MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 34541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010117	AAT	2	6	59843	59848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831197
1002	NC_010117	TTGG	2	8	59868	59875	0 %	50 %	50 %	0 %	161831197
1003	NC_010117	CCG	2	6	59883	59888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831197
1004	NC_010117	GTGG	2	8	59934	59941	0 %	25 %	75 %	0 %	161831197
1005	NC_010117	T	6	6	59950	59955	0 %	100 %	0 %	0 %	161831197
1006	NC_010117	TTAT	2	8	59971	59978	25 %	75 %	0 %	0 %	161831197
1007	NC_010117	CCA	2	6	60004	60009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831197
1008	NC_010117	TC	3	6	60013	60018	0 %	50 %	0 %	50 %	161831197
1009	NC_010117	T	7	7	60111	60117	0 %	100 %	0 %	0 %	161830389
1010	NC_010117	ACA	2	6	60131	60136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830389
1011	NC_010117	GTG	2	6	60156	60161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830389
1012	NC_010117	CGT	2	6	60182	60187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830389
1013	NC_010117	CTG	2	6	60204	60209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830389
1014	NC_010117	ACC	2	6	60445	60450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830271
1015	NC_010117	AAT	2	6	60452	60457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830271
1016	NC_010117	TAA	2	6	60461	60466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830271
1017	NC_010117	GCC	2	6	60470	60475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830271
1018	NC_010117	TTA	2	6	60541	60546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830271
1019	NC_010117	GTTTTT	2	12	60580	60591	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	161830271
1020	NC_010117	G	6	6	60597	60602	0 %	0 %	100 %	0 %	161830271
1021	NC_010117	TTCGT	2	10	60608	60617	0 %	60 %	20 %	20 %	161830271
1022	NC_010117	CGT	2	6	60652	60657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830271
1023	NC_010117	AAT	2	6	60660	60665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830271
1024	NC_010117	GTT	2	6	60742	60747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830271
1025	NC_010117	T	6	6	60841	60846	0 %	100 %	0 %	0 %	161830271
1026	NC_010117	GCA	2	6	60847	60852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830271
1027	NC_010117	AAT	3	9	60909	60917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830271
1028	NC_010117	GCC	2	6	60978	60983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830271
1029	NC_010117	TAA	2	6	61073	61078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830271
1030	NC_010117	GTCA	2	8	61163	61170	25 %	25 %	25 %	25 %	161830271
1031	NC_010117	GAAA	2	8	61207	61214	75 %	0 %	25 %	0 %	161830271
1032	NC_010117	T	6	6	61387	61392	0 %	100 %	0 %	0 %	161830271
1033	NC_010117	GGC	2	6	61430	61435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830271
1034	NC_010117	GT	3	6	61467	61472	0 %	50 %	50 %	0 %	161830271
1035	NC_010117	CGA	2	6	61483	61488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830271
1036	NC_010117	GCT	2	6	61619	61624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830271
1037	NC_010117	AGAAGC	2	12	61658	61669	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	161830271
1038	NC_010117	TCA	2	6	61680	61685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830271
1039	NC_010117	GGA	2	6	61761	61766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830271
1040	NC_010117	TTC	2	6	61790	61795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830271
1041	NC_010117	ATC	2	6	61802	61807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830271
1042	NC_010117	CGG	2	6	61821	61826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830271
1043	NC_010117	ATA	2	6	61831	61836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830271
1044	NC_010117	TTC	2	6	61868	61873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830271
1045	NC_010117	CG	3	6	61897	61902	0 %	0 %	50 %	50 %	161830271
1046	NC_010117	AATT	2	8	62011	62018	50 %	50 %	0 %	0 %	161830271
1047	NC_010117	CGA	2	6	62056	62061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830100
1048	NC_010117	AAT	2	6	62075	62080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830100
1049	NC_010117	GTG	2	6	62113	62118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830100
1050	NC_010117	TAA	2	6	62136	62141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830100
1051	NC_010117	TTG	2	6	62160	62165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830100
1052	NC_010117	AAT	2	6	62190	62195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830100
1053	NC_010117	GCG	2	6	62248	62253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830100
1054	NC_010117	TGA	2	6	62270	62275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830100
1055	NC_010117	ATA	2	6	62279	62284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830100
1056	NC_010117	TCC	2	6	62309	62314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830100
1057	NC_010117	AAT	2	6	62458	62463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830100
1058	NC_010117	ATA	2	6	62519	62524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830100
1059	NC_010117	A	6	6	62524	62529	100 %	0 %	0 %	0 %	161830100
1060	NC_010117	AG	3	6	62581	62586	50 %	0 %	50 %	0 %	161830100
1061	NC_010117	TCA	2	6	62658	62663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830100
1062	NC_010117	CCG	2	6	62698	62703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831469
1063	NC_010117	CTT	2	6	62762	62767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831469
1064	NC_010117	CT	3	6	62809	62814	0 %	50 %	0 %	50 %	161831469
1065	NC_010117	GCA	2	6	62846	62851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831469
1066	NC_010117	ACC	2	6	62928	62933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831469
1067	NC_010117	ATTG	2	8	62953	62960	25 %	50 %	25 %	0 %	161831469
1068	NC_010117	ACGAT	2	10	63007	63016	40 %	20 %	20 %	20 %	161831469
1069	NC_010117	A	6	6	63019	63024	100 %	0 %	0 %	0 %	161831469
1070	NC_010117	CGA	2	6	63100	63105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831469
1071	NC_010117	GGC	2	6	63123	63128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831469
1072	NC_010117	GCC	2	6	63201	63206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831469
1073	NC_010117	TCAT	2	8	63298	63305	25 %	50 %	0 %	25 %	161831469
1074	NC_010117	CGC	2	6	63318	63323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831469
1075	NC_010117	T	6	6	63356	63361	0 %	100 %	0 %	0 %	161831469
1076	NC_010117	TCAT	2	8	63409	63416	25 %	50 %	0 %	25 %	161831469
1077	NC_010117	GGA	2	6	63511	63516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830957
1078	NC_010117	AATT	2	8	63571	63578	50 %	50 %	0 %	0 %	161830957
1079	NC_010117	TCA	2	6	63611	63616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830957
1080	NC_010117	TGAA	2	8	63627	63634	50 %	25 %	25 %	0 %	161830957
1081	NC_010117	ACG	2	6	63674	63679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830957
1082	NC_010117	CAA	2	6	63704	63709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830957
1083	NC_010117	TCT	2	6	63731	63736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830957
1084	NC_010117	CT	3	6	63741	63746	0 %	50 %	0 %	50 %	161830957
1085	NC_010117	TAATTC	2	12	63781	63792	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	161830957
1086	NC_010117	CCT	2	6	63822	63827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830957
1087	NC_010117	TCA	2	6	63839	63844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830957
1088	NC_010117	GAA	2	6	63847	63852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830957
1089	NC_010117	AT	3	6	63865	63870	50 %	50 %	0 %	0 %	161830957
1090	NC_010117	TCA	2	6	63920	63925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830957
1091	NC_010117	GAAA	2	8	63971	63978	75 %	0 %	25 %	0 %	161830957
1092	NC_010117	T	6	6	64038	64043	0 %	100 %	0 %	0 %	161830957
1093	NC_010117	CTT	2	6	64059	64064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830957
1094	NC_010117	T	8	8	64063	64070	0 %	100 %	0 %	0 %	161830957
1095	NC_010117	TCT	2	6	64073	64078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830957
1096	NC_010117	TAT	2	6	65770	65775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831173
1097	NC_010117	T	6	6	65775	65780	0 %	100 %	0 %	0 %	161831173
1098	NC_010117	T	7	7	65893	65899	0 %	100 %	0 %	0 %	161831173
1099	NC_010117	AATTT	2	10	65912	65921	40 %	60 %	0 %	0 %	161831173
1100	NC_010117	AAG	2	6	66010	66015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831173
1101	NC_010117	GAT	3	9	66090	66098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831173
1102	NC_010117	TAAGA	2	10	66102	66111	60 %	20 %	20 %	0 %	161831173
1103	NC_010117	A	7	7	66157	66163	100 %	0 %	0 %	0 %	161831173
1104	NC_010117	ATAA	2	8	66174	66181	75 %	25 %	0 %	0 %	161831173
1105	NC_010117	GAG	2	6	66195	66200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831173
1106	NC_010117	GAC	2	6	66496	66501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830759
1107	NC_010117	GCA	3	9	66502	66510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830759
1108	NC_010117	CGC	2	6	66577	66582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830759
1109	NC_010117	TAATA	2	10	66583	66592	60 %	40 %	0 %	0 %	161830759
1110	NC_010117	GTGG	2	8	66620	66627	0 %	25 %	75 %	0 %	161830759
1111	NC_010117	CAA	2	6	66638	66643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830759
1112	NC_010117	A	7	7	66677	66683	100 %	0 %	0 %	0 %	161830759
1113	NC_010117	GT	3	6	66724	66729	0 %	50 %	50 %	0 %	161830759
1114	NC_010117	GGC	2	6	66751	66756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830759
1115	NC_010117	TATT	2	8	66757	66764	25 %	75 %	0 %	0 %	161830759
1116	NC_010117	CCT	2	6	66776	66781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830759
1117	NC_010117	ATG	2	6	66834	66839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830759
1118	NC_010117	TGAATG	2	12	66882	66893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830759
1119	NC_010117	CTC	2	6	66910	66915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830759
1120	NC_010117	GAA	2	6	67037	67042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830759
1121	NC_010117	GGC	2	6	67168	67173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830759
1122	NC_010117	AGA	2	6	67312	67317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830759
1123	NC_010117	AGC	2	6	67368	67373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830759
1124	NC_010117	TCAT	2	8	67374	67381	25 %	50 %	0 %	25 %	161830759
1125	NC_010117	TTGT	2	8	67620	67627	0 %	75 %	25 %	0 %	161830731
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1127	NC_010117	AAC	2	6	67654	67659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830731
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