MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 34541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010117	GC	3	6	27274	27279	0 %	0 %	50 %	50 %	161829860
502	NC_010117	A	6	6	27282	27287	100 %	0 %	0 %	0 %	161829860
503	NC_010117	ATACG	2	10	27304	27313	40 %	20 %	20 %	20 %	161829860
504	NC_010117	ATCA	2	8	27324	27331	50 %	25 %	0 %	25 %	161829860
505	NC_010117	TTC	2	6	27336	27341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829860
506	NC_010117	CGT	2	6	27383	27388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161829860
507	NC_010117	TCG	2	6	27445	27450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161829860
508	NC_010117	CTGT	2	8	27496	27503	0 %	50 %	25 %	25 %	161829860
509	NC_010117	T	7	7	27510	27516	0 %	100 %	0 %	0 %	161829860
510	NC_010117	GGC	2	6	27552	27557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161829860
511	NC_010117	CG	3	6	27623	27628	0 %	0 %	50 %	50 %	161829860
512	NC_010117	ATG	2	6	27633	27638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161829860
513	NC_010117	ATC	3	9	27681	27689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829860
514	NC_010117	TGGTAT	2	12	27749	27760	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	161829860
515	NC_010117	GCT	2	6	27794	27799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161829860
516	NC_010117	CAA	2	6	27831	27836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161829860
517	NC_010117	TAA	3	9	27849	27857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829860
518	NC_010117	CTT	3	9	27977	27985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829860
519	NC_010117	TTTG	2	8	27986	27993	0 %	75 %	25 %	0 %	161829860
520	NC_010117	TAA	2	6	27995	28000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829860
521	NC_010117	GTTT	2	8	28009	28016	0 %	75 %	25 %	0 %	161829860
522	NC_010117	ATC	2	6	28080	28085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829860
523	NC_010117	CGC	2	6	28233	28238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161829860
524	NC_010117	T	7	7	28282	28288	0 %	100 %	0 %	0 %	161829860
525	NC_010117	CTT	2	6	28385	28390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829860
526	NC_010117	GCG	2	6	28394	28399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161829860
527	NC_010117	CTT	2	6	28480	28485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831081
528	NC_010117	GAG	2	6	28874	28879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830734
529	NC_010117	A	8	8	28882	28889	100 %	0 %	0 %	0 %	161830734
530	NC_010117	TTA	2	6	28950	28955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830734
531	NC_010117	AATT	2	8	28971	28978	50 %	50 %	0 %	0 %	161830734
532	NC_010117	CCTT	2	8	29029	29036	0 %	50 %	0 %	50 %	161830734
533	NC_010117	GTT	2	6	29116	29121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830734
534	NC_010117	CTTT	2	8	29129	29136	0 %	75 %	0 %	25 %	161830734
535	NC_010117	GT	3	6	29169	29174	0 %	50 %	50 %	0 %	161830734
536	NC_010117	AAG	2	6	29205	29210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830734
537	NC_010117	AATGC	2	10	29284	29293	40 %	20 %	20 %	20 %	161830734
538	NC_010117	CTC	3	9	29340	29348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830734
539	NC_010117	CAC	4	12	29412	29423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830734
540	NC_010117	CTTT	2	8	29484	29491	0 %	75 %	0 %	25 %	161830734
541	NC_010117	T	6	6	29489	29494	0 %	100 %	0 %	0 %	161830734
542	NC_010117	CAC	2	6	29499	29504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830734
543	NC_010117	GAAA	2	8	29515	29522	75 %	0 %	25 %	0 %	161830734
544	NC_010117	TTTA	2	8	29542	29549	25 %	75 %	0 %	0 %	161830734
545	NC_010117	GAGG	2	8	29651	29658	25 %	0 %	75 %	0 %	161830734
546	NC_010117	GAG	2	6	29666	29671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830734
547	NC_010117	T	6	6	29734	29739	0 %	100 %	0 %	0 %	161830734
548	NC_010117	AAC	2	6	29745	29750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830734
549	NC_010117	ACGA	2	8	30188	30195	50 %	0 %	25 %	25 %	161829965
550	NC_010117	GAA	2	6	30203	30208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829965
551	NC_010117	TAG	2	6	30229	30234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161829965
552	NC_010117	CTTG	2	8	30295	30302	0 %	50 %	25 %	25 %	161829965
553	NC_010117	CTC	2	6	30315	30320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161829965
554	NC_010117	ATT	2	6	30335	30340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829965
555	NC_010117	GTT	2	6	30354	30359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161829965
556	NC_010117	GAG	2	6	30422	30427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161829965
557	NC_010117	GT	4	8	30473	30480	0 %	50 %	50 %	0 %	161829965
558	NC_010117	CTA	2	6	30503	30508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829965
559	NC_010117	ATG	2	6	30537	30542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161829965
560	NC_010117	T	6	6	30561	30566	0 %	100 %	0 %	0 %	161829965
561	NC_010117	CG	3	6	30581	30586	0 %	0 %	50 %	50 %	161829965
562	NC_010117	CGT	2	6	30599	30604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161829965
563	NC_010117	TAA	2	6	30644	30649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830612
564	NC_010117	TGG	2	6	30664	30669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830612
565	NC_010117	TTGTT	2	10	30672	30681	0 %	80 %	20 %	0 %	161830612
566	NC_010117	GAA	2	6	30757	30762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830612
567	NC_010117	GAT	2	6	30787	30792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830612
568	NC_010117	CAG	2	6	30796	30801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830612
569	NC_010117	TCAC	2	8	30812	30819	25 %	25 %	0 %	50 %	161830612
570	NC_010117	AAG	2	6	30845	30850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830612
571	NC_010117	GTT	2	6	30868	30873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830612
572	NC_010117	GAA	2	6	30892	30897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830612
573	NC_010117	AAG	2	6	30902	30907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830612
574	NC_010117	AGG	2	6	30908	30913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830612
575	NC_010117	T	6	6	30935	30940	0 %	100 %	0 %	0 %	161830612
576	NC_010117	TAA	2	6	30960	30965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830612
577	NC_010117	GTTTT	2	10	31000	31009	0 %	80 %	20 %	0 %	161830612
578	NC_010117	T	6	6	31006	31011	0 %	100 %	0 %	0 %	161830612
579	NC_010117	CCG	2	6	31015	31020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830612
580	NC_010117	AGG	2	6	31076	31081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830612
581	NC_010117	GGA	2	6	31092	31097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830612
582	NC_010117	CAT	2	6	31147	31152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830612
583	NC_010117	GA	3	6	31171	31176	50 %	0 %	50 %	0 %	161830612
584	NC_010117	GAGCTC	2	12	31179	31190	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161830612
585	NC_010117	TCT	2	6	31270	31275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830810
586	NC_010117	TGGG	2	8	31316	31323	0 %	25 %	75 %	0 %	161830810
587	NC_010117	T	6	6	31369	31374	0 %	100 %	0 %	0 %	161830810
588	NC_010117	ACGC	2	8	31385	31392	25 %	0 %	25 %	50 %	161830810
589	NC_010117	CAC	2	6	31396	31401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830810
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593	NC_010117	ATT	2	6	31623	31628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830810
594	NC_010117	T	6	6	31636	31641	0 %	100 %	0 %	0 %	161830810
595	NC_010117	CG	3	6	31682	31687	0 %	0 %	50 %	50 %	161830810
596	NC_010117	GTG	2	6	31691	31696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830810
597	NC_010117	GCG	2	6	31770	31775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830810
598	NC_010117	ATT	2	6	31819	31824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830810
599	NC_010117	GCG	2	6	31855	31860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830810
600	NC_010117	TTGG	2	8	31862	31869	0 %	50 %	50 %	0 %	161830810
601	NC_010117	ATT	2	6	31897	31902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830810
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604	NC_010117	A	6	6	31965	31970	100 %	0 %	0 %	0 %	161830810
605	NC_010117	AAT	2	6	32030	32035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830810
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607	NC_010117	TAT	2	6	32154	32159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830810
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609	NC_010117	TGAA	2	8	32232	32239	50 %	25 %	25 %	0 %	161830810
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611	NC_010117	GA	3	6	32545	32550	50 %	0 %	50 %	0 %	161831447
612	NC_010117	A	7	7	32553	32559	100 %	0 %	0 %	0 %	161831447
613	NC_010117	CAA	3	9	32592	32600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831447
614	NC_010117	CAA	2	6	32604	32609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831447
615	NC_010117	AAGCGG	2	12	32647	32658	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	161831447
616	NC_010117	ACG	2	6	32911	32916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831447
617	NC_010117	ATTT	2	8	32917	32924	25 %	75 %	0 %	0 %	161831447
618	NC_010117	AAT	2	6	32949	32954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831447
619	NC_010117	T	6	6	32990	32995	0 %	100 %	0 %	0 %	161831447
620	NC_010117	TAA	2	6	33026	33031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831447
621	NC_010117	TTGCTT	2	12	33033	33044	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	161831447
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624	NC_010117	GCA	2	6	33155	33160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831447
625	NC_010117	CAA	2	6	33180	33185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831447
626	NC_010117	T	6	6	33191	33196	0 %	100 %	0 %	0 %	161831447
627	NC_010117	TTA	2	6	33210	33215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831447
628	NC_010117	ACTT	2	8	33219	33226	25 %	50 %	0 %	25 %	161831447
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