MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 19991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_010280	ATC	2	6	75361	75366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154910
1503	NC_010280	GAA	2	6	75438	75443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154910
1504	NC_010280	A	6	6	75462	75467	100 %	0 %	0 %	0 %	166154910
1505	NC_010280	AAGCTC	2	12	75478	75489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	166154910
1506	NC_010280	GGAG	2	8	75556	75563	25 %	0 %	75 %	0 %	166154910
1507	NC_010280	AGGA	2	8	75574	75581	50 %	0 %	50 %	0 %	166154910
1508	NC_010280	CCT	2	6	75699	75704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154910
1509	NC_010280	TTC	2	6	75749	75754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154910
1510	NC_010280	GCT	2	6	75786	75791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154910
1511	NC_010280	GTA	2	6	75792	75797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154910
1512	NC_010280	CTA	2	6	76190	76195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154911
1513	NC_010280	TCT	2	6	76297	76302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154911
1514	NC_010280	GAG	2	6	76304	76309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154911
1515	NC_010280	TC	3	6	76358	76363	0 %	50 %	0 %	50 %	166154911
1516	NC_010280	ACT	3	9	76375	76383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154911
1517	NC_010280	ATC	2	6	76418	76423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154911
1518	NC_010280	ATT	2	6	76489	76494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154911
1519	NC_010280	TGCG	2	8	76505	76512	0 %	25 %	50 %	25 %	166154911
1520	NC_010280	ACT	2	6	76639	76644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154911
1521	NC_010280	AGCG	2	8	76651	76658	25 %	0 %	50 %	25 %	166154911
1522	NC_010280	GCGT	2	8	76669	76676	0 %	25 %	50 %	25 %	166154911
1523	NC_010280	GGGA	2	8	76767	76774	25 %	0 %	75 %	0 %	166154911
1524	NC_010280	TGA	2	6	76833	76838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154911
1525	NC_010280	AGC	2	6	76881	76886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154911
1526	NC_010280	AGA	2	6	77001	77006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154911
1527	NC_010280	CTT	2	6	77123	77128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154911
1528	NC_010280	AGT	3	9	77189	77197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154912
1529	NC_010280	G	6	6	77217	77222	0 %	0 %	100 %	0 %	166154912
1530	NC_010280	TGA	2	6	77270	77275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154912
1531	NC_010280	AGA	2	6	77303	77308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154912
1532	NC_010280	TAC	2	6	77366	77371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154912
1533	NC_010280	TTC	2	6	77372	77377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154912
1534	NC_010280	GGA	2	6	77417	77422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154912
1535	NC_010280	CGT	2	6	77484	77489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154912
1536	NC_010280	ATG	2	6	77512	77517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154912
1537	NC_010280	A	6	6	77520	77525	100 %	0 %	0 %	0 %	166154912
1538	NC_010280	AGA	2	6	77528	77533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154912
1539	NC_010280	GCA	2	6	77534	77539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154912
1540	NC_010280	TACG	2	8	77626	77633	25 %	25 %	25 %	25 %	166154912
1541	NC_010280	TAT	2	6	77679	77684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154912
1542	NC_010280	TTG	2	6	77746	77751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154912
1543	NC_010280	ATG	2	6	77833	77838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154912
1544	NC_010280	TTG	2	6	77866	77871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154912
1545	NC_010280	ATG	2	6	77872	77877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154912
1546	NC_010280	AGA	2	6	78029	78034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154912
1547	NC_010280	CTT	2	6	78037	78042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154912
1548	NC_010280	TAT	2	6	78061	78066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154912
1549	NC_010280	ATA	2	6	78075	78080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154912
1550	NC_010280	ATT	2	6	78168	78173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154912
1551	NC_010280	TCC	2	6	78185	78190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154912
1552	NC_010280	CCT	2	6	78222	78227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154912
1553	NC_010280	AGC	2	6	78235	78240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154912
1554	NC_010280	TTTCTT	2	12	78341	78352	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	166154912
1555	NC_010280	CTT	2	6	78370	78375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154912
1556	NC_010280	ATT	3	9	78506	78514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154913
1557	NC_010280	CTT	2	6	78545	78550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154913
1558	NC_010280	TA	3	6	78560	78565	50 %	50 %	0 %	0 %	166154913
1559	NC_010280	ATTT	2	8	78724	78731	25 %	75 %	0 %	0 %	166154913
1560	NC_010280	AG	4	8	78779	78786	50 %	0 %	50 %	0 %	166154913
1561	NC_010280	ACAA	2	8	78801	78808	75 %	0 %	0 %	25 %	166154913
1562	NC_010280	TAA	2	6	78810	78815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154913
1563	NC_010280	T	6	6	78841	78846	0 %	100 %	0 %	0 %	166154913
1564	NC_010280	AAG	2	6	78865	78870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154913
1565	NC_010280	ATG	2	6	78941	78946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154913
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1567	NC_010280	TGC	2	6	79014	79019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154913
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1570	NC_010280	T	6	6	79104	79109	0 %	100 %	0 %	0 %	166154913
1571	NC_010280	AGA	2	6	79110	79115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154913
1572	NC_010280	AAG	2	6	79165	79170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154913
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1574	NC_010280	GA	3	6	79296	79301	50 %	0 %	50 %	0 %	166154913
1575	NC_010280	GTG	2	6	79390	79395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154913
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1581	NC_010280	AAGA	2	8	79666	79673	75 %	0 %	25 %	0 %	166154914
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1588	NC_010280	TGA	2	6	79969	79974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154914
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1591	NC_010280	GAG	2	6	80175	80180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154914
1592	NC_010280	AAG	2	6	80207	80212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154914
1593	NC_010280	ATA	2	6	80248	80253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154914
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1596	NC_010280	GC	3	6	80487	80492	0 %	0 %	50 %	50 %	166154915
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1600	NC_010280	TAG	2	6	80687	80692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154915
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1603	NC_010280	T	7	7	80911	80917	0 %	100 %	0 %	0 %	166154915
1604	NC_010280	GGAT	2	8	80933	80940	25 %	25 %	50 %	0 %	166154915
1605	NC_010280	TCA	2	6	81004	81009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154915
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1607	NC_010280	GATA	2	8	81033	81040	50 %	25 %	25 %	0 %	166154915
1608	NC_010280	TCT	2	6	81088	81093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154915
1609	NC_010280	TA	3	6	81117	81122	50 %	50 %	0 %	0 %	166154915
1610	NC_010280	CAG	2	6	81221	81226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154915
1611	NC_010280	TGT	2	6	81235	81240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154915
1612	NC_010280	TGC	2	6	81309	81314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154915
1613	NC_010280	CTCC	2	8	81320	81327	0 %	25 %	0 %	75 %	166154915
1614	NC_010280	AGCA	2	8	81353	81360	50 %	0 %	25 %	25 %	166154915
1615	NC_010280	GC	3	6	81418	81423	0 %	0 %	50 %	50 %	166154915
1616	NC_010280	ACAG	2	8	81450	81457	50 %	0 %	25 %	25 %	166154915
1617	NC_010280	A	6	6	81518	81523	100 %	0 %	0 %	0 %	166154915
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1620	NC_010280	CTTC	2	8	81577	81584	0 %	50 %	0 %	50 %	166154915
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1623	NC_010280	TTC	2	6	81965	81970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154916
1624	NC_010280	T	6	6	81981	81986	0 %	100 %	0 %	0 %	166154916
1625	NC_010280	TTA	2	6	82090	82095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154916
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