MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 34541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_010117	GCTC	2	8	2014073	2014080	0 %	25 %	25 %	50 %	161830986
34502	NC_010117	TGAT	2	8	2014115	2014122	25 %	50 %	25 %	0 %	161830986
34503	NC_010117	CGG	2	6	2014143	2014148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830986
34504	NC_010117	AGT	2	6	2014204	2014209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830986
34505	NC_010117	T	6	6	2014250	2014255	0 %	100 %	0 %	0 %	161830986
34506	NC_010117	TCA	2	6	2014274	2014279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830986
34507	NC_010117	GCA	2	6	2014307	2014312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830986
34508	NC_010117	TCG	2	6	2014491	2014496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830662
34509	NC_010117	TTTTAC	2	12	2014516	2014527	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	161830662
34510	NC_010117	AAT	2	6	2014576	2014581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830662
34511	NC_010117	GAT	2	6	2014802	2014807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830662
34512	NC_010117	T	6	6	2014807	2014812	0 %	100 %	0 %	0 %	161830662
34513	NC_010117	GTG	2	6	2014883	2014888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830662
34514	NC_010117	AGC	2	6	2014942	2014947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830662
34515	NC_010117	GATTT	2	10	2015023	2015032	20 %	60 %	20 %	0 %	161831062
34516	NC_010117	A	6	6	2015131	2015136	100 %	0 %	0 %	0 %	161831062
34517	NC_010117	GTT	2	6	2015175	2015180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831062
34518	NC_010117	ATGG	2	8	2015196	2015203	25 %	25 %	50 %	0 %	161831062
34519	NC_010117	AACA	2	8	2015209	2015216	75 %	0 %	0 %	25 %	161831062
34520	NC_010117	GC	3	6	2015229	2015234	0 %	0 %	50 %	50 %	161831062
34521	NC_010117	CG	3	6	2015240	2015245	0 %	0 %	50 %	50 %	161831062
34522	NC_010117	TGA	2	6	2015285	2015290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831062
34523	NC_010117	ATGA	2	8	2015413	2015420	50 %	25 %	25 %	0 %	161831062
34524	NC_010117	CTCA	2	8	2015448	2015455	25 %	25 %	0 %	50 %	161831597
34525	NC_010117	CG	3	6	2015456	2015461	0 %	0 %	50 %	50 %	161831597
34526	NC_010117	ATT	2	6	2015492	2015497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831597
34527	NC_010117	T	6	6	2015496	2015501	0 %	100 %	0 %	0 %	161831597
34528	NC_010117	A	7	7	2015516	2015522	100 %	0 %	0 %	0 %	161831597
34529	NC_010117	T	6	6	2015566	2015571	0 %	100 %	0 %	0 %	161831597
34530	NC_010117	T	6	6	2015721	2015726	0 %	100 %	0 %	0 %	161831597
34531	NC_010117	CGT	2	6	2015787	2015792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831597
34532	NC_010117	ATC	2	6	2015813	2015818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831597
34533	NC_010117	ATT	2	6	2015896	2015901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831597
34534	NC_010117	ATT	2	6	2015994	2015999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831597
34535	NC_010117	A	6	6	2016028	2016033	100 %	0 %	0 %	0 %	161831597
34536	NC_010117	AATT	2	8	2016225	2016232	50 %	50 %	0 %	0 %	161831597
34537	NC_010117	CAA	2	6	2016250	2016255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831597
34538	NC_010117	CAA	2	6	2016268	2016273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831597
34539	NC_010117	ATT	2	6	2016312	2016317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831597
34540	NC_010117	TTG	2	6	2016319	2016324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831597
34541	NC_010117	T	7	7	2016337	2016343	0 %	100 %	0 %	0 %	161831597

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.