MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 3659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010379	AT	3	6	19237	19242	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
502	NC_010379	TCA	2	6	19243	19248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834577
503	NC_010379	TAT	2	6	19249	19254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834577
504	NC_010379	TTCT	2	8	19276	19283	0 %	75 %	0 %	25 %	169834577
505	NC_010379	CTAT	2	8	19293	19300	25 %	50 %	0 %	25 %	169834577
506	NC_010379	TAAAT	2	10	19340	19349	60 %	40 %	0 %	0 %	169834577
507	NC_010379	TAAA	2	8	19381	19388	75 %	25 %	0 %	0 %	169834577
508	NC_010379	TA	3	6	19389	19394	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
509	NC_010379	TTCTC	2	10	19400	19409	0 %	60 %	0 %	40 %	169834577
510	NC_010379	ATTT	2	8	19415	19422	25 %	75 %	0 %	0 %	169834577
511	NC_010379	TA	3	6	19440	19445	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
512	NC_010379	TCA	2	6	19452	19457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834577
513	NC_010379	TAT	2	6	19472	19477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834577
514	NC_010379	TAT	2	6	19516	19521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834577
515	NC_010379	ATCAGG	2	12	19532	19543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	169834577
516	NC_010379	CTA	2	6	19572	19577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834577
517	NC_010379	GCCA	2	8	19592	19599	25 %	0 %	25 %	50 %	169834577
518	NC_010379	GCA	2	6	19605	19610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834577
519	NC_010379	T	9	9	19733	19741	0 %	100 %	0 %	0 %	169834636
520	NC_010379	A	6	6	19768	19773	100 %	0 %	0 %	0 %	169834636
521	NC_010379	TCT	2	6	19829	19834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834636
522	NC_010379	TTTC	2	8	19937	19944	0 %	75 %	0 %	25 %	169834636
523	NC_010379	ATC	2	6	19996	20001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834636
524	NC_010379	TCA	2	6	20012	20017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834636
525	NC_010379	AT	3	6	20044	20049	50 %	50 %	0 %	0 %	169834636
526	NC_010379	TACA	2	8	20077	20084	50 %	25 %	0 %	25 %	169834636
527	NC_010379	AT	3	6	20168	20173	50 %	50 %	0 %	0 %	169834636
528	NC_010379	TC	4	8	20183	20190	0 %	50 %	0 %	50 %	169834636
529	NC_010379	TA	3	6	20197	20202	50 %	50 %	0 %	0 %	169834636
530	NC_010379	TAA	2	6	20223	20228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834636
531	NC_010379	TCTT	2	8	20242	20249	0 %	75 %	0 %	25 %	169834636
532	NC_010379	TTC	2	6	20323	20328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834636
533	NC_010379	ATC	2	6	20365	20370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834636
534	NC_010379	TGTT	2	8	20414	20421	0 %	75 %	25 %	0 %	169834636
535	NC_010379	CATTT	2	10	20437	20446	20 %	60 %	0 %	20 %	169834636
536	NC_010379	ATT	2	6	20497	20502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834636
537	NC_010379	TCA	2	6	20520	20525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834636
538	NC_010379	TGA	2	6	20540	20545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834636
539	NC_010379	TCT	2	6	20600	20605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834636
540	NC_010379	A	6	6	20606	20611	100 %	0 %	0 %	0 %	169834636
541	NC_010379	TCA	2	6	20618	20623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834636
542	NC_010379	TAAT	2	8	20631	20638	50 %	50 %	0 %	0 %	169834636
543	NC_010379	CCT	2	6	20666	20671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834636
544	NC_010379	TCG	2	6	20690	20695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834636
545	NC_010379	CTT	2	6	20751	20756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834636
546	NC_010379	TC	3	6	20774	20779	0 %	50 %	0 %	50 %	169834636
547	NC_010379	TCA	2	6	20786	20791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834636
548	NC_010379	CAT	2	6	20847	20852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834636
549	NC_010379	CTA	2	6	20861	20866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834636
550	NC_010379	ACCA	2	8	20869	20876	50 %	0 %	0 %	50 %	169834636
551	NC_010379	TCA	3	9	20921	20929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834636
552	NC_010379	TGT	2	6	21028	21033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834636
553	NC_010379	AAC	2	6	21041	21046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834636
554	NC_010379	TTC	2	6	21088	21093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834636
555	NC_010379	T	7	7	21118	21124	0 %	100 %	0 %	0 %	169834636
556	NC_010379	ATT	2	6	21477	21482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834710
557	NC_010379	TAT	2	6	21484	21489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834710
558	NC_010379	TAT	2	6	21553	21558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834710
559	NC_010379	TAT	2	6	21580	21585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834710
560	NC_010379	TCTT	2	8	21586	21593	0 %	75 %	0 %	25 %	169834710
561	NC_010379	AT	3	6	21647	21652	50 %	50 %	0 %	0 %	169834710
562	NC_010379	ATA	2	6	21699	21704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834710
563	NC_010379	CAT	2	6	21717	21722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834710
564	NC_010379	CTA	2	6	21759	21764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834710
565	NC_010379	TA	5	10	21763	21772	50 %	50 %	0 %	0 %	169834710
566	NC_010379	TAG	2	6	21801	21806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834710
567	NC_010379	TAG	2	6	21809	21814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834710
568	NC_010379	AGCA	2	8	21828	21835	50 %	0 %	25 %	25 %	169834710
569	NC_010379	ATA	2	6	21859	21864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834710
570	NC_010379	CAT	2	6	21867	21872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834710
571	NC_010379	AT	3	6	21876	21881	50 %	50 %	0 %	0 %	169834710
572	NC_010379	CT	3	6	21924	21929	0 %	50 %	0 %	50 %	169834710
573	NC_010379	TA	3	6	21967	21972	50 %	50 %	0 %	0 %	169834710
574	NC_010379	TCCT	2	8	21979	21986	0 %	50 %	0 %	50 %	169834710
575	NC_010379	TAG	2	6	22005	22010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834710
576	NC_010379	CTA	2	6	22032	22037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834710
577	NC_010379	AAT	2	6	22042	22047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834710
578	NC_010379	T	7	7	22136	22142	0 %	100 %	0 %	0 %	169834591
579	NC_010379	TTTC	2	8	22156	22163	0 %	75 %	0 %	25 %	169834591
580	NC_010379	T	7	7	22209	22215	0 %	100 %	0 %	0 %	169834591
581	NC_010379	ACT	2	6	22266	22271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834591
582	NC_010379	TTC	2	6	22287	22292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834591
583	NC_010379	T	6	6	22293	22298	0 %	100 %	0 %	0 %	169834591
584	NC_010379	AAT	2	6	22302	22307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834591
585	NC_010379	T	6	6	22818	22823	0 %	100 %	0 %	0 %	169834539
586	NC_010379	TCC	2	6	22829	22834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834539
587	NC_010379	CTC	2	6	22869	22874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834539
588	NC_010379	AT	3	6	22963	22968	50 %	50 %	0 %	0 %	169834539
589	NC_010379	TGC	2	6	22985	22990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834539
590	NC_010379	TA	3	6	22992	22997	50 %	50 %	0 %	0 %	169834539
591	NC_010379	ATT	2	6	23044	23049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834539
592	NC_010379	ATA	2	6	23067	23072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834539
593	NC_010379	T	6	6	23083	23088	0 %	100 %	0 %	0 %	169834539
594	NC_010379	CTT	2	6	23090	23095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834539
595	NC_010379	TA	3	6	23104	23109	50 %	50 %	0 %	0 %	169834539
596	NC_010379	TAT	2	6	23149	23154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834539
597	NC_010379	T	6	6	23154	23159	0 %	100 %	0 %	0 %	169834539
598	NC_010379	TCT	2	6	23180	23185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834539
599	NC_010379	ATA	2	6	23186	23191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834539
600	NC_010379	CT	3	6	23205	23210	0 %	50 %	0 %	50 %	169834539
601	NC_010379	ACCT	2	8	23247	23254	25 %	25 %	0 %	50 %	169834539
602	NC_010379	ATA	2	6	23268	23273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834539
603	NC_010379	ATT	2	6	23311	23316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834539
604	NC_010379	TAA	2	6	23365	23370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834539
605	NC_010379	TCT	2	6	23429	23434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834539
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607	NC_010379	ATG	2	6	23488	23493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834539
608	NC_010379	ATT	2	6	23567	23572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834539
609	NC_010379	TAA	2	6	23771	23776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834617
610	NC_010379	ATT	2	6	23799	23804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834617
611	NC_010379	TTA	2	6	23824	23829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834617
612	NC_010379	TCT	2	6	23835	23840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834617
613	NC_010379	T	6	6	23843	23848	0 %	100 %	0 %	0 %	169834617
614	NC_010379	TTG	2	6	23865	23870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834617
615	NC_010379	TTA	2	6	24152	24157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834700
616	NC_010379	T	7	7	24193	24199	0 %	100 %	0 %	0 %	169834700
617	NC_010379	ATA	2	6	24200	24205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834700
618	NC_010379	CATT	2	8	24228	24235	25 %	50 %	0 %	25 %	169834700
619	NC_010379	TAA	2	6	24251	24256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834700
620	NC_010379	CAG	2	6	24283	24288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834700
621	NC_010379	TTC	2	6	24294	24299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834700
622	NC_010379	CTTT	2	8	24303	24310	0 %	75 %	0 %	25 %	169834700
623	NC_010379	TA	3	6	24327	24332	50 %	50 %	0 %	0 %	169834700
624	NC_010379	TTA	2	6	24350	24355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834700
625	NC_010379	TCA	2	6	24386	24391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834700
626	NC_010379	TA	3	6	24423	24428	50 %	50 %	0 %	0 %	169834700
627	NC_010379	TGG	2	6	24460	24465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169834700
628	NC_010379	TAT	2	6	24508	24513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834700
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