MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 19991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010280	TGT	2	6	216228	216233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155015
4002	NC_010280	AGT	2	6	216237	216242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155015
4003	NC_010280	CTT	2	6	216292	216297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155015
4004	NC_010280	AGG	2	6	216307	216312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166155015
4005	NC_010280	GCA	3	9	216315	216323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155015
4006	NC_010280	CAT	2	6	216346	216351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155015
4007	NC_010280	TG	3	6	216393	216398	0 %	50 %	50 %	0 %	166155015
4008	NC_010280	CTT	2	6	216454	216459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155015
4009	NC_010280	A	7	7	216470	216476	100 %	0 %	0 %	0 %	166155015
4010	NC_010280	AAT	2	6	216525	216530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155015
4011	NC_010280	TG	3	6	216560	216565	0 %	50 %	50 %	0 %	166155015
4012	NC_010280	TG	3	6	216647	216652	0 %	50 %	50 %	0 %	166155015
4013	NC_010280	AAT	2	6	216653	216658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155015
4014	NC_010280	AAG	2	6	217274	217279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155016
4015	NC_010280	TTA	2	6	217284	217289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166155016
4016	NC_010280	CTG	2	6	217317	217322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155016
4017	NC_010280	TTTC	2	8	217385	217392	0 %	75 %	0 %	25 %	166155016
4018	NC_010280	ATG	2	6	217497	217502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155016
4019	NC_010280	GAA	2	6	217520	217525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155016
4020	NC_010280	TAG	2	6	217527	217532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155016
4021	NC_010280	AGG	2	6	217603	217608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166155016
4022	NC_010280	GTT	2	6	217640	217645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155016
4023	NC_010280	AAG	2	6	217767	217772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155016
4024	NC_010280	ACG	2	6	217789	217794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155016
4025	NC_010280	GTT	2	6	217818	217823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155017
4026	NC_010280	GAC	2	6	217840	217845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155017
4027	NC_010280	TTG	2	6	217881	217886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155017
4028	NC_010280	T	6	6	217904	217909	0 %	100 %	0 %	0 %	166155017
4029	NC_010280	GTT	2	6	217977	217982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155017
4030	NC_010280	CAC	2	6	217994	217999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166155017
4031	NC_010280	AAG	2	6	218037	218042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155017
4032	NC_010280	TTG	2	6	218071	218076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155017
4033	NC_010280	GAC	2	6	218082	218087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155017
4034	NC_010280	TGG	2	6	218135	218140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166155017
4035	NC_010280	CAATC	2	10	218175	218184	40 %	20 %	0 %	40 %	166155017
4036	NC_010280	ATT	2	6	218185	218190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166155017
4037	NC_010280	TAT	2	6	218254	218259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166155017
4038	NC_010280	TGAA	2	8	218272	218279	50 %	25 %	25 %	0 %	166155017
4039	NC_010280	AGA	2	6	218315	218320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155017
4040	NC_010280	GTT	2	6	218338	218343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155017
4041	NC_010280	A	10	10	218486	218495	100 %	0 %	0 %	0 %	166155018
4042	NC_010280	TGG	2	6	218596	218601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166155018
4043	NC_010280	GTG	2	6	218655	218660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166155018
4044	NC_010280	TAC	2	6	218675	218680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155018
4045	NC_010280	TTTA	2	8	218681	218688	25 %	75 %	0 %	0 %	166155018
4046	NC_010280	GA	3	6	218725	218730	50 %	0 %	50 %	0 %	166155018
4047	NC_010280	TCT	2	6	218749	218754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155018
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4049	NC_010280	AAG	2	6	218787	218792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155018
4050	NC_010280	AAT	2	6	218817	218822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155018
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4052	NC_010280	TTA	2	6	218953	218958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166155019
4053	NC_010280	TTC	2	6	218974	218979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155019
4054	NC_010280	AAG	2	6	218981	218986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155019
4055	NC_010280	TCT	2	6	219000	219005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155019
4056	NC_010280	GCT	2	6	219017	219022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155019
4057	NC_010280	AG	3	6	219037	219042	50 %	0 %	50 %	0 %	166155019
4058	NC_010280	TTA	2	6	219122	219127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166155020
4059	NC_010280	TTG	2	6	219162	219167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155020
4060	NC_010280	GCAA	2	8	219247	219254	50 %	0 %	25 %	25 %	166155020
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4062	NC_010280	TGC	2	6	219273	219278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155020
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4064	NC_010280	AAT	2	6	219368	219373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155020
4065	NC_010280	ATGAT	2	10	219396	219405	40 %	40 %	20 %	0 %	166155020
4066	NC_010280	TGC	2	6	219409	219414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155020
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4070	NC_010280	AGA	2	6	219589	219594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155020
4071	NC_010280	AAG	2	6	219597	219602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155020
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4073	NC_010280	GAT	2	6	219731	219736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155021
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4075	NC_010280	TAAT	2	8	219822	219829	50 %	50 %	0 %	0 %	166155021
4076	NC_010280	AGG	2	6	219958	219963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166155021
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4092	NC_010280	CAA	2	6	220989	220994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155022
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4095	NC_010280	AAG	2	6	221120	221125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155022
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4101	NC_010280	ATAA	2	8	221315	221322	75 %	25 %	0 %	0 %	166155022
4102	NC_010280	CA	3	6	221359	221364	50 %	0 %	0 %	50 %	166155022
4103	NC_010280	CAA	2	6	221367	221372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155022
4104	NC_010280	AAC	2	6	221374	221379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155022
4105	NC_010280	ATGA	2	8	221380	221387	50 %	25 %	25 %	0 %	166155022
4106	NC_010280	AAT	2	6	221389	221394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155022
4107	NC_010280	GAAG	2	8	221399	221406	50 %	0 %	50 %	0 %	166155022
4108	NC_010280	TCAT	2	8	221411	221418	25 %	50 %	0 %	25 %	166155022
4109	NC_010280	A	7	7	221477	221483	100 %	0 %	0 %	0 %	166155022
4110	NC_010280	TTG	2	6	221484	221489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155022
4111	NC_010280	CAA	2	6	221519	221524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155022
4112	NC_010280	GAA	2	6	221565	221570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155022
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4114	NC_010280	GAA	2	6	221597	221602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155022
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4117	NC_010280	AAT	2	6	221710	221715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155022
4118	NC_010280	A	6	6	221738	221743	100 %	0 %	0 %	0 %	166155022
4119	NC_010280	TGC	2	6	221755	221760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155022
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4121	NC_010280	CCA	3	9	221773	221781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166155022
4122	NC_010280	CT	3	6	221826	221831	0 %	50 %	0 %	50 %	166155022
4123	NC_010280	ATA	2	6	221879	221884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155022
4124	NC_010280	TA	3	6	221946	221951	50 %	50 %	0 %	0 %	166155022
4125	NC_010280	ATC	2	6	222062	222067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155022
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4133	NC_010280	T	6	6	222524	222529	0 %	100 %	0 %	0 %	166155023
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4234	NC_010280	CAT	2	6	226690	226695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155025
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4238	NC_010280	ATCG	2	8	226895	226902	25 %	25 %	25 %	25 %	166155025
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4241	NC_010280	CGAT	2	8	226974	226981	25 %	25 %	25 %	25 %	166155025
4242	NC_010280	TTCT	2	8	226982	226989	0 %	75 %	0 %	25 %	166155025
4243	NC_010280	ATA	2	6	227027	227032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155025
4244	NC_010280	CGT	2	6	227045	227050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155025
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4246	NC_010280	T	6	6	227153	227158	0 %	100 %	0 %	0 %	166155025
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4487	NC_010280	CTTG	2	8	240299	240306	0 %	50 %	25 %	25 %	166155036
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4491	NC_010280	TGGT	2	8	240528	240535	0 %	50 %	50 %	0 %	166155036
4492	NC_010280	TGG	2	6	240562	240567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166155036
4493	NC_010280	TGG	2	6	240581	240586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166155036
4494	NC_010280	GTA	2	6	240654	240659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155036
4495	NC_010280	T	6	6	240660	240665	0 %	100 %	0 %	0 %	166155036
4496	NC_010280	ATT	2	6	240680	240685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166155036
4497	NC_010280	ATTTT	2	10	240840	240849	20 %	80 %	0 %	0 %	166155036
4498	NC_010280	GTT	2	6	240870	240875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155036
4499	NC_010280	GAA	2	6	240917	240922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155036
4500	NC_010280	CAT	2	6	240962	240967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155036

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