MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 89487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_010407	GCG	2	6	38215	38220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780494
1003	NC_010407	TCG	2	6	38236	38241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780494
1004	NC_010407	GACC	2	8	38242	38249	25 %	0 %	25 %	50 %	170780494
1005	NC_010407	ACA	2	6	38353	38358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170780494
1006	NC_010407	CAC	2	6	38387	38392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780494
1007	NC_010407	AGC	2	6	38395	38400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780494
1008	NC_010407	ACCG	2	8	38412	38419	25 %	0 %	25 %	50 %	170780494
1009	NC_010407	CG	3	6	38497	38502	0 %	0 %	50 %	50 %	170780494
1010	NC_010407	ACCAC	2	10	38506	38515	40 %	0 %	0 %	60 %	170780494
1011	NC_010407	TCG	2	6	38542	38547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780494
1012	NC_010407	CAC	3	9	38561	38569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780494
1013	NC_010407	CGG	2	6	38615	38620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780494
1014	NC_010407	ACG	2	6	38628	38633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780494
1015	NC_010407	ACGAC	2	10	38641	38650	40 %	0 %	20 %	40 %	170780494
1016	NC_010407	CGA	2	6	38662	38667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780494
1017	NC_010407	CCGTC	2	10	38671	38680	0 %	20 %	20 %	60 %	170780494
1018	NC_010407	ACG	3	9	38691	38699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780494
1019	NC_010407	CGT	2	6	38783	38788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780494
1020	NC_010407	ACA	2	6	38803	38808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170780494
1021	NC_010407	CGT	2	6	38819	38824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780494
1022	NC_010407	GCA	2	6	38971	38976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780494
1023	NC_010407	ACG	2	6	39004	39009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780494
1024	NC_010407	AAC	2	6	39015	39020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170780494
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1033	NC_010407	CGA	2	6	39379	39384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780494
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1042	NC_010407	CGC	2	6	39713	39718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780494
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1053	NC_010407	CGGC	2	8	40015	40022	0 %	0 %	50 %	50 %	170780494
1054	NC_010407	GCC	2	6	40054	40059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780494
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1062	NC_010407	ACG	2	6	40252	40257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780494
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1065	NC_010407	CGA	2	6	40339	40344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780494
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1067	NC_010407	AGGCG	2	10	40484	40493	20 %	0 %	60 %	20 %	170780494
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1094	NC_010407	CCGCGG	2	12	43187	43198	0 %	0 %	50 %	50 %	170780498
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1101	NC_010407	CCCG	2	8	43445	43452	0 %	0 %	25 %	75 %	170780498
1102	NC_010407	GC	3	6	43584	43589	0 %	0 %	50 %	50 %	170780498
1103	NC_010407	CG	3	6	43613	43618	0 %	0 %	50 %	50 %	170780498
1104	NC_010407	CGA	2	6	43634	43639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780498
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1106	NC_010407	ACC	2	6	43646	43651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780498
1107	NC_010407	CGC	2	6	43652	43657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780498
1108	NC_010407	GAG	2	6	43660	43665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780498
1109	NC_010407	GAC	2	6	43845	43850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780499
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1111	NC_010407	CGGC	3	12	43877	43888	0 %	0 %	50 %	50 %	170780499
1112	NC_010407	CAG	2	6	43889	43894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780499
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1114	NC_010407	TCGGTC	2	12	43917	43928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780499
1115	NC_010407	CCT	2	6	43951	43956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780499
1116	NC_010407	CGG	2	6	43957	43962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780499
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1123	NC_010407	GCC	2	6	44307	44312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780500
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1125	NC_010407	CGA	2	6	44433	44438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780500
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1496	NC_010407	CGT	3	9	60166	60174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780514
1497	NC_010407	CTC	3	9	60182	60190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780514
1498	NC_010407	GCC	2	6	60198	60203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780514
1499	NC_010407	TGA	2	6	60229	60234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780514
1500	NC_010407	CTCCCG	2	12	60244	60255	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	170780514

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