704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035208
5394	NC_010546	GTA	2	6	285719	285724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035208
5395	NC_010546	GAT	2	6	285823	285828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035208
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5397	NC_010546	ATTGAT	2	12	285899	285910	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	172035208
5398	NC_010546	CTT	2	6	286238	286243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035209
5399	NC_010546	TGG	2	6	286347	286352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035209
5400	NC_010546	TGG	2	6	286403	286408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035209
5401	NC_010546	ACG	2	6	286516	286521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035209
5402	NC_010546	GAA	2	6	286627	286632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035209
5403	NC_010546	ATT	2	6	286912	286917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035209
5404	NC_010546	GAT	2	6	286996	287001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035209
5405	NC_010546	ATT	2	6	287115	287120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035209
5406	NC_010546	ATC	2	6	287151	287156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035209
5407	NC_010546	TGAG	2	8	287228	287235	25 %	25 %	50 %	0 %	172035210
5408	NC_010546	TTA	2	6	287353	287358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035210
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5411	NC_010546	TTA	2	6	287553	287558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035210
5412	NC_010546	CAA	2	6	287559	287564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172035210
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5415	NC_010546	TAT	2	6	287628	287633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035210
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5417	NC_010546	TAT	2	6	287709	287714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035210
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5445	NC_010546	TTTTAA	2	12	289124	289135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035211
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5449	NC_010546	ATCG	2	8	289279	289286	25 %	25 %	25 %	25 %	172035211
5450	NC_010546	ATG	2	6	289291	289296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035211
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5464	NC_010546	AACC	2	8	289943	289950	50 %	0 %	0 %	50 %	172035211
5465	NC_010546	TCG	4	12	289968	289979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035211
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5468	NC_010546	CTG	2	6	290231	290236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172035212
5469	NC_010546	ATT	2	6	290305	290310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035212
5470	NC_010546	AGA	2	6	290382	290387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172035212
5471	NC_010546	TTAT	2	8	290429	290436	25 %	75 %	0 %	0 %	172035212
5472	NC_010546	AATTT	2	10	290459	290468	40 %	60 %	0 %	0 %	172035212
5473	NC_010546	GTT	2	6	290518	290523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035212
5474	NC_010546	T	6	6	290538	290543	0 %	100 %	0 %	0 %	172035212
5475	NC_010546	A	6	6	290567	290572	100 %	0 %	0 %	0 %	172035212
5476	NC_010546	TTA	2	6	290589	290594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035212
5477	NC_010546	ATT	2	6	290769	290774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172035213
5478	NC_010546	T	7	7	290773	290779	0 %	100 %	0 %	0 %	172035213
5479	NC_010546	TAC	2	6	290886	290891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035213
5480	NC_010546	GAC	2	6	290949	290954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172035213
5481	NC_010546	CTAACC	2	12	290961	290972	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	172035213
5482	NC_010546	CTT	2	6	291003	291008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035213
5483	NC_010546	AGT	2	6	291161	291166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035213
5484	NC_010546	CTA	2	6	291180	291185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172035213
5485	NC_010546	TCC	2	6	291218	291223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172035213
5486	NC_010546	AC	3	6	291475	291480	50 %	0 %	0 %	50 %	172035213
5487	NC_010546	TGG	2	6	291486	291491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035213
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5489	NC_010546	TCT	3	9	291653	291661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172035213
5490	NC_010546	ATG	2	6	291688	291693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172035213
5491	NC_010546	GTT	2	6	291800	291805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172035213
5492	NC_010546	ACC	2	6	291875	291880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172035213
5493	NC_010546	TGG	2	6	291963	291968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172035213
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