MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_010175	ATT	2	6	92726	92731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845675
1503	NC_010175	GCA	2	6	92732	92737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845675
1504	NC_010175	TCAG	2	8	92747	92754	25 %	25 %	25 %	25 %	163845675
1505	NC_010175	TACA	2	8	92771	92778	50 %	25 %	0 %	25 %	163845675
1506	NC_010175	GTTC	2	8	92817	92824	0 %	50 %	25 %	25 %	163845675
1507	NC_010175	GAC	2	6	92852	92857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845675
1508	NC_010175	TGA	2	6	92902	92907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845675
1509	NC_010175	CGA	2	6	92989	92994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845675
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1511	NC_010175	CTT	2	6	93079	93084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845675
1512	NC_010175	CAA	2	6	93128	93133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845675
1513	NC_010175	TGAA	2	8	93141	93148	50 %	25 %	25 %	0 %	163845675
1514	NC_010175	AAG	2	6	93177	93182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845675
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1519	NC_010175	CAT	2	6	93710	93715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845676
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1521	NC_010175	GGC	2	6	93872	93877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845676
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1524	NC_010175	ACCGG	2	10	93936	93945	20 %	0 %	40 %	40 %	163845676
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1555	NC_010175	GGGGT	2	10	97791	97800	0 %	20 %	80 %	0 %	163845678
1556	NC_010175	GGAA	2	8	97846	97853	50 %	0 %	50 %	0 %	163845678
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1559	NC_010175	CAT	2	6	98628	98633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845679
1560	NC_010175	CCG	2	6	98668	98673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845679
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1603	NC_010175	C	6	6	100980	100985	0 %	0 %	0 %	100 %	163845679
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1622	NC_010175	CTGC	3	12	101951	101962	0 %	25 %	25 %	50 %	163845679
1623	NC_010175	GCA	2	6	102026	102031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845679
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1739	NC_010175	CTTTT	2	10	111010	111019	0 %	80 %	0 %	20 %	163845685
1740	NC_010175	ACGTGA	2	12	111173	111184	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163845685
1741	NC_010175	CTGC	2	8	111255	111262	0 %	25 %	25 %	50 %	163845685
1742	NC_010175	GAG	3	9	111298	111306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845685
1743	NC_010175	CCAT	2	8	111317	111324	25 %	25 %	0 %	50 %	163845685
1744	NC_010175	GAC	2	6	111328	111333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845685
1745	NC_010175	ATG	2	6	111344	111349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845685
1746	NC_010175	CAG	2	6	111439	111444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845685
1747	NC_010175	ACGC	2	8	111453	111460	25 %	0 %	25 %	50 %	163845685
1748	NC_010175	CTTC	2	8	111485	111492	0 %	50 %	0 %	50 %	163845685
1749	NC_010175	TG	3	6	111583	111588	0 %	50 %	50 %	0 %	163845685
1750	NC_010175	CGG	2	6	111619	111624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845685
1751	NC_010175	CGG	2	6	111662	111667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845685
1752	NC_010175	GTC	2	6	111745	111750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845685
1753	NC_010175	CGT	2	6	111763	111768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845685
1754	NC_010175	TGC	2	6	111859	111864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845685
1755	NC_010175	TCG	2	6	111905	111910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845685
1756	NC_010175	ACC	2	6	112024	112029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845685
1757	NC_010175	CGC	2	6	112133	112138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845685
1758	NC_010175	CGGCC	2	10	112141	112150	0 %	0 %	40 %	60 %	163845685
1759	NC_010175	CTGCCG	2	12	112224	112235	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	163845685
1760	NC_010175	GCA	2	6	112305	112310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845685
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1762	NC_010175	GGGC	2	8	112383	112390	0 %	0 %	75 %	25 %	163845685
1763	NC_010175	GCC	3	9	112400	112408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845685
1764	NC_010175	GCTG	2	8	112503	112510	0 %	25 %	50 %	25 %	163845685
1765	NC_010175	TGC	2	6	112523	112528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845685
1766	NC_010175	AGCA	2	8	112576	112583	50 %	0 %	25 %	25 %	163845685
1767	NC_010175	GCT	2	6	112605	112610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845685
1768	NC_010175	GCA	2	6	112659	112664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845685
1769	NC_010175	GCA	2	6	112667	112672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845685
1770	NC_010175	ATA	2	6	112673	112678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845685
1771	NC_010175	TCT	2	6	112758	112763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845685
1772	NC_010175	GGT	2	6	112768	112773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845685
1773	NC_010175	GCA	2	6	112808	112813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845685
1774	NC_010175	GCG	2	6	112824	112829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845685
1775	NC_010175	GCG	2	6	112839	112844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845685
1776	NC_010175	CAC	2	6	112876	112881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845685
1777	NC_010175	ACG	2	6	112916	112921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845685
1778	NC_010175	ATC	2	6	112987	112992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845685
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1782	NC_010175	ATTG	2	8	113077	113084	25 %	50 %	25 %	0 %	163845685
1783	NC_010175	TCA	2	6	113090	113095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845685
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1800	NC_010175	TAC	2	6	114715	114720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845687
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1813	NC_010175	CAGGGG	2	12	115168	115179	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	163845688
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1822	NC_010175	GTG	2	6	115731	115736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845689
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1825	NC_010175	CAG	2	6	115786	115791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845689
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1984	NC_010175	CCG	2	6	126816	126821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845695
1985	NC_010175	ACCCG	2	10	126880	126889	20 %	0 %	20 %	60 %	163845695
1986	NC_010175	GCC	2	6	126911	126916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845695
1987	NC_010175	TCG	2	6	126918	126923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845695
1988	NC_010175	CAC	2	6	126934	126939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845695
1989	NC_010175	GAA	2	6	126944	126949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845695
1990	NC_010175	CACG	2	8	127023	127030	25 %	0 %	25 %	50 %	163845695
1991	NC_010175	GCC	2	6	127047	127052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845695
1992	NC_010175	CTG	2	6	127070	127075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845695
1993	NC_010175	CCG	2	6	131320	131325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845696
1994	NC_010175	ACC	2	6	131349	131354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845696
1995	NC_010175	CGG	2	6	131363	131368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845696
1996	NC_010175	CCA	2	6	131389	131394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845696
1997	NC_010175	AC	3	6	131470	131475	50 %	0 %	0 %	50 %	163845696
1998	NC_010175	GCC	2	6	131629	131634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845696
1999	NC_010175	TCG	2	6	131659	131664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845696
2000	NC_010175	CCAGGC	2	12	131702	131713	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163845696

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