MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 20171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010287	TTG	2	6	47906	47911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154014
1002	NC_010287	GCT	2	6	47925	47930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154014
1003	NC_010287	GGAG	2	8	48003	48010	25 %	0 %	75 %	0 %	166154014
1004	NC_010287	TTG	2	6	48033	48038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154014
1005	NC_010287	AGA	2	6	48111	48116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154014
1006	NC_010287	AGA	3	9	48201	48209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154014
1007	NC_010287	GTT	2	6	48220	48225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154014
1008	NC_010287	T	7	7	48312	48318	0 %	100 %	0 %	0 %	166154014
1009	NC_010287	AGA	2	6	48384	48389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154014
1010	NC_010287	GAA	2	6	48397	48402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154014
1011	NC_010287	AGG	2	6	48411	48416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154014
1012	NC_010287	CAA	2	6	48440	48445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154014
1013	NC_010287	ATT	2	6	48556	48561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154014
1014	NC_010287	CAT	2	6	48591	48596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154014
1015	NC_010287	TCC	2	6	48798	48803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154015
1016	NC_010287	TGT	2	6	48893	48898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154015
1017	NC_010287	TTC	2	6	48940	48945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154015
1018	NC_010287	GAA	3	9	48954	48962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154015
1019	NC_010287	GGA	2	6	49007	49012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154015
1020	NC_010287	AT	3	6	49283	49288	50 %	50 %	0 %	0 %	166154015
1021	NC_010287	GAGCA	2	10	49296	49305	40 %	0 %	40 %	20 %	166154015
1022	NC_010287	TTG	2	6	49350	49355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154015
1023	NC_010287	GCA	2	6	49461	49466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154015
1024	NC_010287	AAGA	2	8	49542	49549	75 %	0 %	25 %	0 %	166154015
1025	NC_010287	TGT	2	6	49553	49558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154015
1026	NC_010287	AG	3	6	49585	49590	50 %	0 %	50 %	0 %	166154015
1027	NC_010287	ATA	2	6	49672	49677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154015
1028	NC_010287	ATG	2	6	49761	49766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154015
1029	NC_010287	GAG	2	6	49788	49793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154015
1030	NC_010287	AAG	2	6	49867	49872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154015
1031	NC_010287	TTG	2	6	49880	49885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154015
1032	NC_010287	AGA	2	6	49904	49909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154015
1033	NC_010287	A	6	6	49949	49954	100 %	0 %	0 %	0 %	166154015
1034	NC_010287	G	7	7	49962	49968	0 %	0 %	100 %	0 %	166154015
1035	NC_010287	GGA	2	6	50003	50008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154015
1036	NC_010287	AC	3	6	50069	50074	50 %	0 %	0 %	50 %	166154015
1037	NC_010287	TATATT	2	12	50095	50106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154015
1038	NC_010287	CTT	2	6	50110	50115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154015
1039	NC_010287	AT	3	6	50146	50151	50 %	50 %	0 %	0 %	166154015
1040	NC_010287	GTT	2	6	50327	50332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154016
1041	NC_010287	GCG	2	6	50339	50344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166154016
1042	NC_010287	CTT	2	6	50394	50399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154016
1043	NC_010287	CAG	2	6	50423	50428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154016
1044	NC_010287	GCT	2	6	50432	50437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154016
1045	NC_010287	TC	3	6	50604	50609	0 %	50 %	0 %	50 %	166154016
1046	NC_010287	AGA	2	6	50654	50659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154016
1047	NC_010287	GCAG	2	8	50698	50705	25 %	0 %	50 %	25 %	166154016
1048	NC_010287	CTG	2	6	50706	50711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154016
1049	NC_010287	A	7	7	50718	50724	100 %	0 %	0 %	0 %	166154016
1050	NC_010287	AGG	2	6	50736	50741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154016
1051	NC_010287	AAG	4	12	50751	50762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154016
1052	NC_010287	TCG	2	6	50797	50802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154016
1053	NC_010287	AGA	2	6	50842	50847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154016
1054	NC_010287	GAA	2	6	50896	50901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154016
1055	NC_010287	AAG	3	9	50961	50969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154016
1056	NC_010287	A	6	6	50972	50977	100 %	0 %	0 %	0 %	166154016
1057	NC_010287	AAAC	2	8	50992	50999	75 %	0 %	0 %	25 %	166154016
1058	NC_010287	AAG	2	6	51024	51029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154016
1059	NC_010287	GAT	2	6	51173	51178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154016
1060	NC_010287	GTA	2	6	51326	51331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154016
1061	NC_010287	CTG	2	6	51369	51374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154016
1062	NC_010287	ATT	2	6	51383	51388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154016
1063	NC_010287	GCT	2	6	51394	51399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154016
1064	NC_010287	CT	3	6	51398	51403	0 %	50 %	0 %	50 %	166154016
1065	NC_010287	ATG	2	6	51405	51410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154016
1066	NC_010287	ATT	2	6	51413	51418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154016
1067	NC_010287	ATG	2	6	51537	51542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154016
1068	NC_010287	GCT	2	6	51560	51565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154016
1069	NC_010287	CAATT	2	10	51687	51696	40 %	40 %	0 %	20 %	166154016
1070	NC_010287	CTG	3	9	51753	51761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154016
1071	NC_010287	GCT	2	6	51779	51784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154016
1072	NC_010287	CTT	2	6	51802	51807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154016
1073	NC_010287	ACA	2	6	51884	51889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154016
1074	NC_010287	TCA	2	6	51906	51911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154016
1075	NC_010287	AAC	2	6	51944	51949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154016
1076	NC_010287	CCTC	2	8	52015	52022	0 %	25 %	0 %	75 %	166154016
1077	NC_010287	TTG	2	6	52142	52147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154016
1078	NC_010287	AATC	2	8	52178	52185	50 %	25 %	0 %	25 %	166154016
1079	NC_010287	ATG	2	6	52256	52261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154016
1080	NC_010287	ATT	2	6	52289	52294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154016
1081	NC_010287	G	6	6	52337	52342	0 %	0 %	100 %	0 %	166154016
1082	NC_010287	ACA	2	6	52414	52419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154016
1083	NC_010287	TTG	2	6	52530	52535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154016
1084	NC_010287	TAA	2	6	52555	52560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154016
1085	NC_010287	GGAT	2	8	52669	52676	25 %	25 %	50 %	0 %	166154016
1086	NC_010287	TCA	2	6	52833	52838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154016
1087	NC_010287	AGGA	2	8	52848	52855	50 %	0 %	50 %	0 %	166154016
1088	NC_010287	AAT	2	6	53004	53009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154016
1089	NC_010287	CT	3	6	53317	53322	0 %	50 %	0 %	50 %	166154017
1090	NC_010287	AAT	2	6	53331	53336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154017
1091	NC_010287	TTG	2	6	53357	53362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154017
1092	NC_010287	GGT	2	6	53477	53482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154017
1093	NC_010287	ACA	2	6	53562	53567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154017
1094	NC_010287	T	6	6	53605	53610	0 %	100 %	0 %	0 %	166154017
1095	NC_010287	TTTC	2	8	53624	53631	0 %	75 %	0 %	25 %	166154017
1096	NC_010287	CAG	2	6	53657	53662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154017
1097	NC_010287	ACT	2	6	53677	53682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154017
1098	NC_010287	AGA	2	6	53784	53789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154017
1099	NC_010287	GAA	2	6	53929	53934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154017
1100	NC_010287	TGT	2	6	53953	53958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154017
1101	NC_010287	AAC	2	6	54061	54066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154017
1102	NC_010287	TGCC	2	8	54068	54075	0 %	25 %	25 %	50 %	166154017
1103	NC_010287	AAC	2	6	54104	54109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154017
1104	NC_010287	AAT	2	6	54131	54136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154017
1105	NC_010287	TAA	2	6	54141	54146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154017
1106	NC_010287	GTTT	2	8	54248	54255	0 %	75 %	25 %	0 %	166154017
1107	NC_010287	AG	3	6	54306	54311	50 %	0 %	50 %	0 %	166154017
1108	NC_010287	GGCGT	2	10	54323	54332	0 %	20 %	60 %	20 %	166154017
1109	NC_010287	GTA	2	6	54395	54400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154018
1110	NC_010287	T	6	6	54407	54412	0 %	100 %	0 %	0 %	166154018
1111	NC_010287	CTG	2	6	54438	54443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154018
1112	NC_010287	TGA	2	6	54516	54521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154018
1113	NC_010287	GTT	2	6	54525	54530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154018
1114	NC_010287	GGATA	2	10	54616	54625	40 %	20 %	40 %	0 %	166154018
1115	NC_010287	TACA	2	8	54795	54802	50 %	25 %	0 %	25 %	166154018
1116	NC_010287	CTT	2	6	55294	55299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154019
1117	NC_010287	TCT	2	6	55357	55362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154019
1118	NC_010287	CTT	2	6	55453	55458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154019
1119	NC_010287	GCT	2	6	55474	55479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154019
1120	NC_010287	TCG	2	6	55490	55495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154019
1121	NC_010287	TTC	2	6	55499	55504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154019
1122	NC_010287	TGC	2	6	55568	55573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154019
1123	NC_010287	A	6	6	55763	55768	100 %	0 %	0 %	0 %	166154019
1124	NC_010287	TCC	2	6	55819	55824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154020
1125	NC_010287	AGA	2	6	55831	55836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154020
1126	NC_010287	CCT	2	6	55866	55871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154020
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1377	NC_010287	AGG	3	9	69216	69224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154029
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