MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 plasmid QpH1

Total Repeats: 554

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010115	CCGG	2	8	29696	29703	0 %	0 %	50 %	50 %	161789079
502	NC_010115	AAT	2	6	29722	29727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161789079
503	NC_010115	GGC	2	6	29797	29802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161789079
504	NC_010115	AGC	2	6	29853	29858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161789079
505	NC_010115	CATCAA	2	12	29886	29897	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	161789079
506	NC_010115	CTG	2	6	30138	30143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161789106
507	NC_010115	TG	3	6	30156	30161	0 %	50 %	50 %	0 %	161789106
508	NC_010115	GCCAC	2	10	30228	30237	20 %	0 %	20 %	60 %	161789106
509	NC_010115	A	6	6	30283	30288	100 %	0 %	0 %	0 %	161789106
510	NC_010115	ATG	2	6	30344	30349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161789106
511	NC_010115	AAT	2	6	30412	30417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161789106
512	NC_010115	ATT	2	6	30433	30438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161789106
513	NC_010115	T	6	6	30542	30547	0 %	100 %	0 %	0 %	161789106
514	NC_010115	CAG	2	6	30579	30584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161789106
515	NC_010115	TTC	2	6	30598	30603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161789106
516	NC_010115	ATT	2	6	30628	30633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161789106
517	NC_010115	ATT	2	6	30652	30657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161789106
518	NC_010115	CTTG	2	8	30659	30666	0 %	50 %	25 %	25 %	161789106
519	NC_010115	T	6	6	30684	30689	0 %	100 %	0 %	0 %	161789106
520	NC_010115	CTT	2	6	30708	30713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161789106
521	NC_010115	TTC	2	6	30733	30738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161789106
522	NC_010115	ATA	2	6	30784	30789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161789106
523	NC_010115	TCA	2	6	30791	30796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161789106
524	NC_010115	CGC	2	6	30802	30807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161789106
525	NC_010115	ATC	2	6	30826	30831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161789106
526	NC_010115	ATT	2	6	30925	30930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161789106
527	NC_010115	CTT	3	9	30948	30956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161789106
528	NC_010115	CAA	3	9	30976	30984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161789106
529	NC_010115	TTGA	2	8	30985	30992	25 %	50 %	25 %	0 %	161789106
530	NC_010115	TTCT	2	8	31022	31029	0 %	75 %	0 %	25 %	161789106
531	NC_010115	A	6	6	31064	31069	100 %	0 %	0 %	0 %	161789106
532	NC_010115	AG	3	6	31127	31132	50 %	0 %	50 %	0 %	161789106
533	NC_010115	ATTTT	2	10	31161	31170	20 %	80 %	0 %	0 %	161789106
534	NC_010115	T	8	8	31167	31174	0 %	100 %	0 %	0 %	161789106
535	NC_010115	CCT	2	6	31214	31219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161789086
536	NC_010115	TAT	2	6	31252	31257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161789086
537	NC_010115	AGA	2	6	31261	31266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161789086
538	NC_010115	A	6	6	31270	31275	100 %	0 %	0 %	0 %	161789086
539	NC_010115	AGTTA	2	10	31291	31300	40 %	40 %	20 %	0 %	161789086
540	NC_010115	GAA	2	6	31932	31937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161789103
541	NC_010115	CAATG	2	10	31947	31956	40 %	20 %	20 %	20 %	161789103
542	NC_010115	ATT	2	6	31977	31982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161789103
543	NC_010115	TTTA	2	8	32049	32056	25 %	75 %	0 %	0 %	161789103
544	NC_010115	ATT	2	6	32089	32094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161789103
545	NC_010115	TGG	2	6	32145	32150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161789103
546	NC_010115	TA	3	6	32167	32172	50 %	50 %	0 %	0 %	161789103
547	NC_010115	A	6	6	32184	32189	100 %	0 %	0 %	0 %	161789103
548	NC_010115	AAAT	2	8	32248	32255	75 %	25 %	0 %	0 %	161789103
549	NC_010115	GA	3	6	32296	32301	50 %	0 %	50 %	0 %	161789103
550	NC_010115	CCA	2	6	32306	32311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161789103
551	NC_010115	GAAA	2	8	32359	32366	75 %	0 %	25 %	0 %	161789103
552	NC_010115	TAA	2	6	32487	32492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161789087
553	NC_010115	ACCA	2	8	32516	32523	50 %	0 %	0 %	50 %	161789087
554	NC_010115	ATGA	2	8	32676	32683	50 %	25 %	25 %	0 %	161789087

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