MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra chromosome

Total Repeats: 89146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010516	A	7	7	92365	92371	100 %	0 %	0 %	0 %	170756863
1502	NC_010516	GGC	2	6	92373	92378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170756863
1503	NC_010516	TA	3	6	92404	92409	50 %	50 %	0 %	0 %	170756863
1504	NC_010516	ATG	2	6	92413	92418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756863
1505	NC_010516	ATA	2	6	92422	92427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756863
1506	NC_010516	ATGGA	2	10	92455	92464	40 %	20 %	40 %	0 %	170756863
1507	NC_010516	ATAA	2	8	92465	92472	75 %	25 %	0 %	0 %	170756863
1508	NC_010516	AGGA	2	8	92501	92508	50 %	0 %	50 %	0 %	170754439
1509	NC_010516	AGA	2	6	92577	92582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170754439
1510	NC_010516	AGC	2	6	92595	92600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170754439
1511	NC_010516	ATT	2	6	92625	92630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170754439
1512	NC_010516	A	8	8	92646	92653	100 %	0 %	0 %	0 %	170754439
1513	NC_010516	GAA	2	6	92680	92685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170754439
1514	NC_010516	ATA	2	6	92701	92706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170754439
1515	NC_010516	A	6	6	92724	92729	100 %	0 %	0 %	0 %	170754439
1516	NC_010516	A	7	7	92790	92796	100 %	0 %	0 %	0 %	170754439
1517	NC_010516	AGA	2	6	92802	92807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170754439
1518	NC_010516	ATA	2	6	92812	92817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170754439
1519	NC_010516	TAC	2	6	92847	92852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170754439
1520	NC_010516	TAC	2	6	92877	92882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170754439
1521	NC_010516	AAAATA	2	12	92915	92926	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170754439
1522	NC_010516	AGGAT	2	10	92951	92960	40 %	20 %	40 %	0 %	170754439
1523	NC_010516	T	6	6	92972	92977	0 %	100 %	0 %	0 %	170754439
1524	NC_010516	AT	3	6	93041	93046	50 %	50 %	0 %	0 %	170754439
1525	NC_010516	GAA	2	6	93076	93081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170754439
1526	NC_010516	AGA	2	6	93099	93104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170754439
1527	NC_010516	CAA	2	6	93127	93132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170754439
1528	NC_010516	GTTTTA	2	12	93148	93159	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	170754439
1529	NC_010516	AGA	2	6	93174	93179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170754439
1530	NC_010516	GAAAAG	2	12	93184	93195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170754439
1531	NC_010516	AATATA	2	12	93211	93222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170754439
1532	NC_010516	A	6	6	93234	93239	100 %	0 %	0 %	0 %	170754439
1533	NC_010516	TA	3	6	93241	93246	50 %	50 %	0 %	0 %	170754439
1534	NC_010516	A	6	6	93262	93267	100 %	0 %	0 %	0 %	170754439
1535	NC_010516	TAG	2	6	93281	93286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170754439
1536	NC_010516	TA	3	6	93317	93322	50 %	50 %	0 %	0 %	170754439
1537	NC_010516	AT	3	6	93335	93340	50 %	50 %	0 %	0 %	170754439
1538	NC_010516	GCA	2	6	93567	93572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170755254
1539	NC_010516	GAA	2	6	93612	93617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170755254
1540	NC_010516	A	6	6	93616	93621	100 %	0 %	0 %	0 %	170755254
1541	NC_010516	AGA	2	6	93665	93670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170755254
1542	NC_010516	TAA	3	9	93671	93679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755254
1543	NC_010516	AGA	2	6	93698	93703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170755254
1544	NC_010516	ATTT	2	8	93763	93770	25 %	75 %	0 %	0 %	170755254
1545	NC_010516	TAA	2	6	93853	93858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755254
1546	NC_010516	A	7	7	93923	93929	100 %	0 %	0 %	0 %	170755254
1547	NC_010516	GAA	2	6	93930	93935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170755254
1548	NC_010516	AAAGA	2	10	93939	93948	80 %	0 %	20 %	0 %	170755254
1549	NC_010516	AAGAA	2	10	94064	94073	80 %	0 %	20 %	0 %	170755254
1550	NC_010516	GAAA	2	8	94077	94084	75 %	0 %	25 %	0 %	170755254
1551	NC_010516	AGC	2	6	94085	94090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170755254
1552	NC_010516	AGC	2	6	94094	94099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170755254
1553	NC_010516	GCT	2	6	94110	94115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170755254
1554	NC_010516	GA	3	6	94116	94121	50 %	0 %	50 %	0 %	170755254
1555	NC_010516	ATCACA	2	12	94127	94138	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	170755254
1556	NC_010516	TCA	2	6	94194	94199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170755254
1557	NC_010516	AGT	4	12	94203	94214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755254
1558	NC_010516	TTC	2	6	94220	94225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170755254
1559	NC_010516	TAA	2	6	94235	94240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755254
1560	NC_010516	CAC	2	6	94255	94260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170755254
1561	NC_010516	GTA	2	6	94278	94283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755254
1562	NC_010516	G	8	8	94321	94328	0 %	0 %	100 %	0 %	170755254
1563	NC_010516	TA	3	6	94372	94377	50 %	50 %	0 %	0 %	170755254
1564	NC_010516	TGC	2	6	94382	94387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170755254
1565	NC_010516	TA	5	10	94499	94508	50 %	50 %	0 %	0 %	170755254
1566	NC_010516	GGA	2	6	94512	94517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170755254
1567	NC_010516	CTC	2	6	94531	94536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170755254
1568	NC_010516	GTA	2	6	94548	94553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755254
1569	NC_010516	TTC	2	6	94559	94564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170755254
1570	NC_010516	GTAAGA	2	12	94587	94598	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170755254
1571	NC_010516	TAAT	2	8	94599	94606	50 %	50 %	0 %	0 %	170755254
1572	NC_010516	ATT	2	6	94700	94705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170756510
1573	NC_010516	CTT	2	6	94876	94881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170756510
1574	NC_010516	TTC	2	6	94901	94906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170756510
1575	NC_010516	AT	3	6	94945	94950	50 %	50 %	0 %	0 %	170756510
1576	NC_010516	A	6	6	95772	95777	100 %	0 %	0 %	0 %	170755541
1577	NC_010516	TA	3	6	95783	95788	50 %	50 %	0 %	0 %	170755541
1578	NC_010516	TAA	2	6	95812	95817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755541
1579	NC_010516	TAG	2	6	95823	95828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755541
1580	NC_010516	ATT	2	6	95877	95882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170755541
1581	NC_010516	ATA	2	6	95916	95921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755541
1582	NC_010516	AG	3	6	95976	95981	50 %	0 %	50 %	0 %	170755541
1583	NC_010516	TTAC	2	8	96035	96042	25 %	50 %	0 %	25 %	170755541
1584	NC_010516	GAG	2	6	96047	96052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170755541
1585	NC_010516	A	6	6	96055	96060	100 %	0 %	0 %	0 %	170755541
1586	NC_010516	TGA	2	6	96100	96105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755541
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1588	NC_010516	TGA	2	6	96190	96195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755541
1589	NC_010516	ATA	2	6	96212	96217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755541
1590	NC_010516	TGA	2	6	96238	96243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755541
1591	NC_010516	A	7	7	96304	96310	100 %	0 %	0 %	0 %	170755541
1592	NC_010516	A	7	7	96317	96323	100 %	0 %	0 %	0 %	170755541
1593	NC_010516	AATA	2	8	96360	96367	75 %	25 %	0 %	0 %	170755541
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1596	NC_010516	TTA	2	6	96900	96905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170756148
1597	NC_010516	TGA	2	6	96908	96913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756148
1598	NC_010516	AAG	2	6	96937	96942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756148
1599	NC_010516	AAG	2	6	96968	96973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756148
1600	NC_010516	AGA	2	6	96998	97003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756148
1601	NC_010516	AGC	2	6	97007	97012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170756148
1602	NC_010516	AAAG	2	8	97065	97072	75 %	0 %	25 %	0 %	170756148
1603	NC_010516	A	6	6	97099	97104	100 %	0 %	0 %	0 %	170756148
1604	NC_010516	A	7	7	97106	97112	100 %	0 %	0 %	0 %	170756148
1605	NC_010516	GAAA	2	8	97127	97134	75 %	0 %	25 %	0 %	170756148
1606	NC_010516	GAA	2	6	97200	97205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756148
1607	NC_010516	T	6	6	97211	97216	0 %	100 %	0 %	0 %	170756148
1608	NC_010516	AAG	3	9	97307	97315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756148
1609	NC_010516	AT	3	6	97334	97339	50 %	50 %	0 %	0 %	170756148
1610	NC_010516	ATC	2	6	97348	97353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170756148
1611	NC_010516	AGTT	2	8	97426	97433	25 %	50 %	25 %	0 %	170756148
1612	NC_010516	TGA	2	6	97439	97444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756148
1613	NC_010516	TAT	2	6	97540	97545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170756148
1614	NC_010516	ATG	2	6	97669	97674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756148
1615	NC_010516	A	6	6	97675	97680	100 %	0 %	0 %	0 %	170756148
1616	NC_010516	AGAT	2	8	97705	97712	50 %	25 %	25 %	0 %	170756148
1617	NC_010516	ATG	2	6	97810	97815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756148
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1619	NC_010516	AAT	2	6	97896	97901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756148
1620	NC_010516	ATGT	2	8	97958	97965	25 %	50 %	25 %	0 %	170756148
1621	NC_010516	TTTA	2	8	97973	97980	25 %	75 %	0 %	0 %	170756148
1622	NC_010516	TAAA	2	8	97991	97998	75 %	25 %	0 %	0 %	170756148
1623	NC_010516	CTT	3	9	98118	98126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170757729
1624	NC_010516	CTC	2	6	98146	98151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170757729
1625	NC_010516	GTA	2	6	98153	98158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170757729
1626	NC_010516	ATT	2	6	98176	98181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757729
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