MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 8961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010529	CAA	2	6	308489	308494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591608
5002	NC_010529	CA	3	6	308516	308521	50 %	0 %	0 %	50 %	188591608
5003	NC_010529	GAC	2	6	308537	308542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591608
5004	NC_010529	GCC	2	6	308549	308554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591608
5005	NC_010529	CACG	2	8	308693	308700	25 %	0 %	25 %	50 %	188591609
5006	NC_010529	TTA	2	6	308715	308720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188591609
5007	NC_010529	GAT	2	6	308784	308789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591609
5008	NC_010529	GCCTC	2	10	308823	308832	0 %	20 %	20 %	60 %	188591609
5009	NC_010529	A	6	6	308927	308932	100 %	0 %	0 %	0 %	188591609
5010	NC_010529	CGAA	2	8	308970	308977	50 %	0 %	25 %	25 %	188591609
5011	NC_010529	TTG	2	6	309016	309021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591609
5012	NC_010529	TCA	2	6	309025	309030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591609
5013	NC_010529	TGA	2	6	309049	309054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591609
5014	NC_010529	GAG	2	6	309143	309148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591609
5015	NC_010529	TGC	2	6	309163	309168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591609
5016	NC_010529	TGT	2	6	309183	309188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591609
5017	NC_010529	TTGC	2	8	309311	309318	0 %	50 %	25 %	25 %	188591609
5018	NC_010529	GAA	2	6	309323	309328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591609
5019	NC_010529	AAG	2	6	309347	309352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591609
5020	NC_010529	GAA	2	6	309355	309360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591609
5021	NC_010529	GCA	3	9	309392	309400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591609
5022	NC_010529	CGCT	2	8	309428	309435	0 %	25 %	25 %	50 %	188591609
5023	NC_010529	GGC	2	6	309521	309526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591609
5024	NC_010529	T	6	6	309561	309566	0 %	100 %	0 %	0 %	188591609
5025	NC_010529	CAT	2	6	309571	309576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591609
5026	NC_010529	CGT	2	6	309584	309589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591609
5027	NC_010529	GCG	2	6	309636	309641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591609
5028	NC_010529	GAA	3	9	309673	309681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591609
5029	NC_010529	TCA	2	6	309753	309758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591609
5030	NC_010529	GCC	2	6	309871	309876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591609
5031	NC_010529	TGG	2	6	309955	309960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591609
5032	NC_010529	TTCG	2	8	310572	310579	0 %	50 %	25 %	25 %	188591610
5033	NC_010529	CAT	2	6	310589	310594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591610
5034	NC_010529	CGGG	2	8	310659	310666	0 %	0 %	75 %	25 %	188591610
5035	NC_010529	CATT	2	8	310712	310719	25 %	50 %	0 %	25 %	188591610
5036	NC_010529	TGA	2	6	310799	310804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591610
5037	NC_010529	GAA	2	6	310956	310961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591610
5038	NC_010529	TCG	2	6	311345	311350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591611
5039	NC_010529	GTTC	2	8	311490	311497	0 %	50 %	25 %	25 %	188591611
5040	NC_010529	CCGT	2	8	311528	311535	0 %	25 %	25 %	50 %	188591611
5041	NC_010529	ACG	2	6	311601	311606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591611
5042	NC_010529	AAG	2	6	311650	311655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591611
5043	NC_010529	TAC	2	6	311762	311767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591611
5044	NC_010529	GTT	3	9	311772	311780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591611
5045	NC_010529	TG	3	6	311823	311828	0 %	50 %	50 %	0 %	188591611
5046	NC_010529	AGC	2	6	311849	311854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591611
5047	NC_010529	T	6	6	311944	311949	0 %	100 %	0 %	0 %	188591611
5048	NC_010529	TTG	2	6	311984	311989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591611
5049	NC_010529	ATCGC	2	10	312032	312041	20 %	20 %	20 %	40 %	188591611
5050	NC_010529	AGCA	2	8	312168	312175	50 %	0 %	25 %	25 %	188591611
5051	NC_010529	GAA	2	6	312231	312236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591611
5052	NC_010529	CTGA	2	8	312239	312246	25 %	25 %	25 %	25 %	188591611
5053	NC_010529	CG	3	6	312378	312383	0 %	0 %	50 %	50 %	188591612
5054	NC_010529	GAC	2	6	312434	312439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591612
5055	NC_010529	T	6	6	312487	312492	0 %	100 %	0 %	0 %	188591612
5056	NC_010529	GC	3	6	312508	312513	0 %	0 %	50 %	50 %	188591612
5057	NC_010529	AG	3	6	312516	312521	50 %	0 %	50 %	0 %	188591612
5058	NC_010529	GTT	2	6	312524	312529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591612
5059	NC_010529	TCC	2	6	312531	312536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591612
5060	NC_010529	TTG	2	6	312573	312578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591612
5061	NC_010529	GGC	2	6	312602	312607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591612
5062	NC_010529	GC	3	6	312627	312632	0 %	0 %	50 %	50 %	188591612
5063	NC_010529	CGATTT	2	12	312730	312741	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188591613
5064	NC_010529	TCG	2	6	312770	312775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591613
5065	NC_010529	TTC	2	6	312930	312935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591613
5066	NC_010529	CATT	2	8	312958	312965	25 %	50 %	0 %	25 %	188591613
5067	NC_010529	ACG	2	6	312999	313004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591613
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5069	NC_010529	GTT	2	6	313175	313180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591613
5070	NC_010529	GCT	3	9	313201	313209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591613
5071	NC_010529	CAT	2	6	313274	313279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591613
5072	NC_010529	GCG	2	6	313475	313480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591613
5073	NC_010529	CGG	2	6	313579	313584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591613
5074	NC_010529	AGG	2	6	313675	313680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591613
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5076	NC_010529	ACGT	2	8	313947	313954	25 %	25 %	25 %	25 %	188591613
5077	NC_010529	CGA	2	6	313983	313988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591613
5078	NC_010529	TG	3	6	314025	314030	0 %	50 %	50 %	0 %	188591613
5079	NC_010529	AGCG	2	8	314113	314120	25 %	0 %	50 %	25 %	188591613
5080	NC_010529	TGCCC	2	10	314173	314182	0 %	20 %	20 %	60 %	188591613
5081	NC_010529	GA	4	8	314207	314214	50 %	0 %	50 %	0 %	188591613
5082	NC_010529	GCG	2	6	314261	314266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591613
5083	NC_010529	ATG	2	6	314570	314575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591614
5084	NC_010529	TGG	2	6	314586	314591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591614
5085	NC_010529	CAG	2	6	314623	314628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591614
5086	NC_010529	A	7	7	314685	314691	100 %	0 %	0 %	0 %	188591614
5087	NC_010529	CTT	2	6	314700	314705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591614
5088	NC_010529	AGG	2	6	314752	314757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591615
5089	NC_010529	TGCC	2	8	314774	314781	0 %	25 %	25 %	50 %	188591615
5090	NC_010529	CTA	2	6	314807	314812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591615
5091	NC_010529	CCG	2	6	314819	314824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591615
5092	NC_010529	GCG	2	6	314871	314876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591615
5093	NC_010529	GCG	2	6	314887	314892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591615
5094	NC_010529	CATG	2	8	314915	314922	25 %	25 %	25 %	25 %	188591615
5095	NC_010529	CGA	2	6	315019	315024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591615
5096	NC_010529	AGCA	2	8	315030	315037	50 %	0 %	25 %	25 %	188591615
5097	NC_010529	GCTG	2	8	315139	315146	0 %	25 %	50 %	25 %	188591615
5098	NC_010529	TGGGC	2	10	315187	315196	0 %	20 %	60 %	20 %	188591615
5099	NC_010529	GCA	2	6	315251	315256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591615
5100	NC_010529	CCAGGA	2	12	315264	315275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591615
5101	NC_010529	TGC	2	6	315280	315285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591615
5102	NC_010529	CAGT	2	8	315299	315306	25 %	25 %	25 %	25 %	188591615
5103	NC_010529	GCA	2	6	315355	315360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591615
5104	NC_010529	TTG	2	6	315377	315382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591615
5105	NC_010529	TTC	2	6	315405	315410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591615
5106	NC_010529	T	7	7	315451	315457	0 %	100 %	0 %	0 %	188591615
5107	NC_010529	GCAGG	2	10	315462	315471	20 %	0 %	60 %	20 %	188591615
5108	NC_010529	CGG	2	6	316044	316049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591616
5109	NC_010529	GCGAC	2	10	316062	316071	20 %	0 %	40 %	40 %	188591616
5110	NC_010529	TGC	2	6	316086	316091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591616
5111	NC_010529	CGA	2	6	316104	316109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591616
5112	NC_010529	GC	3	6	316222	316227	0 %	0 %	50 %	50 %	188591616
5113	NC_010529	CGCGC	2	10	316340	316349	0 %	0 %	40 %	60 %	188591616
5114	NC_010529	GGGC	2	8	316453	316460	0 %	0 %	75 %	25 %	188591616
5115	NC_010529	GCA	2	6	316548	316553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591616
5116	NC_010529	GAC	2	6	316588	316593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591616
5117	NC_010529	GCT	2	6	316605	316610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591616
5118	NC_010529	ACC	2	6	316630	316635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591616
5119	NC_010529	TCGC	2	8	316670	316677	0 %	25 %	25 %	50 %	188591616
5120	NC_010529	CGC	2	6	316685	316690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591616
5121	NC_010529	CAGC	2	8	316744	316751	25 %	0 %	25 %	50 %	188591616
5122	NC_010529	CGGC	2	8	316832	316839	0 %	0 %	50 %	50 %	188591616
5123	NC_010529	CTT	2	6	316851	316856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591616
5124	NC_010529	TCG	2	6	316872	316877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591616
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5231	NC_010529	AAAG	2	8	324532	324539	75 %	0 %	25 %	0 %	188591624
5232	NC_010529	GAA	2	6	324637	324642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591624
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5234	NC_010529	GAGTT	2	10	324715	324724	20 %	40 %	40 %	0 %	188591624
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5242	NC_010529	GTC	2	6	324935	324940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591624
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5244	NC_010529	ACGA	2	8	324960	324967	50 %	0 %	25 %	25 %	188591624
5245	NC_010529	TCG	2	6	324972	324977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591624
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5248	NC_010529	GCG	2	6	325158	325163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591624
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5265	NC_010529	CCG	3	9	326579	326587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591626
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5273	NC_010529	CGGT	2	8	326929	326936	0 %	25 %	50 %	25 %	188591626
5274	NC_010529	GGC	2	6	326998	327003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591626
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5355	NC_010529	ACG	2	6	332565	332570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591634
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5357	NC_010529	CA	3	6	332708	332713	50 %	0 %	0 %	50 %	188591634
5358	NC_010529	GCG	2	6	333148	333153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591635
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5361	NC_010529	GCAG	2	8	333370	333377	25 %	0 %	50 %	25 %	188591635
5362	NC_010529	TCAA	2	8	333391	333398	50 %	25 %	0 %	25 %	188591635
5363	NC_010529	ATG	2	6	333446	333451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591635
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5365	NC_010529	GAT	2	6	333537	333542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591635
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5367	NC_010529	ACA	2	6	333560	333565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591635
5368	NC_010529	GCG	3	9	333596	333604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591635
5369	NC_010529	TGGG	2	8	333611	333618	0 %	25 %	75 %	0 %	188591635
5370	NC_010529	CAGG	2	8	333781	333788	25 %	0 %	50 %	25 %	188591635
5371	NC_010529	GGA	2	6	333870	333875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591635
5372	NC_010529	CGA	2	6	333909	333914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591635
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5382	NC_010529	CGA	2	6	334514	334519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591636
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5391	NC_010529	CGAT	2	8	334869	334876	25 %	25 %	25 %	25 %	188591636
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5394	NC_010529	TGA	2	6	334988	334993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591636
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5402	NC_010529	ACTG	2	8	335743	335750	25 %	25 %	25 %	25 %	188591637
5403	NC_010529	TAC	2	6	335852	335857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591637
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5488	NC_010529	CTTCGA	2	12	340839	340850	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	188591639
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5491	NC_010529	ATG	2	6	341693	341698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591640
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