MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 2393

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010407	CCGAC	2	10	14	23	20 %	0 %	20 %	60 %	170780463
2	NC_010407	GATCA	2	10	3668	3677	40 %	20 %	20 %	20 %	170780465
3	NC_010407	GGGCA	2	10	5215	5224	20 %	0 %	60 %	20 %	170780467
4	NC_010407	ACGGC	2	10	5411	5420	20 %	0 %	40 %	40 %	170780467
5	NC_010407	GTCGG	2	10	5502	5511	0 %	20 %	60 %	20 %	170780467
6	NC_010407	CCAGG	2	10	6147	6156	20 %	0 %	40 %	40 %	170780467
7	NC_010407	GCACC	2	10	7784	7793	20 %	0 %	20 %	60 %	170780469
8	NC_010407	CGCGG	2	10	13080	13089	0 %	0 %	60 %	40 %	170780472
9	NC_010407	GGGCA	2	10	13663	13672	20 %	0 %	60 %	20 %	170780473
10	NC_010407	GCGCG	2	10	14753	14762	0 %	0 %	60 %	40 %	170780474
11	NC_010407	GCCCG	2	10	16403	16412	0 %	0 %	40 %	60 %	170780477
12	NC_010407	CGGGC	2	10	16696	16705	0 %	0 %	60 %	40 %	170780478
13	NC_010407	CGGCG	2	10	19708	19717	0 %	0 %	60 %	40 %	170780480
14	NC_010407	GCGAT	2	10	20987	20996	20 %	20 %	40 %	20 %	170780480
15	NC_010407	CGACG	2	10	21270	21279	20 %	0 %	40 %	40 %	170780481
16	NC_010407	CAGCG	2	10	23640	23649	20 %	0 %	40 %	40 %	170780482
17	NC_010407	GAGCA	2	10	24574	24583	40 %	0 %	40 %	20 %	170780483
18	NC_010407	CCCGC	2	10	25058	25067	0 %	0 %	20 %	80 %	170780483
19	NC_010407	GTCGA	2	10	25250	25259	20 %	20 %	40 %	20 %	170780484
20	NC_010407	GGACG	2	10	25459	25468	20 %	0 %	60 %	20 %	170780484
21	NC_010407	GCGGG	2	10	25534	25543	0 %	0 %	80 %	20 %	170780484
22	NC_010407	TCCGC	2	10	26249	26258	0 %	20 %	20 %	60 %	170780485
23	NC_010407	GATCA	2	10	29592	29601	40 %	20 %	20 %	20 %	170780486
24	NC_010407	GCGAC	2	10	30922	30931	20 %	0 %	40 %	40 %	170780488
25	NC_010407	CGGGC	2	10	31906	31915	0 %	0 %	60 %	40 %	170780488
26	NC_010407	CCGGG	2	10	32144	32153	0 %	0 %	60 %	40 %	170780489
27	NC_010407	CGGGC	2	10	33133	33142	0 %	0 %	60 %	40 %	170780491
28	NC_010407	CGCGC	2	10	33460	33469	0 %	0 %	40 %	60 %	170780491
29	NC_010407	GCGTC	2	10	33582	33591	0 %	20 %	40 %	40 %	170780491
30	NC_010407	GCACG	2	10	33847	33856	20 %	0 %	40 %	40 %	170780491
31	NC_010407	ACCGC	2	10	34156	34165	20 %	0 %	20 %	60 %	170780492
32	NC_010407	GCGAG	2	10	37060	37069	20 %	0 %	60 %	20 %	170780493
33	NC_010407	ACCAC	2	10	38506	38515	40 %	0 %	0 %	60 %	170780494
34	NC_010407	ACGAC	2	10	38641	38650	40 %	0 %	20 %	40 %	170780494
35	NC_010407	CCGTC	2	10	38671	38680	0 %	20 %	20 %	60 %	170780494
36	NC_010407	AGGCG	2	10	40484	40493	20 %	0 %	60 %	20 %	170780494
37	NC_010407	GATCA	2	10	43273	43282	40 %	20 %	20 %	20 %	170780498
38	NC_010407	GCCCG	2	10	47747	47756	0 %	0 %	40 %	60 %	170780504
39	NC_010407	GCGCC	2	10	47810	47819	0 %	0 %	40 %	60 %	170780504
40	NC_010407	GCCCC	2	10	50016	50025	0 %	0 %	20 %	80 %	170780505
41	NC_010407	CTGCC	2	10	50279	50288	0 %	20 %	20 %	60 %	170780505
42	NC_010407	GTCGC	2	10	54500	54509	0 %	20 %	40 %	40 %	170780509
43	NC_010407	CCGCA	2	10	58039	58048	20 %	0 %	20 %	60 %	170780512
44	NC_010407	TGATC	2	10	59669	59678	20 %	40 %	20 %	20 %	170780513
45	NC_010407	CCGCG	2	10	60521	60530	0 %	0 %	40 %	60 %	170780514
46	NC_010407	CGGCG	2	10	61556	61565	0 %	0 %	60 %	40 %	170780514
47	NC_010407	CGGGC	2	10	62753	62762	0 %	0 %	60 %	40 %	170780515
48	NC_010407	CGCGC	2	10	62771	62780	0 %	0 %	40 %	60 %	170780515
49	NC_010407	GCACG	2	10	63233	63242	20 %	0 %	40 %	40 %	170780515
50	NC_010407	GACGG	2	10	66424	66433	20 %	0 %	60 %	20 %	170780517
51	NC_010407	CGACG	2	10	66586	66595	20 %	0 %	40 %	40 %	170780517
52	NC_010407	CGGCG	2	10	67683	67692	0 %	0 %	60 %	40 %	170780518
53	NC_010407	GACCG	2	10	67759	67768	20 %	0 %	40 %	40 %	170780518
54	NC_010407	CGCTG	2	10	67812	67821	0 %	20 %	40 %	40 %	170780518
55	NC_010407	CGACC	2	10	69436	69445	20 %	0 %	20 %	60 %	170780520
56	NC_010407	CTCGC	2	10	70639	70648	0 %	20 %	20 %	60 %	170780521
57	NC_010407	CGCGG	2	10	71149	71158	0 %	0 %	60 %	40 %	170780521
58	NC_010407	CCCGG	2	10	71202	71211	0 %	0 %	40 %	60 %	170780521
59	NC_010407	CGGCG	2	10	71447	71456	0 %	0 %	60 %	40 %	170780522
60	NC_010407	CGCCA	2	10	73525	73534	20 %	0 %	20 %	60 %	170780523
61	NC_010407	CGCGG	2	10	74405	74414	0 %	0 %	60 %	40 %	170780523
62	NC_010407	CCGCA	2	10	74440	74449	20 %	0 %	20 %	60 %	170780523
63	NC_010407	TGGCG	2	10	75094	75103	0 %	20 %	60 %	20 %	170780524
64	NC_010407	GCCGT	2	10	75211	75220	0 %	20 %	40 %	40 %	170780524
65	NC_010407	CCGGG	2	10	75241	75250	0 %	0 %	60 %	40 %	170780524
66	NC_010407	TCGCC	2	10	76764	76773	0 %	20 %	20 %	60 %	170780524
67	NC_010407	CGCCC	2	10	76891	76900	0 %	0 %	20 %	80 %	170780524
68	NC_010407	CGCGC	2	10	77858	77867	0 %	0 %	40 %	60 %	170780525
69	NC_010407	GGTCC	2	10	79309	79318	0 %	20 %	40 %	40 %	170780527
70	NC_010407	CCCGA	2	10	79624	79633	20 %	0 %	20 %	60 %	170780527
71	NC_010407	GCAGC	2	10	80742	80751	20 %	0 %	40 %	40 %	170780528
72	NC_010407	GCCGC	2	10	81411	81420	0 %	0 %	40 %	60 %	170780528
73	NC_010407	CCTGG	2	10	82633	82642	0 %	20 %	40 %	40 %	170780528
74	NC_010407	GAGAT	2	10	83212	83221	40 %	20 %	40 %	0 %	170780529
75	NC_010407	CTGCG	2	10	85138	85147	0 %	20 %	40 %	40 %	170780532
76	NC_010407	CACCC	2	10	88146	88155	20 %	0 %	0 %	80 %	170780536
77	NC_010407	GTCGC	2	10	92546	92555	0 %	20 %	40 %	40 %	170780537
78	NC_010407	CGACG	2	10	93067	93076	20 %	0 %	40 %	40 %	170780537
79	NC_010407	TCGCG	2	10	94957	94966	0 %	20 %	40 %	40 %	170780538
80	NC_010407	ACCCG	2	10	95631	95640	20 %	0 %	20 %	60 %	170780538
81	NC_010407	GCCCG	2	10	98303	98312	0 %	0 %	40 %	60 %	170780541
82	NC_010407	TGATC	2	10	105153	105162	20 %	40 %	20 %	20 %	170780542
83	NC_010407	CCCGC	2	10	109777	109786	0 %	0 %	20 %	80 %	170780547
84	NC_010407	GCCGT	2	10	109998	110007	0 %	20 %	40 %	40 %	170780547
85	NC_010407	GCTGC	2	10	111681	111690	0 %	20 %	40 %	40 %	170780548
86	NC_010407	GCGGG	2	10	112384	112393	0 %	0 %	80 %	20 %	170780548
87	NC_010407	CGGCG	2	10	113096	113105	0 %	0 %	60 %	40 %	170780549
88	NC_010407	GCCGC	2	10	118250	118259	0 %	0 %	40 %	60 %	170780553
89	NC_010407	ACGCC	2	10	121806	121815	20 %	0 %	20 %	60 %	170780557
90	NC_010407	GGCCG	2	10	122570	122579	0 %	0 %	60 %	40 %	170780557
91	NC_010407	CCTCC	2	10	123314	123323	0 %	20 %	0 %	80 %	170780558
92	NC_010407	GGCCC	2	10	124575	124584	0 %	0 %	40 %	60 %	170780560
93	NC_010407	CGCGC	2	10	124928	124937	0 %	0 %	40 %	60 %	170780561
94	NC_010407	GCCGG	2	10	125266	125275	0 %	0 %	60 %	40 %	170780561
95	NC_010407	CTCGT	2	10	125483	125492	0 %	40 %	20 %	40 %	170780562
96	NC_010407	TCCCG	2	10	125927	125936	0 %	20 %	20 %	60 %	170780562
97	NC_010407	CGGGT	2	10	126266	126275	0 %	20 %	60 %	20 %	170780562
98	NC_010407	ACCCC	2	10	127053	127062	20 %	0 %	0 %	80 %	170780562
99	NC_010407	CGCGC	2	10	127105	127114	0 %	0 %	40 %	60 %	170780562
100	NC_010407	GAGCG	2	10	127339	127348	20 %	0 %	60 %	20 %	170780563
101	NC_010407	GCGCC	2	10	128565	128574	0 %	0 %	40 %	60 %	170780564
102	NC_010407	CGTCG	2	10	135429	135438	0 %	20 %	40 %	40 %	170780570
103	NC_010407	CGGCG	2	10	136246	136255	0 %	0 %	60 %	40 %	170780571
104	NC_010407	GGCGA	2	10	136669	136678	20 %	0 %	60 %	20 %	170780572
105	NC_010407	GCCCA	2	10	137567	137576	20 %	0 %	20 %	60 %	170780573
106	NC_010407	CGCGG	2	10	138151	138160	0 %	0 %	60 %	40 %	170780573
107	NC_010407	CCGCG	2	10	138267	138276	0 %	0 %	40 %	60 %	170780573
108	NC_010407	GCGTC	2	10	140189	140198	0 %	20 %	40 %	40 %	170780575
109	NC_010407	CGCCC	2	10	140238	140247	0 %	0 %	20 %	80 %	170780575
110	NC_010407	GACGC	2	10	140278	140287	20 %	0 %	40 %	40 %	170780575
111	NC_010407	GCGAC	2	10	142818	142827	20 %	0 %	40 %	40 %	170780577
112	NC_010407	TCGAG	2	10	143151	143160	20 %	20 %	40 %	20 %	170780577
113	NC_010407	CTGAT	2	10	143322	143331	20 %	40 %	20 %	20 %	170780578
114	NC_010407	TCGTC	2	10	144461	144470	0 %	40 %	20 %	40 %	170780579
115	NC_010407	CGCGT	2	10	146506	146515	0 %	20 %	40 %	40 %	170780580
116	NC_010407	CCGCG	2	10	146853	146862	0 %	0 %	40 %	60 %	170780580
117	NC_010407	CGCGA	2	10	150016	150025	20 %	0 %	40 %	40 %	170780583
118	NC_010407	AGCCG	2	10	150072	150081	20 %	0 %	40 %	40 %	170780583
119	NC_010407	TCGCC	2	10	150924	150933	0 %	20 %	20 %	60 %	170780584
120	NC_010407	CGTCG	2	10	151854	151863	0 %	20 %	40 %	40 %	170780585
121	NC_010407	GCCCA	2	10	153757	153766	20 %	0 %	20 %	60 %	170780587
122	NC_010407	GGTCA	2	10	158338	158347	20 %	20 %	40 %	20 %	170780590
123	NC_010407	GATCA	2	10	164770	164779	40 %	20 %	20 %	20 %	170780596
124	NC_010407	CGCGC	2	10	173995	174004	0 %	0 %	40 %	60 %	170780604
125	NC_010407	GGCCG	2	10	174850	174859	0 %	0 %	60 %	40 %	170780605
126	NC_010407	CTCCG	2	10	177243	177252	0 %	20 %	20 %	60 %	170780607
127	NC_010407	GCGCG	2	10	178343	178352	0 %	0 %	60 %	40 %	170780607
128	NC_010407	GCTCG	2	10	183942	183951	0 %	20 %	40 %	40 %	170780611
129	NC_010407	GACGG	2	10	184489	184498	20 %	0 %	60 %	20 %	170780611
130	NC_010407	CGACG	2	10	187437	187446	20 %	0 %	40 %	40 %	170780611
131	NC_010407	AGTCC	2	10	187731	187740	20 %	20 %	20 %	40 %	170780611
132	NC_010407	ACCCC	2	10	188321	188330	20 %	0 %	0 %	80 %	170780612
133	NC_010407	AGCGC	2	10	191866	191875	20 %	0 %	40 %	40 %	170780614
134	NC_010407	TCCCG	2	10	192402	192411	0 %	20 %	20 %	60 %	170780614
135	NC_010407	CGGAC	2	10	193193	193202	20 %	0 %	40 %	40 %	170780615
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