MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010175	CAA	2	6	34818	34823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845629
502	NC_010175	CCA	2	6	34832	34837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845629
503	NC_010175	AACCG	2	10	35010	35019	40 %	0 %	20 %	40 %	163845629
504	NC_010175	CAC	2	6	35063	35068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845629
505	NC_010175	ATG	3	9	35071	35079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845629
506	NC_010175	AGCC	2	8	35101	35108	25 %	0 %	25 %	50 %	163845629
507	NC_010175	GTA	2	6	35124	35129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845629
508	NC_010175	GAT	2	6	35130	35135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845629
509	NC_010175	GAA	2	6	35148	35153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845629
510	NC_010175	GCC	2	6	35155	35160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845629
511	NC_010175	GTG	2	6	35167	35172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845629
512	NC_010175	CGC	2	6	35226	35231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845629
513	NC_010175	CCG	2	6	35232	35237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845629
514	NC_010175	CCG	2	6	35329	35334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845629
515	NC_010175	CCA	2	6	35373	35378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845629
516	NC_010175	TGA	2	6	35399	35404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845629
517	NC_010175	TGG	2	6	35408	35413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845629
518	NC_010175	AGC	2	6	35431	35436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845629
519	NC_010175	GAT	2	6	35562	35567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845629
520	NC_010175	AAG	2	6	35637	35642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845629
521	NC_010175	CGCCAG	2	12	35688	35699	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163845629
522	NC_010175	GCC	2	6	35726	35731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845629
523	NC_010175	CCG	2	6	35804	35809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845629
524	NC_010175	TCA	2	6	35810	35815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845629
525	NC_010175	TGCG	2	8	35837	35844	0 %	25 %	50 %	25 %	163845629
526	NC_010175	GCT	2	6	35875	35880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845629
527	NC_010175	ACC	2	6	35882	35887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845629
528	NC_010175	GC	3	6	36008	36013	0 %	0 %	50 %	50 %	163845629
529	NC_010175	CCA	2	6	36035	36040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845629
530	NC_010175	AGAA	2	8	36088	36095	75 %	0 %	25 %	0 %	163845629
531	NC_010175	AGT	2	6	36181	36186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845629
532	NC_010175	CGA	2	6	36194	36199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845629
533	NC_010175	TTC	2	6	36252	36257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845629
534	NC_010175	ACG	2	6	36272	36277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845629
535	NC_010175	GAT	2	6	36321	36326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845629
536	NC_010175	CAA	2	6	36350	36355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845629
537	NC_010175	GCA	2	6	36421	36426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845630
538	NC_010175	CTG	2	6	36513	36518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845630
539	NC_010175	ACC	2	6	36567	36572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845630
540	NC_010175	CCAT	2	8	36992	36999	25 %	25 %	0 %	50 %	163845631
541	NC_010175	ATG	2	6	37021	37026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845631
542	NC_010175	GCT	3	9	37066	37074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845631
543	NC_010175	TCA	2	6	37087	37092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845631
544	NC_010175	GGC	2	6	37106	37111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845631
545	NC_010175	TGC	2	6	37224	37229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845631
546	NC_010175	CAG	2	6	37265	37270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845631
547	NC_010175	ATC	2	6	37299	37304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845631
548	NC_010175	TTG	2	6	37347	37352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845631
549	NC_010175	CAC	2	6	37394	37399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845631
550	NC_010175	GTAAA	3	15	37449	37463	60 %	20 %	20 %	0 %	163845631
551	NC_010175	AACG	2	8	37570	37577	50 %	0 %	25 %	25 %	163845631
552	NC_010175	ATC	2	6	37623	37628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845631
553	NC_010175	GAC	2	6	37650	37655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845631
554	NC_010175	AAT	2	6	37683	37688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845631
555	NC_010175	ATG	2	6	37777	37782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845631
556	NC_010175	GTC	3	9	37893	37901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845631
557	NC_010175	CTT	2	6	37928	37933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845631
558	NC_010175	AGC	2	6	37966	37971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845632
559	NC_010175	GTG	2	6	38024	38029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845632
560	NC_010175	CAAT	2	8	38088	38095	50 %	25 %	0 %	25 %	163845632
561	NC_010175	TCA	2	6	38102	38107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845632
562	NC_010175	ACC	2	6	38111	38116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845632
563	NC_010175	GCA	2	6	38141	38146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845632
564	NC_010175	CGA	3	9	38229	38237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845632
565	NC_010175	CA	3	6	38272	38277	50 %	0 %	0 %	50 %	163845632
566	NC_010175	CTG	2	6	38287	38292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845632
567	NC_010175	CCGA	2	8	38320	38327	25 %	0 %	25 %	50 %	163845632
568	NC_010175	CGA	2	6	38436	38441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845632
569	NC_010175	TCA	2	6	38483	38488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845632
570	NC_010175	AGGC	2	8	38496	38503	25 %	0 %	50 %	25 %	163845632
571	NC_010175	GCAG	2	8	38511	38518	25 %	0 %	50 %	25 %	163845632
572	NC_010175	CGC	2	6	38604	38609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845632
573	NC_010175	GCG	2	6	38626	38631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845632
574	NC_010175	CGA	2	6	38652	38657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845632
575	NC_010175	GGAT	2	8	38674	38681	25 %	25 %	50 %	0 %	163845632
576	NC_010175	CAA	2	6	38703	38708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845632
577	NC_010175	CGC	2	6	38724	38729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845632
578	NC_010175	GGT	2	6	38836	38841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845632
579	NC_010175	A	7	7	38861	38867	100 %	0 %	0 %	0 %	163845632
580	NC_010175	TATTT	2	10	39520	39529	20 %	80 %	0 %	0 %	163845633
581	NC_010175	CAT	2	6	39540	39545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845633
582	NC_010175	GCC	2	6	39575	39580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845633
583	NC_010175	GACC	2	8	39614	39621	25 %	0 %	25 %	50 %	163845633
584	NC_010175	CCG	2	6	39634	39639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845633
585	NC_010175	ACC	3	9	39646	39654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845633
586	NC_010175	GCA	2	6	39665	39670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845633
587	NC_010175	GTC	2	6	39761	39766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845633
588	NC_010175	CATC	3	12	39829	39840	25 %	25 %	0 %	50 %	163845633
589	NC_010175	GCT	2	6	39841	39846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845633
590	NC_010175	GA	3	6	39894	39899	50 %	0 %	50 %	0 %	163845633
591	NC_010175	CCA	2	6	39980	39985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845633
592	NC_010175	A	6	6	40127	40132	100 %	0 %	0 %	0 %	163845633
593	NC_010175	TAT	2	6	40243	40248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845633
594	NC_010175	GCG	2	6	40253	40258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845633
595	NC_010175	CGC	2	6	40379	40384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845633
596	NC_010175	CTGG	2	8	40402	40409	0 %	25 %	50 %	25 %	163845633
597	NC_010175	ACA	2	6	40425	40430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845633
598	NC_010175	TTC	2	6	41299	41304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845634
599	NC_010175	GAA	2	6	41419	41424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845634
600	NC_010175	TGC	2	6	41448	41453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845634
601	NC_010175	TGA	2	6	41579	41584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845634
602	NC_010175	ATT	2	6	41605	41610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845634
603	NC_010175	GA	4	8	41688	41695	50 %	0 %	50 %	0 %	163845634
604	NC_010175	GTA	2	6	41724	41729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845634
605	NC_010175	TGC	2	6	41776	41781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845635
606	NC_010175	GTG	2	6	41793	41798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845635
607	NC_010175	CTA	2	6	41812	41817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845635
608	NC_010175	ACT	4	12	41823	41834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845635
609	NC_010175	ACA	2	6	41996	42001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845635
610	NC_010175	CCA	2	6	42083	42088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845635
611	NC_010175	TGG	2	6	42100	42105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845635
612	NC_010175	GTG	2	6	42206	42211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845635
613	NC_010175	TGG	2	6	42248	42253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845635
614	NC_010175	CAG	2	6	42746	42751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845636
615	NC_010175	G	6	6	42790	42795	0 %	0 %	100 %	0 %	163845636
616	NC_010175	GGC	2	6	42801	42806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845636
617	NC_010175	CAT	2	6	42816	42821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845636
618	NC_010175	TCGT	2	8	42823	42830	0 %	50 %	25 %	25 %	163845636
619	NC_010175	CGG	2	6	42848	42853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845636
620	NC_010175	TTG	2	6	42859	42864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845636
621	NC_010175	AGC	2	6	42922	42927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845636
622	NC_010175	CAG	2	6	43065	43070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845636
623	NC_010175	TGC	2	6	43095	43100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845636
624	NC_010175	GCCA	2	8	43204	43211	25 %	0 %	25 %	50 %	163845636
625	NC_010175	GGC	2	6	43309	43314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845636
626	NC_010175	CCA	2	6	43344	43349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845636
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