MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010175	AC	4	8	161342	161349	50 %	0 %	0 %	50 %	163845723
2502	NC_010175	ACCA	2	8	161352	161359	50 %	0 %	0 %	50 %	163845723
2503	NC_010175	GGA	2	6	161412	161417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845723
2504	NC_010175	CCA	2	6	161618	161623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845723
2505	NC_010175	TCA	2	6	161635	161640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845723
2506	NC_010175	AACG	2	8	161641	161648	50 %	0 %	25 %	25 %	163845723
2507	NC_010175	CTG	2	6	161659	161664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845723
2508	NC_010175	ACA	2	6	161677	161682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845723
2509	NC_010175	GCC	2	6	161746	161751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845723
2510	NC_010175	GGAC	2	8	161803	161810	25 %	0 %	50 %	25 %	163845723
2511	NC_010175	ACA	2	6	161835	161840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845723
2512	NC_010175	AGC	2	6	161852	161857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845723
2513	NC_010175	CGC	2	6	162362	162367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845724
2514	NC_010175	GCC	2	6	162384	162389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845724
2515	NC_010175	CTCG	2	8	162446	162453	0 %	25 %	25 %	50 %	163845724
2516	NC_010175	CGTG	2	8	162554	162561	0 %	25 %	50 %	25 %	163845724
2517	NC_010175	CGA	2	6	162611	162616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845724
2518	NC_010175	TCA	2	6	162802	162807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845724
2519	NC_010175	ATG	2	6	162877	162882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845724
2520	NC_010175	TGA	2	6	162887	162892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845724
2521	NC_010175	TGA	2	6	162961	162966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845724
2522	NC_010175	TCA	2	6	162982	162987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845724
2523	NC_010175	AG	3	6	162989	162994	50 %	0 %	50 %	0 %	163845724
2524	NC_010175	GC	3	6	162998	163003	0 %	0 %	50 %	50 %	163845724
2525	NC_010175	ACCT	2	8	163008	163015	25 %	25 %	0 %	50 %	163845724
2526	NC_010175	GTG	2	6	163047	163052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845724
2527	NC_010175	CGG	2	6	163161	163166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845724
2528	NC_010175	GAA	2	6	163182	163187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845724
2529	NC_010175	GTG	2	6	163188	163193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845724
2530	NC_010175	CGA	2	6	163367	163372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845724
2531	NC_010175	CGG	2	6	163398	163403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845724
2532	NC_010175	GGCC	2	8	163427	163434	0 %	0 %	50 %	50 %	163845724
2533	NC_010175	CGA	2	6	163598	163603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845725
2534	NC_010175	GTC	2	6	163620	163625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845725
2535	NC_010175	CAT	2	6	163650	163655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845725
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2537	NC_010175	CAG	3	9	163776	163784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845725
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2539	NC_010175	TCGC	2	8	163815	163822	0 %	25 %	25 %	50 %	163845725
2540	NC_010175	CTA	2	6	163911	163916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845726
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2542	NC_010175	CAG	2	6	164020	164025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845726
2543	NC_010175	ATT	2	6	164057	164062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845726
2544	NC_010175	TTGA	2	8	164149	164156	25 %	50 %	25 %	0 %	163845726
2545	NC_010175	GATCC	2	10	164170	164179	20 %	20 %	20 %	40 %	163845726
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2547	NC_010175	GAT	2	6	164218	164223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845726
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2550	NC_010175	GCTG	2	8	164313	164320	0 %	25 %	50 %	25 %	163845726
2551	NC_010175	TGATG	2	10	164349	164358	20 %	40 %	40 %	0 %	163845726
2552	NC_010175	TGC	2	6	164370	164375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845726
2553	NC_010175	TGC	2	6	164436	164441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845726
2554	NC_010175	GCC	2	6	164493	164498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845726
2555	NC_010175	AAATC	2	10	164499	164508	60 %	20 %	0 %	20 %	163845726
2556	NC_010175	CTCG	2	8	164524	164531	0 %	25 %	25 %	50 %	163845726
2557	NC_010175	GCG	2	6	164550	164555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845726
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2559	NC_010175	CAG	2	6	164716	164721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845726
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2561	NC_010175	GCACC	2	10	164773	164782	20 %	0 %	20 %	60 %	163845726
2562	NC_010175	TCCGC	2	10	164895	164904	0 %	20 %	20 %	60 %	163845726
2563	NC_010175	GCA	2	6	165078	165083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845727
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2569	NC_010175	GGC	2	6	165203	165208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845727
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2572	NC_010175	ACC	2	6	165342	165347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845727
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2574	NC_010175	GTA	2	6	165484	165489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845727
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2579	NC_010175	TGG	2	6	165640	165645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845727
2580	NC_010175	AGGAAG	2	12	165665	165676	50 %	0 %	50 %	0 %	163845727
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2585	NC_010175	GCG	2	6	165967	165972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845727
2586	NC_010175	GCGG	2	8	166020	166027	0 %	0 %	75 %	25 %	163845727
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2600	NC_010175	CGG	2	6	166473	166478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845728
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2606	NC_010175	CGA	2	6	166951	166956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845728
2607	NC_010175	CTT	2	6	166960	166965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845728
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2611	NC_010175	TAA	2	6	167137	167142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845728
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2622	NC_010175	AGC	2	6	167619	167624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845728
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2744	NC_010175	GCG	2	6	174285	174290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845736
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2984	NC_010175	TGA	2	6	193935	193940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845753
2985	NC_010175	TAC	2	6	193957	193962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845753
2986	NC_010175	TGCC	2	8	194019	194026	0 %	25 %	25 %	50 %	163845754
2987	NC_010175	GCG	2	6	194051	194056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845754
2988	NC_010175	GGC	2	6	194069	194074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845754
2989	NC_010175	GAA	2	6	194090	194095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845754
2990	NC_010175	GCTG	2	8	194170	194177	0 %	25 %	50 %	25 %	163845754
2991	NC_010175	GTG	2	6	194181	194186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845754
2992	NC_010175	CACG	2	8	194228	194235	25 %	0 %	25 %	50 %	163845754
2993	NC_010175	GCTGCC	2	12	194300	194311	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	163845754
2994	NC_010175	CTG	2	6	194359	194364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845754
2995	NC_010175	CTG	2	6	194405	194410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845754
2996	NC_010175	GGT	2	6	194501	194506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845754
2997	NC_010175	TGC	2	6	194545	194550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845754
2998	NC_010175	G	6	6	194631	194636	0 %	0 %	100 %	0 %	163845754
2999	NC_010175	GGT	2	6	194644	194649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845754
3000	NC_010175	GCGA	2	8	194712	194719	25 %	0 %	50 %	25 %	163845754

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