MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 19991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_010280	TGC	3	9	101202	101210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154928
2003	NC_010280	T	7	7	101231	101237	0 %	100 %	0 %	0 %	166154928
2004	NC_010280	A	6	6	101255	101260	100 %	0 %	0 %	0 %	166154928
2005	NC_010280	CACCTA	2	12	101336	101347	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	166154928
2006	NC_010280	AAC	2	6	101358	101363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154928
2007	NC_010280	TTG	2	6	101393	101398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154928
2008	NC_010280	TTC	2	6	101406	101411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154928
2009	NC_010280	TAA	2	6	101433	101438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154928
2010	NC_010280	TGA	2	6	101481	101486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154928
2011	NC_010280	G	6	6	101509	101514	0 %	0 %	100 %	0 %	166154928
2012	NC_010280	AGA	3	9	101535	101543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154928
2013	NC_010280	CAA	2	6	101596	101601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154928
2014	NC_010280	AAT	2	6	101683	101688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154928
2015	NC_010280	AAAGT	2	10	101705	101714	60 %	20 %	20 %	0 %	166154928
2016	NC_010280	CGATG	2	10	101781	101790	20 %	20 %	40 %	20 %	166154928
2017	NC_010280	CT	3	6	101811	101816	0 %	50 %	0 %	50 %	166154928
2018	NC_010280	GA	3	6	101824	101829	50 %	0 %	50 %	0 %	166154928
2019	NC_010280	AACA	2	8	101909	101916	75 %	0 %	0 %	25 %	166154928
2020	NC_010280	GCTT	2	8	101975	101982	0 %	50 %	25 %	25 %	166154928
2021	NC_010280	TGA	2	6	102030	102035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154928
2022	NC_010280	TCAT	2	8	102077	102084	25 %	50 %	0 %	25 %	166154928
2023	NC_010280	TGA	2	6	102093	102098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154928
2024	NC_010280	TTA	2	6	102174	102179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154928
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2027	NC_010280	CTT	2	6	102230	102235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154928
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2042	NC_010280	TTA	2	6	103018	103023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154928
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2049	NC_010280	AGC	2	6	103286	103291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154928
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2371	NC_010280	TGA	2	6	119066	119071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154944
2372	NC_010280	GGA	2	6	119102	119107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154944
2373	NC_010280	AGA	2	6	119214	119219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154944
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2375	NC_010280	AAC	2	6	119250	119255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154944
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2383	NC_010280	A	6	6	119789	119794	100 %	0 %	0 %	0 %	166154944
2384	NC_010280	AAT	2	6	119835	119840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154945
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2393	NC_010280	TCTT	2	8	120246	120253	0 %	75 %	0 %	25 %	166154945
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2400	NC_010280	T	7	7	120470	120476	0 %	100 %	0 %	0 %	166154945
2401	NC_010280	TGA	2	6	120480	120485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154945
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2403	NC_010280	TCC	2	6	120534	120539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154945
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2485	NC_010280	GGA	2	6	124545	124550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154949
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2491	NC_010280	GGAA	2	8	124885	124892	50 %	0 %	50 %	0 %	166154949
2492	NC_010280	AAG	2	6	125023	125028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154950
2493	NC_010280	AGAA	2	8	125063	125070	75 %	0 %	25 %	0 %	166154950
2494	NC_010280	CTA	2	6	125113	125118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154950
2495	NC_010280	CTT	2	6	125278	125283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154950
2496	NC_010280	TCA	2	6	125341	125346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154950
2497	NC_010280	GTAA	2	8	125414	125421	50 %	25 %	25 %	0 %	166154950
2498	NC_010280	TTG	2	6	125456	125461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154950
2499	NC_010280	TG	3	6	125489	125494	0 %	50 %	50 %	0 %	166154950
2500	NC_010280	CAG	2	6	125581	125586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154950

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