MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 20171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010287	CA	3	6	161966	161971	50 %	0 %	0 %	50 %	166154092
3002	NC_010287	ATT	2	6	162003	162008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154092
3003	NC_010287	TAT	2	6	162017	162022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154092
3004	NC_010287	AAG	2	6	162040	162045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154092
3005	NC_010287	AGA	2	6	162119	162124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154092
3006	NC_010287	TGC	2	6	162161	162166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154092
3007	NC_010287	ACA	2	6	162170	162175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154092
3008	NC_010287	GAA	2	6	162195	162200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154092
3009	NC_010287	GATT	2	8	162262	162269	25 %	50 %	25 %	0 %	166154092
3010	NC_010287	GAA	2	6	162294	162299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154092
3011	NC_010287	CGG	2	6	162403	162408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166154092
3012	NC_010287	TC	3	6	162410	162415	0 %	50 %	0 %	50 %	166154092
3013	NC_010287	AAG	2	6	162442	162447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154092
3014	NC_010287	T	6	6	162569	162574	0 %	100 %	0 %	0 %	166154092
3015	NC_010287	ATT	2	6	162586	162591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154092
3016	NC_010287	CGATT	2	10	162601	162610	20 %	40 %	20 %	20 %	166154092
3017	NC_010287	AGC	2	6	162611	162616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154092
3018	NC_010287	TTG	2	6	162664	162669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154092
3019	NC_010287	GCT	2	6	162783	162788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154092
3020	NC_010287	CTAC	2	8	162834	162841	25 %	25 %	0 %	50 %	166154092
3021	NC_010287	AGGA	2	8	162907	162914	50 %	0 %	50 %	0 %	166154092
3022	NC_010287	TG	3	6	162934	162939	0 %	50 %	50 %	0 %	166154092
3023	NC_010287	TTG	2	6	163025	163030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154092
3024	NC_010287	GA	3	6	163041	163046	50 %	0 %	50 %	0 %	166154092
3025	NC_010287	AGG	2	6	163076	163081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154092
3026	NC_010287	ATGG	2	8	163167	163174	25 %	25 %	50 %	0 %	166154092
3027	NC_010287	ATA	2	6	163231	163236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154092
3028	NC_010287	ATC	2	6	163301	163306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154093
3029	NC_010287	AG	3	6	163374	163379	50 %	0 %	50 %	0 %	166154093
3030	NC_010287	GCA	2	6	163530	163535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154093
3031	NC_010287	TTA	2	6	163602	163607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154093
3032	NC_010287	T	6	6	163690	163695	0 %	100 %	0 %	0 %	166154093
3033	NC_010287	G	6	6	163728	163733	0 %	0 %	100 %	0 %	166154093
3034	NC_010287	AAT	2	6	163783	163788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154093
3035	NC_010287	GCT	2	6	163839	163844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154093
3036	NC_010287	GGAA	2	8	163854	163861	50 %	0 %	50 %	0 %	166154093
3037	NC_010287	GCT	2	6	163884	163889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154093
3038	NC_010287	GAT	2	6	163913	163918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154093
3039	NC_010287	AAG	2	6	164024	164029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154093
3040	NC_010287	TTC	2	6	164096	164101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154093
3041	NC_010287	T	7	7	164107	164113	0 %	100 %	0 %	0 %	166154093
3042	NC_010287	A	6	6	164505	164510	100 %	0 %	0 %	0 %	166154094
3043	NC_010287	AGC	2	6	164553	164558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154094
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3045	NC_010287	T	6	6	164631	164636	0 %	100 %	0 %	0 %	166154094
3046	NC_010287	TTA	2	6	164666	164671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154094
3047	NC_010287	AT	3	6	164681	164686	50 %	50 %	0 %	0 %	166154094
3048	NC_010287	CAA	2	6	164811	164816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154094
3049	NC_010287	GAA	2	6	164855	164860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154094
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3051	NC_010287	AAG	2	6	164951	164956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154095
3052	NC_010287	AAT	2	6	164976	164981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154095
3053	NC_010287	AGC	2	6	165038	165043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154095
3054	NC_010287	CTTTT	2	10	165061	165070	0 %	80 %	0 %	20 %	166154095
3055	NC_010287	T	6	6	165067	165072	0 %	100 %	0 %	0 %	166154095
3056	NC_010287	T	7	7	165107	165113	0 %	100 %	0 %	0 %	166154095
3057	NC_010287	T	8	8	165146	165153	0 %	100 %	0 %	0 %	166154095
3058	NC_010287	TTC	2	6	165225	165230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154096
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3060	NC_010287	GAT	2	6	165383	165388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154096
3061	NC_010287	TCA	2	6	165443	165448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154096
3062	NC_010287	TTG	2	6	165494	165499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154096
3063	NC_010287	GAAGA	2	10	165548	165557	60 %	0 %	40 %	0 %	166154096
3064	NC_010287	ACCA	2	8	165614	165621	50 %	0 %	0 %	50 %	166154096
3065	NC_010287	GAA	2	6	165641	165646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154096
3066	NC_010287	ACC	2	6	165650	165655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166154096
3067	NC_010287	GAGT	2	8	165662	165669	25 %	25 %	50 %	0 %	166154096
3068	NC_010287	T	6	6	165669	165674	0 %	100 %	0 %	0 %	166154096
3069	NC_010287	TTA	2	6	165703	165708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154096
3070	NC_010287	GTTT	2	8	165727	165734	0 %	75 %	25 %	0 %	166154096
3071	NC_010287	T	6	6	165732	165737	0 %	100 %	0 %	0 %	166154096
3072	NC_010287	CAT	2	6	165758	165763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154096
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3074	NC_010287	GAAA	2	8	165808	165815	75 %	0 %	25 %	0 %	166154096
3075	NC_010287	CA	3	6	165870	165875	50 %	0 %	0 %	50 %	166154096
3076	NC_010287	GCT	2	6	165893	165898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154096
3077	NC_010287	GA	3	6	165920	165925	50 %	0 %	50 %	0 %	166154096
3078	NC_010287	CCT	2	6	165949	165954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154096
3079	NC_010287	T	7	7	166165	166171	0 %	100 %	0 %	0 %	166154097
3080	NC_010287	TGC	2	6	166178	166183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154097
3081	NC_010287	AAG	2	6	166204	166209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154097
3082	NC_010287	AGA	2	6	166215	166220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154097
3083	NC_010287	A	6	6	166246	166251	100 %	0 %	0 %	0 %	166154097
3084	NC_010287	TCT	2	6	166299	166304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154097
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3087	NC_010287	AG	3	6	166347	166352	50 %	0 %	50 %	0 %	166154097
3088	NC_010287	CAA	2	6	166366	166371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154097
3089	NC_010287	TCCA	2	8	166376	166383	25 %	25 %	0 %	50 %	166154097
3090	NC_010287	GTT	2	6	166402	166407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154097
3091	NC_010287	AG	3	6	166411	166416	50 %	0 %	50 %	0 %	166154097
3092	NC_010287	CAG	2	6	166444	166449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154097
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3094	NC_010287	GAAGAG	2	12	166473	166484	50 %	0 %	50 %	0 %	166154097
3095	NC_010287	AGA	2	6	166503	166508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154097
3096	NC_010287	T	7	7	166639	166645	0 %	100 %	0 %	0 %	166154097
3097	NC_010287	TCT	2	6	166668	166673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154097
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3099	NC_010287	TAG	2	6	166790	166795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154097
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3102	NC_010287	GGC	2	6	166827	166832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166154097
3103	NC_010287	TCT	2	6	166869	166874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154097
3104	NC_010287	ACT	2	6	166899	166904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154097
3105	NC_010287	A	6	6	166975	166980	100 %	0 %	0 %	0 %	166154097
3106	NC_010287	TTC	2	6	166997	167002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154097
3107	NC_010287	T	6	6	167009	167014	0 %	100 %	0 %	0 %	166154097
3108	NC_010287	CTT	2	6	167178	167183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154097
3109	NC_010287	GAG	2	6	167377	167382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154097
3110	NC_010287	AGA	2	6	167441	167446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154097
3111	NC_010287	A	6	6	167571	167576	100 %	0 %	0 %	0 %	166154097
3112	NC_010287	GAA	2	6	167583	167588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154097
3113	NC_010287	GAG	2	6	167589	167594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154097
3114	NC_010287	TGA	2	6	167655	167660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154097
3115	NC_010287	TTG	2	6	167682	167687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154097
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3118	NC_010287	TTA	2	6	168182	168187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154098
3119	NC_010287	CTCG	2	8	168201	168208	0 %	25 %	25 %	50 %	166154098
3120	NC_010287	GAA	2	6	168211	168216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154098
3121	NC_010287	T	6	6	168266	168271	0 %	100 %	0 %	0 %	166154098
3122	NC_010287	AGC	2	6	168316	168321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154098
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3124	NC_010287	ACT	2	6	168494	168499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154098
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