MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 20171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010287	TTCT	2	8	22374	22381	0 %	75 %	0 %	25 %	166153987
502	NC_010287	AGGG	2	8	22426	22433	25 %	0 %	75 %	0 %	166153987
503	NC_010287	GCT	2	6	22483	22488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166153988
504	NC_010287	CAG	2	6	22529	22534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153988
505	NC_010287	GA	3	6	22563	22568	50 %	0 %	50 %	0 %	166153988
506	NC_010287	TCT	2	6	22591	22596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153988
507	NC_010287	AGC	2	6	22626	22631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153988
508	NC_010287	GA	3	6	22670	22675	50 %	0 %	50 %	0 %	166153988
509	NC_010287	GTG	2	6	22735	22740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166153988
510	NC_010287	AGA	2	6	22776	22781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153988
511	NC_010287	GA	3	6	22814	22819	50 %	0 %	50 %	0 %	166153988
512	NC_010287	GTT	2	6	22827	22832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153988
513	NC_010287	TAT	2	6	22877	22882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166153988
514	NC_010287	TCTT	2	8	22926	22933	0 %	75 %	0 %	25 %	166153988
515	NC_010287	TCA	2	6	22957	22962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166153988
516	NC_010287	TG	3	6	23008	23013	0 %	50 %	50 %	0 %	166153988
517	NC_010287	TC	4	8	23183	23190	0 %	50 %	0 %	50 %	166153989
518	NC_010287	TACA	2	8	23216	23223	50 %	25 %	0 %	25 %	166153989
519	NC_010287	GCA	2	6	23229	23234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153989
520	NC_010287	ACG	2	6	23256	23261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153989
521	NC_010287	AAT	2	6	23304	23309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166153989
522	NC_010287	GTT	2	6	23417	23422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153989
523	NC_010287	AAC	2	6	23429	23434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166153989
524	NC_010287	GGAA	2	8	23536	23543	50 %	0 %	50 %	0 %	166153989
525	NC_010287	GAA	2	6	23592	23597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153989
526	NC_010287	AAAC	2	8	23613	23620	75 %	0 %	0 %	25 %	166153989
527	NC_010287	TTG	2	6	23679	23684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153989
528	NC_010287	AGA	3	9	23687	23695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153989
529	NC_010287	GAA	2	6	23748	23753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153989
530	NC_010287	TGA	2	6	23864	23869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166153989
531	NC_010287	GAA	2	6	23925	23930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153989
532	NC_010287	TTA	2	6	23967	23972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166153989
533	NC_010287	TCT	2	6	24131	24136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153989
534	NC_010287	AGG	2	6	24227	24232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166153989
535	NC_010287	AAAG	2	8	24239	24246	75 %	0 %	25 %	0 %	166153989
536	NC_010287	GTT	2	6	24309	24314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153990
537	NC_010287	CGA	2	6	24317	24322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153990
538	NC_010287	AGC	2	6	24342	24347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153990
539	NC_010287	AGC	2	6	24370	24375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153990
540	NC_010287	CTC	2	6	24497	24502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166153990
541	NC_010287	GGAT	2	8	24519	24526	25 %	25 %	50 %	0 %	166153990
542	NC_010287	AG	3	6	24559	24564	50 %	0 %	50 %	0 %	166153990
543	NC_010287	CTA	2	6	24691	24696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166153990
544	NC_010287	T	6	6	24703	24708	0 %	100 %	0 %	0 %	166153990
545	NC_010287	AGC	2	6	24753	24758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153990
546	NC_010287	ATG	2	6	24786	24791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166153990
547	NC_010287	AG	3	6	24913	24918	50 %	0 %	50 %	0 %	532524908
548	NC_010287	A	7	7	24936	24942	100 %	0 %	0 %	0 %	532524908
549	NC_010287	T	7	7	24951	24957	0 %	100 %	0 %	0 %	532524908
550	NC_010287	TGT	2	6	24976	24981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532524908
551	NC_010287	TCT	2	6	25050	25055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532524908
552	NC_010287	CAA	2	6	25064	25069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532524908
553	NC_010287	CCGA	2	8	25090	25097	25 %	0 %	25 %	50 %	166153991
554	NC_010287	TTC	2	6	25175	25180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153991
555	NC_010287	GAA	2	6	25258	25263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153991
556	NC_010287	AAC	2	6	25298	25303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166153991
557	NC_010287	GGC	2	6	25349	25354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166153991
558	NC_010287	TGC	2	6	25391	25396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166153991
559	NC_010287	TGTGAT	2	12	25499	25510	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	166153991
560	NC_010287	AGC	2	6	25520	25525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153991
561	NC_010287	ATG	2	6	25590	25595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166153991
562	NC_010287	GGA	2	6	25713	25718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166153991
563	NC_010287	TTC	2	6	25736	25741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153991
564	NC_010287	TCG	2	6	25757	25762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166153991
565	NC_010287	GAG	2	6	25780	25785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166153991
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568	NC_010287	TTC	2	6	25889	25894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153991
569	NC_010287	A	7	7	25924	25930	100 %	0 %	0 %	0 %	166153991
570	NC_010287	TAT	2	6	25931	25936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166153991
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573	NC_010287	TCT	2	6	26182	26187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532524909
574	NC_010287	TTTCT	2	10	26200	26209	0 %	80 %	0 %	20 %	532524909
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577	NC_010287	T	7	7	26493	26499	0 %	100 %	0 %	0 %	166153992
578	NC_010287	GA	3	6	26504	26509	50 %	0 %	50 %	0 %	166153992
579	NC_010287	AG	3	6	26559	26564	50 %	0 %	50 %	0 %	166153992
580	NC_010287	TGT	2	6	26619	26624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153992
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582	NC_010287	T	6	6	26674	26679	0 %	100 %	0 %	0 %	166153992
583	NC_010287	TTTTG	2	10	26711	26720	0 %	80 %	20 %	0 %	166153992
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591	NC_010287	CAA	2	6	27056	27061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166153992
592	NC_010287	TAT	2	6	27180	27185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166153992
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597	NC_010287	A	6	6	27462	27467	100 %	0 %	0 %	0 %	166153992
598	NC_010287	T	6	6	27508	27513	0 %	100 %	0 %	0 %	166153992
599	NC_010287	CTT	2	6	27583	27588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153992
600	NC_010287	GTT	2	6	27599	27604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153992
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603	NC_010287	TTC	2	6	27738	27743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153992
604	NC_010287	GAG	2	6	27763	27768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166153992
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607	NC_010287	TAT	2	6	27808	27813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166153992
608	NC_010287	T	6	6	27923	27928	0 %	100 %	0 %	0 %	166153992
609	NC_010287	CTAG	2	8	27954	27961	25 %	25 %	25 %	25 %	166153992
610	NC_010287	T	6	6	28003	28008	0 %	100 %	0 %	0 %	166153992
611	NC_010287	TGGC	2	8	28047	28054	0 %	25 %	50 %	25 %	166153992
612	NC_010287	ACT	2	6	28085	28090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166153992
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620	NC_010287	AGA	2	6	28516	28521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153993
621	NC_010287	GTT	2	6	28532	28537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153993
622	NC_010287	ATT	2	6	28561	28566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166153993
623	NC_010287	TGCTC	2	10	28648	28657	0 %	40 %	20 %	40 %	166153993
624	NC_010287	AGA	2	6	28660	28665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153993
625	NC_010287	TC	4	8	28704	28711	0 %	50 %	0 %	50 %	166153993
626	NC_010287	GGA	2	6	28718	28723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166153993
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