MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 20171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010287	CTG	2	6	238510	238515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154160
4502	NC_010287	TCT	2	6	238518	238523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154160
4503	NC_010287	AC	3	6	238566	238571	50 %	0 %	0 %	50 %	166154160
4504	NC_010287	ATT	2	6	238644	238649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154160
4505	NC_010287	AGA	2	6	238670	238675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154160
4506	NC_010287	GTA	2	6	238692	238697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154160
4507	NC_010287	TCA	2	6	238701	238706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154160
4508	NC_010287	ATC	2	6	238837	238842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154160
4509	NC_010287	TAT	2	6	238852	238857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154160
4510	NC_010287	TGC	2	6	238859	238864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154160
4511	NC_010287	TCT	2	6	238914	238919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154160
4512	NC_010287	T	6	6	238931	238936	0 %	100 %	0 %	0 %	166154160
4513	NC_010287	AGA	2	6	239066	239071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154160
4514	NC_010287	A	6	6	239082	239087	100 %	0 %	0 %	0 %	166154160
4515	NC_010287	ATT	2	6	239095	239100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154160
4516	NC_010287	T	6	6	239186	239191	0 %	100 %	0 %	0 %	166154160
4517	NC_010287	CTT	2	6	239245	239250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154160
4518	NC_010287	AT	3	6	239345	239350	50 %	50 %	0 %	0 %	166154160
4519	NC_010287	GCTA	2	8	239363	239370	25 %	25 %	25 %	25 %	166154160
4520	NC_010287	TCA	2	6	239374	239379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154160
4521	NC_010287	GTCA	2	8	239380	239387	25 %	25 %	25 %	25 %	166154160
4522	NC_010287	CAGCT	2	10	239557	239566	20 %	20 %	20 %	40 %	166154160
4523	NC_010287	GCAA	2	8	239636	239643	50 %	0 %	25 %	25 %	166154160
4524	NC_010287	GAG	2	6	239724	239729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154160
4525	NC_010287	AGC	2	6	239780	239785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154160
4526	NC_010287	TTAAAA	2	12	239787	239798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154160
4527	NC_010287	TTA	2	6	239863	239868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154160
4528	NC_010287	GCT	2	6	240000	240005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154160
4529	NC_010287	CGA	2	6	240011	240016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154160
4530	NC_010287	TGC	2	6	240047	240052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154160
4531	NC_010287	AG	3	6	240106	240111	50 %	0 %	50 %	0 %	166154160
4532	NC_010287	TAGA	2	8	240121	240128	50 %	25 %	25 %	0 %	166154160
4533	NC_010287	CTTG	2	8	240293	240300	0 %	50 %	25 %	25 %	166154161
4534	NC_010287	AAC	2	6	240308	240313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154161
4535	NC_010287	ACG	2	6	240372	240377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154161
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4537	NC_010287	TGGT	2	8	240522	240529	0 %	50 %	50 %	0 %	166154161
4538	NC_010287	TGG	2	6	240556	240561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154161
4539	NC_010287	TGG	2	6	240575	240580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154161
4540	NC_010287	GTA	2	6	240648	240653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154161
4541	NC_010287	T	6	6	240654	240659	0 %	100 %	0 %	0 %	166154161
4542	NC_010287	ATT	2	6	240674	240679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154161
4543	NC_010287	ATTTT	2	10	240834	240843	20 %	80 %	0 %	0 %	166154161
4544	NC_010287	GTT	2	6	240864	240869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154161
4545	NC_010287	GAA	2	6	240911	240916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154161
4546	NC_010287	CAT	2	6	240956	240961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154161
4547	NC_010287	TTTC	2	8	240994	241001	0 %	75 %	0 %	25 %	166154161
4548	NC_010287	T	6	6	241089	241094	0 %	100 %	0 %	0 %	166154161
4549	NC_010287	T	6	6	241098	241103	0 %	100 %	0 %	0 %	166154161
4550	NC_010287	T	6	6	241149	241154	0 %	100 %	0 %	0 %	166154161
4551	NC_010287	GAAA	2	8	241345	241352	75 %	0 %	25 %	0 %	166154161
4552	NC_010287	TTA	2	6	241355	241360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154161
4553	NC_010287	TTC	2	6	241372	241377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154161
4554	NC_010287	CT	3	6	241393	241398	0 %	50 %	0 %	50 %	166154161
4555	NC_010287	CTT	2	6	241419	241424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154161
4556	NC_010287	GT	3	6	241663	241668	0 %	50 %	50 %	0 %	166154162
4557	NC_010287	AGG	2	6	241669	241674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154162
4558	NC_010287	TTG	2	6	241683	241688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154162
4559	NC_010287	GT	3	6	241710	241715	0 %	50 %	50 %	0 %	166154162
4560	NC_010287	GTG	2	6	241760	241765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154162
4561	NC_010287	TTGG	2	8	241780	241787	0 %	50 %	50 %	0 %	166154162
4562	NC_010287	GAA	2	6	241871	241876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154162
4563	NC_010287	GGA	2	6	241961	241966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154162
4564	NC_010287	TTCT	2	8	241971	241978	0 %	75 %	0 %	25 %	166154162
4565	NC_010287	GA	3	6	241989	241994	50 %	0 %	50 %	0 %	166154162
4566	NC_010287	ATT	2	6	242088	242093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154162
4567	NC_010287	GTTT	2	8	242104	242111	0 %	75 %	25 %	0 %	166154162
4568	NC_010287	CT	3	6	242200	242205	0 %	50 %	0 %	50 %	166154162
4569	NC_010287	TCT	2	6	242223	242228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154162
4570	NC_010287	ACT	2	6	242268	242273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154162
4571	NC_010287	CTG	2	6	242415	242420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154162
4572	NC_010287	ATT	2	6	242473	242478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154162
4573	NC_010287	T	6	6	242483	242488	0 %	100 %	0 %	0 %	166154162
4574	NC_010287	CTT	2	6	242499	242504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154162
4575	NC_010287	TA	3	6	242537	242542	50 %	50 %	0 %	0 %	166154162
4576	NC_010287	T	6	6	242622	242627	0 %	100 %	0 %	0 %	166154162
4577	NC_010287	ATGGA	2	10	242713	242722	40 %	20 %	40 %	0 %	166154162
4578	NC_010287	AGG	2	6	242764	242769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154162
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4581	NC_010287	TGG	2	6	243037	243042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154163
4582	NC_010287	CTG	2	6	243110	243115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154163
4583	NC_010287	CGC	2	6	243183	243188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	166154163
4584	NC_010287	CTG	2	6	243227	243232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154163
4585	NC_010287	CAG	2	6	243251	243256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154163
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4587	NC_010287	GTT	2	6	243378	243383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154163
4588	NC_010287	AGT	2	6	243432	243437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154163
4589	NC_010287	TCG	2	6	243453	243458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154163
4590	NC_010287	CGTAG	2	10	243466	243475	20 %	20 %	40 %	20 %	166154163
4591	NC_010287	CTTT	2	8	243502	243509	0 %	75 %	0 %	25 %	166154163
4592	NC_010287	TTG	2	6	243559	243564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154163
4593	NC_010287	AG	4	8	243811	243818	50 %	0 %	50 %	0 %	166154164
4594	NC_010287	CCT	2	6	243819	243824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154164
4595	NC_010287	ATCG	2	8	243923	243930	25 %	25 %	25 %	25 %	166154164
4596	NC_010287	TCA	2	6	243931	243936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154164
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4598	NC_010287	AAG	2	6	244001	244006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154164
4599	NC_010287	GT	6	12	244011	244022	0 %	50 %	50 %	0 %	166154164
4600	NC_010287	CTG	2	6	244069	244074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154164
4601	NC_010287	GCA	3	9	244098	244106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154164
4602	NC_010287	TCC	2	6	244109	244114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154164
4603	NC_010287	CAA	2	6	244155	244160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154164
4604	NC_010287	CGGAA	2	10	244180	244189	40 %	0 %	40 %	20 %	166154164
4605	NC_010287	ATA	2	6	244232	244237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154164
4606	NC_010287	GTT	2	6	244260	244265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154164
4607	NC_010287	AAT	2	6	244343	244348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154164
4608	NC_010287	AAGA	2	8	244356	244363	75 %	0 %	25 %	0 %	166154164
4609	NC_010287	TCA	2	6	244389	244394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154164
4610	NC_010287	TTC	2	6	244415	244420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154164
4611	NC_010287	TAA	2	6	244484	244489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154164
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4613	NC_010287	AG	3	6	244515	244520	50 %	0 %	50 %	0 %	166154164
4614	NC_010287	GTTT	2	8	244525	244532	0 %	75 %	25 %	0 %	166154164
4615	NC_010287	TTAT	2	8	244613	244620	25 %	75 %	0 %	0 %	166154165
4616	NC_010287	C	6	6	244676	244681	0 %	0 %	0 %	100 %	166154165
4617	NC_010287	AGC	2	6	244714	244719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154165
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4619	NC_010287	A	6	6	244783	244788	100 %	0 %	0 %	0 %	166154165
4620	NC_010287	GGT	2	6	244795	244800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154165
4621	NC_010287	TTA	2	6	244823	244828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154165
4622	NC_010287	GCA	2	6	244829	244834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154165
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4991	NC_010287	CAC	2	6	263577	263582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166154180
4992	NC_010287	AAAC	2	8	263631	263638	75 %	0 %	0 %	25 %	166154180
4993	NC_010287	TCT	2	6	263792	263797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154180
4994	NC_010287	TGGT	2	8	263916	263923	0 %	50 %	50 %	0 %	166154180
4995	NC_010287	AGA	2	6	263985	263990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154180
4996	NC_010287	A	6	6	264469	264474	100 %	0 %	0 %	0 %	166154181
4997	NC_010287	ATT	2	6	264486	264491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154181
4998	NC_010287	CAA	2	6	264520	264525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154181
4999	NC_010287	CT	3	6	264528	264533	0 %	50 %	0 %	50 %	166154181
5000	NC_010287	GAA	2	6	264541	264546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154181

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