MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C chromosome

Total Repeats: 32220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010424	AAT	2	6	117	122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830220
2	NC_010424	GCA	2	6	132	137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830220
3	NC_010424	ACT	2	6	182	187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830220
4	NC_010424	CAA	2	6	219	224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169830220
5	NC_010424	CTT	2	6	289	294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830220
6	NC_010424	CAT	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830220
7	NC_010424	CGA	2	6	729	734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830220
8	NC_010424	GAA	2	6	769	774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830220
9	NC_010424	TTC	2	6	775	780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830220
10	NC_010424	GCC	2	6	837	842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830220
11	NC_010424	GGA	2	6	861	866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830220
12	NC_010424	GAA	2	6	964	969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830220
13	NC_010424	GCC	2	6	1131	1136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830220
14	NC_010424	GTG	2	6	1177	1182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830220
15	NC_010424	AAG	2	6	1222	1227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830220
16	NC_010424	ACC	2	6	1336	1341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830220
17	NC_010424	AAT	2	6	1401	1406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830220
18	NC_010424	ACC	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830221
19	NC_010424	CCT	2	6	1605	1610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169830221
20	NC_010424	CAC	2	6	1620	1625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830221
21	NC_010424	GCC	2	6	1660	1665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830221
22	NC_010424	GCA	2	6	1730	1735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830221
23	NC_010424	AAT	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830221
24	NC_010424	CGC	2	6	1828	1833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830221
25	NC_010424	ACC	2	6	1865	1870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830221
26	NC_010424	GCC	2	6	1930	1935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830221
27	NC_010424	CGA	2	6	2118	2123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830221
28	NC_010424	TGC	2	6	2429	2434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830221
29	NC_010424	GAA	2	6	2614	2619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830221
30	NC_010424	AGG	2	6	2747	2752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830221
31	NC_010424	CGG	2	6	2822	2827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830222
32	NC_010424	CGG	2	6	3026	3031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830222
33	NC_010424	GAC	2	6	3112	3117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830222
34	NC_010424	TCA	2	6	3125	3130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830222
35	NC_010424	GCC	2	6	3149	3154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830222
36	NC_010424	CGG	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830222
37	NC_010424	GTG	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830222
38	NC_010424	TGC	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830222
39	NC_010424	GAA	2	6	3400	3405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830222
40	NC_010424	GCC	2	6	3487	3492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830222
41	NC_010424	GAC	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830222
42	NC_010424	CAG	2	6	3601	3606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830222
43	NC_010424	CGA	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830222
44	NC_010424	TGT	2	6	3695	3700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169830222
45	NC_010424	ACG	2	6	3749	3754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830222
46	NC_010424	ACC	2	6	3769	3774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830222
47	NC_010424	AGG	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830222
48	NC_010424	TGA	2	6	3872	3877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169830223
49	NC_010424	CAT	2	6	3891	3896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830223
50	NC_010424	TGG	2	6	3923	3928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830223
51	NC_010424	TGG	2	6	3971	3976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830223
52	NC_010424	GAG	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830223
53	NC_010424	CAC	2	6	4017	4022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830223
54	NC_010424	CAC	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830224
55	NC_010424	GGT	2	6	4326	4331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830224
56	NC_010424	ACA	2	6	4334	4339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169830224
57	NC_010424	CGA	2	6	4344	4349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830224
58	NC_010424	GGT	2	6	4380	4385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830224
59	NC_010424	CGG	2	6	4500	4505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
60	NC_010424	CGG	2	6	4512	4517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
61	NC_010424	CGG	2	6	4536	4541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
62	NC_010424	GTG	2	6	4564	4569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830224
63	NC_010424	GAA	2	6	4729	4734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830224
64	NC_010424	ACG	2	6	4748	4753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830224
65	NC_010424	CGA	2	6	4815	4820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830224
66	NC_010424	TTC	2	6	4901	4906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830224
67	NC_010424	CGG	2	6	5031	5036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
68	NC_010424	GCG	2	6	5126	5131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
69	NC_010424	TGG	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830224
70	NC_010424	GTG	2	6	5248	5253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830224
71	NC_010424	GCC	2	6	5266	5271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830224
72	NC_010424	GAA	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830224
73	NC_010424	GGC	2	6	5343	5348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
74	NC_010424	CGG	2	6	5350	5355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
75	NC_010424	TGG	2	6	5459	5464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830224
76	NC_010424	CCG	2	6	5562	5567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830224
77	NC_010424	ACC	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830224
78	NC_010424	ACC	2	6	5784	5789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830224
79	NC_010424	CAG	2	6	5845	5850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830224
80	NC_010424	TTC	2	6	5860	5865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830224
81	NC_010424	GGC	2	6	5876	5881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
82	NC_010424	ACC	2	6	5944	5949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830224
83	NC_010424	GGA	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830224
84	NC_010424	GGC	2	6	6000	6005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830224
85	NC_010424	AGC	2	6	6008	6013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830224
86	NC_010424	GCA	2	6	6066	6071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830224
87	NC_010424	TCC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169830225
88	NC_010424	GAA	2	6	6223	6228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830225
89	NC_010424	ACT	3	9	6234	6242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830225
90	NC_010424	TGG	2	6	6366	6371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830225
91	NC_010424	CAC	2	6	6520	6525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830225
92	NC_010424	CGG	2	6	6526	6531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830225
93	NC_010424	CCG	2	6	6543	6548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830225
94	NC_010424	CGG	2	6	6568	6573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830225
95	NC_010424	GGT	2	6	6577	6582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830225
96	NC_010424	GGT	2	6	7128	7133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830226
97	NC_010424	ATG	2	6	7207	7212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169830226
98	NC_010424	GCG	2	6	7218	7223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830226
99	NC_010424	AGC	2	6	7237	7242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830226
100	NC_010424	GAA	2	6	7494	7499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830227
101	NC_010424	CGG	2	6	7587	7592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830227
102	NC_010424	GCC	2	6	7698	7703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830227
103	NC_010424	ACG	2	6	7708	7713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830227
104	NC_010424	ACG	2	6	7897	7902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830227
105	NC_010424	GAG	2	6	7911	7916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830227
106	NC_010424	GTG	2	6	7920	7925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830227
107	NC_010424	CCT	2	6	7946	7951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169830227
108	NC_010424	CCA	2	6	7987	7992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830227
109	NC_010424	ACC	2	6	8047	8052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830227
110	NC_010424	TGG	2	6	8263	8268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830227
111	NC_010424	CGC	2	6	8276	8281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830227
112	NC_010424	GAA	2	6	8294	8299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830227
113	NC_010424	GCG	2	6	8366	8371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830227
114	NC_010424	CTG	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830227
115	NC_010424	TGG	2	6	8455	8460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830227
116	NC_010424	TCA	2	6	8527	8532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830227
117	NC_010424	CGG	2	6	8535	8540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830227
118	NC_010424	TCG	2	6	8581	8586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830227
119	NC_010424	CGA	2	6	8615	8620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830227
120	NC_010424	CCG	2	6	8636	8641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830227
121	NC_010424	TGG	2	6	8785	8790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830227
122	NC_010424	CGA	2	6	8822	8827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830227
123	NC_010424	CCG	2	6	8891	8896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830227
124	NC_010424	TGG	2	6	8905	8910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830227
125	NC_010424	AGG	2	6	8950	8955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830227
126	NC_010424	ATC	2	6	8964	8969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830227
127	NC_010424	ACG	2	6	8977	8982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830227
128	NC_010424	GCC	2	6	8999	9004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830227
129	NC_010424	GGC	2	6	9030	9035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830227
130	NC_010424	TCG	2	6	9088	9093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830227
131	NC_010424	CCT	2	6	9110	9115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169830227
132	NC_010424	TTC	2	6	9117	9122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830227
133	NC_010424	CCG	2	6	9193	9198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830227
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135	NC_010424	TGC	2	6	9319	9324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830227
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140	NC_010424	TGG	2	6	9577	9582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830227
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143	NC_010424	GAA	2	6	9720	9725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830227
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147	NC_010424	AAG	2	6	9889	9894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830227
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253	NC_010424	AAC	2	6	17442	17447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169830233
254	NC_010424	CGA	2	6	17773	17778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830234
255	NC_010424	CGG	2	6	17782	17787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830234
256	NC_010424	TCA	2	6	17789	17794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830234
257	NC_010424	GAG	2	6	17907	17912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830234
258	NC_010424	CCA	3	9	17933	17941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830234
259	NC_010424	TCC	2	6	17956	17961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169830234
260	NC_010424	GGT	2	6	18013	18018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830234
261	NC_010424	CGG	2	6	18118	18123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830234
262	NC_010424	ACC	2	6	18125	18130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830234
263	NC_010424	GGC	2	6	18192	18197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830234
264	NC_010424	TAA	2	6	18232	18237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830234
265	NC_010424	CAT	2	6	18266	18271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830234
266	NC_010424	GCC	2	6	18307	18312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830234
267	NC_010424	GGA	2	6	18467	18472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830234
268	NC_010424	GGC	2	6	18624	18629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830234
269	NC_010424	CGT	2	6	18698	18703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830234
270	NC_010424	CAG	2	6	18720	18725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830234
271	NC_010424	ACC	2	6	18952	18957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830234
272	NC_010424	CGG	2	6	19211	19216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830234
273	NC_010424	AGT	2	6	19361	19366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169830234
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275	NC_010424	ATC	2	6	19539	19544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830234
276	NC_010424	GAG	2	6	19650	19655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830234
277	NC_010424	GGA	2	6	19675	19680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830234
278	NC_010424	ATC	2	6	19794	19799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830234
279	NC_010424	CTT	2	6	19877	19882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830234
280	NC_010424	CGC	2	6	19916	19921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830234
281	NC_010424	GGA	2	6	20026	20031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830234
282	NC_010424	GGA	3	9	20072	20080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830234
283	NC_010424	AAT	2	6	20692	20697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830235
284	NC_010424	CAT	2	6	20766	20771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830235
285	NC_010424	GAA	2	6	20791	20796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830235
286	NC_010424	GGA	2	6	20814	20819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830235
287	NC_010424	TTG	2	6	20858	20863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169830235
288	NC_010424	ACC	2	6	20950	20955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830235
289	NC_010424	TTC	3	9	21001	21009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830235
290	NC_010424	CTG	2	6	21114	21119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830235
291	NC_010424	TGA	2	6	21164	21169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169830235
292	NC_010424	GAA	2	6	21199	21204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830235
293	NC_010424	GCC	2	6	21252	21257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830235
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301	NC_010424	AAT	2	6	22206	22211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169830236
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304	NC_010424	CGG	2	6	22527	22532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830237
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326	NC_010424	GGT	2	6	23774	23779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830238
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365	NC_010424	GGA	2	6	26639	26644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830241
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368	NC_010424	CCA	2	6	26876	26881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830241
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372	NC_010424	CAT	2	6	27463	27468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830242
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374	NC_010424	TTC	2	6	27758	27763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830242
375	NC_010424	TCC	2	6	27814	27819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169830242
376	NC_010424	TGA	2	6	27929	27934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169830242
377	NC_010424	CTG	3	9	28015	28023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830242
378	NC_010424	TGA	2	6	28046	28051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169830242
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385	NC_010424	CTG	2	6	28357	28362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830242
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