MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
82501	NC_010175	CGCTC	2	10	5218500	5218509	0 %	20 %	20 %	60 %	163849427
82502	NC_010175	GATC	2	8	5218516	5218523	25 %	25 %	25 %	25 %	163849427
82503	NC_010175	CAA	2	6	5218528	5218533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163849427
82504	NC_010175	CTA	2	6	5218555	5218560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849427
82505	NC_010175	GTG	2	6	5218590	5218595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849427
82506	NC_010175	CTT	2	6	5218675	5218680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163849427
82507	NC_010175	TCAA	2	8	5218692	5218699	50 %	25 %	0 %	25 %	163849427
82508	NC_010175	AAC	2	6	5218844	5218849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163849427
82509	NC_010175	AAC	2	6	5218913	5218918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163849427
82510	NC_010175	TGG	2	6	5218924	5218929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849427
82511	NC_010175	GGCT	2	8	5218934	5218941	0 %	25 %	50 %	25 %	163849427
82512	NC_010175	GAG	2	6	5218959	5218964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849427
82513	NC_010175	GTG	2	6	5218968	5218973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849427
82514	NC_010175	GGAGCT	2	12	5218993	5219004	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	163849427
82515	NC_010175	GGCC	2	8	5219058	5219065	0 %	0 %	50 %	50 %	163849427
82516	NC_010175	CGG	2	6	5219165	5219170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849427
82517	NC_010175	ACG	2	6	5219223	5219228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849427
82518	NC_010175	ACC	2	6	5219380	5219385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163849427
82519	NC_010175	CGCC	2	8	5219465	5219472	0 %	0 %	25 %	75 %	163849427
82520	NC_010175	GCCC	2	8	5219571	5219578	0 %	0 %	25 %	75 %	163849427
82521	NC_010175	CG	3	6	5219637	5219642	0 %	0 %	50 %	50 %	163849427
82522	NC_010175	CAAA	2	8	5219689	5219696	75 %	0 %	0 %	25 %	163849427
82523	NC_010175	GGT	2	6	5219798	5219803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849427
82524	NC_010175	CAA	2	6	5219857	5219862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163849427
82525	NC_010175	GGT	2	6	5219882	5219887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849427
82526	NC_010175	TGG	2	6	5220049	5220054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849427
82527	NC_010175	ACT	2	6	5220068	5220073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849427
82528	NC_010175	TGA	2	6	5220112	5220117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849427
82529	NC_010175	GGT	2	6	5220143	5220148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849427
82530	NC_010175	GAT	2	6	5220361	5220366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849427
82531	NC_010175	TGG	2	6	5220463	5220468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849427
82532	NC_010175	GAG	2	6	5220578	5220583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849427
82533	NC_010175	TACC	2	8	5220595	5220602	25 %	25 %	0 %	50 %	163849427
82534	NC_010175	TCT	2	6	5220618	5220623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163849427
82535	NC_010175	CTGCGC	2	12	5220767	5220778	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	163849427
82536	NC_010175	ATGT	2	8	5220789	5220796	25 %	50 %	25 %	0 %	163849427
82537	NC_010175	TAGG	3	12	5220806	5220817	25 %	25 %	50 %	0 %	163849427
82538	NC_010175	TGA	2	6	5220925	5220930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849428
82539	NC_010175	GCT	2	6	5220962	5220967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849428
82540	NC_010175	TTC	2	6	5220972	5220977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163849428
82541	NC_010175	TGC	2	6	5220986	5220991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849428
82542	NC_010175	TGC	2	6	5221003	5221008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849428
82543	NC_010175	ACC	2	6	5221010	5221015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163849428
82544	NC_010175	ATC	2	6	5221059	5221064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849428
82545	NC_010175	GTC	2	6	5221110	5221115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849428
82546	NC_010175	CAA	2	6	5221135	5221140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163849428
82547	NC_010175	CAA	2	6	5221193	5221198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163849428
82548	NC_010175	TACTGC	2	12	5221205	5221216	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	163849428
82549	NC_010175	GCAGAA	2	12	5221302	5221313	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	163849428
82550	NC_010175	TTG	2	6	5221342	5221347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163849428
82551	NC_010175	CGC	2	6	5221409	5221414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849428
82552	NC_010175	AC	3	6	5221453	5221458	50 %	0 %	0 %	50 %	163849428
82553	NC_010175	GGGCAG	2	12	5221477	5221488	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	163849428
82554	NC_010175	ACTG	2	8	5221557	5221564	25 %	25 %	25 %	25 %	163849428
82555	NC_010175	CCA	2	6	5221582	5221587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163849428
82556	NC_010175	AGCG	2	8	5221597	5221604	25 %	0 %	50 %	25 %	163849428
82557	NC_010175	CAT	2	6	5221625	5221630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849428
82558	NC_010175	GAT	2	6	5221671	5221676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849428
82559	NC_010175	GATT	2	8	5221763	5221770	25 %	50 %	25 %	0 %	163849428
82560	NC_010175	GGC	2	6	5221785	5221790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849428
82561	NC_010175	TCT	2	6	5221840	5221845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163849428
82562	NC_010175	TCCA	2	8	5221876	5221883	25 %	25 %	0 %	50 %	163849428
82563	NC_010175	CTG	2	6	5221888	5221893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849428
82564	NC_010175	CGC	2	6	5221958	5221963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849428
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82567	NC_010175	CAA	2	6	5222086	5222091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163849428
82568	NC_010175	GCG	2	6	5222134	5222139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849428
82569	NC_010175	CTA	2	6	5222204	5222209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849428
82570	NC_010175	AAT	2	6	5222346	5222351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163849428
82571	NC_010175	TTC	2	6	5222359	5222364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163849428
82572	NC_010175	TCG	2	6	5222375	5222380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849428
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82574	NC_010175	AGCG	2	8	5222420	5222427	25 %	0 %	50 %	25 %	163849428
82575	NC_010175	GCA	2	6	5222445	5222450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849428
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82577	NC_010175	AATC	2	8	5222475	5222482	50 %	25 %	0 %	25 %	163849428
82578	NC_010175	CCAA	2	8	5222490	5222497	50 %	0 %	0 %	50 %	163849428
82579	NC_010175	TTG	2	6	5222506	5222511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163849428
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82583	NC_010175	GTG	2	6	5222697	5222702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849428
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82588	NC_010175	CTG	2	6	5222934	5222939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849428
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82593	NC_010175	CCGTT	2	10	5223274	5223283	0 %	40 %	20 %	40 %	163849428
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82600	NC_010175	ATC	2	6	5223842	5223847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849429
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82602	NC_010175	GCT	2	6	5223916	5223921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849429
82603	NC_010175	GGGT	2	8	5223990	5223997	0 %	25 %	75 %	0 %	163849429
82604	NC_010175	ATG	2	6	5224010	5224015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849429
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82606	NC_010175	CA	3	6	5224115	5224120	50 %	0 %	0 %	50 %	163849429
82607	NC_010175	TC	3	6	5224186	5224191	0 %	50 %	0 %	50 %	163849429
82608	NC_010175	TGA	2	6	5224228	5224233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849429
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82610	NC_010175	GGA	2	6	5224295	5224300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849429
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82612	NC_010175	ACC	2	6	5224319	5224324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163849429
82613	NC_010175	GTA	2	6	5224399	5224404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849429
82614	NC_010175	TAT	2	6	5224433	5224438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163849430
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