MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 20171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010287	CTC	2	6	314688	314693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154218
6002	NC_010287	GAA	2	6	314786	314791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154218
6003	NC_010287	TTC	2	6	314877	314882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154218
6004	NC_010287	CAG	2	6	314901	314906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154218
6005	NC_010287	GA	3	6	314907	314912	50 %	0 %	50 %	0 %	166154218
6006	NC_010287	GA	3	6	314923	314928	50 %	0 %	50 %	0 %	166154218
6007	NC_010287	TCA	3	9	315074	315082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154218
6008	NC_010287	T	6	6	315126	315131	0 %	100 %	0 %	0 %	166154218
6009	NC_010287	A	6	6	315164	315169	100 %	0 %	0 %	0 %	166154218
6010	NC_010287	ATA	2	6	315183	315188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154218
6011	NC_010287	AAT	4	12	315224	315235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154218
6012	NC_010287	TGG	3	9	315238	315246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154218
6013	NC_010287	TTTC	2	8	315309	315316	0 %	75 %	0 %	25 %	166154218
6014	NC_010287	GCGGAG	2	12	315336	315347	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	166154218
6015	NC_010287	AGG	2	6	315385	315390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154218
6016	NC_010287	TTC	2	6	315395	315400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154218
6017	NC_010287	GAT	2	6	315419	315424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154218
6018	NC_010287	TGC	2	6	315436	315441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154218
6019	NC_010287	AGG	2	6	315469	315474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154218
6020	NC_010287	GGA	2	6	315479	315484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154218
6021	NC_010287	GAT	2	6	315500	315505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154218
6022	NC_010287	GAT	2	6	315608	315613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154218
6023	NC_010287	CAG	2	6	315636	315641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154218
6024	NC_010287	CTA	2	6	315669	315674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154218
6025	NC_010287	GAAA	2	8	315710	315717	75 %	0 %	25 %	0 %	166154218
6026	NC_010287	AGG	2	6	315730	315735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154218
6027	NC_010287	T	6	6	315810	315815	0 %	100 %	0 %	0 %	166154218
6028	NC_010287	AGCGC	2	10	315846	315855	20 %	0 %	40 %	40 %	166154218
6029	NC_010287	AAC	2	6	315877	315882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154218
6030	NC_010287	GTA	2	6	315932	315937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154218
6031	NC_010287	CAG	2	6	315948	315953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154218
6032	NC_010287	ACCATC	2	12	315967	315978	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	166154218
6033	NC_010287	TTC	3	9	315979	315987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154218
6034	NC_010287	CTG	2	6	315993	315998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154218
6035	NC_010287	CCG	2	6	316041	316046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	166154218
6036	NC_010287	AGG	2	6	316120	316125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154218
6037	NC_010287	GTTG	2	8	316129	316136	0 %	50 %	50 %	0 %	166154218
6038	NC_010287	ACT	2	6	316157	316162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154218
6039	NC_010287	TGC	2	6	316231	316236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154218
6040	NC_010287	ATA	2	6	316239	316244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154218
6041	NC_010287	GATT	2	8	316273	316280	25 %	50 %	25 %	0 %	166154218
6042	NC_010287	TCT	2	6	316445	316450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154218
6043	NC_010287	AGT	2	6	316451	316456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154218
6044	NC_010287	ATG	2	6	316494	316499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154218
6045	NC_010287	TGC	2	6	316504	316509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154218
6046	NC_010287	CCT	2	6	316586	316591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154218
6047	NC_010287	CT	3	6	316687	316692	0 %	50 %	0 %	50 %	166154218
6048	NC_010287	GAT	2	6	316817	316822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154218
6049	NC_010287	CTG	2	6	316863	316868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154218
6050	NC_010287	CAAA	2	8	316925	316932	75 %	0 %	0 %	25 %	166154218
6051	NC_010287	TGT	2	6	316974	316979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154218
6052	NC_010287	GAA	2	6	316989	316994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154218
6053	NC_010287	TGT	2	6	317023	317028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154218
6054	NC_010287	CAA	2	6	317128	317133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154218
6055	NC_010287	TAT	2	6	317138	317143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154218
6056	NC_010287	GGA	2	6	317246	317251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154218
6057	NC_010287	GAG	2	6	317301	317306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154218
6058	NC_010287	ATA	2	6	317313	317318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154218
6059	NC_010287	TC	3	6	317321	317326	0 %	50 %	0 %	50 %	166154218
6060	NC_010287	ATT	2	6	317447	317452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154218
6061	NC_010287	CTT	3	9	317503	317511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154218
6062	NC_010287	TCA	2	6	317536	317541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154218
6063	NC_010287	TCG	3	9	317578	317586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154218
6064	NC_010287	TAA	2	6	317630	317635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154218
6065	NC_010287	TGC	2	6	318068	318073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154219
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6067	NC_010287	ATC	2	6	318216	318221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154219
6068	NC_010287	A	7	7	318244	318250	100 %	0 %	0 %	0 %	166154219
6069	NC_010287	TGT	2	6	318263	318268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154219
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6071	NC_010287	TA	3	6	318366	318371	50 %	50 %	0 %	0 %	166154219
6072	NC_010287	GA	3	6	318405	318410	50 %	0 %	50 %	0 %	166154219
6073	NC_010287	AG	3	6	318451	318456	50 %	0 %	50 %	0 %	166154219
6074	NC_010287	GTTAG	2	10	318464	318473	20 %	40 %	40 %	0 %	166154219
6075	NC_010287	GGGA	2	8	318526	318533	25 %	0 %	75 %	0 %	166154219
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6081	NC_010287	T	8	8	319005	319012	0 %	100 %	0 %	0 %	166154220
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6086	NC_010287	TA	3	6	319344	319349	50 %	50 %	0 %	0 %	166154220
6087	NC_010287	TAA	2	6	319370	319375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154220
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6097	NC_010287	AG	3	6	319890	319895	50 %	0 %	50 %	0 %	166154220
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6109	NC_010287	GAACA	2	10	320433	320442	60 %	0 %	20 %	20 %	166154220
6110	NC_010287	AG	3	6	320463	320468	50 %	0 %	50 %	0 %	166154220
6111	NC_010287	CTCC	2	8	320470	320477	0 %	25 %	0 %	75 %	166154220
6112	NC_010287	TGT	2	6	320513	320518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154220
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6114	NC_010287	CAAG	2	8	320623	320630	50 %	0 %	25 %	25 %	166154220
6115	NC_010287	AG	6	12	320629	320640	50 %	0 %	50 %	0 %	166154220
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6118	NC_010287	TAC	2	6	320747	320752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154220
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6121	NC_010287	AGA	2	6	320862	320867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154220
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6123	NC_010287	ATT	2	6	320976	320981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154220
6124	NC_010287	TGA	2	6	321007	321012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154220
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6128	NC_010287	A	6	6	321237	321242	100 %	0 %	0 %	0 %	166154220
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6148	NC_010287	GCC	2	6	322249	322254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	166154221
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6231	NC_010287	A	7	7	326619	326625	100 %	0 %	0 %	0 %	166154225
6232	NC_010287	TGA	2	6	326717	326722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154225
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6243	NC_010287	TTGG	2	8	327207	327214	0 %	50 %	50 %	0 %	166154225
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6493	NC_010287	GAA	2	6	340415	340420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154237
6494	NC_010287	TC	3	6	340470	340475	0 %	50 %	0 %	50 %	166154237
6495	NC_010287	AGA	2	6	340519	340524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154237
6496	NC_010287	TGC	2	6	340842	340847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154238
6497	NC_010287	TC	3	6	340898	340903	0 %	50 %	0 %	50 %	166154238
6498	NC_010287	GA	3	6	340913	340918	50 %	0 %	50 %	0 %	166154238
6499	NC_010287	GA	3	6	341012	341017	50 %	0 %	50 %	0 %	166154238
6500	NC_010287	ACT	2	6	341024	341029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154238

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