MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 83160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010175	GGCC	2	8	297114	297121	0 %	0 %	50 %	50 %	163845833
4502	NC_010175	ACC	2	6	297137	297142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845833
4503	NC_010175	GGC	2	6	297217	297222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845833
4504	NC_010175	ATCGTA	2	12	297257	297268	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	163845833
4505	NC_010175	GCA	2	6	297350	297355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845833
4506	NC_010175	TCA	2	6	297414	297419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845833
4507	NC_010175	TCA	2	6	297723	297728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845834
4508	NC_010175	CGC	2	6	297824	297829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845834
4509	NC_010175	ATT	2	6	297833	297838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845834
4510	NC_010175	CAG	2	6	297874	297879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845834
4511	NC_010175	CCAC	2	8	297939	297946	25 %	0 %	0 %	75 %	163845834
4512	NC_010175	ACCA	2	8	297977	297984	50 %	0 %	0 %	50 %	163845834
4513	NC_010175	TTG	2	6	298128	298133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845834
4514	NC_010175	GCC	2	6	298140	298145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845834
4515	NC_010175	GCA	2	6	298161	298166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845834
4516	NC_010175	CAA	2	6	298192	298197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845834
4517	NC_010175	TGC	2	6	298232	298237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845834
4518	NC_010175	CAC	2	6	298241	298246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845834
4519	NC_010175	AGCC	2	8	298259	298266	25 %	0 %	25 %	50 %	163845834
4520	NC_010175	CGGT	2	8	298269	298276	0 %	25 %	50 %	25 %	163845834
4521	NC_010175	GA	3	6	298284	298289	50 %	0 %	50 %	0 %	163845834
4522	NC_010175	ACC	2	6	298307	298312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845834
4523	NC_010175	CAG	2	6	298325	298330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845834
4524	NC_010175	CATCG	2	10	298373	298382	20 %	20 %	20 %	40 %	163845834
4525	NC_010175	TGG	2	6	298429	298434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845834
4526	NC_010175	GAA	2	6	298436	298441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845834
4527	NC_010175	ATC	2	6	298590	298595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845834
4528	NC_010175	ACCC	2	8	298621	298628	25 %	0 %	0 %	75 %	163845834
4529	NC_010175	CCGCG	2	10	298643	298652	0 %	0 %	40 %	60 %	163845834
4530	NC_010175	ACC	2	6	298686	298691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845834
4531	NC_010175	CAC	2	6	298807	298812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845834
4532	NC_010175	GCC	2	6	298817	298822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845834
4533	NC_010175	TCA	2	6	299130	299135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845835
4534	NC_010175	CAA	2	6	299163	299168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845835
4535	NC_010175	GCC	2	6	299176	299181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845835
4536	NC_010175	GAT	2	6	299227	299232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845835
4537	NC_010175	CTA	2	6	299242	299247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845835
4538	NC_010175	TGA	2	6	299248	299253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845835
4539	NC_010175	GGT	2	6	299339	299344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845835
4540	NC_010175	GCTG	2	8	299578	299585	0 %	25 %	50 %	25 %	163845835
4541	NC_010175	CGG	2	6	299631	299636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845835
4542	NC_010175	AGC	2	6	299680	299685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845835
4543	NC_010175	GGC	2	6	299748	299753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845835
4544	NC_010175	ACA	2	6	299900	299905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845836
4545	NC_010175	TCA	2	6	299947	299952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845836
4546	NC_010175	GCA	2	6	299966	299971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845836
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4548	NC_010175	ACC	2	6	300118	300123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845836
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4550	NC_010175	TGC	2	6	300265	300270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845836
4551	NC_010175	CGC	2	6	300279	300284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845836
4552	NC_010175	AATC	2	8	300368	300375	50 %	25 %	0 %	25 %	163845836
4553	NC_010175	G	6	6	300417	300422	0 %	0 %	100 %	0 %	163845836
4554	NC_010175	CAG	2	6	300428	300433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845836
4555	NC_010175	CAG	2	6	300531	300536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845836
4556	NC_010175	CTGA	2	8	300549	300556	25 %	25 %	25 %	25 %	163845836
4557	NC_010175	AAGCTG	2	12	300588	300599	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163845836
4558	NC_010175	CCG	2	6	300714	300719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845836
4559	NC_010175	GCC	2	6	300745	300750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845836
4560	NC_010175	GAT	2	6	300822	300827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845836
4561	NC_010175	ATT	2	6	300840	300845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845836
4562	NC_010175	GCT	2	6	300908	300913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845836
4563	NC_010175	GTT	2	6	300920	300925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845836
4564	NC_010175	GCT	2	6	300926	300931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845836
4565	NC_010175	CTT	2	6	300932	300937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845836
4566	NC_010175	TCAAA	2	10	300956	300965	60 %	20 %	0 %	20 %	163845836
4567	NC_010175	GCC	2	6	301015	301020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845836
4568	NC_010175	CGAA	2	8	301023	301030	50 %	0 %	25 %	25 %	163845836
4569	NC_010175	ACA	2	6	301109	301114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845836
4570	NC_010175	ATC	2	6	301134	301139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845836
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4579	NC_010175	CGT	2	6	301473	301478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845836
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4596	NC_010175	CGCAT	2	10	302659	302668	20 %	20 %	20 %	40 %	163845837
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4602	NC_010175	A	7	7	303027	303033	100 %	0 %	0 %	0 %	163845837
4603	NC_010175	GAT	2	6	303037	303042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845837
4604	NC_010175	GATTGA	2	12	303068	303079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845837
4605	NC_010175	CGT	2	6	303141	303146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845837
4606	NC_010175	CGT	2	6	303189	303194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845837
4607	NC_010175	TTCCCG	2	12	303197	303208	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	163845837
4608	NC_010175	CCA	3	9	303247	303255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845837
4609	NC_010175	TCG	2	6	303262	303267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845837
4610	NC_010175	CGTTG	2	10	303292	303301	0 %	40 %	40 %	20 %	163845837
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4743	NC_010175	CGG	2	6	312148	312153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845842
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4980	NC_010175	CGC	2	6	325206	325211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845851
4981	NC_010175	GCC	2	6	325216	325221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845851
4982	NC_010175	CGC	2	6	325254	325259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845851
4983	NC_010175	CGC	2	6	325302	325307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845851
4984	NC_010175	CGC	2	6	325398	325403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845851
4985	NC_010175	CGC	2	6	325494	325499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845851
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