MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 20171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010287	TGA	2	6	214083	214088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154138
4002	NC_010287	ATG	2	6	214089	214094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154138
4003	NC_010287	CAT	2	6	214130	214135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154138
4004	NC_010287	GGT	2	6	214701	214706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154139
4005	NC_010287	AT	3	6	214786	214791	50 %	50 %	0 %	0 %	166154139
4006	NC_010287	CA	3	6	214882	214887	50 %	0 %	0 %	50 %	166154139
4007	NC_010287	C	6	6	214889	214894	0 %	0 %	0 %	100 %	166154139
4008	NC_010287	TTA	2	6	214944	214949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154139
4009	NC_010287	TAG	2	6	214972	214977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154139
4010	NC_010287	GCT	2	6	214991	214996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154139
4011	NC_010287	TTC	2	6	215022	215027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154139
4012	NC_010287	CTT	2	6	215038	215043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154139
4013	NC_010287	TCA	2	6	215046	215051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154139
4014	NC_010287	TAG	2	6	215130	215135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154139
4015	NC_010287	TTA	2	6	215189	215194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154139
4016	NC_010287	GGC	2	6	215264	215269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166154140
4017	NC_010287	GAA	2	6	215283	215288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154140
4018	NC_010287	TGGT	2	8	215328	215335	0 %	50 %	50 %	0 %	166154140
4019	NC_010287	AAG	2	6	215397	215402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154140
4020	NC_010287	TCC	2	6	215441	215446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154140
4021	NC_010287	TG	3	6	215493	215498	0 %	50 %	50 %	0 %	166154140
4022	NC_010287	GCG	2	6	215544	215549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166154140
4023	NC_010287	TTC	2	6	215636	215641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154140
4024	NC_010287	TAA	2	6	215671	215676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154140
4025	NC_010287	AAT	2	6	215756	215761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154140
4026	NC_010287	AG	3	6	215786	215791	50 %	0 %	50 %	0 %	166154140
4027	NC_010287	T	6	6	215813	215818	0 %	100 %	0 %	0 %	166154140
4028	NC_010287	A	8	8	215837	215844	100 %	0 %	0 %	0 %	166154140
4029	NC_010287	TGTCG	2	10	215915	215924	0 %	40 %	40 %	20 %	166154140
4030	NC_010287	GAT	2	6	215947	215952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154140
4031	NC_010287	AAT	2	6	215992	215997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154140
4032	NC_010287	AC	3	6	216073	216078	50 %	0 %	0 %	50 %	166154140
4033	NC_010287	ATTC	2	8	216121	216128	25 %	50 %	0 %	25 %	166154140
4034	NC_010287	AGG	2	6	216133	216138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154140
4035	NC_010287	TGT	2	6	216222	216227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154140
4036	NC_010287	AGT	2	6	216231	216236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154140
4037	NC_010287	CTT	2	6	216286	216291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154140
4038	NC_010287	AGG	2	6	216301	216306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154140
4039	NC_010287	GCA	3	9	216309	216317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154140
4040	NC_010287	CAT	2	6	216340	216345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154140
4041	NC_010287	TG	3	6	216387	216392	0 %	50 %	50 %	0 %	166154140
4042	NC_010287	CTT	2	6	216448	216453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154140
4043	NC_010287	A	7	7	216464	216470	100 %	0 %	0 %	0 %	166154140
4044	NC_010287	AAT	2	6	216519	216524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154140
4045	NC_010287	TG	3	6	216554	216559	0 %	50 %	50 %	0 %	166154140
4046	NC_010287	TG	3	6	216641	216646	0 %	50 %	50 %	0 %	166154140
4047	NC_010287	AAT	2	6	216647	216652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154140
4048	NC_010287	AAG	2	6	217268	217273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154141
4049	NC_010287	TTA	2	6	217278	217283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154141
4050	NC_010287	CTG	2	6	217311	217316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154141
4051	NC_010287	TTTC	2	8	217379	217386	0 %	75 %	0 %	25 %	166154141
4052	NC_010287	ATG	2	6	217491	217496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154141
4053	NC_010287	GAA	2	6	217514	217519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154141
4054	NC_010287	AGG	2	6	217597	217602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154141
4055	NC_010287	GTT	2	6	217634	217639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154141
4056	NC_010287	AAG	2	6	217761	217766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154141
4057	NC_010287	ACG	2	6	217783	217788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154141
4058	NC_010287	GTT	2	6	217812	217817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154142
4059	NC_010287	GAC	2	6	217834	217839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154142
4060	NC_010287	TTG	2	6	217875	217880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154142
4061	NC_010287	T	6	6	217898	217903	0 %	100 %	0 %	0 %	166154142
4062	NC_010287	GTT	2	6	217971	217976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154142
4063	NC_010287	CAC	2	6	217988	217993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166154142
4064	NC_010287	AAG	2	6	218031	218036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154142
4065	NC_010287	TTG	2	6	218065	218070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154142
4066	NC_010287	GAC	2	6	218076	218081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154142
4067	NC_010287	TGG	2	6	218129	218134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154142
4068	NC_010287	CAATC	2	10	218169	218178	40 %	20 %	0 %	40 %	166154142
4069	NC_010287	ATT	2	6	218179	218184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154142
4070	NC_010287	TAT	2	6	218248	218253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154142
4071	NC_010287	TGAA	2	8	218266	218273	50 %	25 %	25 %	0 %	166154142
4072	NC_010287	AGA	2	6	218309	218314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154142
4073	NC_010287	TCCT	2	8	218317	218324	0 %	50 %	0 %	50 %	166154142
4074	NC_010287	GTT	2	6	218332	218337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154142
4075	NC_010287	A	10	10	218480	218489	100 %	0 %	0 %	0 %	166154143
4076	NC_010287	TGG	2	6	218590	218595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154143
4077	NC_010287	GTG	2	6	218649	218654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154143
4078	NC_010287	TAC	2	6	218669	218674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154143
4079	NC_010287	TTTA	2	8	218675	218682	25 %	75 %	0 %	0 %	166154143
4080	NC_010287	GA	3	6	218719	218724	50 %	0 %	50 %	0 %	166154143
4081	NC_010287	TCT	2	6	218743	218748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154143
4082	NC_010287	AAGC	2	8	218766	218773	50 %	0 %	25 %	25 %	166154143
4083	NC_010287	AAG	2	6	218781	218786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154143
4084	NC_010287	AAT	2	6	218811	218816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154143
4085	NC_010287	GAAG	2	8	218860	218867	50 %	0 %	50 %	0 %	166154144
4086	NC_010287	TTA	2	6	218947	218952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154144
4087	NC_010287	TTC	2	6	218968	218973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154144
4088	NC_010287	AAG	2	6	218975	218980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154144
4089	NC_010287	TCT	2	6	218994	218999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154144
4090	NC_010287	GCT	2	6	219011	219016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154144
4091	NC_010287	AG	3	6	219031	219036	50 %	0 %	50 %	0 %	166154144
4092	NC_010287	TTA	2	6	219116	219121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154145
4093	NC_010287	TTG	2	6	219156	219161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154145
4094	NC_010287	GCAA	2	8	219241	219248	50 %	0 %	25 %	25 %	166154145
4095	NC_010287	AGC	2	6	219258	219263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154145
4096	NC_010287	TGC	2	6	219267	219272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154145
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4098	NC_010287	AAT	2	6	219362	219367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154145
4099	NC_010287	ATGAT	2	10	219390	219399	40 %	40 %	20 %	0 %	166154145
4100	NC_010287	TGC	2	6	219403	219408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154145
4101	NC_010287	CAA	2	6	219413	219418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154145
4102	NC_010287	GTT	2	6	219422	219427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154145
4103	NC_010287	AAG	2	6	219504	219509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154145
4104	NC_010287	AGA	2	6	219583	219588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154145
4105	NC_010287	AAG	2	6	219591	219596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154145
4106	NC_010287	CTTT	2	8	219670	219677	0 %	75 %	0 %	25 %	166154146
4107	NC_010287	GAT	2	6	219725	219730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154146
4108	NC_010287	TC	3	6	219806	219811	0 %	50 %	0 %	50 %	166154146
4109	NC_010287	TAAT	2	8	219816	219823	50 %	50 %	0 %	0 %	166154146
4110	NC_010287	AGG	2	6	219952	219957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154146
4111	NC_010287	AGT	2	6	219959	219964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154146
4112	NC_010287	GCA	2	6	219968	219973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154146
4113	NC_010287	TGA	2	6	220018	220023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154146
4114	NC_010287	T	6	6	220066	220071	0 %	100 %	0 %	0 %	166154146
4115	NC_010287	AGC	2	6	220084	220089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154146
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4117	NC_010287	AGA	2	6	220126	220131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154146
4118	NC_010287	AGAT	2	8	220141	220148	50 %	25 %	25 %	0 %	166154146
4119	NC_010287	CGT	2	6	220198	220203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154146
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4121	NC_010287	A	6	6	220228	220233	100 %	0 %	0 %	0 %	166154146
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4123	NC_010287	CTT	2	6	220407	220412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154146
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4247	NC_010287	TCC	2	6	225638	225643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154149
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4251	NC_010287	TCT	2	6	225729	225734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154149
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4263	NC_010287	T	7	7	226075	226081	0 %	100 %	0 %	0 %	166154149
4264	NC_010287	AGGG	2	8	226087	226094	25 %	0 %	75 %	0 %	166154149
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4362	NC_010287	GGA	2	6	231637	231642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154155
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4368	NC_010287	GAG	3	9	231890	231898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154155
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4370	NC_010287	GGA	2	6	231940	231945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154155
4371	NC_010287	A	6	6	232015	232020	100 %	0 %	0 %	0 %	166154155
4372	NC_010287	CT	3	6	232033	232038	0 %	50 %	0 %	50 %	166154155
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4492	NC_010287	GGA	2	6	237944	237949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154159
4493	NC_010287	TACAA	2	10	237980	237989	60 %	20 %	0 %	20 %	166154159
4494	NC_010287	GGGAT	2	10	237993	238002	20 %	20 %	60 %	0 %	166154159
4495	NC_010287	TAT	2	6	238027	238032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154159
4496	NC_010287	AAG	2	6	238161	238166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154159
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4500	NC_010287	TTGT	2	8	238467	238474	0 %	75 %	25 %	0 %	166154160

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