MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010175	CCA	2	6	263421	263426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845804
4002	NC_010175	CGC	2	6	263484	263489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845804
4003	NC_010175	GCA	2	6	263508	263513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845804
4004	NC_010175	CT	3	6	263519	263524	0 %	50 %	0 %	50 %	163845804
4005	NC_010175	CAC	3	9	263545	263553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845804
4006	NC_010175	CCG	2	6	263554	263559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845804
4007	NC_010175	GCA	2	6	263618	263623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845804
4008	NC_010175	GCA	2	6	263630	263635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845804
4009	NC_010175	GC	3	6	263642	263647	0 %	0 %	50 %	50 %	163845804
4010	NC_010175	CCA	2	6	263731	263736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845804
4011	NC_010175	GAG	2	6	263760	263765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845804
4012	NC_010175	GTT	2	6	263768	263773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845804
4013	NC_010175	TCA	2	6	263778	263783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845804
4014	NC_010175	CAA	2	6	264169	264174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845805
4015	NC_010175	GGT	2	6	264195	264200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845805
4016	NC_010175	GCGG	2	8	264231	264238	0 %	0 %	75 %	25 %	163845805
4017	NC_010175	TGA	2	6	264299	264304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845805
4018	NC_010175	GTT	2	6	264340	264345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845805
4019	NC_010175	GAAC	2	8	264357	264364	50 %	0 %	25 %	25 %	163845805
4020	NC_010175	TGG	2	6	264401	264406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845805
4021	NC_010175	CTGGC	2	10	264436	264445	0 %	20 %	40 %	40 %	163845805
4022	NC_010175	GAT	2	6	264606	264611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845805
4023	NC_010175	CAC	2	6	264620	264625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845805
4024	NC_010175	GAT	2	6	264646	264651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845805
4025	NC_010175	ATT	2	6	264661	264666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845805
4026	NC_010175	ATC	2	6	264702	264707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845805
4027	NC_010175	GCG	2	6	264746	264751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845806
4028	NC_010175	CAC	2	6	264763	264768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845806
4029	NC_010175	GCT	2	6	264815	264820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845806
4030	NC_010175	CTG	2	6	264822	264827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845806
4031	NC_010175	CGG	2	6	264877	264882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845806
4032	NC_010175	TGG	2	6	264994	264999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845806
4033	NC_010175	ATC	2	6	265008	265013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845806
4034	NC_010175	TCGG	2	8	265024	265031	0 %	25 %	50 %	25 %	163845806
4035	NC_010175	ACCG	2	8	265044	265051	25 %	0 %	25 %	50 %	163845806
4036	NC_010175	GCA	2	6	265089	265094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845806
4037	NC_010175	TCACGC	2	12	265099	265110	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	163845806
4038	NC_010175	GTA	2	6	265128	265133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845806
4039	NC_010175	TGC	2	6	265156	265161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845806
4040	NC_010175	TTC	2	6	265209	265214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845806
4041	NC_010175	TAT	2	6	265322	265327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845806
4042	NC_010175	CGG	2	6	265346	265351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845806
4043	NC_010175	AACG	2	8	265392	265399	50 %	0 %	25 %	25 %	163845806
4044	NC_010175	GTG	2	6	265434	265439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845806
4045	NC_010175	ACC	2	6	265542	265547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845806
4046	NC_010175	CAGT	2	8	265616	265623	25 %	25 %	25 %	25 %	163845806
4047	NC_010175	GGC	2	6	265674	265679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845806
4048	NC_010175	GCC	3	9	265791	265799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845806
4049	NC_010175	TC	4	8	265810	265817	0 %	50 %	0 %	50 %	163845806
4050	NC_010175	TGT	2	6	265820	265825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845806
4051	NC_010175	ATG	2	6	265858	265863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845806
4052	NC_010175	GGT	2	6	265889	265894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845806
4053	NC_010175	ATC	2	6	265962	265967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845806
4054	NC_010175	CAT	2	6	266006	266011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845806
4055	NC_010175	GCT	2	6	266128	266133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845807
4056	NC_010175	GCG	2	6	266256	266261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845807
4057	NC_010175	TCT	2	6	266278	266283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845807
4058	NC_010175	CGG	2	6	266285	266290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845807
4059	NC_010175	CA	3	6	266511	266516	50 %	0 %	0 %	50 %	163845807
4060	NC_010175	AC	3	6	266695	266700	50 %	0 %	0 %	50 %	163845807
4061	NC_010175	CCG	2	6	266719	266724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845807
4062	NC_010175	GAC	2	6	266745	266750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845807
4063	NC_010175	CAC	2	6	266860	266865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845807
4064	NC_010175	GCC	2	6	266919	266924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845807
4065	NC_010175	ACC	2	6	267030	267035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845807
4066	NC_010175	CCG	2	6	267046	267051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845807
4067	NC_010175	GCA	2	6	267057	267062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845807
4068	NC_010175	CGC	2	6	267116	267121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845807
4069	NC_010175	CTG	2	6	267138	267143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845807
4070	NC_010175	TAC	2	6	267147	267152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845807
4071	NC_010175	TCAG	2	8	267172	267179	25 %	25 %	25 %	25 %	163845807
4072	NC_010175	A	6	6	267268	267273	100 %	0 %	0 %	0 %	163845807
4073	NC_010175	AAC	3	9	267368	267376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845808
4074	NC_010175	GAA	2	6	267386	267391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845808
4075	NC_010175	GC	3	6	267395	267400	0 %	0 %	50 %	50 %	163845808
4076	NC_010175	ATC	2	6	267446	267451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845808
4077	NC_010175	CGC	2	6	267488	267493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845808
4078	NC_010175	TGG	2	6	267648	267653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845808
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4080	NC_010175	GTC	2	6	267668	267673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845808
4081	NC_010175	GGT	2	6	267734	267739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845808
4082	NC_010175	GCT	2	6	267754	267759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845808
4083	NC_010175	GC	3	6	267790	267795	0 %	0 %	50 %	50 %	163845808
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4085	NC_010175	CG	3	6	267930	267935	0 %	0 %	50 %	50 %	163845808
4086	NC_010175	ACG	2	6	268035	268040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845808
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4089	NC_010175	CA	3	6	268313	268318	50 %	0 %	0 %	50 %	163845808
4090	NC_010175	T	6	6	268358	268363	0 %	100 %	0 %	0 %	163845808
4091	NC_010175	GCG	2	6	268406	268411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845808
4092	NC_010175	GCA	2	6	269086	269091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845809
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4094	NC_010175	CGA	2	6	269115	269120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845809
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4102	NC_010175	TTAT	2	8	269582	269589	25 %	75 %	0 %	0 %	163845809
4103	NC_010175	TAA	3	9	269631	269639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845809
4104	NC_010175	AGC	2	6	269719	269724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845809
4105	NC_010175	TAA	2	6	269763	269768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845809
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4108	NC_010175	CAG	2	6	269979	269984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845809
4109	NC_010175	GGT	2	6	270033	270038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845809
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4111	NC_010175	CAC	3	9	270144	270152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845809
4112	NC_010175	GCA	2	6	270155	270160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845809
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4121	NC_010175	GCG	2	6	270488	270493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845809
4122	NC_010175	GTG	2	6	270554	270559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845809
4123	NC_010175	CGG	2	6	270642	270647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845809
4124	NC_010175	ACC	2	6	270670	270675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845809
4125	NC_010175	GGT	2	6	270681	270686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845809
4126	NC_010175	CCA	2	6	270713	270718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845809
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4128	NC_010175	GCA	2	6	270803	270808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845809
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4130	NC_010175	ACT	2	6	270868	270873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845809
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4150	NC_010175	GTA	2	6	271522	271527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845809
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4154	NC_010175	TGATCG	2	12	272161	272172	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	163845810
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4162	NC_010175	GAC	2	6	272471	272476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845811
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4164	NC_010175	CTA	2	6	272522	272527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845811
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4184	NC_010175	TCG	2	6	273415	273420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845812
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4189	NC_010175	TGA	2	6	273620	273625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845812
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4194	NC_010175	ACC	2	6	273852	273857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845812
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4200	NC_010175	GTA	2	6	274029	274034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845812
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4222	NC_010175	GCT	2	6	276009	276014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845814
4223	NC_010175	AG	3	6	276061	276066	50 %	0 %	50 %	0 %	163845814
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4225	NC_010175	TAA	2	6	276173	276178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845814
4226	NC_010175	TATCGA	2	12	276262	276273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	163845814
4227	NC_010175	CCA	2	6	276361	276366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845814
4228	NC_010175	CAA	2	6	276493	276498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845814
4229	NC_010175	GT	3	6	276500	276505	0 %	50 %	50 %	0 %	163845814
4230	NC_010175	AGC	2	6	276533	276538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845814
4231	NC_010175	GTGCCA	2	12	276541	276552	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163845814
4232	NC_010175	GCCA	2	8	276722	276729	25 %	0 %	25 %	50 %	163845815
4233	NC_010175	CGG	2	6	276771	276776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845815
4234	NC_010175	ATTGT	2	10	276785	276794	20 %	60 %	20 %	0 %	163845815
4235	NC_010175	GA	3	6	277031	277036	50 %	0 %	50 %	0 %	163845815
4236	NC_010175	ACCG	2	8	277122	277129	25 %	0 %	25 %	50 %	163845815
4237	NC_010175	AG	4	8	277234	277241	50 %	0 %	50 %	0 %	163845815
4238	NC_010175	CCG	2	6	277264	277269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845815
4239	NC_010175	ACCA	2	8	277353	277360	50 %	0 %	0 %	50 %	163845815
4240	NC_010175	CGGCGC	2	12	277361	277372	0 %	0 %	50 %	50 %	163845815
4241	NC_010175	GAT	2	6	277392	277397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845815
4242	NC_010175	AAT	2	6	277414	277419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845815
4243	NC_010175	GAT	2	6	277443	277448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845815
4244	NC_010175	GCT	2	6	277478	277483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845815
4245	NC_010175	ATCGGC	2	12	277552	277563	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163845815
4246	NC_010175	TTC	2	6	277637	277642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845815
4247	NC_010175	CAA	2	6	277671	277676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845815
4248	NC_010175	TTG	2	6	277758	277763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845815
4249	NC_010175	AC	3	6	278085	278090	50 %	0 %	0 %	50 %	163845816
4250	NC_010175	CTG	2	6	278214	278219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845816
4251	NC_010175	GGT	2	6	278249	278254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845816
4252	NC_010175	AC	3	6	278271	278276	50 %	0 %	0 %	50 %	163845816
4253	NC_010175	CGC	2	6	278277	278282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845816
4254	NC_010175	ACAGC	2	10	278425	278434	40 %	0 %	20 %	40 %	163845816
4255	NC_010175	CGT	2	6	278744	278749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845817
4256	NC_010175	TGA	2	6	278842	278847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845817
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4258	NC_010175	GAT	2	6	278926	278931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845817
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4260	NC_010175	GTG	2	6	279001	279006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845817
4261	NC_010175	CAA	2	6	279127	279132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845817
4262	NC_010175	CAG	2	6	279305	279310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845817
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4264	NC_010175	CCG	2	6	279679	279684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845818
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4267	NC_010175	GC	3	6	279974	279979	0 %	0 %	50 %	50 %	163845818
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4270	NC_010175	CAT	2	6	280267	280272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845818
4271	NC_010175	CGC	2	6	280370	280375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845818
4272	NC_010175	TCA	2	6	280496	280501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845818
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4334	NC_010175	GCC	2	6	286695	286700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845822
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4349	NC_010175	TGC	2	6	287405	287410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845822
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4351	NC_010175	ACC	2	6	287441	287446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845822
4352	NC_010175	A	6	6	287465	287470	100 %	0 %	0 %	0 %	163845822
4353	NC_010175	AAT	2	6	287618	287623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845822
4354	NC_010175	GCG	2	6	287681	287686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845822
4355	NC_010175	GCGGT	2	10	287704	287713	0 %	20 %	60 %	20 %	163845822
4356	NC_010175	A	6	6	287741	287746	100 %	0 %	0 %	0 %	163845822
4357	NC_010175	GAC	2	6	287913	287918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845822
4358	NC_010175	TAG	2	6	287926	287931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845822
4359	NC_010175	GC	3	6	288505	288510	0 %	0 %	50 %	50 %	163845823
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4361	NC_010175	ACT	2	6	288641	288646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845823
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4481	NC_010175	GAT	2	6	295614	295619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845832
4482	NC_010175	GCA	3	9	295700	295708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845832
4483	NC_010175	GGC	2	6	295759	295764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845832
4484	NC_010175	CGG	2	6	295863	295868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845832
4485	NC_010175	GAT	2	6	295995	296000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845832
4486	NC_010175	GCC	2	6	296096	296101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845832
4487	NC_010175	GCC	2	6	296255	296260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845832
4488	NC_010175	CTCA	2	8	296269	296276	25 %	25 %	0 %	50 %	163845832
4489	NC_010175	CGG	2	6	296313	296318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845832
4490	NC_010175	TTG	2	6	296352	296357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845832
4491	NC_010175	AATC	2	8	296415	296422	50 %	25 %	0 %	25 %	163845833
4492	NC_010175	ACG	2	6	296467	296472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845833
4493	NC_010175	GTC	2	6	296534	296539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845833
4494	NC_010175	AGC	2	6	296591	296596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845833
4495	NC_010175	TGA	2	6	296708	296713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845833
4496	NC_010175	TGCGG	2	10	296737	296746	0 %	20 %	60 %	20 %	163845833
4497	NC_010175	GCT	2	6	296771	296776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845833
4498	NC_010175	CGG	2	6	296946	296951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845833
4499	NC_010175	GGC	2	6	296979	296984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845833
4500	NC_010175	GCG	2	6	297098	297103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845833

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