MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid B

Total Repeats: 417

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010541	GAA	2	6	128	133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034860
2	NC_010541	TAG	2	6	182	187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034860
3	NC_010541	TAA	2	6	190	195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034860
4	NC_010541	GTG	2	6	265	270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034860
5	NC_010541	CTT	2	6	291	296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034860
6	NC_010541	AAC	2	6	335	340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034860
7	NC_010541	GAT	2	6	357	362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034860
8	NC_010541	CTG	2	6	373	378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034860
9	NC_010541	CTG	2	6	403	408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034860
10	NC_010541	GAA	2	6	528	533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034860
11	NC_010541	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034860
12	NC_010541	TCT	3	9	681	689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034860
13	NC_010541	CTG	2	6	745	750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034860
14	NC_010541	ACT	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034860
15	NC_010541	TTA	2	6	879	884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034860
16	NC_010541	ATC	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034861
17	NC_010541	CCA	2	6	1479	1484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034861
18	NC_010541	AGC	2	6	1498	1503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034861
19	NC_010541	ATT	2	6	1646	1651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034861
20	NC_010541	CGA	2	6	1678	1683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034861
21	NC_010541	CGG	2	6	1904	1909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034861
22	NC_010541	AGC	2	6	1927	1932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034861
23	NC_010541	TGA	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034862
24	NC_010541	TAA	2	6	2073	2078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034862
25	NC_010541	TCA	2	6	2092	2097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034862
26	NC_010541	CAA	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034862
27	NC_010541	CAA	2	6	2188	2193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034862
28	NC_010541	GAC	2	6	2624	2629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034863
29	NC_010541	TTG	2	6	2684	2689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034863
30	NC_010541	ATA	2	6	2791	2796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034864
31	NC_010541	CTG	2	6	2927	2932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034865
32	NC_010541	ACA	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034865
33	NC_010541	CAG	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034866
34	NC_010541	GAC	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034866
35	NC_010541	GCT	2	6	3206	3211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034866
36	NC_010541	ATT	3	9	3454	3462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
37	NC_010541	CGG	2	6	3536	3541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034866
38	NC_010541	AAT	2	6	3564	3569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034866
39	NC_010541	TCT	2	6	3592	3597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034866
40	NC_010541	CCA	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034866
41	NC_010541	CCA	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034866
42	NC_010541	GTG	2	6	3835	3840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034866
43	NC_010541	ATC	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034866
44	NC_010541	TTA	2	6	3970	3975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
45	NC_010541	TGG	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034866
46	NC_010541	TGA	2	6	4046	4051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034866
47	NC_010541	ACC	2	6	4158	4163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034866
48	NC_010541	ACC	2	6	4269	4274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034866
49	NC_010541	GAC	2	6	4515	4520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034866
50	NC_010541	GTT	2	6	4542	4547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034866
51	NC_010541	TAT	2	6	4550	4555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
52	NC_010541	TAA	3	9	4778	4786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034866
53	NC_010541	GTG	2	6	4854	4859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034866
54	NC_010541	TTA	2	6	4878	4883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
55	NC_010541	TGA	2	6	4892	4897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034866
56	NC_010541	CTT	3	9	5090	5098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034866
57	NC_010541	ATT	2	6	5130	5135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
58	NC_010541	ATA	2	6	5206	5211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034866
59	NC_010541	CTA	2	6	5433	5438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034866
60	NC_010541	ATG	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034866
61	NC_010541	CCT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034866
62	NC_010541	GAA	2	6	5625	5630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034866
63	NC_010541	GTT	2	6	6059	6064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034866
64	NC_010541	ACG	2	6	6092	6097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034866
65	NC_010541	GGC	2	6	6188	6193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034866
66	NC_010541	AAT	2	6	6294	6299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034866
67	NC_010541	TAC	2	6	6419	6424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034866
68	NC_010541	ATT	2	6	6570	6575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
69	NC_010541	GAT	2	6	6678	6683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034866
70	NC_010541	CTT	2	6	6704	6709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034866
71	NC_010541	CAG	2	6	6852	6857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034867
72	NC_010541	CAC	2	6	6877	6882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034867
73	NC_010541	TTG	2	6	6956	6961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034867
74	NC_010541	CAA	2	6	6966	6971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034867
75	NC_010541	GGT	2	6	6975	6980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034867
76	NC_010541	TTG	2	6	7033	7038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034867
77	NC_010541	GCT	2	6	7125	7130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034867
78	NC_010541	TCG	2	6	7870	7875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034869
79	NC_010541	GTT	2	6	8154	8159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034869
80	NC_010541	GAT	2	6	8280	8285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034869
81	NC_010541	ATT	2	6	8381	8386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034869
82	NC_010541	TTC	2	6	8500	8505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034869
83	NC_010541	CTT	2	6	8560	8565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034869
84	NC_010541	ATG	2	6	8577	8582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034869
85	NC_010541	AGT	2	6	8587	8592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034869
86	NC_010541	GAA	2	6	8630	8635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034869
87	NC_010541	CAA	2	6	8637	8642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034869
88	NC_010541	CTT	2	6	8679	8684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034869
89	NC_010541	TAA	2	6	8749	8754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034869
90	NC_010541	TTG	2	6	8992	8997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034869
91	NC_010541	TGG	2	6	9015	9020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034869
92	NC_010541	GTT	2	6	9258	9263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034869
93	NC_010541	ATG	2	6	9304	9309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034869
94	NC_010541	CGG	2	6	9603	9608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034869
95	NC_010541	CTG	2	6	9666	9671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034869
96	NC_010541	CGG	2	6	9705	9710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034869
97	NC_010541	AAC	2	6	9734	9739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034869
98	NC_010541	TAA	2	6	9769	9774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034869
99	NC_010541	GCT	2	6	9782	9787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034869
100	NC_010541	CAG	2	6	9924	9929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034869
101	NC_010541	AGT	2	6	9973	9978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034869
102	NC_010541	GGT	2	6	10057	10062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034869
103	NC_010541	TGT	2	6	10073	10078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034869
104	NC_010541	TGG	2	6	10173	10178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034869
105	NC_010541	AGC	2	6	10195	10200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034869
106	NC_010541	GGT	2	6	10204	10209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034869
107	NC_010541	TAA	2	6	10303	10308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034869
108	NC_010541	TTC	2	6	10351	10356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034869
109	NC_010541	CAT	2	6	10371	10376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034869
110	NC_010541	CTC	2	6	10463	10468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034869
111	NC_010541	CTT	2	6	10647	10652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034869
112	NC_010541	TGT	2	6	10727	10732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034869
113	NC_010541	TAA	2	6	10864	10869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034869
114	NC_010541	GGC	2	6	11197	11202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034869
115	NC_010541	GTA	2	6	11356	11361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034869
116	NC_010541	CTG	2	6	11593	11598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034870
117	NC_010541	CTT	2	6	11665	11670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034870
118	NC_010541	TCT	2	6	11751	11756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034870
119	NC_010541	ATC	2	6	11760	11765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034870
120	NC_010541	GGT	2	6	12225	12230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034871
121	NC_010541	GAT	2	6	12231	12236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034871
122	NC_010541	AGA	2	6	12324	12329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034871
123	NC_010541	CAA	2	6	12478	12483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034871
124	NC_010541	GGT	2	6	12525	12530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034871
125	NC_010541	AAG	2	6	12653	12658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034871
126	NC_010541	ATC	2	6	12893	12898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034871
127	NC_010541	ACC	2	6	12916	12921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034871
128	NC_010541	GGA	2	6	12965	12970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034871
129	NC_010541	GGA	2	6	13201	13206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034871
130	NC_010541	TAA	2	6	13281	13286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034871
131	NC_010541	TGA	2	6	13329	13334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034871
132	NC_010541	GAA	2	6	13394	13399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034871
133	NC_010541	TTA	2	6	13732	13737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034872
134	NC_010541	GAG	2	6	13774	13779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034872
135	NC_010541	GCT	2	6	13810	13815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034872
136	NC_010541	ATC	2	6	13835	13840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034872
137	NC_010541	GTC	2	6	13901	13906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034872
138	NC_010541	ATC	2	6	13940	13945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034872
139	NC_010541	CAA	2	6	13946	13951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034872
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143	NC_010541	TCC	2	6	14088	14093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034872
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151	NC_010541	TCA	2	6	14447	14452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034873
152	NC_010541	ATC	2	6	14530	14535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034873
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159	NC_010541	GAA	2	6	15291	15296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034874
160	NC_010541	GTT	2	6	15306	15311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034874
161	NC_010541	TAG	2	6	15345	15350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034874
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251	NC_010541	TAA	2	6	22757	22762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034884
252	NC_010541	ACC	2	6	22779	22784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034884
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.