MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 12658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010280	GAA	2	6	139	144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154849
2	NC_010280	TAA	2	6	258	263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154849
3	NC_010280	ACA	2	6	299	304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154849
4	NC_010280	TCA	2	6	356	361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154849
5	NC_010280	ATA	2	6	413	418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154849
6	NC_010280	ATG	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154849
7	NC_010280	TTG	2	6	494	499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154849
8	NC_010280	ATG	2	6	511	516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154849
9	NC_010280	TTC	2	6	636	641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154849
10	NC_010280	AAG	2	6	695	700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154849
11	NC_010280	GAA	3	9	724	732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154849
12	NC_010280	TGA	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154849
13	NC_010280	GGT	2	6	813	818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154849
14	NC_010280	GCT	2	6	856	861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154849
15	NC_010280	GGT	2	6	872	877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154849
16	NC_010280	TAA	2	6	893	898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154849
17	NC_010280	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154849
18	NC_010280	GAA	2	6	1016	1021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154849
19	NC_010280	GAG	2	6	1047	1052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154850
20	NC_010280	TCT	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154850
21	NC_010280	CTT	2	6	1186	1191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154850
22	NC_010280	TAA	3	9	1216	1224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154850
23	NC_010280	AAT	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154850
24	NC_010280	TCT	2	6	1470	1475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154850
25	NC_010280	GAA	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154850
26	NC_010280	AGG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154850
27	NC_010280	TGT	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154850
28	NC_010280	ACA	2	6	1710	1715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154850
29	NC_010280	TGA	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154850
30	NC_010280	CAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154850
31	NC_010280	TAA	2	6	1911	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154850
32	NC_010280	TCT	2	6	1920	1925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154850
33	NC_010280	GAA	2	6	1929	1934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154850
34	NC_010280	TAA	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154850
35	NC_010280	GAG	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154850
36	NC_010280	CTT	3	9	2150	2158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154850
37	NC_010280	TAA	2	6	2230	2235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154850
38	NC_010280	CAG	2	6	2275	2280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154850
39	NC_010280	AAC	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154850
40	NC_010280	GAG	2	6	2502	2507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154851
41	NC_010280	CTT	2	6	2566	2571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154851
42	NC_010280	ATT	2	6	2663	2668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154851
43	NC_010280	GTC	2	6	2792	2797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154851
44	NC_010280	AGG	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154851
45	NC_010280	ATT	2	6	2885	2890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154851
46	NC_010280	ATC	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154852
47	NC_010280	ATG	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154852
48	NC_010280	AAC	2	6	3200	3205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154852
49	NC_010280	ACA	2	6	3259	3264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154852
50	NC_010280	TCA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154852
51	NC_010280	GGT	2	6	3442	3447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154852
52	NC_010280	TTG	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154852
53	NC_010280	AAG	2	6	3591	3596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154852
54	NC_010280	AGC	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154852
55	NC_010280	TGG	2	6	3710	3715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154852
56	NC_010280	GAA	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154852
57	NC_010280	TGG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154852
58	NC_010280	TCT	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154852
59	NC_010280	ATG	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154852
60	NC_010280	AAG	2	6	3895	3900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154852
61	NC_010280	CTT	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154852
62	NC_010280	TCA	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154852
63	NC_010280	TTG	2	6	4015	4020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154852
64	NC_010280	TGT	2	6	4034	4039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154852
65	NC_010280	AGA	2	6	4151	4156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154852
66	NC_010280	CAA	2	6	4223	4228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154852
67	NC_010280	AAG	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154852
68	NC_010280	AGC	2	6	4322	4327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154852
69	NC_010280	AAG	2	6	4408	4413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154852
70	NC_010280	TAT	2	6	4586	4591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154852
71	NC_010280	AAG	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154852
72	NC_010280	AGA	2	6	4683	4688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154852
73	NC_010280	GAA	2	6	4690	4695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154852
74	NC_010280	ACT	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154852
75	NC_010280	AGA	2	6	4791	4796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154852
76	NC_010280	GAA	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154852
77	NC_010280	GTT	2	6	4963	4968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154852
78	NC_010280	AAG	2	6	5116	5121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154852
79	NC_010280	TCT	2	6	5140	5145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154852
80	NC_010280	TTA	2	6	5441	5446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154853
81	NC_010280	AGA	2	6	5575	5580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154853
82	NC_010280	TCA	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154853
83	NC_010280	TAT	2	6	5774	5779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154853
84	NC_010280	TTG	2	6	5872	5877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154853
85	NC_010280	ATT	2	6	5936	5941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154853
86	NC_010280	AGA	3	9	6001	6009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154853
87	NC_010280	TCG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154853
88	NC_010280	TAC	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154853
89	NC_010280	AGA	2	6	6163	6168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154853
90	NC_010280	AGA	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154853
91	NC_010280	TTG	2	6	6574	6579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154854
92	NC_010280	ATT	2	6	6588	6593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154854
93	NC_010280	TTC	2	6	6664	6669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154854
94	NC_010280	TTG	2	6	6700	6705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154854
95	NC_010280	TTG	2	6	6881	6886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154854
96	NC_010280	TGT	2	6	6929	6934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154854
97	NC_010280	GTT	2	6	6945	6950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154854
98	NC_010280	TGG	2	6	6958	6963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154854
99	NC_010280	TTG	2	6	6967	6972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154854
100	NC_010280	TCA	2	6	6997	7002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154854
101	NC_010280	GTG	2	6	7039	7044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154854
102	NC_010280	TTC	2	6	7384	7389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154854
103	NC_010280	ACC	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166154854
104	NC_010280	AGT	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154854
105	NC_010280	ATG	2	6	7625	7630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154855
106	NC_010280	GCT	2	6	7657	7662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154855
107	NC_010280	GAT	2	6	7773	7778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154855
108	NC_010280	CGA	2	6	7811	7816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154855
109	NC_010280	CTT	3	9	7835	7843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154855
110	NC_010280	GTA	2	6	7844	7849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154855
111	NC_010280	GAA	2	6	7909	7914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154855
112	NC_010280	AAT	2	6	7956	7961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154855
113	NC_010280	AAT	2	6	7993	7998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154855
114	NC_010280	TTC	2	6	8019	8024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154855
115	NC_010280	AGC	2	6	8031	8036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154855
116	NC_010280	AGA	2	6	8160	8165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154855
117	NC_010280	AGG	2	6	8256	8261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154855
118	NC_010280	TGA	2	6	8271	8276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154855
119	NC_010280	CTA	2	6	8309	8314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154855
120	NC_010280	ATG	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154855
121	NC_010280	TAC	2	6	8511	8516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154855
122	NC_010280	CGA	2	6	8583	8588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154855
123	NC_010280	TCA	2	6	8602	8607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154855
124	NC_010280	TGA	2	6	8630	8635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154855
125	NC_010280	AAT	2	6	8734	8739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154855
126	NC_010280	AGA	2	6	8841	8846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154855
127	NC_010280	TCA	2	6	8900	8905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154855
128	NC_010280	TTG	2	6	8922	8927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154855
129	NC_010280	TAG	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154855
130	NC_010280	AAG	2	6	9119	9124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154855
131	NC_010280	TCT	2	6	9148	9153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154855
132	NC_010280	TCT	2	6	9160	9165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154855
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500	NC_010280	AGC	2	6	40266	40271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154880

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