MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus plasmid pCSL1

Total Repeats: 1926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010408	GAC	2	6	29300	29305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016733
502	NC_010408	ACC	2	6	29500	29505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016734
503	NC_010408	TCA	2	6	29531	29536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016734
504	NC_010408	CCG	3	9	29543	29551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016734
505	NC_010408	CGC	2	6	29563	29568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016734
506	NC_010408	CAG	2	6	29572	29577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016734
507	NC_010408	TCC	2	6	29585	29590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016734
508	NC_010408	GCG	2	6	29653	29658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016734
509	NC_010408	CGT	2	6	29700	29705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016734
510	NC_010408	GGA	2	6	29721	29726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016734
511	NC_010408	GCT	2	6	29727	29732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016734
512	NC_010408	CCG	2	6	29753	29758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016734
513	NC_010408	CTC	2	6	29791	29796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016734
514	NC_010408	AACGC	2	10	29801	29810	40 %	0 %	20 %	40 %	189016734
515	NC_010408	CGAG	2	8	29865	29872	25 %	0 %	50 %	25 %	189016734
516	NC_010408	TC	3	6	29894	29899	0 %	50 %	0 %	50 %	189016734
517	NC_010408	TGG	2	6	30074	30079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016735
518	NC_010408	TGC	2	6	30142	30147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016735
519	NC_010408	TTC	2	6	30183	30188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189016736
520	NC_010408	CGG	2	6	30212	30217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016736
521	NC_010408	CG	4	8	30229	30236	0 %	0 %	50 %	50 %	189016736
522	NC_010408	GCC	2	6	30252	30257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016736
523	NC_010408	TCA	2	6	30279	30284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016736
524	NC_010408	TCC	2	6	30285	30290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016736
525	NC_010408	CATC	2	8	30316	30323	25 %	25 %	0 %	50 %	189016736
526	NC_010408	GCG	2	6	30411	30416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016736
527	NC_010408	GC	3	6	30420	30425	0 %	0 %	50 %	50 %	189016736
528	NC_010408	CCA	2	6	30472	30477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016736
529	NC_010408	CAC	2	6	30482	30487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016736
530	NC_010408	GCC	2	6	30501	30506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016736
531	NC_010408	CAT	2	6	30542	30547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016736
532	NC_010408	TCGT	2	8	30585	30592	0 %	50 %	25 %	25 %	189016736
533	NC_010408	CAA	2	6	30662	30667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189016736
534	NC_010408	CGA	2	6	30722	30727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016737
535	NC_010408	GTT	2	6	30780	30785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189016737
536	NC_010408	GCC	2	6	30823	30828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016737
537	NC_010408	TGGGG	2	10	30845	30854	0 %	20 %	80 %	0 %	189016737
538	NC_010408	CTG	3	9	30915	30923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016737
539	NC_010408	CGGTG	2	10	30951	30960	0 %	20 %	60 %	20 %	189016737
540	NC_010408	GTC	2	6	30966	30971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016737
541	NC_010408	CGGT	2	8	30977	30984	0 %	25 %	50 %	25 %	189016737
542	NC_010408	GCC	2	6	31023	31028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016737
543	NC_010408	CGG	2	6	31049	31054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016737
544	NC_010408	GTT	2	6	31071	31076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189016737
545	NC_010408	GCG	2	6	31094	31099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016737
546	NC_010408	GAA	2	6	31110	31115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189016737
547	NC_010408	AGC	2	6	31177	31182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016737
548	NC_010408	CCG	2	6	31226	31231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016737
549	NC_010408	GAG	2	6	31259	31264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016737
550	NC_010408	GC	3	6	31343	31348	0 %	0 %	50 %	50 %	189016737
551	NC_010408	CGG	2	6	31361	31366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016737
552	NC_010408	GAG	2	6	31404	31409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016737
553	NC_010408	CG	3	6	31453	31458	0 %	0 %	50 %	50 %	189016737
554	NC_010408	CCT	2	6	31463	31468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016737
555	NC_010408	TCG	2	6	31486	31491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016737
556	NC_010408	GGCGCG	3	18	31537	31554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016737
557	NC_010408	GGC	3	9	31572	31580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016737
558	NC_010408	CG	3	6	31638	31643	0 %	0 %	50 %	50 %	189016737
559	NC_010408	CGC	2	6	31653	31658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016737
560	NC_010408	CG	3	6	31709	31714	0 %	0 %	50 %	50 %	189016737
561	NC_010408	CG	3	6	31724	31729	0 %	0 %	50 %	50 %	189016737
562	NC_010408	GGGT	2	8	31733	31740	0 %	25 %	75 %	0 %	189016737
563	NC_010408	ACCTGC	2	12	31768	31779	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189016737
564	NC_010408	TCT	3	9	31787	31795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189016737
565	NC_010408	CCA	3	9	31803	31811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016737
566	NC_010408	GAGG	2	8	31836	31843	25 %	0 %	75 %	0 %	189016737
567	NC_010408	TCT	2	6	31850	31855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189016737
568	NC_010408	GTC	2	6	31860	31865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016737
569	NC_010408	TTG	2	6	31966	31971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189016737
570	NC_010408	GC	3	6	31981	31986	0 %	0 %	50 %	50 %	189016737
571	NC_010408	CGG	2	6	32026	32031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016737
572	NC_010408	TCG	2	6	32045	32050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016737
573	NC_010408	GAT	2	6	32109	32114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016737
574	NC_010408	CGG	2	6	32137	32142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016737
575	NC_010408	GAA	2	6	32154	32159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189016737
576	NC_010408	GCG	2	6	32164	32169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016737
577	NC_010408	GC	3	6	32173	32178	0 %	0 %	50 %	50 %	189016737
578	NC_010408	TGCG	2	8	32182	32189	0 %	25 %	50 %	25 %	189016737
579	NC_010408	ATC	2	6	32215	32220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016737
580	NC_010408	CGT	2	6	32228	32233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016737
581	NC_010408	CGA	3	9	32234	32242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016737
582	NC_010408	GC	3	6	32255	32260	0 %	0 %	50 %	50 %	189016737
583	NC_010408	GC	3	6	32291	32296	0 %	0 %	50 %	50 %	189016737
584	NC_010408	GAG	2	6	32460	32465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016737
585	NC_010408	GTC	2	6	32508	32513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016737
586	NC_010408	CGG	2	6	32550	32555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016737
587	NC_010408	GAC	2	6	32628	32633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016738
588	NC_010408	GCG	2	6	32652	32657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016738
589	NC_010408	CGG	2	6	32663	32668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016738
590	NC_010408	GGC	2	6	32748	32753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016738
591	NC_010408	GAG	2	6	32754	32759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016738
592	NC_010408	GTC	2	6	32781	32786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016738
593	NC_010408	GAC	3	9	32811	32819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016738
594	NC_010408	CGG	2	6	32825	32830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016738
595	NC_010408	GGGC	2	8	32846	32853	0 %	0 %	75 %	25 %	189016738
596	NC_010408	CGG	2	6	32867	32872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016738
597	NC_010408	GAG	2	6	32904	32909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016738
598	NC_010408	CAG	2	6	32910	32915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016738
599	NC_010408	CAGG	2	8	32928	32935	25 %	0 %	50 %	25 %	189016738
600	NC_010408	GGT	2	6	32946	32951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016738
601	NC_010408	GGC	2	6	32959	32964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016738
602	NC_010408	GCC	2	6	32977	32982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016738
603	NC_010408	CGG	2	6	33055	33060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016738
604	NC_010408	GAC	2	6	33066	33071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016738
605	NC_010408	CGGC	2	8	33082	33089	0 %	0 %	50 %	50 %	189016738
606	NC_010408	CG	3	6	33170	33175	0 %	0 %	50 %	50 %	189016738
607	NC_010408	GC	3	6	33194	33199	0 %	0 %	50 %	50 %	189016738
608	NC_010408	CGG	2	6	33230	33235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016738
609	NC_010408	CGC	2	6	33355	33360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016739
610	NC_010408	CGT	2	6	33445	33450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016739
611	NC_010408	CGT	3	9	33475	33483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016739
612	NC_010408	CGG	2	6	33561	33566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016739
613	NC_010408	GCC	2	6	33573	33578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016739
614	NC_010408	CG	3	6	33612	33617	0 %	0 %	50 %	50 %	189016739
615	NC_010408	AGC	2	6	33624	33629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016739
616	NC_010408	CGGG	2	8	33640	33647	0 %	0 %	75 %	25 %	189016739
617	NC_010408	CCG	2	6	33649	33654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016739
618	NC_010408	CG	3	6	33674	33679	0 %	0 %	50 %	50 %	189016739
619	NC_010408	GCCTGC	2	12	33690	33701	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189016739
620	NC_010408	CAG	2	6	33713	33718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016739
621	NC_010408	GCT	2	6	33739	33744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016739
622	NC_010408	CTC	2	6	33752	33757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016739
623	NC_010408	CTC	2	6	33788	33793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016739
624	NC_010408	TGG	2	6	33805	33810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016739
625	NC_010408	CGT	2	6	33820	33825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016739
626	NC_010408	GC	3	6	33834	33839	0 %	0 %	50 %	50 %	189016739
627	NC_010408	CGG	2	6	33841	33846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016739
628	NC_010408	TCG	2	6	33911	33916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016740
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