MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 20171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_010287	TGG	2	6	100272	100277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154052
2003	NC_010287	TGAT	2	8	100309	100316	25 %	50 %	25 %	0 %	166154052
2004	NC_010287	GCA	2	6	100353	100358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154052
2005	NC_010287	CTT	2	6	100399	100404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154052
2006	NC_010287	AAT	2	6	100419	100424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154052
2007	NC_010287	TGG	2	6	100457	100462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154052
2008	NC_010287	TGA	2	6	100519	100524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154052
2009	NC_010287	CTA	2	6	100660	100665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154052
2010	NC_010287	CGT	2	6	100779	100784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154052
2011	NC_010287	CAG	2	6	100837	100842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154052
2012	NC_010287	TTG	2	6	100893	100898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154052
2013	NC_010287	GAA	2	6	100989	100994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154052
2014	NC_010287	AAT	2	6	101020	101025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154052
2015	NC_010287	TGC	3	9	101207	101215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154053
2016	NC_010287	T	7	7	101236	101242	0 %	100 %	0 %	0 %	166154053
2017	NC_010287	A	6	6	101260	101265	100 %	0 %	0 %	0 %	166154053
2018	NC_010287	CACCTA	2	12	101341	101352	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	166154053
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2021	NC_010287	TTC	2	6	101411	101416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154053
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2023	NC_010287	TGA	2	6	101486	101491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154053
2024	NC_010287	G	6	6	101514	101519	0 %	0 %	100 %	0 %	166154053
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2029	NC_010287	CGATG	2	10	101786	101795	20 %	20 %	40 %	20 %	166154053
2030	NC_010287	CT	3	6	101816	101821	0 %	50 %	0 %	50 %	166154053
2031	NC_010287	GA	3	6	101829	101834	50 %	0 %	50 %	0 %	166154053
2032	NC_010287	AACA	2	8	101914	101921	75 %	0 %	0 %	25 %	166154053
2033	NC_010287	GCTT	2	8	101980	101987	0 %	50 %	25 %	25 %	166154053
2034	NC_010287	TGA	2	6	102035	102040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154053
2035	NC_010287	TCAT	2	8	102082	102089	25 %	50 %	0 %	25 %	166154053
2036	NC_010287	TGA	2	6	102098	102103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154053
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2040	NC_010287	CTT	2	6	102235	102240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154053
2041	NC_010287	AG	3	6	102291	102296	50 %	0 %	50 %	0 %	166154053
2042	NC_010287	ATA	2	6	102382	102387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154053
2043	NC_010287	TTC	2	6	102420	102425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154053
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2054	NC_010287	A	6	6	102942	102947	100 %	0 %	0 %	0 %	166154053
2055	NC_010287	TTA	2	6	103023	103028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154053
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2057	NC_010287	TGA	2	6	103133	103138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154053
2058	NC_010287	CAG	2	6	103194	103199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154053
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2062	NC_010287	AGC	2	6	103291	103296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154053
2063	NC_010287	CGT	2	6	103306	103311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154053
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2073	NC_010287	AG	3	6	103732	103737	50 %	0 %	50 %	0 %	166154054
2074	NC_010287	AG	4	8	103757	103764	50 %	0 %	50 %	0 %	166154054
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2089	NC_010287	CT	3	6	104590	104595	0 %	50 %	0 %	50 %	166154054
2090	NC_010287	TA	3	6	104613	104618	50 %	50 %	0 %	0 %	166154054
2091	NC_010287	CTAG	2	8	104631	104638	25 %	25 %	25 %	25 %	166154054
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2094	NC_010287	CTTC	2	8	104753	104760	0 %	50 %	0 %	50 %	166154055
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2105	NC_010287	T	6	6	105136	105141	0 %	100 %	0 %	0 %	166154055
2106	NC_010287	CAAA	2	8	105155	105162	75 %	0 %	0 %	25 %	166154055
2107	NC_010287	ATC	2	6	105185	105190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154055
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2109	NC_010287	GTA	2	6	105262	105267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154055
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2111	NC_010287	TGT	2	6	105448	105453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154055
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2118	NC_010287	GT	3	6	105977	105982	0 %	50 %	50 %	0 %	166154056
2119	NC_010287	TGA	2	6	105990	105995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154056
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2121	NC_010287	ACC	2	6	106023	106028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166154056
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2248	NC_010287	GAAAGG	2	12	112098	112109	50 %	0 %	50 %	0 %	166154062
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2251	NC_010287	GA	3	6	112184	112189	50 %	0 %	50 %	0 %	166154062
2252	NC_010287	TCT	2	6	112192	112197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154062
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2371	NC_010287	AAGC	2	8	118395	118402	50 %	0 %	25 %	25 %	166154069
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2402	NC_010287	TCT	2	6	120086	120091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154070
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2492	NC_010287	GAT	2	6	124408	124413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154073
2493	NC_010287	GGA	3	9	124416	124424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154073
2494	NC_010287	TTG	2	6	124476	124481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154074
2495	NC_010287	TTG	2	6	124515	124520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154074
2496	NC_010287	T	6	6	124537	124542	0 %	100 %	0 %	0 %	166154074
2497	NC_010287	GGA	2	6	124550	124555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154074
2498	NC_010287	CTT	3	9	124560	124568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154074
2499	NC_010287	TTGC	2	8	124656	124663	0 %	50 %	25 %	25 %	166154074
2500	NC_010287	GC	3	6	124807	124812	0 %	0 %	50 %	50 %	166154074

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