MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_010175	ACC	2	6	131750	131755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845696
2003	NC_010175	ACC	2	6	131760	131765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845696
2004	NC_010175	A	6	6	131794	131799	100 %	0 %	0 %	0 %	163845696
2005	NC_010175	CAAT	2	8	131832	131839	50 %	25 %	0 %	25 %	163845696
2006	NC_010175	CCAC	2	8	131944	131951	25 %	0 %	0 %	75 %	163845697
2007	NC_010175	GGC	2	6	131962	131967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845697
2008	NC_010175	CAC	2	6	132018	132023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845697
2009	NC_010175	CGA	2	6	132097	132102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845697
2010	NC_010175	TAT	2	6	132128	132133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845697
2011	NC_010175	CA	3	6	132141	132146	50 %	0 %	0 %	50 %	163845697
2012	NC_010175	GAA	2	6	132174	132179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845697
2013	NC_010175	GCG	2	6	132215	132220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845697
2014	NC_010175	T	6	6	132253	132258	0 %	100 %	0 %	0 %	163845697
2015	NC_010175	ATA	2	6	132310	132315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845697
2016	NC_010175	CAGGTA	2	12	132368	132379	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163845697
2017	NC_010175	ATC	2	6	132420	132425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845697
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2019	NC_010175	A	6	6	132498	132503	100 %	0 %	0 %	0 %	163845698
2020	NC_010175	GAC	2	6	132504	132509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845698
2021	NC_010175	CGA	3	9	132611	132619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845698
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2023	NC_010175	GCT	2	6	132677	132682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845698
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2025	NC_010175	CGC	2	6	132729	132734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845698
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2030	NC_010175	CGG	2	6	132968	132973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845698
2031	NC_010175	TCTG	2	8	132986	132993	0 %	50 %	25 %	25 %	163845698
2032	NC_010175	CGG	2	6	133028	133033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845698
2033	NC_010175	GAT	2	6	133125	133130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845698
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2038	NC_010175	GAA	2	6	133248	133253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845698
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2041	NC_010175	ACCTCA	2	12	134535	134546	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	163845699
2042	NC_010175	GC	3	6	134552	134557	0 %	0 %	50 %	50 %	163845699
2043	NC_010175	GCC	2	6	134694	134699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845699
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2049	NC_010175	GTC	3	9	135108	135116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845699
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2051	NC_010175	TCT	2	6	135201	135206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845699
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2053	NC_010175	TGC	2	6	135606	135611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845700
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2055	NC_010175	CGC	2	6	135693	135698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845700
2056	NC_010175	TGC	2	6	135717	135722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845700
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2120	NC_010175	TGA	3	9	138461	138469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845701
2121	NC_010175	TCG	2	6	138503	138508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845701
2122	NC_010175	GATC	2	8	138596	138603	25 %	25 %	25 %	25 %	163845701
2123	NC_010175	GCT	2	6	138644	138649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845701
2124	NC_010175	CAT	2	6	138671	138676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845701
2125	NC_010175	CCA	2	6	138708	138713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845701
2126	NC_010175	TCA	2	6	138798	138803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845701
2127	NC_010175	CCG	2	6	138887	138892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845702
2128	NC_010175	TGGC	2	8	138915	138922	0 %	25 %	50 %	25 %	163845702
2129	NC_010175	TTG	3	9	138982	138990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845702
2130	NC_010175	GCCGGC	2	12	139031	139042	0 %	0 %	50 %	50 %	163845702
2131	NC_010175	CGC	3	9	139053	139061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845702
2132	NC_010175	TGA	2	6	139085	139090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845702
2133	NC_010175	GCTACG	2	12	139120	139131	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163845702
2134	NC_010175	CAG	2	6	139143	139148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845702
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2136	NC_010175	CCTTCG	2	12	139243	139254	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	163845702
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2141	NC_010175	ACC	2	6	139464	139469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845702
2142	NC_010175	GTC	2	6	139476	139481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845702
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2144	NC_010175	GTG	2	6	139684	139689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845702
2145	NC_010175	C	7	7	139696	139702	0 %	0 %	0 %	100 %	163845702
2146	NC_010175	GCC	2	6	139800	139805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845702
2147	NC_010175	CCGGTG	2	12	139921	139932	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163845702
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2151	NC_010175	GGT	2	6	140049	140054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845702
2152	NC_010175	CCG	2	6	140207	140212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845703
2153	NC_010175	AGC	2	6	140297	140302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845703
2154	NC_010175	ATT	2	6	140340	140345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845703
2155	NC_010175	CTCA	2	8	140357	140364	25 %	25 %	0 %	50 %	163845703
2156	NC_010175	ACG	2	6	140370	140375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845703
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2158	NC_010175	ATC	2	6	140457	140462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845703
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2160	NC_010175	CGG	2	6	140572	140577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845703
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2169	NC_010175	CTG	2	6	141003	141008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845703
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2190	NC_010175	TGGGT	2	10	142355	142364	0 %	40 %	60 %	0 %	163845704
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2192	NC_010175	GCTG	2	8	142455	142462	0 %	25 %	50 %	25 %	163845704
2193	NC_010175	GGT	2	6	142492	142497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845704
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2197	NC_010175	ACTGCC	2	12	142974	142985	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	163845705
2198	NC_010175	ACA	2	6	143010	143015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845705
2199	NC_010175	AT	3	6	143051	143056	50 %	50 %	0 %	0 %	163845705
2200	NC_010175	CGA	2	6	143060	143065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845705
2201	NC_010175	GGT	2	6	143075	143080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845705
2202	NC_010175	GCG	2	6	143247	143252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845705
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2204	NC_010175	GTA	2	6	143367	143372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845705
2205	NC_010175	TGC	2	6	143429	143434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845705
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2209	NC_010175	TGC	2	6	143643	143648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845706
2210	NC_010175	CAGC	2	8	143707	143714	25 %	0 %	25 %	50 %	163845706
2211	NC_010175	AGA	2	6	143784	143789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845706
2212	NC_010175	TCG	2	6	143859	143864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845706
2213	NC_010175	CGA	2	6	144037	144042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845706
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2215	NC_010175	GTA	2	6	144118	144123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845706
2216	NC_010175	TCG	2	6	144206	144211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845707
2217	NC_010175	TGC	2	6	144444	144449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845707
2218	NC_010175	CTG	2	6	144582	144587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845707
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2222	NC_010175	TCGC	2	8	144742	144749	0 %	25 %	25 %	50 %	163845707
2223	NC_010175	CCT	2	6	144802	144807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845707
2224	NC_010175	CAAC	2	8	144910	144917	50 %	0 %	0 %	50 %	163845708
2225	NC_010175	TG	3	6	144995	145000	0 %	50 %	50 %	0 %	163845708
2226	NC_010175	TGC	2	6	145070	145075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845708
2227	NC_010175	CGA	2	6	145155	145160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845708
2228	NC_010175	TGA	2	6	145194	145199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845708
2229	NC_010175	TGG	2	6	145232	145237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845708
2230	NC_010175	GCAAC	2	10	145263	145272	40 %	0 %	20 %	40 %	163845708
2231	NC_010175	GC	3	6	145327	145332	0 %	0 %	50 %	50 %	163845708
2232	NC_010175	CTGGCC	2	12	145390	145401	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	163845708
2233	NC_010175	ACCG	2	8	145471	145478	25 %	0 %	25 %	50 %	163845708
2234	NC_010175	GTCA	2	8	145495	145502	25 %	25 %	25 %	25 %	163845708
2235	NC_010175	TTG	2	6	145574	145579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845708
2236	NC_010175	GGC	2	6	145640	145645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845709
2237	NC_010175	TGG	4	12	145679	145690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845709
2238	NC_010175	GTG	2	6	145696	145701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845709
2239	NC_010175	GTAC	2	8	145765	145772	25 %	25 %	25 %	25 %	163845709
2240	NC_010175	CAC	2	6	145827	145832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845709
2241	NC_010175	CTG	2	6	145840	145845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845709
2242	NC_010175	GCA	2	6	145871	145876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845709
2243	NC_010175	AGT	2	6	145885	145890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845709
2244	NC_010175	CGC	2	6	145891	145896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845709
2245	NC_010175	TGC	2	6	145899	145904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845709
2246	NC_010175	ACG	2	6	145913	145918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845709
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2249	NC_010175	GAT	2	6	146019	146024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845709
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2252	NC_010175	CGT	2	6	146146	146151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845709
2253	NC_010175	TGA	2	6	146166	146171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845709
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2260	NC_010175	CGT	2	6	147263	147268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845710
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2266	NC_010175	CTGG	2	8	147583	147590	0 %	25 %	50 %	25 %	163845711
2267	NC_010175	TG	3	6	147610	147615	0 %	50 %	50 %	0 %	163845711
2268	NC_010175	TGA	2	6	147660	147665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845711
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2270	NC_010175	CTG	2	6	147710	147715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845711
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2278	NC_010175	CTG	2	6	148692	148697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845712
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2280	NC_010175	GCT	2	6	148931	148936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845712
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2284	NC_010175	A	6	6	149209	149214	100 %	0 %	0 %	0 %	163845712
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2345	NC_010175	CA	3	6	152307	152312	50 %	0 %	0 %	50 %	163845715
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2349	NC_010175	CCGGC	2	10	152492	152501	0 %	0 %	40 %	60 %	163845715
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2354	NC_010175	TGAT	2	8	152728	152735	25 %	50 %	25 %	0 %	163845715
2355	NC_010175	CAA	2	6	152789	152794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845715
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2357	NC_010175	GCC	2	6	152893	152898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845715
2358	NC_010175	GATC	2	8	152966	152973	25 %	25 %	25 %	25 %	163845715
2359	NC_010175	GCA	2	6	152983	152988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845715
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2363	NC_010175	CGG	2	6	153746	153751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845716
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2482	NC_010175	TGG	2	6	159603	159608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845721
2483	NC_010175	GCC	2	6	159633	159638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845721
2484	NC_010175	CGG	2	6	159662	159667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845721
2485	NC_010175	ACGA	2	8	159726	159733	50 %	0 %	25 %	25 %	163845721
2486	NC_010175	TCA	2	6	160511	160516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845722
2487	NC_010175	CCAG	2	8	160607	160614	25 %	0 %	25 %	50 %	163845722
2488	NC_010175	CGCT	2	8	160681	160688	0 %	25 %	25 %	50 %	163845722
2489	NC_010175	ACC	2	6	160701	160706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845722
2490	NC_010175	AAG	2	6	160720	160725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845722
2491	NC_010175	A	6	6	160805	160810	100 %	0 %	0 %	0 %	163845722
2492	NC_010175	CGA	2	6	160814	160819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845722
2493	NC_010175	CCG	2	6	160821	160826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845722
2494	NC_010175	CAC	2	6	160838	160843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845722
2495	NC_010175	CTCA	2	8	160866	160873	25 %	25 %	0 %	50 %	163845722
2496	NC_010175	TCACG	2	10	161017	161026	20 %	20 %	20 %	40 %	163845723
2497	NC_010175	CTG	2	6	161100	161105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845723
2498	NC_010175	GATC	2	8	161240	161247	25 %	25 %	25 %	25 %	163845723
2499	NC_010175	AT	3	6	161282	161287	50 %	50 %	0 %	0 %	163845723
2500	NC_010175	AAC	2	6	161320	161325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845723

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