MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 8961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010529	GGA	3	9	32862	32870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591346
502	NC_010529	CCGCT	2	10	32911	32920	0 %	20 %	20 %	60 %	188591346
503	NC_010529	GCC	2	6	32985	32990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591346
504	NC_010529	GAC	2	6	33007	33012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591346
505	NC_010529	GGTG	2	8	33037	33044	0 %	25 %	75 %	0 %	188591346
506	NC_010529	GAT	3	9	33058	33066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591346
507	NC_010529	TTG	2	6	33107	33112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591346
508	NC_010529	CTGGCG	2	12	33172	33183	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	188591346
509	NC_010529	CTG	2	6	33206	33211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591346
510	NC_010529	GAC	2	6	33223	33228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591346
511	NC_010529	G	7	7	33245	33251	0 %	0 %	100 %	0 %	188591346
512	NC_010529	TC	3	6	33328	33333	0 %	50 %	0 %	50 %	188591346
513	NC_010529	TCT	2	6	33341	33346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591346
514	NC_010529	TCA	2	6	33350	33355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591346
515	NC_010529	CGG	2	6	33438	33443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591346
516	NC_010529	GAA	2	6	33565	33570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591346
517	NC_010529	AGGG	2	8	33616	33623	25 %	0 %	75 %	0 %	188591346
518	NC_010529	TCA	2	6	33635	33640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591346
519	NC_010529	TGG	2	6	33661	33666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591346
520	NC_010529	TTA	2	6	33716	33721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188591346
521	NC_010529	GCG	2	6	33788	33793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591346
522	NC_010529	ATG	2	6	33874	33879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591346
523	NC_010529	CG	3	6	33880	33885	0 %	0 %	50 %	50 %	188591346
524	NC_010529	ATC	2	6	33911	33916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591346
525	NC_010529	ACC	2	6	33945	33950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591346
526	NC_010529	CAG	2	6	34416	34421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591347
527	NC_010529	CAT	2	6	34664	34669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591348
528	NC_010529	TTTG	2	8	34710	34717	0 %	75 %	25 %	0 %	188591348
529	NC_010529	AATTG	2	10	34736	34745	40 %	40 %	20 %	0 %	188591348
530	NC_010529	ACG	2	6	34811	34816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591348
531	NC_010529	GCG	3	9	34847	34855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591348
532	NC_010529	TCGAAG	2	12	34859	34870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188591348
533	NC_010529	ATT	2	6	34885	34890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188591348
534	NC_010529	TTC	2	6	34929	34934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591348
535	NC_010529	A	7	7	34941	34947	100 %	0 %	0 %	0 %	188591348
536	NC_010529	CG	3	6	35003	35008	0 %	0 %	50 %	50 %	188591348
537	NC_010529	CCG	2	6	35031	35036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591348
538	NC_010529	TCC	2	6	35039	35044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591348
539	NC_010529	CCG	2	6	35076	35081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591348
540	NC_010529	TCC	2	6	35120	35125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591348
541	NC_010529	GGATT	2	10	35151	35160	20 %	40 %	40 %	0 %	188591348
542	NC_010529	GGT	2	6	35508	35513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591349
543	NC_010529	CCAA	2	8	35538	35545	50 %	0 %	0 %	50 %	188591349
544	NC_010529	AC	3	6	35550	35555	50 %	0 %	0 %	50 %	188591349
545	NC_010529	TCG	2	6	35593	35598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591349
546	NC_010529	AACGC	2	10	35632	35641	40 %	0 %	20 %	40 %	188591349
547	NC_010529	CGG	2	6	35647	35652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591349
548	NC_010529	CGG	3	9	35666	35674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591349
549	NC_010529	GTC	2	6	35852	35857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591350
550	NC_010529	CCG	2	6	35862	35867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591350
551	NC_010529	TCG	2	6	36130	36135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591350
552	NC_010529	TGA	2	6	36193	36198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591350
553	NC_010529	TTGT	2	8	36209	36216	0 %	75 %	25 %	0 %	188591350
554	NC_010529	GAA	2	6	36313	36318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591350
555	NC_010529	CCT	2	6	36381	36386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591350
556	NC_010529	CCG	2	6	36448	36453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591350
557	NC_010529	TTC	2	6	36554	36559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591350
558	NC_010529	GTA	2	6	36604	36609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591350
559	NC_010529	GC	3	6	36661	36666	0 %	0 %	50 %	50 %	188591350
560	NC_010529	GATA	2	8	36702	36709	50 %	25 %	25 %	0 %	188591350
561	NC_010529	TCG	2	6	36870	36875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591350
562	NC_010529	CATA	2	8	36898	36905	50 %	25 %	0 %	25 %	188591350
563	NC_010529	CG	3	6	36919	36924	0 %	0 %	50 %	50 %	188591350
564	NC_010529	CT	3	6	36985	36990	0 %	50 %	0 %	50 %	188591350
565	NC_010529	T	6	6	36993	36998	0 %	100 %	0 %	0 %	188591350
566	NC_010529	CTT	2	6	37030	37035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591350
567	NC_010529	TCC	2	6	37053	37058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591350
568	NC_010529	TTGC	2	8	37117	37124	0 %	50 %	25 %	25 %	188591350
569	NC_010529	GTA	2	6	37148	37153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591350
570	NC_010529	TC	3	6	37184	37189	0 %	50 %	0 %	50 %	188591350
571	NC_010529	TGA	2	6	37304	37309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591350
572	NC_010529	AGT	2	6	37362	37367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591350
573	NC_010529	ACCC	2	8	37387	37394	25 %	0 %	0 %	75 %	188591350
574	NC_010529	AAAGC	2	10	37409	37418	60 %	0 %	20 %	20 %	188591350
575	NC_010529	TAG	2	6	37424	37429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591350
576	NC_010529	CTTG	2	8	37480	37487	0 %	50 %	25 %	25 %	188591350
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579	NC_010529	AATG	2	8	37600	37607	50 %	25 %	25 %	0 %	188591350
580	NC_010529	GTC	2	6	37652	37657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591350
581	NC_010529	GGT	2	6	37733	37738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591350
582	NC_010529	TCAT	2	8	37808	37815	25 %	50 %	0 %	25 %	188591351
583	NC_010529	CAAA	2	8	37833	37840	75 %	0 %	0 %	25 %	188591351
584	NC_010529	TGT	2	6	37860	37865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591351
585	NC_010529	GC	3	6	37910	37915	0 %	0 %	50 %	50 %	188591351
586	NC_010529	GA	3	6	37941	37946	50 %	0 %	50 %	0 %	188591351
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589	NC_010529	TTG	2	6	38109	38114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591352
590	NC_010529	CAA	2	6	38200	38205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591352
591	NC_010529	CCAG	2	8	38223	38230	25 %	0 %	25 %	50 %	188591352
592	NC_010529	TGCT	2	8	38243	38250	0 %	50 %	25 %	25 %	188591352
593	NC_010529	TTGCT	2	10	38303	38312	0 %	60 %	20 %	20 %	188591352
594	NC_010529	T	6	6	38353	38358	0 %	100 %	0 %	0 %	188591352
595	NC_010529	T	7	7	38377	38383	0 %	100 %	0 %	0 %	188591352
596	NC_010529	GCAA	2	8	38515	38522	50 %	0 %	25 %	25 %	188591352
597	NC_010529	TGCT	2	8	38541	38548	0 %	50 %	25 %	25 %	188591352
598	NC_010529	GCA	2	6	38689	38694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591352
599	NC_010529	CGT	2	6	38803	38808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591352
600	NC_010529	TCA	3	9	38965	38973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591352
601	NC_010529	AATT	2	8	39689	39696	50 %	50 %	0 %	0 %	188591353
602	NC_010529	GTT	2	6	39780	39785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591353
603	NC_010529	GGC	2	6	39905	39910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591353
604	NC_010529	AAC	2	6	39914	39919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591353
605	NC_010529	AAT	2	6	39995	40000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188591353
606	NC_010529	TGC	2	6	40054	40059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591353
607	NC_010529	AGC	2	6	40083	40088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591353
608	NC_010529	CTG	2	6	40735	40740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591354
609	NC_010529	CGCC	2	8	40743	40750	0 %	0 %	25 %	75 %	188591354
610	NC_010529	TCC	2	6	40812	40817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591354
611	NC_010529	GGC	2	6	40870	40875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591354
612	NC_010529	CG	3	6	40921	40926	0 %	0 %	50 %	50 %	188591354
613	NC_010529	GCC	2	6	40987	40992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591354
614	NC_010529	GCTT	2	8	41087	41094	0 %	50 %	25 %	25 %	188591354
615	NC_010529	T	7	7	41133	41139	0 %	100 %	0 %	0 %	188591354
616	NC_010529	CCG	2	6	41207	41212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591355
617	NC_010529	AGGC	2	8	41231	41238	25 %	0 %	50 %	25 %	188591355
618	NC_010529	AGA	2	6	41302	41307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591355
619	NC_010529	GC	3	6	41335	41340	0 %	0 %	50 %	50 %	188591355
620	NC_010529	GCG	2	6	41392	41397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591355
621	NC_010529	GCG	2	6	41467	41472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591355
622	NC_010529	CGC	2	6	41535	41540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591355
623	NC_010529	ACT	2	6	41568	41573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591355
624	NC_010529	TCA	2	6	41640	41645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591355
625	NC_010529	TCG	2	6	41652	41657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591355
626	NC_010529	CAA	2	6	41730	41735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591355
627	NC_010529	TGG	2	6	41870	41875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591355
628	NC_010529	TCGTGA	2	12	41888	41899	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	188591355
629	NC_010529	GTG	2	6	41928	41933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591355
630	NC_010529	AATTG	2	10	41935	41944	40 %	40 %	20 %	0 %	188591355
631	NC_010529	AAT	2	6	42014	42019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188591355
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634	NC_010529	AAT	2	6	42230	42235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188591355
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641	NC_010529	CTT	2	6	42734	42739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591356
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