MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 34541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010117	GA	3	6	228005	228010	50 %	0 %	50 %	0 %	161829714
4002	NC_010117	A	6	6	228014	228019	100 %	0 %	0 %	0 %	161829714
4003	NC_010117	GAAA	2	8	228036	228043	75 %	0 %	25 %	0 %	161830840
4004	NC_010117	A	6	6	228062	228067	100 %	0 %	0 %	0 %	161830840
4005	NC_010117	ATT	2	6	228083	228088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830840
4006	NC_010117	GAT	2	6	228139	228144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830840
4007	NC_010117	ATT	2	6	228165	228170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830840
4008	NC_010117	AATTG	2	10	228201	228210	40 %	40 %	20 %	0 %	161830840
4009	NC_010117	ATG	2	6	228212	228217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830840
4010	NC_010117	AAT	2	6	228249	228254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830840
4011	NC_010117	AAC	2	6	228280	228285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830840
4012	NC_010117	AAC	2	6	228287	228292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830840
4013	NC_010117	AAT	2	6	228376	228381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830840
4014	NC_010117	ATCAT	2	10	228407	228416	40 %	40 %	0 %	20 %	161830840
4015	NC_010117	TTTAT	2	10	228437	228446	20 %	80 %	0 %	0 %	161830840
4016	NC_010117	AAT	2	6	228462	228467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830840
4017	NC_010117	AC	3	6	228499	228504	50 %	0 %	0 %	50 %	161830840
4018	NC_010117	ATAA	2	8	229663	229670	75 %	25 %	0 %	0 %	161831626
4019	NC_010117	CGT	2	6	229679	229684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831626
4020	NC_010117	AGG	2	6	229693	229698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831626
4021	NC_010117	AT	3	6	229708	229713	50 %	50 %	0 %	0 %	161831626
4022	NC_010117	AAC	2	6	229776	229781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831626
4023	NC_010117	A	6	6	229791	229796	100 %	0 %	0 %	0 %	161831626
4024	NC_010117	T	6	6	229799	229804	0 %	100 %	0 %	0 %	161831626
4025	NC_010117	TAA	2	6	229844	229849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831626
4026	NC_010117	TAC	2	6	229895	229900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831626
4027	NC_010117	TTTGT	2	10	229972	229981	0 %	80 %	20 %	0 %	161831626
4028	NC_010117	TCA	2	6	230061	230066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831626
4029	NC_010117	T	6	6	230085	230090	0 %	100 %	0 %	0 %	161831626
4030	NC_010117	TGT	2	6	230290	230295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831005
4031	NC_010117	TCG	2	6	230298	230303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831005
4032	NC_010117	T	7	7	230496	230502	0 %	100 %	0 %	0 %	161831005
4033	NC_010117	GGA	2	6	230619	230624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831005
4034	NC_010117	ATC	2	6	230657	230662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831005
4035	NC_010117	GAA	2	6	230845	230850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830586
4036	NC_010117	GGA	2	6	230926	230931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830586
4037	NC_010117	TAT	2	6	230944	230949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830586
4038	NC_010117	GCG	2	6	230954	230959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830586
4039	NC_010117	ATC	2	6	230970	230975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830586
4040	NC_010117	A	7	7	231013	231019	100 %	0 %	0 %	0 %	161830586
4041	NC_010117	TA	3	6	231021	231026	50 %	50 %	0 %	0 %	161830586
4042	NC_010117	CAT	2	6	231070	231075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830586
4043	NC_010117	A	8	8	231083	231090	100 %	0 %	0 %	0 %	161830586
4044	NC_010117	TCG	2	6	231117	231122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830586
4045	NC_010117	TGT	2	6	231195	231200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830586
4046	NC_010117	A	6	6	231284	231289	100 %	0 %	0 %	0 %	161830586
4047	NC_010117	TGAT	2	8	231312	231319	25 %	50 %	25 %	0 %	161830586
4048	NC_010117	CTA	2	6	231339	231344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830586
4049	NC_010117	CAA	2	6	231356	231361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830586
4050	NC_010117	TTA	2	6	231375	231380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830586
4051	NC_010117	T	6	6	231384	231389	0 %	100 %	0 %	0 %	161830586
4052	NC_010117	ATTA	3	12	231534	231545	50 %	50 %	0 %	0 %	161830586
4053	NC_010117	TTAT	2	8	231642	231649	25 %	75 %	0 %	0 %	161830376
4054	NC_010117	T	7	7	231886	231892	0 %	100 %	0 %	0 %	161830376
4055	NC_010117	TTA	2	6	231918	231923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830376
4056	NC_010117	CTT	2	6	231964	231969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830376
4057	NC_010117	GAA	2	6	231987	231992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830376
4058	NC_010117	ATT	2	6	232044	232049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830376
4059	NC_010117	TGC	2	6	232094	232099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830376
4060	NC_010117	TATT	2	8	232100	232107	25 %	75 %	0 %	0 %	161830376
4061	NC_010117	ACGC	2	8	232212	232219	25 %	0 %	25 %	50 %	161830376
4062	NC_010117	A	7	7	232255	232261	100 %	0 %	0 %	0 %	161830376
4063	NC_010117	ATT	2	6	232281	232286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830376
4064	NC_010117	T	6	6	232313	232318	0 %	100 %	0 %	0 %	161830376
4065	NC_010117	ATA	2	6	232357	232362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830376
4066	NC_010117	T	6	6	232370	232375	0 %	100 %	0 %	0 %	161830376
4067	NC_010117	TTCC	2	8	232459	232466	0 %	50 %	0 %	50 %	161830376
4068	NC_010117	AAG	2	6	232480	232485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830376
4069	NC_010117	TAT	2	6	232493	232498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830376
4070	NC_010117	A	6	6	232526	232531	100 %	0 %	0 %	0 %	161830376
4071	NC_010117	TGA	2	6	232694	232699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830376
4072	NC_010117	ATC	2	6	232735	232740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830376
4073	NC_010117	TCT	2	6	232764	232769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830376
4074	NC_010117	TC	3	6	232804	232809	0 %	50 %	0 %	50 %	161831505
4075	NC_010117	GAG	2	6	232816	232821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831505
4076	NC_010117	TTAA	2	8	232827	232834	50 %	50 %	0 %	0 %	161831505
4077	NC_010117	T	6	6	232918	232923	0 %	100 %	0 %	0 %	161831505
4078	NC_010117	A	6	6	232980	232985	100 %	0 %	0 %	0 %	161831505
4079	NC_010117	GTA	2	6	233009	233014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831505
4080	NC_010117	TAAAT	2	10	233127	233136	60 %	40 %	0 %	0 %	161831505
4081	NC_010117	GCA	2	6	233229	233234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831505
4082	NC_010117	TTA	2	6	233328	233333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831505
4083	NC_010117	AAATT	2	10	233353	233362	60 %	40 %	0 %	0 %	161831505
4084	NC_010117	TGC	2	6	233367	233372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831505
4085	NC_010117	GAG	2	6	233404	233409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831505
4086	NC_010117	ATG	2	6	233426	233431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831505
4087	NC_010117	TAAG	2	8	233441	233448	50 %	25 %	25 %	0 %	161831505
4088	NC_010117	TAA	2	6	233489	233494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831505
4089	NC_010117	ATG	2	6	233505	233510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831505
4090	NC_010117	TTTC	2	8	233531	233538	0 %	75 %	0 %	25 %	161831505
4091	NC_010117	AT	3	6	233592	233597	50 %	50 %	0 %	0 %	161831505
4092	NC_010117	T	8	8	233634	233641	0 %	100 %	0 %	0 %	161831505
4093	NC_010117	GAT	2	6	233660	233665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831505
4094	NC_010117	ATCA	2	8	233669	233676	50 %	25 %	0 %	25 %	161831505
4095	NC_010117	AATAAA	2	12	233702	233713	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	161831505
4096	NC_010117	TTAAT	2	10	233716	233725	40 %	60 %	0 %	0 %	161831505
4097	NC_010117	T	7	7	233725	233731	0 %	100 %	0 %	0 %	161831505
4098	NC_010117	ACC	2	6	233888	233893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831505
4099	NC_010117	AAT	2	6	233963	233968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831505
4100	NC_010117	TGC	2	6	234032	234037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831505
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4103	NC_010117	TAA	2	6	234095	234100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831505
4104	NC_010117	TGG	2	6	234124	234129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831505
4105	NC_010117	ATA	2	6	234270	234275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831505
4106	NC_010117	AAAGAT	2	12	234301	234312	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	161831505
4107	NC_010117	TAA	2	6	234317	234322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831505
4108	NC_010117	AGG	2	6	234337	234342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831505
4109	NC_010117	TTAT	2	8	234345	234352	25 %	75 %	0 %	0 %	161831505
4110	NC_010117	T	7	7	234383	234389	0 %	100 %	0 %	0 %	161831225
4111	NC_010117	TGC	2	6	234404	234409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831225
4112	NC_010117	ATT	2	6	234451	234456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831225
4113	NC_010117	T	6	6	234467	234472	0 %	100 %	0 %	0 %	161831225
4114	NC_010117	GTGA	2	8	234547	234554	25 %	25 %	50 %	0 %	161831225
4115	NC_010117	TAA	2	6	234655	234660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831225
4116	NC_010117	TGT	2	6	234704	234709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831225
4117	NC_010117	CAG	2	6	234783	234788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831225
4118	NC_010117	GCA	2	6	234819	234824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831225
4119	NC_010117	T	7	7	234845	234851	0 %	100 %	0 %	0 %	161831225
4120	NC_010117	AAT	2	6	234869	234874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831225
4121	NC_010117	GAA	2	6	235022	235027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831225
4122	NC_010117	ATG	2	6	235133	235138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831225
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4124	NC_010117	T	6	6	235229	235234	0 %	100 %	0 %	0 %	161829941
4125	NC_010117	T	8	8	235265	235272	0 %	100 %	0 %	0 %	161829941
4126	NC_010117	GTTT	2	8	235278	235285	0 %	75 %	25 %	0 %	161829941
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4232	NC_010117	GAA	2	6	246436	246441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829843
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4239	NC_010117	A	6	6	252708	252713	100 %	0 %	0 %	0 %	161830542
4240	NC_010117	GCCG	2	8	252745	252752	0 %	0 %	50 %	50 %	161830542
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4246	NC_010117	A	7	7	253047	253053	100 %	0 %	0 %	0 %	161830542
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4248	NC_010117	AAT	2	6	253095	253100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830542
4249	NC_010117	TTTA	2	8	253110	253117	25 %	75 %	0 %	0 %	161830542
4250	NC_010117	A	6	6	253125	253130	100 %	0 %	0 %	0 %	161830542
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4252	NC_010117	CTA	2	6	253151	253156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830542
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4257	NC_010117	A	6	6	253321	253326	100 %	0 %	0 %	0 %	161830542
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4361	NC_010117	GAA	2	6	258433	258438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830692
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4363	NC_010117	ATT	2	6	258483	258488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830692
4364	NC_010117	ATTTT	2	10	258505	258514	20 %	80 %	0 %	0 %	161830692
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4367	NC_010117	AATA	2	8	258570	258577	75 %	25 %	0 %	0 %	161830692
4368	NC_010117	ATG	2	6	258591	258596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830692
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4493	NC_010117	ATC	2	6	266411	266416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830508
4494	NC_010117	TTAT	2	8	266420	266427	25 %	75 %	0 %	0 %	161830508
4495	NC_010117	CGG	2	6	266445	266450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830508
4496	NC_010117	GAG	2	6	266481	266486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830508
4497	NC_010117	TAT	2	6	266490	266495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830508
4498	NC_010117	GTG	2	6	266534	266539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830508
4499	NC_010117	AGT	2	6	266569	266574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830508
4500	NC_010117	TGGT	2	8	266591	266598	0 %	50 %	50 %	0 %	161830508

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