MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 19991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010280	CAA	2	6	48445	48450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154889
1002	NC_010280	ATT	2	6	48561	48566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154889
1003	NC_010280	CAT	2	6	48596	48601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154889
1004	NC_010280	TCC	2	6	48803	48808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154890
1005	NC_010280	TGT	2	6	48898	48903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154890
1006	NC_010280	TTC	2	6	48945	48950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154890
1007	NC_010280	GAA	3	9	48959	48967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154890
1008	NC_010280	GGA	2	6	49012	49017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154890
1009	NC_010280	AT	3	6	49288	49293	50 %	50 %	0 %	0 %	166154890
1010	NC_010280	GAGCA	2	10	49301	49310	40 %	0 %	40 %	20 %	166154890
1011	NC_010280	TTG	2	6	49355	49360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154890
1012	NC_010280	GCA	2	6	49466	49471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154890
1013	NC_010280	AAGA	2	8	49547	49554	75 %	0 %	25 %	0 %	166154890
1014	NC_010280	TGT	2	6	49558	49563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154890
1015	NC_010280	AG	3	6	49590	49595	50 %	0 %	50 %	0 %	166154890
1016	NC_010280	ATA	2	6	49677	49682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154890
1017	NC_010280	ATG	2	6	49766	49771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154890
1018	NC_010280	GAG	2	6	49793	49798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154890
1019	NC_010280	AAG	2	6	49872	49877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154890
1020	NC_010280	TTG	2	6	49885	49890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154890
1021	NC_010280	AGA	2	6	49909	49914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154890
1022	NC_010280	A	6	6	49954	49959	100 %	0 %	0 %	0 %	166154890
1023	NC_010280	G	7	7	49967	49973	0 %	0 %	100 %	0 %	166154890
1024	NC_010280	GGA	2	6	50008	50013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154890
1025	NC_010280	AC	3	6	50074	50079	50 %	0 %	0 %	50 %	166154890
1026	NC_010280	TATATT	2	12	50100	50111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154890
1027	NC_010280	CTT	2	6	50115	50120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154890
1028	NC_010280	AT	3	6	50151	50156	50 %	50 %	0 %	0 %	166154890
1029	NC_010280	GTT	2	6	50332	50337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154891
1030	NC_010280	GCG	2	6	50344	50349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166154891
1031	NC_010280	CTT	2	6	50399	50404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154891
1032	NC_010280	CAG	2	6	50428	50433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154891
1033	NC_010280	GCT	2	6	50437	50442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154891
1034	NC_010280	TC	3	6	50609	50614	0 %	50 %	0 %	50 %	166154891
1035	NC_010280	AGA	2	6	50659	50664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154891
1036	NC_010280	GCAG	2	8	50703	50710	25 %	0 %	50 %	25 %	166154891
1037	NC_010280	CTG	2	6	50711	50716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154891
1038	NC_010280	A	7	7	50723	50729	100 %	0 %	0 %	0 %	166154891
1039	NC_010280	AGG	2	6	50741	50746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154891
1040	NC_010280	AAG	4	12	50756	50767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154891
1041	NC_010280	TCG	2	6	50802	50807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154891
1042	NC_010280	AGA	2	6	50847	50852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154891
1043	NC_010280	GAA	2	6	50901	50906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154891
1044	NC_010280	AAG	3	9	50966	50974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154891
1045	NC_010280	A	6	6	50977	50982	100 %	0 %	0 %	0 %	166154891
1046	NC_010280	AAAC	2	8	50997	51004	75 %	0 %	0 %	25 %	166154891
1047	NC_010280	AAG	2	6	51029	51034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154891
1048	NC_010280	GAT	2	6	51178	51183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154891
1049	NC_010280	GTA	2	6	51331	51336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154891
1050	NC_010280	CTG	2	6	51374	51379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154891
1051	NC_010280	ATT	2	6	51388	51393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154891
1052	NC_010280	GCT	2	6	51399	51404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154891
1053	NC_010280	CT	3	6	51403	51408	0 %	50 %	0 %	50 %	166154891
1054	NC_010280	ATG	2	6	51410	51415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154891
1055	NC_010280	ATT	2	6	51418	51423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154891
1056	NC_010280	ATG	2	6	51542	51547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154891
1057	NC_010280	GCT	2	6	51565	51570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154891
1058	NC_010280	CAATT	2	10	51692	51701	40 %	40 %	0 %	20 %	166154891
1059	NC_010280	CTG	3	9	51758	51766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154891
1060	NC_010280	GCT	2	6	51784	51789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154891
1061	NC_010280	CTT	2	6	51807	51812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154891
1062	NC_010280	ACA	2	6	51889	51894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154891
1063	NC_010280	TCA	2	6	51911	51916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154891
1064	NC_010280	AAC	2	6	51949	51954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154891
1065	NC_010280	CCTC	2	8	52020	52027	0 %	25 %	0 %	75 %	166154891
1066	NC_010280	TTG	2	6	52147	52152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154891
1067	NC_010280	AATC	2	8	52183	52190	50 %	25 %	0 %	25 %	166154891
1068	NC_010280	ATG	2	6	52261	52266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154891
1069	NC_010280	ATT	2	6	52294	52299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154891
1070	NC_010280	G	6	6	52342	52347	0 %	0 %	100 %	0 %	166154891
1071	NC_010280	ACA	2	6	52419	52424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154891
1072	NC_010280	TTG	2	6	52535	52540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154891
1073	NC_010280	TAA	2	6	52560	52565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154891
1074	NC_010280	GT	3	6	52619	52624	0 %	50 %	50 %	0 %	166154891
1075	NC_010280	GGAT	2	8	52674	52681	25 %	25 %	50 %	0 %	166154891
1076	NC_010280	TCA	2	6	52838	52843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154891
1077	NC_010280	AGGA	2	8	52853	52860	50 %	0 %	50 %	0 %	166154891
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1080	NC_010280	AAT	2	6	53336	53341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154892
1081	NC_010280	TTG	2	6	53362	53367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154892
1082	NC_010280	GGT	2	6	53482	53487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154892
1083	NC_010280	ACA	2	6	53567	53572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154892
1084	NC_010280	T	6	6	53610	53615	0 %	100 %	0 %	0 %	166154892
1085	NC_010280	TTTC	2	8	53629	53636	0 %	75 %	0 %	25 %	166154892
1086	NC_010280	CAG	2	6	53662	53667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154892
1087	NC_010280	ACT	2	6	53682	53687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154892
1088	NC_010280	AGA	2	6	53789	53794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154892
1089	NC_010280	GAA	2	6	53934	53939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154892
1090	NC_010280	TGT	2	6	53958	53963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154892
1091	NC_010280	AAC	2	6	54066	54071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154892
1092	NC_010280	TGCC	2	8	54073	54080	0 %	25 %	25 %	50 %	166154892
1093	NC_010280	AAC	2	6	54109	54114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154892
1094	NC_010280	AAT	2	6	54136	54141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154892
1095	NC_010280	TAA	2	6	54146	54151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154892
1096	NC_010280	GTTT	2	8	54253	54260	0 %	75 %	25 %	0 %	166154892
1097	NC_010280	AG	3	6	54311	54316	50 %	0 %	50 %	0 %	166154892
1098	NC_010280	GGCGT	2	10	54328	54337	0 %	20 %	60 %	20 %	166154892
1099	NC_010280	GTA	2	6	54400	54405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154893
1100	NC_010280	T	6	6	54412	54417	0 %	100 %	0 %	0 %	166154893
1101	NC_010280	CTG	2	6	54443	54448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154893
1102	NC_010280	TGA	2	6	54521	54526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154893
1103	NC_010280	GTT	2	6	54530	54535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154893
1104	NC_010280	GGATA	2	10	54621	54630	40 %	20 %	40 %	0 %	166154893
1105	NC_010280	TACA	2	8	54800	54807	50 %	25 %	0 %	25 %	166154893
1106	NC_010280	CTT	2	6	55299	55304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154894
1107	NC_010280	TCT	2	6	55362	55367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154894
1108	NC_010280	CTT	2	6	55458	55463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154894
1109	NC_010280	GCT	2	6	55479	55484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154894
1110	NC_010280	TCG	2	6	55495	55500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154894
1111	NC_010280	TTC	2	6	55504	55509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154894
1112	NC_010280	TGC	2	6	55573	55578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154894
1113	NC_010280	A	6	6	55768	55773	100 %	0 %	0 %	0 %	166154894
1114	NC_010280	TCC	2	6	55824	55829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154895
1115	NC_010280	AGA	2	6	55836	55841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154895
1116	NC_010280	CCT	2	6	55871	55876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154895
1117	NC_010280	GATC	2	8	55949	55956	25 %	25 %	25 %	25 %	166154895
1118	NC_010280	GA	3	6	55972	55977	50 %	0 %	50 %	0 %	166154895
1119	NC_010280	GTT	2	6	56122	56127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154895
1120	NC_010280	TA	3	6	56204	56209	50 %	50 %	0 %	0 %	166154895
1121	NC_010280	CCATT	2	10	56288	56297	20 %	40 %	0 %	40 %	166154895
1122	NC_010280	GA	3	6	56365	56370	50 %	0 %	50 %	0 %	166154895
1123	NC_010280	GGA	2	6	56375	56380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154895
1124	NC_010280	ACC	2	6	56398	56403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166154895
1125	NC_010280	GAC	2	6	56427	56432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154895
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1127	NC_010280	TCTT	2	8	56460	56467	0 %	75 %	0 %	25 %	166154895
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