MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus plasmid pCSL1

Total Repeats: 1926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010408	CGG	2	6	50652	50657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016759
1002	NC_010408	GTA	2	6	50695	50700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016759
1003	NC_010408	CGC	2	6	50791	50796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016759
1004	NC_010408	GGCG	2	8	50821	50828	0 %	0 %	75 %	25 %	189016759
1005	NC_010408	GGCG	2	8	50839	50846	0 %	0 %	75 %	25 %	189016759
1006	NC_010408	GCT	2	6	50894	50899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016759
1007	NC_010408	AGC	2	6	50902	50907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016759
1008	NC_010408	CCG	2	6	50915	50920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016759
1009	NC_010408	CGG	2	6	50943	50948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016759
1010	NC_010408	ATC	2	6	50951	50956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016759
1011	NC_010408	GCT	3	9	50967	50975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016759
1012	NC_010408	TGG	3	9	51000	51008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016759
1013	NC_010408	CGGC	2	8	51011	51018	0 %	0 %	50 %	50 %	189016759
1014	NC_010408	GATG	2	8	51019	51026	25 %	25 %	50 %	0 %	189016759
1015	NC_010408	CGA	2	6	51078	51083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016759
1016	NC_010408	GCCG	2	8	51175	51182	0 %	0 %	50 %	50 %	189016759
1017	NC_010408	CAG	2	6	51187	51192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016759
1018	NC_010408	CGG	2	6	51195	51200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016759
1019	NC_010408	GAT	2	6	51211	51216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016759
1020	NC_010408	CGA	2	6	51219	51224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016759
1021	NC_010408	CT	3	6	51274	51279	0 %	50 %	0 %	50 %	189016760
1022	NC_010408	GGTGTT	2	12	51296	51307	0 %	50 %	50 %	0 %	189016760
1023	NC_010408	GCT	2	6	51341	51346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016760
1024	NC_010408	GCC	2	6	51380	51385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016760
1025	NC_010408	CGC	2	6	51433	51438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016760
1026	NC_010408	TCT	2	6	51448	51453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189016760
1027	NC_010408	GGAAGC	2	12	51454	51465	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	189016760
1028	NC_010408	GGC	2	6	51503	51508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016760
1029	NC_010408	CGC	2	6	51553	51558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016760
1030	NC_010408	GGA	2	6	51572	51577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016760
1031	NC_010408	TCGCGG	2	12	51583	51594	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189016760
1032	NC_010408	GCGGG	2	10	51646	51655	0 %	0 %	80 %	20 %	189016760
1033	NC_010408	GTT	2	6	51656	51661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189016760
1034	NC_010408	CGG	2	6	51716	51721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016760
1035	NC_010408	GTC	2	6	51722	51727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016760
1036	NC_010408	GCGGCC	2	12	51795	51806	0 %	0 %	50 %	50 %	189016760
1037	NC_010408	GAC	2	6	51824	51829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016760
1038	NC_010408	GCCG	2	8	51830	51837	0 %	0 %	50 %	50 %	189016760
1039	NC_010408	G	8	8	51837	51844	0 %	0 %	100 %	0 %	189016760
1040	NC_010408	CCTG	2	8	52290	52297	0 %	25 %	25 %	50 %	189016761
1041	NC_010408	GAC	2	6	52460	52465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016761
1042	NC_010408	GC	3	6	52480	52485	0 %	0 %	50 %	50 %	189016761
1043	NC_010408	CGT	3	9	52511	52519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016761
1044	NC_010408	CTT	2	6	52562	52567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189016761
1045	NC_010408	GCC	2	6	52581	52586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016761
1046	NC_010408	GATC	2	8	52627	52634	25 %	25 %	25 %	25 %	189016761
1047	NC_010408	CGG	2	6	52736	52741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016761
1048	NC_010408	CGC	2	6	52837	52842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016761
1049	NC_010408	C	6	6	52842	52847	0 %	0 %	0 %	100 %	189016761
1050	NC_010408	GAG	2	6	52862	52867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016761
1051	NC_010408	GAC	2	6	52868	52873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016761
1052	NC_010408	CGA	2	6	52891	52896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016761
1053	NC_010408	GTGC	2	8	52900	52907	0 %	25 %	50 %	25 %	189016761
1054	NC_010408	TGA	2	6	52915	52920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016761
1055	NC_010408	CGA	2	6	52953	52958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016762
1056	NC_010408	CCCGAT	2	12	52993	53004	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189016762
1057	NC_010408	GAC	3	9	53044	53052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016762
1058	NC_010408	GTT	2	6	53056	53061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189016762
1059	NC_010408	GCC	2	6	53126	53131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016762
1060	NC_010408	CGC	2	6	53173	53178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016762
1061	NC_010408	ACG	3	9	53255	53263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016762
1062	NC_010408	GAT	2	6	53269	53274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016762
1063	NC_010408	TCA	2	6	53298	53303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016762
1064	NC_010408	C	6	6	53480	53485	0 %	0 %	0 %	100 %	189016763
1065	NC_010408	GA	3	6	53490	53495	50 %	0 %	50 %	0 %	189016763
1066	NC_010408	GCAC	2	8	53529	53536	25 %	0 %	25 %	50 %	189016763
1067	NC_010408	CGC	3	9	53537	53545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016763
1068	NC_010408	CG	3	6	53593	53598	0 %	0 %	50 %	50 %	189016763
1069	NC_010408	CAGCCG	2	12	53599	53610	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189016763
1070	NC_010408	CCG	2	6	53632	53637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016763
1071	NC_010408	CCT	2	6	53716	53721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016763
1072	NC_010408	GA	3	6	53843	53848	50 %	0 %	50 %	0 %	189016764
1073	NC_010408	ACGGTG	2	12	53867	53878	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189016764
1074	NC_010408	GAGGT	2	10	53909	53918	20 %	20 %	60 %	0 %	189016764
1075	NC_010408	CGCC	2	8	53946	53953	0 %	0 %	25 %	75 %	189016764
1076	NC_010408	CGCTGT	2	12	53961	53972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016764
1077	NC_010408	GC	4	8	53984	53991	0 %	0 %	50 %	50 %	189016764
1078	NC_010408	GGC	2	6	54010	54015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016764
1079	NC_010408	GAA	2	6	54064	54069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189016764
1080	NC_010408	ATCGC	2	10	54098	54107	20 %	20 %	20 %	40 %	189016764
1081	NC_010408	CGT	2	6	54117	54122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016764
1082	NC_010408	CGAGC	2	10	54154	54163	20 %	0 %	40 %	40 %	189016764
1083	NC_010408	TGA	2	6	54168	54173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016764
1084	NC_010408	TGG	2	6	54180	54185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016764
1085	NC_010408	GAT	2	6	54242	54247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016765
1086	NC_010408	GAT	2	6	54272	54277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016765
1087	NC_010408	TCC	2	6	54333	54338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016765
1088	NC_010408	TGG	2	6	54406	54411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016765
1089	NC_010408	GGA	2	6	54442	54447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016766
1090	NC_010408	TGG	2	6	54514	54519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016766
1091	NC_010408	GCG	2	6	54528	54533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016766
1092	NC_010408	GTC	2	6	54539	54544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016766
1093	NC_010408	GCG	2	6	54546	54551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016766
1094	NC_010408	CG	3	6	54578	54583	0 %	0 %	50 %	50 %	189016766
1095	NC_010408	GACC	2	8	54598	54605	25 %	0 %	25 %	50 %	189016766
1096	NC_010408	CAT	2	6	54623	54628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016766
1097	NC_010408	GCT	2	6	54661	54666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016766
1098	NC_010408	CGG	2	6	54738	54743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016766
1099	NC_010408	CGC	2	6	54767	54772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016766
1100	NC_010408	GGT	2	6	54794	54799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016766
1101	NC_010408	GAG	2	6	54806	54811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016766
1102	NC_010408	GAG	3	9	54935	54943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016766
1103	NC_010408	GAA	3	9	54953	54961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189016766
1104	NC_010408	GAGC	2	8	54967	54974	25 %	0 %	50 %	25 %	189016766
1105	NC_010408	GGA	2	6	54988	54993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016766
1106	NC_010408	CG	3	6	55035	55040	0 %	0 %	50 %	50 %	189016766
1107	NC_010408	GAG	2	6	55064	55069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016766
1108	NC_010408	GTG	2	6	55158	55163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016766
1109	NC_010408	GCG	2	6	55173	55178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016766
1110	NC_010408	CGT	2	6	55204	55209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016766
1111	NC_010408	G	6	6	55225	55230	0 %	0 %	100 %	0 %	189016766
1112	NC_010408	GGA	2	6	55237	55242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016766
1113	NC_010408	GAG	2	6	55280	55285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016766
1114	NC_010408	GC	3	6	55309	55314	0 %	0 %	50 %	50 %	189016767
1115	NC_010408	GAT	2	6	55333	55338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016767
1116	NC_010408	GAT	2	6	55402	55407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016767
1117	NC_010408	GAC	2	6	55408	55413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016767
1118	NC_010408	ACG	2	6	55472	55477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016767
1119	NC_010408	CGA	2	6	55497	55502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016767
1120	NC_010408	GCG	2	6	55525	55530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016767
1121	NC_010408	GGC	2	6	55557	55562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016767
1122	NC_010408	GCT	2	6	55563	55568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016767
1123	NC_010408	GCC	2	6	55618	55623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016767
1124	NC_010408	GCC	2	6	55637	55642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016767
1125	NC_010408	GAC	2	6	55657	55662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016767
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1496	NC_010408	GCA	2	6	71391	71396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016783
1497	NC_010408	TCG	2	6	71420	71425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016783
1498	NC_010408	ACG	2	6	71429	71434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016783
1499	NC_010408	TCGGCG	2	12	71447	71458	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189016783
1500	NC_010408	TGC	2	6	71501	71506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016783

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