MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 19991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010280	TTCT	2	8	22372	22379	0 %	75 %	0 %	25 %	166154862
502	NC_010280	AGGG	2	8	22424	22431	25 %	0 %	75 %	0 %	166154862
503	NC_010280	GCT	2	6	22481	22486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154863
504	NC_010280	CAG	2	6	22527	22532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154863
505	NC_010280	GA	3	6	22561	22566	50 %	0 %	50 %	0 %	166154863
506	NC_010280	TCT	2	6	22589	22594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154863
507	NC_010280	AGC	2	6	22624	22629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154863
508	NC_010280	GA	3	6	22668	22673	50 %	0 %	50 %	0 %	166154863
509	NC_010280	GTG	2	6	22733	22738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154863
510	NC_010280	AGA	2	6	22774	22779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154863
511	NC_010280	GA	3	6	22812	22817	50 %	0 %	50 %	0 %	166154863
512	NC_010280	TTTC	2	8	22830	22837	0 %	75 %	0 %	25 %	166154863
513	NC_010280	TAT	2	6	22875	22880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154863
514	NC_010280	TCTT	2	8	22924	22931	0 %	75 %	0 %	25 %	166154863
515	NC_010280	TCA	2	6	22955	22960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154863
516	NC_010280	TG	3	6	23006	23011	0 %	50 %	50 %	0 %	166154863
517	NC_010280	TC	4	8	23181	23188	0 %	50 %	0 %	50 %	166154864
518	NC_010280	TACA	2	8	23214	23221	50 %	25 %	0 %	25 %	166154864
519	NC_010280	GCA	2	6	23227	23232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154864
520	NC_010280	ACG	2	6	23254	23259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154864
521	NC_010280	AAT	2	6	23302	23307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154864
522	NC_010280	GTT	2	6	23415	23420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154864
523	NC_010280	AAC	2	6	23427	23432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154864
524	NC_010280	GGAA	2	8	23534	23541	50 %	0 %	50 %	0 %	166154864
525	NC_010280	GAA	2	6	23590	23595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154864
526	NC_010280	AAAC	2	8	23611	23618	75 %	0 %	0 %	25 %	166154864
527	NC_010280	TTG	2	6	23677	23682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154864
528	NC_010280	AGA	3	9	23685	23693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154864
529	NC_010280	GAA	2	6	23746	23751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154864
530	NC_010280	TGA	2	6	23862	23867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154864
531	NC_010280	GAA	2	6	23923	23928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154864
532	NC_010280	TTA	2	6	23965	23970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154864
533	NC_010280	TCT	2	6	24129	24134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154864
534	NC_010280	AGG	2	6	24225	24230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154864
535	NC_010280	AAAG	2	8	24237	24244	75 %	0 %	25 %	0 %	166154864
536	NC_010280	TAT	2	6	24267	24272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154864
537	NC_010280	GTT	2	6	24307	24312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154865
538	NC_010280	CGA	2	6	24315	24320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154865
539	NC_010280	AGC	2	6	24340	24345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154865
540	NC_010280	AGC	2	6	24368	24373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154865
541	NC_010280	CTC	2	6	24495	24500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154865
542	NC_010280	GGAT	2	8	24517	24524	25 %	25 %	50 %	0 %	166154865
543	NC_010280	AG	3	6	24557	24562	50 %	0 %	50 %	0 %	166154865
544	NC_010280	CTA	2	6	24689	24694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154865
545	NC_010280	T	6	6	24701	24706	0 %	100 %	0 %	0 %	166154865
546	NC_010280	AGC	2	6	24751	24756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154865
547	NC_010280	ATG	2	6	24784	24789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154865
548	NC_010280	CCGA	2	8	25088	25095	25 %	0 %	25 %	50 %	166154866
549	NC_010280	TTC	2	6	25173	25178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154866
550	NC_010280	GAA	2	6	25256	25261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154866
551	NC_010280	AAC	2	6	25296	25301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154866
552	NC_010280	GGC	2	6	25347	25352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166154866
553	NC_010280	TGC	2	6	25389	25394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154866
554	NC_010280	TGTGAT	2	12	25497	25508	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	166154866
555	NC_010280	AGC	2	6	25518	25523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154866
556	NC_010280	ATG	2	6	25588	25593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154866
557	NC_010280	GGA	2	6	25711	25716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154866
558	NC_010280	TTC	2	6	25734	25739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154866
559	NC_010280	TCG	2	6	25755	25760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154866
560	NC_010280	GAG	2	6	25778	25783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154866
561	NC_010280	A	6	6	25824	25829	100 %	0 %	0 %	0 %	166154866
562	NC_010280	CTC	2	6	25838	25843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154866
563	NC_010280	TTC	2	6	25887	25892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154866
564	NC_010280	A	7	7	25922	25928	100 %	0 %	0 %	0 %	166154866
565	NC_010280	TAT	2	6	25929	25934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154866
566	NC_010280	GTT	2	6	26025	26030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154866
567	NC_010280	T	7	7	26491	26497	0 %	100 %	0 %	0 %	166154867
568	NC_010280	GA	3	6	26502	26507	50 %	0 %	50 %	0 %	166154867
569	NC_010280	AG	3	6	26557	26562	50 %	0 %	50 %	0 %	166154867
570	NC_010280	TGT	2	6	26617	26622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154867
571	NC_010280	AAAG	2	8	26645	26652	75 %	0 %	25 %	0 %	166154867
572	NC_010280	T	6	6	26672	26677	0 %	100 %	0 %	0 %	166154867
573	NC_010280	TTTTG	2	10	26709	26718	0 %	80 %	20 %	0 %	166154867
574	NC_010280	GTT	2	6	26727	26732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154867
575	NC_010280	T	6	6	26757	26762	0 %	100 %	0 %	0 %	166154867
576	NC_010280	T	6	6	26836	26841	0 %	100 %	0 %	0 %	166154867
577	NC_010280	GGT	2	6	26900	26905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154867
578	NC_010280	AGA	2	6	26979	26984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154867
579	NC_010280	AGC	2	6	26988	26993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154867
580	NC_010280	TTA	2	6	27038	27043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154867
581	NC_010280	CAA	2	6	27054	27059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154867
582	NC_010280	TAT	2	6	27178	27183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154867
583	NC_010280	T	6	6	27194	27199	0 %	100 %	0 %	0 %	166154867
584	NC_010280	GCA	2	6	27279	27284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154867
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587	NC_010280	A	6	6	27460	27465	100 %	0 %	0 %	0 %	166154867
588	NC_010280	T	6	6	27506	27511	0 %	100 %	0 %	0 %	166154867
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590	NC_010280	GTT	2	6	27597	27602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154867
591	NC_010280	GAT	2	6	27640	27645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154867
592	NC_010280	GAG	2	6	27685	27690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154867
593	NC_010280	TTC	2	6	27736	27741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154867
594	NC_010280	GAG	2	6	27761	27766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154867
595	NC_010280	AGG	2	6	27770	27775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154867
596	NC_010280	GCCT	2	8	27778	27785	0 %	25 %	25 %	50 %	166154867
597	NC_010280	TAT	2	6	27806	27811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154867
598	NC_010280	T	6	6	27921	27926	0 %	100 %	0 %	0 %	166154867
599	NC_010280	CTAG	2	8	27952	27959	25 %	25 %	25 %	25 %	166154867
600	NC_010280	T	6	6	28001	28006	0 %	100 %	0 %	0 %	166154867
601	NC_010280	TGGC	2	8	28045	28052	0 %	25 %	50 %	25 %	166154867
602	NC_010280	ACT	2	6	28083	28088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154867
603	NC_010280	TAG	2	6	28100	28105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154867
604	NC_010280	GGA	2	6	28158	28163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154867
605	NC_010280	TTC	2	6	28300	28305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154868
606	NC_010280	ATT	2	6	28394	28399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154868
607	NC_010280	TGA	2	6	28430	28435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154868
608	NC_010280	AAC	2	6	28471	28476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154868
609	NC_010280	TGT	2	6	28495	28500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154868
610	NC_010280	AGA	2	6	28514	28519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154868
611	NC_010280	GTT	2	6	28530	28535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154868
612	NC_010280	ATT	2	6	28559	28564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154868
613	NC_010280	TGCTC	2	10	28646	28655	0 %	40 %	20 %	40 %	166154868
614	NC_010280	AGA	2	6	28658	28663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154868
615	NC_010280	TC	4	8	28702	28709	0 %	50 %	0 %	50 %	166154868
616	NC_010280	GGA	2	6	28716	28721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154868
617	NC_010280	GAT	2	6	28754	28759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154868
618	NC_010280	CTA	2	6	28938	28943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154868
619	NC_010280	TGA	2	6	28949	28954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154868
620	NC_010280	GAG	2	6	29005	29010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154868
621	NC_010280	AGT	2	6	29111	29116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154868
622	NC_010280	AGCG	2	8	29189	29196	25 %	0 %	50 %	25 %	166154868
623	NC_010280	AAG	2	6	29245	29250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154868
624	NC_010280	AGC	2	6	29282	29287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154868
625	NC_010280	AAG	2	6	29290	29295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154868
626	NC_010280	T	6	6	29342	29347	0 %	100 %	0 %	0 %	166154868
627	NC_010280	GTT	3	9	29360	29368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154868
628	NC_010280	ATC	2	6	29409	29414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154868
629	NC_010280	TAT	2	6	29532	29537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154868
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757	NC_010280	GGA	2	6	36763	36768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154878
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