MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 8961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010529	TCG	2	6	64809	64814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591375
1002	NC_010529	ACG	2	6	64851	64856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591375
1003	NC_010529	GGC	2	6	64858	64863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591375
1004	NC_010529	GTCG	2	8	64864	64871	0 %	25 %	50 %	25 %	188591375
1005	NC_010529	CG	3	6	64967	64972	0 %	0 %	50 %	50 %	188591375
1006	NC_010529	GCCG	2	8	65197	65204	0 %	0 %	50 %	50 %	188591375
1007	NC_010529	TCGAA	2	10	65468	65477	40 %	20 %	20 %	20 %	188591376
1008	NC_010529	TGGCCG	2	12	65510	65521	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	188591376
1009	NC_010529	TCT	2	6	65523	65528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591376
1010	NC_010529	GCA	2	6	65565	65570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591376
1011	NC_010529	CAA	2	6	65575	65580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591376
1012	NC_010529	CAG	2	6	65608	65613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591376
1013	NC_010529	AGA	2	6	65651	65656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591376
1014	NC_010529	AGG	2	6	65696	65701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591376
1015	NC_010529	CCG	2	6	65751	65756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591377
1016	NC_010529	CAG	2	6	65764	65769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591377
1017	NC_010529	GCGGTT	2	12	65829	65840	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	188591377
1018	NC_010529	TCTTA	2	10	65868	65877	20 %	60 %	0 %	20 %	188591377
1019	NC_010529	ACC	2	6	65900	65905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591377
1020	NC_010529	GCGG	2	8	65906	65913	0 %	0 %	75 %	25 %	188591377
1021	NC_010529	CAT	2	6	65940	65945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591377
1022	NC_010529	CTTC	2	8	65994	66001	0 %	50 %	0 %	50 %	188591378
1023	NC_010529	TTC	2	6	66020	66025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591378
1024	NC_010529	GCC	2	6	66161	66166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591378
1025	NC_010529	GGC	2	6	66268	66273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591378
1026	NC_010529	TG	3	6	66361	66366	0 %	50 %	50 %	0 %	188591379
1027	NC_010529	GCA	2	6	66567	66572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591379
1028	NC_010529	CGT	2	6	66770	66775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591380
1029	NC_010529	GCC	2	6	66783	66788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591380
1030	NC_010529	GGC	2	6	66888	66893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591380
1031	NC_010529	GCA	2	6	66947	66952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591380
1032	NC_010529	GCC	2	6	66970	66975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591380
1033	NC_010529	AGC	2	6	66996	67001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591380
1034	NC_010529	TC	3	6	67063	67068	0 %	50 %	0 %	50 %	188591380
1035	NC_010529	GTC	2	6	67098	67103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591380
1036	NC_010529	CG	3	6	67125	67130	0 %	0 %	50 %	50 %	188591380
1037	NC_010529	ACA	2	6	67132	67137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591380
1038	NC_010529	CGG	2	6	67241	67246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591380
1039	NC_010529	CGC	2	6	67322	67327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591380
1040	NC_010529	CGGCAC	3	18	67361	67378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	188591380
1041	NC_010529	CGGCC	2	10	67415	67424	0 %	0 %	40 %	60 %	188591380
1042	NC_010529	GGC	2	6	67434	67439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591380
1043	NC_010529	ACG	2	6	67558	67563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591380
1044	NC_010529	ACT	2	6	67627	67632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591380
1045	NC_010529	CTCG	2	8	67700	67707	0 %	25 %	25 %	50 %	188591380
1046	NC_010529	GAAG	2	8	68092	68099	50 %	0 %	50 %	0 %	188591381
1047	NC_010529	GGC	2	6	68264	68269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591381
1048	NC_010529	GCG	2	6	68277	68282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591381
1049	NC_010529	GCC	2	6	68386	68391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591381
1050	NC_010529	CTG	2	6	68399	68404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591381
1051	NC_010529	CGA	2	6	68449	68454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591381
1052	NC_010529	CTC	2	6	68471	68476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591381
1053	NC_010529	TGT	2	6	68521	68526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591381
1054	NC_010529	CTC	2	6	68543	68548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591381
1055	NC_010529	CCCAG	2	10	68598	68607	20 %	0 %	20 %	60 %	188591381
1056	NC_010529	AGC	2	6	68636	68641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591381
1057	NC_010529	AGG	2	6	68774	68779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591382
1058	NC_010529	GAA	2	6	68787	68792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591382
1059	NC_010529	GCC	3	9	68812	68820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591382
1060	NC_010529	TCGG	2	8	68821	68828	0 %	25 %	50 %	25 %	188591382
1061	NC_010529	GCCT	2	8	68837	68844	0 %	25 %	25 %	50 %	188591382
1062	NC_010529	GCTGT	2	10	68893	68902	0 %	40 %	40 %	20 %	188591382
1063	NC_010529	GC	3	6	69036	69041	0 %	0 %	50 %	50 %	188591382
1064	NC_010529	TC	3	6	69084	69089	0 %	50 %	0 %	50 %	188591382
1065	NC_010529	CCG	2	6	69098	69103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591382
1066	NC_010529	CG	3	6	69167	69172	0 %	0 %	50 %	50 %	188591382
1067	NC_010529	GGC	2	6	69213	69218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591382
1068	NC_010529	CGG	2	6	69223	69228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591382
1069	NC_010529	GC	3	6	69249	69254	0 %	0 %	50 %	50 %	188591382
1070	NC_010529	CGC	2	6	69387	69392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591383
1071	NC_010529	G	7	7	69423	69429	0 %	0 %	100 %	0 %	188591383
1072	NC_010529	CTG	2	6	69453	69458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591383
1073	NC_010529	CA	3	6	69461	69466	50 %	0 %	0 %	50 %	188591383
1074	NC_010529	A	6	6	69486	69491	100 %	0 %	0 %	0 %	188591383
1075	NC_010529	CG	3	6	69505	69510	0 %	0 %	50 %	50 %	188591383
1076	NC_010529	ACG	2	6	69636	69641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591384
1077	NC_010529	CCGAT	2	10	69710	69719	20 %	20 %	20 %	40 %	188591384
1078	NC_010529	GCA	2	6	69722	69727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591384
1079	NC_010529	CTCTG	2	10	69779	69788	0 %	40 %	20 %	40 %	188591384
1080	NC_010529	TCG	2	6	69796	69801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591384
1081	NC_010529	CAT	2	6	69839	69844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591384
1082	NC_010529	GAC	2	6	69863	69868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591384
1083	NC_010529	GGC	2	6	69875	69880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591384
1084	NC_010529	TC	3	6	69895	69900	0 %	50 %	0 %	50 %	188591384
1085	NC_010529	TTCCG	2	10	69937	69946	0 %	40 %	20 %	40 %	188591384
1086	NC_010529	AGC	2	6	69997	70002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591384
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1088	NC_010529	CGCAG	2	10	70040	70049	20 %	0 %	40 %	40 %	188591384
1089	NC_010529	GTC	2	6	70097	70102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591385
1090	NC_010529	CTG	2	6	70142	70147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591385
1091	NC_010529	GACC	2	8	70162	70169	25 %	0 %	25 %	50 %	188591385
1092	NC_010529	CCT	2	6	70219	70224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591385
1093	NC_010529	CG	3	6	70225	70230	0 %	0 %	50 %	50 %	188591385
1094	NC_010529	CG	3	6	70266	70271	0 %	0 %	50 %	50 %	188591385
1095	NC_010529	TGA	2	6	70275	70280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591385
1096	NC_010529	CCTGAC	2	12	70343	70354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	188591385
1097	NC_010529	ATC	2	6	70400	70405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591385
1098	NC_010529	AGC	2	6	70432	70437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591385
1099	NC_010529	TCG	2	6	70479	70484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591385
1100	NC_010529	ACC	2	6	70533	70538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591385
1101	NC_010529	GAA	2	6	70549	70554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591385
1102	NC_010529	ACC	2	6	70583	70588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591385
1103	NC_010529	GTCC	2	8	70671	70678	0 %	25 %	25 %	50 %	188591386
1104	NC_010529	CGT	2	6	70704	70709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591386
1105	NC_010529	CGA	2	6	70720	70725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591386
1106	NC_010529	GGCAG	2	10	70740	70749	20 %	0 %	60 %	20 %	188591386
1107	NC_010529	AAG	2	6	70760	70765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591386
1108	NC_010529	TGC	2	6	70767	70772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591386
1109	NC_010529	GCC	2	6	70913	70918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591387
1110	NC_010529	ACG	2	6	70955	70960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591387
1111	NC_010529	GCA	2	6	71010	71015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591387
1112	NC_010529	GCG	2	6	71024	71029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591387
1113	NC_010529	GC	3	6	71031	71036	0 %	0 %	50 %	50 %	188591387
1114	NC_010529	CCG	2	6	71045	71050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591387
1115	NC_010529	CAG	2	6	71059	71064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591387
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1117	NC_010529	GTC	2	6	71116	71121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591387
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1119	NC_010529	TGA	2	6	71139	71144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591387
1120	NC_010529	GGCC	2	8	71166	71173	0 %	0 %	50 %	50 %	188591387
1121	NC_010529	GCC	2	6	71200	71205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591387
1122	NC_010529	CGC	2	6	71221	71226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591387
1123	NC_010529	CGA	2	6	71280	71285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591387
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1125	NC_010529	GAAG	2	8	71712	71719	50 %	0 %	50 %	0 %	188591388
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1250	NC_010529	ACTTCG	2	12	78603	78614	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	188591393
1251	NC_010529	GCC	2	6	78621	78626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591393
1252	NC_010529	GAC	2	6	78632	78637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591393
1253	NC_010529	ATC	2	6	78642	78647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591393
1254	NC_010529	GCA	2	6	78699	78704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591393
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1256	NC_010529	GCTG	2	8	79237	79244	0 %	25 %	50 %	25 %	188591394
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1262	NC_010529	GGC	2	6	79457	79462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591394
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1265	NC_010529	CGAGC	2	10	79618	79627	20 %	0 %	40 %	40 %	188591394
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