MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 8961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010529	CGC	2	6	181595	181600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591496
3002	NC_010529	GCCA	2	8	181690	181697	25 %	0 %	25 %	50 %	188591496
3003	NC_010529	GC	3	6	181737	181742	0 %	0 %	50 %	50 %	188591496
3004	NC_010529	CAG	2	6	181744	181749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591496
3005	NC_010529	CAAG	2	8	181760	181767	50 %	0 %	25 %	25 %	188591496
3006	NC_010529	GT	3	6	181811	181816	0 %	50 %	50 %	0 %	188591496
3007	NC_010529	CAC	2	6	181840	181845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591496
3008	NC_010529	TGA	2	6	181899	181904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591496
3009	NC_010529	CGGA	2	8	182018	182025	25 %	0 %	50 %	25 %	188591497
3010	NC_010529	CCG	2	6	182104	182109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591497
3011	NC_010529	GGT	2	6	182117	182122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591497
3012	NC_010529	GTT	2	6	182198	182203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591497
3013	NC_010529	CGC	2	6	182209	182214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591497
3014	NC_010529	CGG	2	6	182221	182226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591497
3015	NC_010529	TGC	2	6	182359	182364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591497
3016	NC_010529	CCG	2	6	182457	182462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591497
3017	NC_010529	CGT	3	9	182537	182545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591497
3018	NC_010529	GCC	2	6	182546	182551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591497
3019	NC_010529	GCC	2	6	182643	182648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591497
3020	NC_010529	CTG	2	6	182654	182659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591497
3021	NC_010529	GCG	2	6	182704	182709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591497
3022	NC_010529	GC	4	8	182735	182742	0 %	0 %	50 %	50 %	188591497
3023	NC_010529	ATC	2	6	182771	182776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591497
3024	NC_010529	CGC	2	6	182821	182826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591497
3025	NC_010529	CCGCT	2	10	182888	182897	0 %	20 %	20 %	60 %	188591497
3026	NC_010529	CTGC	2	8	182914	182921	0 %	25 %	25 %	50 %	188591497
3027	NC_010529	GC	3	6	182920	182925	0 %	0 %	50 %	50 %	188591497
3028	NC_010529	GCT	2	6	182971	182976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591497
3029	NC_010529	CG	4	8	182987	182994	0 %	0 %	50 %	50 %	188591497
3030	NC_010529	CTTCG	2	10	183005	183014	0 %	40 %	20 %	40 %	188591497
3031	NC_010529	TCG	2	6	183021	183026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591497
3032	NC_010529	AGT	2	6	183040	183045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591497
3033	NC_010529	CCG	2	6	183067	183072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591497
3034	NC_010529	CGA	2	6	183197	183202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591498
3035	NC_010529	TCG	2	6	183227	183232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591498
3036	NC_010529	GCA	2	6	183240	183245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591498
3037	NC_010529	ACC	2	6	183269	183274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591498
3038	NC_010529	GCC	2	6	183280	183285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591498
3039	NC_010529	CAC	3	9	183301	183309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591498
3040	NC_010529	GCG	2	6	183356	183361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591498
3041	NC_010529	TCG	2	6	183392	183397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591498
3042	NC_010529	C	6	6	183497	183502	0 %	0 %	0 %	100 %	188591498
3043	NC_010529	CGA	2	6	183622	183627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591498
3044	NC_010529	CGC	2	6	183688	183693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591498
3045	NC_010529	ACGT	2	8	183742	183749	25 %	25 %	25 %	25 %	188591498
3046	NC_010529	TCG	2	6	183782	183787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591498
3047	NC_010529	GC	3	6	183819	183824	0 %	0 %	50 %	50 %	188591498
3048	NC_010529	CCT	2	6	184173	184178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591499
3049	NC_010529	CGGC	2	8	184182	184189	0 %	0 %	50 %	50 %	188591499
3050	NC_010529	GCT	2	6	184221	184226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591499
3051	NC_010529	GTC	2	6	184253	184258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591499
3052	NC_010529	CGC	2	6	184435	184440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591499
3053	NC_010529	GAT	2	6	184448	184453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591499
3054	NC_010529	GCG	2	6	184461	184466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591499
3055	NC_010529	ACC	2	6	184488	184493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591499
3056	NC_010529	CG	3	6	184557	184562	0 %	0 %	50 %	50 %	188591499
3057	NC_010529	CAC	2	6	184606	184611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591499
3058	NC_010529	CGG	3	9	184615	184623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591499
3059	NC_010529	CGA	2	6	184641	184646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591499
3060	NC_010529	GCG	2	6	184658	184663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591499
3061	NC_010529	CGG	2	6	184665	184670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591499
3062	NC_010529	GGCTT	2	10	184775	184784	0 %	40 %	40 %	20 %	188591499
3063	NC_010529	GA	3	6	184800	184805	50 %	0 %	50 %	0 %	188591499
3064	NC_010529	ACC	2	6	185186	185191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591500
3065	NC_010529	TTC	2	6	185236	185241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591500
3066	NC_010529	ACG	2	6	185261	185266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591500
3067	NC_010529	GAT	2	6	185278	185283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591500
3068	NC_010529	GCG	2	6	185328	185333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591500
3069	NC_010529	CCT	2	6	185402	185407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591500
3070	NC_010529	CAT	2	6	185445	185450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591500
3071	NC_010529	GCG	2	6	185479	185484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591500
3072	NC_010529	TCGA	2	8	185500	185507	25 %	25 %	25 %	25 %	188591500
3073	NC_010529	TCG	2	6	185526	185531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591500
3074	NC_010529	GAA	2	6	185541	185546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591500
3075	NC_010529	CG	3	6	185595	185600	0 %	0 %	50 %	50 %	188591500
3076	NC_010529	CCG	2	6	185758	185763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591500
3077	NC_010529	TCA	2	6	185774	185779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591500
3078	NC_010529	CAC	2	6	185856	185861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591500
3079	NC_010529	GCA	2	6	185862	185867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591500
3080	NC_010529	CGG	2	6	185925	185930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591500
3081	NC_010529	ACG	2	6	185969	185974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591500
3082	NC_010529	CTC	2	6	186040	186045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591500
3083	NC_010529	CCGGCT	2	12	186056	186067	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	188591500
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3085	NC_010529	CAA	2	6	186183	186188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591500
3086	NC_010529	C	6	6	186239	186244	0 %	0 %	0 %	100 %	188591501
3087	NC_010529	GC	3	6	186255	186260	0 %	0 %	50 %	50 %	188591501
3088	NC_010529	CGCA	2	8	186270	186277	25 %	0 %	25 %	50 %	188591501
3089	NC_010529	TCG	2	6	186302	186307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591501
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3091	NC_010529	CCG	4	12	186329	186340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591501
3092	NC_010529	TCA	2	6	186395	186400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591501
3093	NC_010529	GCGT	2	8	186499	186506	0 %	25 %	50 %	25 %	188591501
3094	NC_010529	CGC	2	6	186519	186524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591501
3095	NC_010529	GGC	2	6	186525	186530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591501
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3098	NC_010529	GCT	2	6	186679	186684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591502
3099	NC_010529	CGG	2	6	186720	186725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591502
3100	NC_010529	GCT	2	6	186757	186762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591502
3101	NC_010529	TGG	2	6	186788	186793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591502
3102	NC_010529	ACA	2	6	186813	186818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591502
3103	NC_010529	GTCC	2	8	186838	186845	0 %	25 %	25 %	50 %	188591502
3104	NC_010529	CTGAAA	2	12	186910	186921	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188591502
3105	NC_010529	GCCG	2	8	186923	186930	0 %	0 %	50 %	50 %	188591503
3106	NC_010529	GGAT	2	8	186987	186994	25 %	25 %	50 %	0 %	188591503
3107	NC_010529	GGC	2	6	187002	187007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591503
3108	NC_010529	TGG	2	6	187117	187122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591503
3109	NC_010529	CCG	2	6	187134	187139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591503
3110	NC_010529	ACC	2	6	187216	187221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591503
3111	NC_010529	ACGC	2	8	187240	187247	25 %	0 %	25 %	50 %	188591503
3112	NC_010529	TTC	2	6	187288	187293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591503
3113	NC_010529	G	6	6	187321	187326	0 %	0 %	100 %	0 %	188591503
3114	NC_010529	GGC	2	6	187353	187358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591503
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3120	NC_010529	CAT	2	6	187743	187748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591503
3121	NC_010529	CG	4	8	187767	187774	0 %	0 %	50 %	50 %	188591503
3122	NC_010529	GGC	2	6	187815	187820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591503
3123	NC_010529	ATG	2	6	187837	187842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591503
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3126	NC_010529	AGG	2	6	187901	187906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591503
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3154	NC_010529	CTAC	2	8	189186	189193	25 %	25 %	0 %	50 %	188591503
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3234	NC_010529	ATCG	2	8	193494	193501	25 %	25 %	25 %	25 %	188591507
3235	NC_010529	CTGCC	2	10	193594	193603	0 %	20 %	20 %	60 %	188591507
3236	NC_010529	GA	3	6	193627	193632	50 %	0 %	50 %	0 %	188591507
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3240	NC_010529	CATCG	2	10	193793	193802	20 %	20 %	20 %	40 %	188591507
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3243	NC_010529	TCG	2	6	193936	193941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591507
3244	NC_010529	GCA	2	6	193994	193999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591507
3245	NC_010529	AAC	2	6	194016	194021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591507
3246	NC_010529	GTC	2	6	194103	194108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591507
3247	NC_010529	AGC	2	6	194112	194117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591507
3248	NC_010529	GCA	2	6	194310	194315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591508
3249	NC_010529	TGA	2	6	194392	194397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591508
3250	NC_010529	TCCGCG	2	12	194436	194447	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	188591508
3251	NC_010529	GC	3	6	194494	194499	0 %	0 %	50 %	50 %	188591508
3252	NC_010529	ATG	2	6	194534	194539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591508
3253	NC_010529	AGC	2	6	194646	194651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591508
3254	NC_010529	CGT	2	6	194677	194682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591508
3255	NC_010529	CGA	2	6	194683	194688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591508
3256	NC_010529	CG	3	6	194813	194818	0 %	0 %	50 %	50 %	188591509
3257	NC_010529	GCG	2	6	194823	194828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591509
3258	NC_010529	GTG	2	6	194872	194877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591509
3259	NC_010529	CATG	2	8	194900	194907	25 %	25 %	25 %	25 %	188591509
3260	NC_010529	GCC	2	6	194921	194926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591509
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3262	NC_010529	TCT	2	6	195019	195024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591509
3263	NC_010529	TGGC	2	8	195060	195067	0 %	25 %	50 %	25 %	188591509
3264	NC_010529	TTCGC	2	10	195100	195109	0 %	40 %	20 %	40 %	188591510
3265	NC_010529	TGA	2	6	195140	195145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591510
3266	NC_010529	TCG	2	6	195248	195253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591510
3267	NC_010529	GCGGT	2	10	195296	195305	0 %	20 %	60 %	20 %	188591510
3268	NC_010529	GCC	3	9	195358	195366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591510
3269	NC_010529	GCA	2	6	195384	195389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591510
3270	NC_010529	TCA	2	6	195435	195440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591510
3271	NC_010529	ACG	2	6	195482	195487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591510
3272	NC_010529	CGC	2	6	195510	195515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591510
3273	NC_010529	GCTTCG	2	12	195575	195586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591510
3274	NC_010529	CTG	2	6	195598	195603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591510
3275	NC_010529	TGG	2	6	195628	195633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591510
3276	NC_010529	CTGCT	2	10	195658	195667	0 %	40 %	20 %	40 %	188591510
3277	NC_010529	GCG	2	6	195676	195681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591510
3278	NC_010529	CAT	2	6	195753	195758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591511
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3280	NC_010529	GCA	2	6	195795	195800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591511
3281	NC_010529	CCGA	2	8	195808	195815	25 %	0 %	25 %	50 %	188591511
3282	NC_010529	GCT	2	6	195820	195825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591511
3283	NC_010529	TCG	2	6	195833	195838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591511
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3286	NC_010529	GCTCAA	2	12	196107	196118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	188591511
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3290	NC_010529	CCCT	2	8	196375	196382	0 %	25 %	0 %	75 %	188591511
3291	NC_010529	GC	3	6	196419	196424	0 %	0 %	50 %	50 %	188591511
3292	NC_010529	ACG	2	6	196511	196516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591511
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3299	NC_010529	AGC	2	6	197075	197080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591512
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3303	NC_010529	GGA	2	6	197184	197189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591512
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3313	NC_010529	CAA	2	6	197571	197576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591512
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3317	NC_010529	CGG	3	9	197744	197752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591512
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3323	NC_010529	AAAGA	2	10	198026	198035	80 %	0 %	20 %	0 %	188591512
3324	NC_010529	CGG	2	6	198065	198070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591512
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3334	NC_010529	AGCG	2	8	198979	198986	25 %	0 %	50 %	25 %	188591513
3335	NC_010529	GGT	2	6	198998	199003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591513
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3352	NC_010529	GTC	2	6	199743	199748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591513
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3355	NC_010529	GCA	2	6	199853	199858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591513
3356	NC_010529	GGC	2	6	199880	199885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591513
3357	NC_010529	TCC	2	6	199996	200001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591513
3358	NC_010529	A	6	6	200639	200644	100 %	0 %	0 %	0 %	188591514
3359	NC_010529	TGTT	2	8	200732	200739	0 %	75 %	25 %	0 %	188591514
3360	NC_010529	TTTG	2	8	200769	200776	0 %	75 %	25 %	0 %	188591514
3361	NC_010529	TCA	2	6	200828	200833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591515
3362	NC_010529	CTCCC	2	10	200905	200914	0 %	20 %	0 %	80 %	188591515
3363	NC_010529	GGTT	2	8	200927	200934	0 %	50 %	50 %	0 %	188591515
3364	NC_010529	GGC	2	6	200962	200967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591515
3365	NC_010529	GAA	2	6	200978	200983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591515
3366	NC_010529	CCAG	2	8	201104	201111	25 %	0 %	25 %	50 %	188591516
3367	NC_010529	GCC	2	6	201112	201117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591516
3368	NC_010529	CCG	2	6	201179	201184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591516
3369	NC_010529	AAG	2	6	201214	201219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591516
3370	NC_010529	GC	3	6	201231	201236	0 %	0 %	50 %	50 %	188591516
3371	NC_010529	CAT	2	6	201256	201261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591516
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3373	NC_010529	CGA	2	6	201342	201347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591516
3374	NC_010529	TCGCGA	2	12	201372	201383	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	188591516
3375	NC_010529	GATCC	2	10	201394	201403	20 %	20 %	20 %	40 %	188591516
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3387	NC_010529	ACC	2	6	201871	201876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591516
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3393	NC_010529	ATC	2	6	202174	202179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591516
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3395	NC_010529	CGA	2	6	202203	202208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591516
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3397	NC_010529	GCT	2	6	202221	202226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591516
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3399	NC_010529	CACC	2	8	202326	202333	25 %	0 %	0 %	75 %	188591516
3400	NC_010529	GCG	2	6	202859	202864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591517
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3402	NC_010529	CAAC	2	8	202950	202957	50 %	0 %	0 %	50 %	188591517
3403	NC_010529	ATC	2	6	202961	202966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591517
3404	NC_010529	C	6	6	203019	203024	0 %	0 %	0 %	100 %	188591517
3405	NC_010529	TCG	2	6	203030	203035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591517
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3409	NC_010529	CAA	2	6	203238	203243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591517
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3422	NC_010529	T	7	7	204367	204373	0 %	100 %	0 %	0 %	188591518
3423	NC_010529	GCATC	2	10	204428	204437	20 %	20 %	20 %	40 %	188591518
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3430	NC_010529	CTG	2	6	205115	205120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591519
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3432	NC_010529	CGT	2	6	205138	205143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591519
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3434	NC_010529	GC	3	6	205341	205346	0 %	0 %	50 %	50 %	188591519
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3439	NC_010529	TCG	2	6	205473	205478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591519
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3443	NC_010529	CGC	2	6	205676	205681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591519
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3485	NC_010529	ACGAG	2	10	207709	207718	40 %	0 %	40 %	20 %	188591521
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