MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 20171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_010287	TCACA	2	10	623278	623287	40 %	20 %	0 %	40 %	166154483
12003	NC_010287	ACT	2	6	623292	623297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154483
12004	NC_010287	AAT	2	6	623313	623318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154483
12005	NC_010287	CT	3	6	623325	623330	0 %	50 %	0 %	50 %	166154483
12006	NC_010287	CAAA	2	8	623823	623830	75 %	0 %	0 %	25 %	166154484
12007	NC_010287	A	7	7	623832	623838	100 %	0 %	0 %	0 %	166154484
12008	NC_010287	TCC	2	6	623858	623863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154484
12009	NC_010287	AAC	2	6	623878	623883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154484
12010	NC_010287	CTTA	2	8	623896	623903	25 %	50 %	0 %	25 %	166154484
12011	NC_010287	TC	3	6	623910	623915	0 %	50 %	0 %	50 %	166154484
12012	NC_010287	CAAGAC	2	12	623931	623942	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	166154484
12013	NC_010287	A	6	6	623947	623952	100 %	0 %	0 %	0 %	166154484
12014	NC_010287	A	6	6	624023	624028	100 %	0 %	0 %	0 %	166154484
12015	NC_010287	CTC	2	6	624035	624040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154484
12016	NC_010287	ACA	2	6	624059	624064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154484
12017	NC_010287	AGA	2	6	624089	624094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154484
12018	NC_010287	GAA	2	6	624261	624266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154485
12019	NC_010287	T	8	8	624331	624338	0 %	100 %	0 %	0 %	166154485
12020	NC_010287	AGG	2	6	624389	624394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154485
12021	NC_010287	AGA	2	6	624521	624526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154485
12022	NC_010287	CGT	2	6	624553	624558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154485
12023	NC_010287	TAC	2	6	624595	624600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154485
12024	NC_010287	C	6	6	624615	624620	0 %	0 %	0 %	100 %	166154485
12025	NC_010287	GCA	2	6	624899	624904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154486
12026	NC_010287	GCT	2	6	624938	624943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154486
12027	NC_010287	AGA	2	6	624987	624992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154486
12028	NC_010287	A	6	6	625001	625006	100 %	0 %	0 %	0 %	166154486
12029	NC_010287	A	6	6	625060	625065	100 %	0 %	0 %	0 %	166154486
12030	NC_010287	GTT	2	6	625120	625125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154486
12031	NC_010287	AGCTTA	2	12	625211	625222	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	166154486
12032	NC_010287	TCCA	2	8	625257	625264	25 %	25 %	0 %	50 %	166154486
12033	NC_010287	TGC	2	6	625296	625301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154486
12034	NC_010287	TATT	2	8	625328	625335	25 %	75 %	0 %	0 %	166154486
12035	NC_010287	TGG	2	6	625338	625343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154486
12036	NC_010287	CAT	2	6	625399	625404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154486
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12038	NC_010287	TCA	2	6	625458	625463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154486
12039	NC_010287	ATCG	2	8	625502	625509	25 %	25 %	25 %	25 %	166154486
12040	NC_010287	TCG	2	6	625523	625528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154486
12041	NC_010287	TTG	2	6	625616	625621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154486
12042	NC_010287	TTG	2	6	625691	625696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154486
12043	NC_010287	TA	3	6	625792	625797	50 %	50 %	0 %	0 %	166154486
12044	NC_010287	TAA	2	6	625842	625847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154486
12045	NC_010287	TAA	2	6	625872	625877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154486
12046	NC_010287	AAC	2	6	625890	625895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154486
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12048	NC_010287	TGC	2	6	626103	626108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154486
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12050	NC_010287	A	6	6	626184	626189	100 %	0 %	0 %	0 %	166154486
12051	NC_010287	AAT	2	6	626209	626214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154486
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12053	NC_010287	A	6	6	626316	626321	100 %	0 %	0 %	0 %	166154487
12054	NC_010287	TGA	2	6	626328	626333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154487
12055	NC_010287	TA	3	6	626382	626387	50 %	50 %	0 %	0 %	166154487
12056	NC_010287	AGAAC	2	10	626395	626404	60 %	0 %	20 %	20 %	166154487
12057	NC_010287	AAG	2	6	626468	626473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154487
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12059	NC_010287	GAA	2	6	626533	626538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154487
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12061	NC_010287	ATT	2	6	626647	626652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154487
12062	NC_010287	GAA	2	6	626692	626697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154487
12063	NC_010287	TG	3	6	626800	626805	0 %	50 %	50 %	0 %	166154487
12064	NC_010287	TG	3	6	626822	626827	0 %	50 %	50 %	0 %	166154487
12065	NC_010287	TTC	2	6	626915	626920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154488
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12067	NC_010287	CTG	2	6	626968	626973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154488
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12069	NC_010287	TC	3	6	627056	627061	0 %	50 %	0 %	50 %	166154488
12070	NC_010287	GAA	2	6	627072	627077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154488
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12072	NC_010287	AG	3	6	627221	627226	50 %	0 %	50 %	0 %	166154488
12073	NC_010287	TAC	2	6	627325	627330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154488
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12077	NC_010287	GCA	2	6	627380	627385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154488
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12095	NC_010287	AAAG	2	8	628191	628198	75 %	0 %	25 %	0 %	166154489
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12106	NC_010287	AAC	2	6	628727	628732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154489
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12364	NC_010287	TAA	2	6	641476	641481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154499
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