MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 52008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010520	AAT	2	6	128	133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760502
2	NC_010520	ACT	2	6	257	262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170760502
3	NC_010520	GAA	2	6	263	268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760502
4	NC_010520	ATA	2	6	285	290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760502
5	NC_010520	ATG	2	6	315	320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760502
6	NC_010520	CTA	2	6	327	332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170760502
7	NC_010520	GCA	2	6	395	400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170760502
8	NC_010520	TGG	2	6	454	459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170760502
9	NC_010520	AGT	2	6	532	537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760502
10	NC_010520	TCT	2	6	545	550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170760502
11	NC_010520	GAT	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760502
12	NC_010520	TGA	2	6	643	648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760502
13	NC_010520	AAT	2	6	730	735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760502
14	NC_010520	AGA	2	6	775	780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760502
15	NC_010520	TAA	2	6	960	965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760502
16	NC_010520	TAG	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760502
17	NC_010520	TCA	2	6	980	985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170760502
18	NC_010520	TAA	2	6	991	996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760502
19	NC_010520	AAG	2	6	1083	1088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760502
20	NC_010520	TAT	2	6	1100	1105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170760502
21	NC_010520	AGA	2	6	1117	1122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760502
22	NC_010520	AGA	2	6	1136	1141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760502
23	NC_010520	GAA	2	6	1223	1228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760502
24	NC_010520	TAC	2	6	1246	1251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170760502
25	NC_010520	TAA	2	6	1279	1284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760502
26	NC_010520	TAT	2	6	1699	1704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761565
27	NC_010520	TTA	2	6	1714	1719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761565
28	NC_010520	TAA	2	6	1724	1729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
29	NC_010520	AGA	2	6	1799	1804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761565
30	NC_010520	ATA	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
31	NC_010520	AGA	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761565
32	NC_010520	ATA	2	6	1905	1910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
33	NC_010520	TAT	2	6	1970	1975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761565
34	NC_010520	TAG	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170761565
35	NC_010520	AAG	2	6	2147	2152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761565
36	NC_010520	GTT	2	6	2157	2162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170761565
37	NC_010520	AGA	3	9	2228	2236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761565
38	NC_010520	AAT	2	6	2300	2305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
39	NC_010520	ATT	2	6	2312	2317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761565
40	NC_010520	GAA	2	6	2355	2360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761565
41	NC_010520	ATA	2	6	2373	2378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
42	NC_010520	AAG	2	6	2431	2436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761565
43	NC_010520	TAA	2	6	2482	2487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
44	NC_010520	AGA	2	6	2516	2521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761565
45	NC_010520	GGT	2	6	2528	2533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170761565
46	NC_010520	GAT	2	6	2604	2609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170761565
47	NC_010520	AGT	2	6	2631	2636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170761565
48	NC_010520	TAT	2	6	2648	2653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761565
49	NC_010520	AAT	2	6	2670	2675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
50	NC_010520	AAT	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761565
51	NC_010520	GAT	2	6	2736	2741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170758477
52	NC_010520	ATA	2	6	2764	2769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758477
53	NC_010520	CAA	2	6	2801	2806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170758477
54	NC_010520	AGA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170758477
55	NC_010520	TAA	2	6	2916	2921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758477
56	NC_010520	ATT	2	6	2935	2940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170758477
57	NC_010520	TAA	2	6	3034	3039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759251
58	NC_010520	ATG	2	6	3052	3057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170759251
59	NC_010520	TAA	2	6	3101	3106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759251
60	NC_010520	ATA	2	6	3208	3213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759251
61	NC_010520	TGT	2	6	3350	3355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170759251
62	NC_010520	AGA	2	6	3368	3373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170759251
63	NC_010520	AAT	2	6	3380	3385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759251
64	NC_010520	TAT	2	6	3450	3455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170759251
65	NC_010520	ATA	2	6	3472	3477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759251
66	NC_010520	ATG	2	6	3547	3552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170759251
67	NC_010520	ATT	2	6	3618	3623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170759251
68	NC_010520	AAG	2	6	3639	3644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170759251
69	NC_010520	AGA	2	6	3659	3664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170759251
70	NC_010520	GAT	2	6	3792	3797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170759251
71	NC_010520	ACA	2	6	3848	3853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170759251
72	NC_010520	CAT	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170759251
73	NC_010520	ATA	2	6	3894	3899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759251
74	NC_010520	GAT	2	6	3936	3941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170759251
75	NC_010520	TAA	2	6	4009	4014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759251
76	NC_010520	AGA	2	6	4028	4033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170759251
77	NC_010520	TAA	2	6	4079	4084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759251
78	NC_010520	TTC	2	6	4131	4136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170760277
79	NC_010520	GTA	3	9	4151	4159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760277
80	NC_010520	TTG	2	6	4254	4259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170760277
81	NC_010520	ATG	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760652
82	NC_010520	TCA	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170760652
83	NC_010520	ATA	2	6	4550	4555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760652
84	NC_010520	GAT	2	6	4633	4638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760652
85	NC_010520	CTG	2	6	4682	4687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170760652
86	NC_010520	TAA	2	6	4694	4699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760652
87	NC_010520	TGG	3	9	4728	4736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170760652
88	NC_010520	TGG	2	6	4752	4757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170760652
89	NC_010520	TGT	2	6	4779	4784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170760652
90	NC_010520	AGA	2	6	4819	4824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760652
91	NC_010520	TGA	2	6	4944	4949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760652
92	NC_010520	CAA	2	6	5125	5130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170760652
93	NC_010520	CAG	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170760652
94	NC_010520	TAG	2	6	5468	5473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760652
95	NC_010520	ATA	2	6	5521	5526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760652
96	NC_010520	AGA	2	6	5590	5595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760652
97	NC_010520	TTC	2	6	5643	5648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170760652
98	NC_010520	CAT	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170760652
99	NC_010520	GAA	2	6	5717	5722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760652
100	NC_010520	ATA	2	6	5879	5884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760652
101	NC_010520	AAT	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760652
102	NC_010520	ACC	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170760652
103	NC_010520	ATT	2	6	6075	6080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170760652
104	NC_010520	AAC	2	6	6149	6154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170760652
105	NC_010520	TAC	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170760652
106	NC_010520	ATT	2	6	6189	6194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170760652
107	NC_010520	GGC	2	6	6219	6224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170760652
108	NC_010520	AAG	2	6	6267	6272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760652
109	NC_010520	AGA	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760652
110	NC_010520	GGT	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170760652
111	NC_010520	AGA	2	6	6479	6484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170758200
112	NC_010520	ATA	2	6	6485	6490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758200
113	NC_010520	ATC	2	6	6573	6578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170758200
114	NC_010520	CAG	2	6	6591	6596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170758200
115	NC_010520	TAG	2	6	6648	6653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170758200
116	NC_010520	GAA	4	12	6797	6808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170758200
117	NC_010520	CTA	2	6	6879	6884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170758200
118	NC_010520	CCA	2	6	6890	6895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170758200
119	NC_010520	AAT	3	9	6922	6930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758200
120	NC_010520	TAA	2	6	7141	7146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758200
121	NC_010520	TAA	2	6	7351	7356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758200
122	NC_010520	ATT	2	6	7395	7400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170758200
123	NC_010520	TAA	2	6	7419	7424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758200
124	NC_010520	GAA	3	9	7425	7433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170758200
125	NC_010520	TGA	2	6	7507	7512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170758200
126	NC_010520	ATC	2	6	7531	7536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170758200
127	NC_010520	AAG	2	6	7557	7562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170758200
128	NC_010520	AGA	3	9	7657	7665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170758200
129	NC_010520	AGA	2	6	7717	7722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170758200
130	NC_010520	TAA	2	6	7737	7742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758200
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132	NC_010520	AGA	2	6	7784	7789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170758200
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259	NC_010520	AAT	2	6	20231	20236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760698
260	NC_010520	GAT	2	6	20313	20318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760698
261	NC_010520	ATG	2	6	20347	20352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760698
262	NC_010520	GAT	2	6	20367	20372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760698
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