MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010175	GAGG	2	8	227028	227035	25 %	0 %	75 %	0 %	163845779
3502	NC_010175	TCG	2	6	228809	228814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845780
3503	NC_010175	GCG	2	6	228884	228889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845780
3504	NC_010175	TGA	2	6	228918	228923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845780
3505	NC_010175	ATC	2	6	228968	228973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845780
3506	NC_010175	CGC	2	6	229146	229151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845780
3507	NC_010175	CCA	2	6	229184	229189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845780
3508	NC_010175	ATCGAC	2	12	229214	229225	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	163845780
3509	NC_010175	TG	3	6	229332	229337	0 %	50 %	50 %	0 %	163845780
3510	NC_010175	TGAT	2	8	229433	229440	25 %	50 %	25 %	0 %	163845780
3511	NC_010175	CAT	2	6	229471	229476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845780
3512	NC_010175	AGA	2	6	229497	229502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845780
3513	NC_010175	GAA	2	6	229533	229538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845780
3514	NC_010175	GGCC	2	8	229603	229610	0 %	0 %	50 %	50 %	163845780
3515	NC_010175	TTGAT	2	10	229649	229658	20 %	60 %	20 %	0 %	163845780
3516	NC_010175	ATT	2	6	229817	229822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845780
3517	NC_010175	TGG	2	6	229830	229835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845780
3518	NC_010175	TCG	2	6	229872	229877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845780
3519	NC_010175	CCA	2	6	229913	229918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845780
3520	NC_010175	CGTG	2	8	229940	229947	0 %	25 %	50 %	25 %	163845780
3521	NC_010175	GT	3	6	229948	229953	0 %	50 %	50 %	0 %	163845780
3522	NC_010175	GTT	2	6	230022	230027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845780
3523	NC_010175	CCT	2	6	230190	230195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845780
3524	NC_010175	GAT	2	6	230212	230217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845780
3525	NC_010175	ATC	2	6	230240	230245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845780
3526	NC_010175	AAC	2	6	230297	230302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845780
3527	NC_010175	CCG	2	6	230312	230317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845780
3528	NC_010175	TTG	2	6	230376	230381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845781
3529	NC_010175	CGCCAC	2	12	230493	230504	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	163845781
3530	NC_010175	TCG	2	6	230563	230568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845781
3531	NC_010175	CTG	2	6	230741	230746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845781
3532	NC_010175	ATC	2	6	230750	230755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845781
3533	NC_010175	CTTT	2	8	230785	230792	0 %	75 %	0 %	25 %	163845781
3534	NC_010175	TGA	2	6	230868	230873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845781
3535	NC_010175	GTG	2	6	230903	230908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845781
3536	NC_010175	TCC	2	6	230920	230925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845781
3537	NC_010175	TCT	2	6	230988	230993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845781
3538	NC_010175	CTG	2	6	231011	231016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845781
3539	NC_010175	ACCT	2	8	231095	231102	25 %	25 %	0 %	50 %	163845781
3540	NC_010175	TCT	2	6	231132	231137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845781
3541	NC_010175	CTC	2	6	231275	231280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845782
3542	NC_010175	CCGGCG	2	12	231288	231299	0 %	0 %	50 %	50 %	163845782
3543	NC_010175	CGG	2	6	231391	231396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845782
3544	NC_010175	GCA	2	6	231478	231483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845782
3545	NC_010175	ACC	2	6	231494	231499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845782
3546	NC_010175	GGC	2	6	231590	231595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845782
3547	NC_010175	GGGTC	2	10	231685	231694	0 %	20 %	60 %	20 %	163845782
3548	NC_010175	GACGA	2	10	231765	231774	40 %	0 %	40 %	20 %	163845782
3549	NC_010175	AGA	2	6	231775	231780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845782
3550	NC_010175	CGG	2	6	231783	231788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845782
3551	NC_010175	CGG	2	6	231937	231942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845782
3552	NC_010175	TTC	2	6	232034	232039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845782
3553	NC_010175	AAC	2	6	232040	232045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845782
3554	NC_010175	GCG	2	6	232097	232102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845782
3555	NC_010175	TGCT	2	8	232108	232115	0 %	50 %	25 %	25 %	163845782
3556	NC_010175	GCT	2	6	232147	232152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845783
3557	NC_010175	GGAT	2	8	232176	232183	25 %	25 %	50 %	0 %	163845783
3558	NC_010175	ATCA	2	8	232238	232245	50 %	25 %	0 %	25 %	163845783
3559	NC_010175	CTG	2	6	232327	232332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845783
3560	NC_010175	TGA	2	6	232390	232395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845783
3561	NC_010175	TTGC	2	8	232457	232464	0 %	50 %	25 %	25 %	163845783
3562	NC_010175	CGG	2	6	232467	232472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845783
3563	NC_010175	CGG	2	6	232493	232498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845783
3564	NC_010175	ACCGA	2	10	232553	232562	40 %	0 %	20 %	40 %	163845783
3565	NC_010175	CTG	2	6	232670	232675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845783
3566	NC_010175	TTCG	2	8	232713	232720	0 %	50 %	25 %	25 %	163845783
3567	NC_010175	CACT	2	8	232746	232753	25 %	25 %	0 %	50 %	163845783
3568	NC_010175	TGG	3	9	232766	232774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845783
3569	NC_010175	GAT	2	6	232793	232798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845783
3570	NC_010175	GCT	2	6	232834	232839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845783
3571	NC_010175	GCC	2	6	232851	232856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845783
3572	NC_010175	GTG	2	6	232899	232904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845783
3573	NC_010175	CCCA	2	8	232991	232998	25 %	0 %	0 %	75 %	163845783
3574	NC_010175	AGA	2	6	233005	233010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845783
3575	NC_010175	ACC	2	6	233132	233137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845783
3576	NC_010175	GGT	2	6	233144	233149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845783
3577	NC_010175	CCG	2	6	233169	233174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845783
3578	NC_010175	GGGCCA	2	12	233239	233250	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	163845783
3579	NC_010175	CGC	2	6	233365	233370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845783
3580	NC_010175	CTG	2	6	233408	233413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845783
3581	NC_010175	CG	3	6	233443	233448	0 %	0 %	50 %	50 %	163845783
3582	NC_010175	CCAG	2	8	233473	233480	25 %	0 %	25 %	50 %	163845783
3583	NC_010175	CAC	2	6	233527	233532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845783
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3585	NC_010175	TGA	2	6	233638	233643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845783
3586	NC_010175	GTT	2	6	233662	233667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845783
3587	NC_010175	TAG	2	6	233673	233678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845783
3588	NC_010175	GTT	2	6	233702	233707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845783
3589	NC_010175	CCAAT	2	10	233745	233754	40 %	20 %	0 %	40 %	163845783
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3591	NC_010175	GTT	2	6	233846	233851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845783
3592	NC_010175	GTA	2	6	233885	233890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845783
3593	NC_010175	GCA	2	6	233961	233966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845783
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3599	NC_010175	GCGA	2	8	235475	235482	25 %	0 %	50 %	25 %	163845784
3600	NC_010175	GCAGT	2	10	235614	235623	20 %	20 %	40 %	20 %	163845784
3601	NC_010175	CGG	2	6	235641	235646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845784
3602	NC_010175	GCC	2	6	235831	235836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845784
3603	NC_010175	ATC	2	6	235981	235986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845785
3604	NC_010175	ACC	2	6	236093	236098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845785
3605	NC_010175	TGG	2	6	236137	236142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845785
3606	NC_010175	ATC	2	6	236174	236179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845785
3607	NC_010175	TGC	2	6	236185	236190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845785
3608	NC_010175	G	6	6	236338	236343	0 %	0 %	100 %	0 %	163845785
3609	NC_010175	AGC	2	6	236464	236469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845785
3610	NC_010175	CAG	2	6	236584	236589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845785
3611	NC_010175	ACG	2	6	236611	236616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845785
3612	NC_010175	GC	3	6	236630	236635	0 %	0 %	50 %	50 %	163845785
3613	NC_010175	GGTT	2	8	236638	236645	0 %	50 %	50 %	0 %	163845785
3614	NC_010175	GCA	2	6	236723	236728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845785
3615	NC_010175	GTGGCA	2	12	236745	236756	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	163845785
3616	NC_010175	CGC	2	6	236807	236812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845785
3617	NC_010175	ATC	2	6	236909	236914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845785
3618	NC_010175	CAT	2	6	236956	236961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845785
3619	NC_010175	GATA	2	8	237108	237115	50 %	25 %	25 %	0 %	163845785
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3621	NC_010175	GCA	2	6	237236	237241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845785
3622	NC_010175	GCA	2	6	237258	237263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845785
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3969	NC_010175	GCCA	2	8	261782	261789	25 %	0 %	25 %	50 %	163845802
3970	NC_010175	AT	3	6	261887	261892	50 %	50 %	0 %	0 %	163845802
3971	NC_010175	GCA	2	6	261900	261905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845802
3972	NC_010175	TCG	2	6	261911	261916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845802
3973	NC_010175	GAC	2	6	261925	261930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845802
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3975	NC_010175	CTG	2	6	261957	261962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845802
3976	NC_010175	AGCG	2	8	261978	261985	25 %	0 %	50 %	25 %	163845802
3977	NC_010175	CGC	2	6	261993	261998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845802
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3980	NC_010175	CGGGC	2	10	262112	262121	0 %	0 %	60 %	40 %	163845803
3981	NC_010175	GTC	2	6	262135	262140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845803
3982	NC_010175	GAGCA	2	10	262144	262153	40 %	0 %	40 %	20 %	163845803
3983	NC_010175	CAT	2	6	262182	262187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845803
3984	NC_010175	CAC	2	6	262248	262253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845803
3985	NC_010175	ACC	2	6	262369	262374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845803
3986	NC_010175	CGT	2	6	262393	262398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845803
3987	NC_010175	CGC	2	6	262413	262418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845803
3988	NC_010175	AGC	2	6	262427	262432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845803
3989	NC_010175	GCC	2	6	262451	262456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845803
3990	NC_010175	CAG	2	6	262543	262548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845803
3991	NC_010175	GTAC	2	8	262586	262593	25 %	25 %	25 %	25 %	163845803
3992	NC_010175	TCA	2	6	262622	262627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845803
3993	NC_010175	CGG	2	6	262656	262661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845803
3994	NC_010175	ACCAC	2	10	262789	262798	40 %	0 %	0 %	60 %	163845803
3995	NC_010175	GAC	2	6	262816	262821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845803
3996	NC_010175	CTG	2	6	262828	262833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845803
3997	NC_010175	GAC	2	6	262882	262887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845803
3998	NC_010175	TCG	2	6	263135	263140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845804
3999	NC_010175	GCG	2	6	263214	263219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845804
4000	NC_010175	CTG	3	9	263227	263235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845804

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