MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid A

Total Repeats: 789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010539	TCA	2	6	24851	24856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034840
502	NC_010539	T	6	6	24916	24921	0 %	100 %	0 %	0 %	172034840
503	NC_010539	AT	4	8	24964	24971	50 %	50 %	0 %	0 %	172034840
504	NC_010539	TTA	2	6	25001	25006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034841
505	NC_010539	TTC	2	6	25046	25051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034841
506	NC_010539	AAAT	2	8	25085	25092	75 %	25 %	0 %	0 %	172034841
507	NC_010539	CCA	2	6	25101	25106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034841
508	NC_010539	CTT	2	6	25108	25113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034841
509	NC_010539	TC	3	6	25163	25168	0 %	50 %	0 %	50 %	172034841
510	NC_010539	ATT	2	6	25214	25219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034841
511	NC_010539	TTC	2	6	25222	25227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034841
512	NC_010539	TTG	2	6	25247	25252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034841
513	NC_010539	TGTC	2	8	25261	25268	0 %	50 %	25 %	25 %	172034841
514	NC_010539	TTTC	2	8	25285	25292	0 %	75 %	0 %	25 %	172034841
515	NC_010539	CAG	2	6	25309	25314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034841
516	NC_010539	TGT	2	6	25346	25351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034841
517	NC_010539	TAA	2	6	25387	25392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034841
518	NC_010539	GTT	2	6	25416	25421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034841
519	NC_010539	AT	3	6	25432	25437	50 %	50 %	0 %	0 %	172034841
520	NC_010539	T	6	6	25450	25455	0 %	100 %	0 %	0 %	172034841
521	NC_010539	TCA	2	6	25473	25478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034841
522	NC_010539	ATCTCT	2	12	25490	25501	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	172034841
523	NC_010539	TAA	2	6	25505	25510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034841
524	NC_010539	AGC	2	6	25544	25549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034841
525	NC_010539	TCTTCA	2	12	25656	25667	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	172034841
526	NC_010539	TAA	2	6	25670	25675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034841
527	NC_010539	TAA	3	9	25700	25708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034841
528	NC_010539	AT	3	6	25796	25801	50 %	50 %	0 %	0 %	172034841
529	NC_010539	AGT	2	6	25844	25849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034841
530	NC_010539	TTC	2	6	25871	25876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034841
531	NC_010539	TCA	2	6	26043	26048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034841
532	NC_010539	ATC	2	6	26075	26080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034841
533	NC_010539	CAA	2	6	26098	26103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034841
534	NC_010539	AAAT	2	8	26120	26127	75 %	25 %	0 %	0 %	172034841
535	NC_010539	GAA	2	6	26173	26178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034841
536	NC_010539	AGC	2	6	26219	26224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034841
537	NC_010539	TTC	2	6	26255	26260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034841
538	NC_010539	ATTTCT	2	12	26363	26374	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	172034841
539	NC_010539	TTC	2	6	26417	26422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034841
540	NC_010539	GCT	2	6	26512	26517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034841
541	NC_010539	ATT	2	6	26636	26641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034841
542	NC_010539	AC	3	6	26768	26773	50 %	0 %	0 %	50 %	172034842
543	NC_010539	ATC	3	9	26786	26794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034842
544	NC_010539	CTC	2	6	26795	26800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034842
545	NC_010539	ACC	2	6	26808	26813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034842
546	NC_010539	GCT	2	6	26844	26849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034842
547	NC_010539	T	6	6	26849	26854	0 %	100 %	0 %	0 %	172034842
548	NC_010539	CAAA	2	8	26989	26996	75 %	0 %	0 %	25 %	172034842
549	NC_010539	GAA	2	6	27041	27046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034842
550	NC_010539	ATA	2	6	27080	27085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034842
551	NC_010539	TAA	2	6	27113	27118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034842
552	NC_010539	ATA	2	6	27123	27128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034842
553	NC_010539	TAG	2	6	27184	27189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034842
554	NC_010539	CTC	2	6	27260	27265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034842
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556	NC_010539	AGT	2	6	27486	27491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034842
557	NC_010539	CCT	2	6	27516	27521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034842
558	NC_010539	AAT	2	6	27600	27605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034843
559	NC_010539	AGAA	2	8	27685	27692	75 %	0 %	25 %	0 %	172034844
560	NC_010539	GTT	3	9	27719	27727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034844
561	NC_010539	TTC	2	6	27748	27753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034844
562	NC_010539	ATTT	2	8	27808	27815	25 %	75 %	0 %	0 %	172034844
563	NC_010539	A	6	6	27894	27899	100 %	0 %	0 %	0 %	172034844
564	NC_010539	TTGA	2	8	27915	27922	25 %	50 %	25 %	0 %	172034844
565	NC_010539	ACT	2	6	27980	27985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034844
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567	NC_010539	ATC	2	6	28003	28008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034844
568	NC_010539	ATC	3	9	28054	28062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034844
569	NC_010539	TCC	2	6	28108	28113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034844
570	NC_010539	GTAA	2	8	28126	28133	50 %	25 %	25 %	0 %	172034844
571	NC_010539	ATT	2	6	28135	28140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034844
572	NC_010539	ATT	2	6	28157	28162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034844
573	NC_010539	GGT	2	6	28178	28183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034844
574	NC_010539	TTA	2	6	28212	28217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034844
575	NC_010539	ATTG	2	8	28230	28237	25 %	50 %	25 %	0 %	172034844
576	NC_010539	TAA	2	6	28329	28334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034845
577	NC_010539	TAG	2	6	28404	28409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034845
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579	NC_010539	CTA	2	6	28486	28491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034845
580	NC_010539	A	8	8	28499	28506	100 %	0 %	0 %	0 %	172034845
581	NC_010539	ACC	2	6	28623	28628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034845
582	NC_010539	GAA	2	6	28667	28672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034845
583	NC_010539	TCT	2	6	28755	28760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034845
584	NC_010539	AGGAGA	2	12	28767	28778	50 %	0 %	50 %	0 %	172034845
585	NC_010539	A	6	6	28831	28836	100 %	0 %	0 %	0 %	172034845
586	NC_010539	AGA	2	6	28854	28859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034845
587	NC_010539	TAA	2	6	28868	28873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034845
588	NC_010539	ATA	2	6	28888	28893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034845
589	NC_010539	AG	3	6	28954	28959	50 %	0 %	50 %	0 %	172034846
590	NC_010539	ACAT	2	8	28977	28984	50 %	25 %	0 %	25 %	172034846
591	NC_010539	AT	4	8	29014	29021	50 %	50 %	0 %	0 %	172034846
592	NC_010539	TA	3	6	29053	29058	50 %	50 %	0 %	0 %	172034846
593	NC_010539	AGC	2	6	29062	29067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034846
594	NC_010539	TGA	2	6	29162	29167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034846
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596	NC_010539	TGTT	2	8	29194	29201	0 %	75 %	25 %	0 %	172034846
597	NC_010539	AT	3	6	29208	29213	50 %	50 %	0 %	0 %	172034846
598	NC_010539	GAA	2	6	29265	29270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034846
599	NC_010539	ATA	2	6	29291	29296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034846
600	NC_010539	CT	3	6	29301	29306	0 %	50 %	0 %	50 %	172034846
601	NC_010539	GTTG	2	8	29338	29345	0 %	50 %	50 %	0 %	172034846
602	NC_010539	GCT	2	6	29402	29407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034846
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604	NC_010539	GTA	2	6	29507	29512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034846
605	NC_010539	ATTA	2	8	29580	29587	50 %	50 %	0 %	0 %	172034847
606	NC_010539	AAT	2	6	29596	29601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034847
607	NC_010539	AAACG	2	10	29741	29750	60 %	0 %	20 %	20 %	172034847
608	NC_010539	CTTTCT	2	12	29805	29816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034847
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610	NC_010539	TTC	2	6	30105	30110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034847
611	NC_010539	T	6	6	30112	30117	0 %	100 %	0 %	0 %	172034847
612	NC_010539	AAC	2	6	30213	30218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034848
613	NC_010539	CCAT	2	8	30223	30230	25 %	25 %	0 %	50 %	172034848
614	NC_010539	TTGC	2	8	30275	30282	0 %	50 %	25 %	25 %	172034848
615	NC_010539	TA	3	6	30327	30332	50 %	50 %	0 %	0 %	172034848
616	NC_010539	GTT	2	6	30336	30341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034848
617	NC_010539	ATTC	2	8	30355	30362	25 %	50 %	0 %	25 %	172034848
618	NC_010539	AAG	2	6	30409	30414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034848
619	NC_010539	ATA	2	6	30439	30444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034848
620	NC_010539	GGT	2	6	30458	30463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034848
621	NC_010539	TAA	2	6	30494	30499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034848
622	NC_010539	TAACTT	2	12	30522	30533	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	172034848
623	NC_010539	TTA	2	6	30536	30541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034848
624	NC_010539	CTAT	2	8	30563	30570	25 %	50 %	0 %	25 %	172034848
625	NC_010539	TTG	2	6	30595	30600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034848
626	NC_010539	T	6	6	30601	30606	0 %	100 %	0 %	0 %	172034848
627	NC_010539	T	6	6	30657	30662	0 %	100 %	0 %	0 %	172034848
628	NC_010539	TTG	2	6	30674	30679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034848
629	NC_010539	GACAG	2	10	30773	30782	40 %	0 %	40 %	20 %	172034848
630	NC_010539	TC	3	6	30823	30828	0 %	50 %	0 %	50 %	172034848
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