MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK

Total Repeats: 6592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010418	ATTT	2	8	17201	17208	25 %	75 %	0 %	0 %	169834988
502	NC_010418	A	6	6	17212	17217	100 %	0 %	0 %	0 %	169834988
503	NC_010418	TCT	2	6	17266	17271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834988
504	NC_010418	TTA	2	6	17279	17284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834988
505	NC_010418	TCG	2	6	17323	17328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834988
506	NC_010418	T	6	6	17347	17352	0 %	100 %	0 %	0 %	169834988
507	NC_010418	TCC	2	6	17388	17393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834988
508	NC_010418	TTA	2	6	17410	17415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834988
509	NC_010418	TTAT	2	8	17425	17432	25 %	75 %	0 %	0 %	169834988
510	NC_010418	T	6	6	17459	17464	0 %	100 %	0 %	0 %	169834988
511	NC_010418	ATTA	2	8	17535	17542	50 %	50 %	0 %	0 %	169834988
512	NC_010418	CT	3	6	17588	17593	0 %	50 %	0 %	50 %	169834988
513	NC_010418	AAT	2	6	17637	17642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834988
514	NC_010418	GTT	2	6	17689	17694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834988
515	NC_010418	ATT	2	6	17733	17738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834988
516	NC_010418	T	7	7	17780	17786	0 %	100 %	0 %	0 %	169834988
517	NC_010418	AT	4	8	17849	17856	50 %	50 %	0 %	0 %	169834918
518	NC_010418	ATA	2	6	17966	17971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834918
519	NC_010418	T	6	6	17993	17998	0 %	100 %	0 %	0 %	169834918
520	NC_010418	T	7	7	18018	18024	0 %	100 %	0 %	0 %	169834918
521	NC_010418	TAT	2	6	18047	18052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834918
522	NC_010418	TATT	2	8	18083	18090	25 %	75 %	0 %	0 %	169834918
523	NC_010418	TAT	2	6	18095	18100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834918
524	NC_010418	TTTA	2	8	18138	18145	25 %	75 %	0 %	0 %	169834918
525	NC_010418	AT	3	6	18158	18163	50 %	50 %	0 %	0 %	169834918
526	NC_010418	T	6	6	18284	18289	0 %	100 %	0 %	0 %	169835045
527	NC_010418	TTA	2	6	18338	18343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169835045
528	NC_010418	TTTCTT	2	12	18398	18409	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	169835045
529	NC_010418	T	6	6	18421	18426	0 %	100 %	0 %	0 %	169835045
530	NC_010418	TTC	2	6	18441	18446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169835045
531	NC_010418	TAA	2	6	18456	18461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169835045
532	NC_010418	TTC	2	6	18470	18475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169835045
533	NC_010418	ACT	2	6	18495	18500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169835045
534	NC_010418	ATA	2	6	18563	18568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169835045
535	NC_010418	ATC	2	6	18621	18626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169835045
536	NC_010418	TAT	2	6	18654	18659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169835045
537	NC_010418	ATA	2	6	18688	18693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169835045
538	NC_010418	ATTT	2	8	18725	18732	25 %	75 %	0 %	0 %	169835045
539	NC_010418	TCT	2	6	18739	18744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169835045
540	NC_010418	ATC	2	6	18750	18755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169835045
541	NC_010418	AT	3	6	18803	18808	50 %	50 %	0 %	0 %	169835045
542	NC_010418	AT	3	6	18875	18880	50 %	50 %	0 %	0 %	169835045
543	NC_010418	TGCTT	2	10	18889	18898	0 %	60 %	20 %	20 %	169835045
544	NC_010418	TAA	2	6	18900	18905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169835045
545	NC_010418	ATT	2	6	18946	18951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169835045
546	NC_010418	TCC	2	6	19012	19017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169835045
547	NC_010418	CTG	2	6	19190	19195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169835045
548	NC_010418	AAT	2	6	19227	19232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169835045
549	NC_010418	CTT	2	6	19298	19303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169835045
550	NC_010418	TTA	2	6	19313	19318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169835045
551	NC_010418	TCT	2	6	19366	19371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169835045
552	NC_010418	TTA	2	6	19429	19434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169835045
553	NC_010418	TTC	2	6	19497	19502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169835045
554	NC_010418	TTTTA	2	10	19524	19533	20 %	80 %	0 %	0 %	169835045
555	NC_010418	GTC	2	6	19542	19547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169835045
556	NC_010418	T	7	7	19586	19592	0 %	100 %	0 %	0 %	169835045
557	NC_010418	TGT	2	6	19599	19604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169835045
558	NC_010418	T	7	7	19623	19629	0 %	100 %	0 %	0 %	169835045
559	NC_010418	TTA	2	6	19649	19654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169835045
560	NC_010418	GATAT	2	10	19673	19682	40 %	40 %	20 %	0 %	169835045
561	NC_010418	AT	4	8	19679	19686	50 %	50 %	0 %	0 %	169835045
562	NC_010418	AAT	2	6	19798	19803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169835045
563	NC_010418	ATT	2	6	19821	19826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169835045
564	NC_010418	GTT	2	6	19841	19846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169835045
565	NC_010418	AT	4	8	19929	19936	50 %	50 %	0 %	0 %	169835045
566	NC_010418	TA	3	6	19979	19984	50 %	50 %	0 %	0 %	169835045
567	NC_010418	ACA	2	6	20026	20031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169835045
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569	NC_010418	AGA	3	9	20229	20237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169835045
570	NC_010418	T	7	7	20241	20247	0 %	100 %	0 %	0 %	169835045
571	NC_010418	T	6	6	20273	20278	0 %	100 %	0 %	0 %	169835045
572	NC_010418	TACT	2	8	20291	20298	25 %	50 %	0 %	25 %	169835045
573	NC_010418	TCT	3	9	20302	20310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169835045
574	NC_010418	AT	3	6	20359	20364	50 %	50 %	0 %	0 %	169835045
575	NC_010418	TC	3	6	20377	20382	0 %	50 %	0 %	50 %	169835045
576	NC_010418	TAT	3	9	20415	20423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169835045
577	NC_010418	TAAT	2	8	20453	20460	50 %	50 %	0 %	0 %	169835045
578	NC_010418	T	6	6	20460	20465	0 %	100 %	0 %	0 %	169835045
579	NC_010418	ATA	2	6	20522	20527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169835045
580	NC_010418	CT	3	6	20535	20540	0 %	50 %	0 %	50 %	169835045
581	NC_010418	GAT	2	6	20564	20569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169835045
582	NC_010418	TTAT	2	8	20590	20597	25 %	75 %	0 %	0 %	169835045
583	NC_010418	ATG	2	6	20642	20647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169835045
584	NC_010418	T	6	6	20659	20664	0 %	100 %	0 %	0 %	169835045
585	NC_010418	TAT	2	6	20804	20809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834732
586	NC_010418	TAT	2	6	20842	20847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834732
587	NC_010418	ACC	2	6	20868	20873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834732
588	NC_010418	TTCCA	2	10	20913	20922	20 %	40 %	0 %	40 %	169834732
589	NC_010418	CAA	2	6	21492	21497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834821
590	NC_010418	TGA	2	6	21498	21503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834821
591	NC_010418	ATTG	2	8	21536	21543	25 %	50 %	25 %	0 %	169834821
592	NC_010418	GAT	2	6	21584	21589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834821
593	NC_010418	AAC	2	6	21609	21614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834821
594	NC_010418	TAT	2	6	21629	21634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834821
595	NC_010418	TTC	2	6	21639	21644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834821
596	NC_010418	TTC	2	6	21653	21658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834821
597	NC_010418	ATT	2	6	21681	21686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834821
598	NC_010418	TCT	2	6	21703	21708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834821
599	NC_010418	T	7	7	21752	21758	0 %	100 %	0 %	0 %	169834821
600	NC_010418	TAT	2	6	21777	21782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834821
601	NC_010418	CTG	2	6	21818	21823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834821
602	NC_010418	ACT	2	6	21826	21831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834821
603	NC_010418	CTTT	2	8	21843	21850	0 %	75 %	0 %	25 %	169834821
604	NC_010418	TTA	2	6	21922	21927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834821
605	NC_010418	TCT	2	6	22024	22029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834821
606	NC_010418	TTGCT	2	10	22104	22113	0 %	60 %	20 %	20 %	169834821
607	NC_010418	T	7	7	22122	22128	0 %	100 %	0 %	0 %	169834821
608	NC_010418	TCT	2	6	22153	22158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834821
609	NC_010418	AGA	2	6	22187	22192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834821
610	NC_010418	AGT	2	6	22208	22213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834821
611	NC_010418	TACT	2	8	22235	22242	25 %	50 %	0 %	25 %	169834821
612	NC_010418	AGCT	2	8	22244	22251	25 %	25 %	25 %	25 %	169834821
613	NC_010418	CTA	2	6	22255	22260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834821
614	NC_010418	TAATA	2	10	22289	22298	60 %	40 %	0 %	0 %	169834821
615	NC_010418	CTT	2	6	22301	22306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834821
616	NC_010418	TTA	2	6	22325	22330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834821
617	NC_010418	AT	3	6	22361	22366	50 %	50 %	0 %	0 %	169834821
618	NC_010418	TAA	2	6	22420	22425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834821
619	NC_010418	TAT	2	6	22433	22438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834821
620	NC_010418	AT	3	6	22465	22470	50 %	50 %	0 %	0 %	169834821
621	NC_010418	ACAAA	2	10	22478	22487	80 %	0 %	0 %	20 %	169834821
622	NC_010418	AT	3	6	22494	22499	50 %	50 %	0 %	0 %	169834821
623	NC_010418	CTT	2	6	22520	22525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834821
624	NC_010418	ATC	2	6	22533	22538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834821
625	NC_010418	ACTAGA	2	12	22623	22634	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	169834821
626	NC_010418	ATT	3	9	22659	22667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834821
627	NC_010418	TAT	2	6	22679	22684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834821
628	NC_010418	ACA	2	6	22690	22695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834821
629	NC_010418	AAT	2	6	22707	22712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834821
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631	NC_010418	TA	3	6	22760	22765	50 %	50 %	0 %	0 %	169834821
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